Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
313,275 |
T→G |
intergenic (‑33/+441) |
ykgR ← / ← ykgP |
uncharacterized protein/pseudogene, oxidoreductase family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 313,275 | 0 | T | G | 99.2%
| 885.6
/ ‑2.4
| 248 | intergenic (‑33/+441) | ykgR/ykgP | uncharacterized protein/pseudogene, oxidoreductase family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (100/145); total (101/147) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.50e-01 |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
ATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATT > NC_000913/313178‑313371
|
aTTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCg < 1:2057452/100‑1 (MQ=255)
ttGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGt < 2:1608145/100‑1 (MQ=255)
gCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTaa > 2:2137792/1‑100 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg > 2:4084194/1‑100 (MQ=255)
gACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGt > 2:2976156/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGc > 1:269178/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGc > 2:4924537/1‑100 (MQ=255)
cAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGc > 1:1877895/1‑100 (MQ=255)
acaacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTta < 1:2923855/100‑1 (MQ=255)
acaacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTta < 2:4781290/100‑1 (MQ=255)
caacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtat < 1:92403/100‑1 (MQ=255)
caacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtat < 2:2094201/100‑1 (MQ=255)
caacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtat > 1:2141806/1‑100 (MQ=255)
caacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtat > 2:5446696/1‑100 (MQ=255)
acGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtatat > 2:1390047/1‑100 (MQ=255)
acGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtatat < 2:623639/100‑1 (MQ=255)
cGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtatata > 1:3990970/1‑100 (MQ=255)
atatTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATataaa > 1:1437590/1‑100 (MQ=255)
tatTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATataaat < 2:2256510/100‑1 (MQ=255)
atTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAACAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATataaata < 2:3723340/100‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATataaataa > 1:3550755/1‑100 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg > 2:2823136/1‑100 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg < 1:793398/100‑1 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg > 2:1009035/1‑100 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg < 1:3789204/100‑1 (MQ=255)
aTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGa > 2:123325/1‑100 (MQ=255)
aTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGa > 1:4560057/1‑100 (MQ=255)
tCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAg < 1:5418780/100‑1 (MQ=255)
tCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAg < 1:1033062/100‑1 (MQ=255)
gTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATACATAACGAGttt > 2:4391320/1‑100 (MQ=255)
tttATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTg < 2:4136412/100‑1 (MQ=255)
ttATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTgg < 1:4813996/100‑1 (MQ=255)
tATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTGATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGGAATGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGCTTTTgat > 1:4467305/1‑98 (MQ=255)
aTGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTc < 1:3589581/100‑1 (MQ=255)
tgaaggATTGGCTGTACTTGATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCATTATATAAATAACGAGTTTGGTCa < 2:4222769/95‑1 (MQ=255)
gACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCaa > 2:845625/1‑100 (MQ=255)
gATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCaa > 1:3076911/1‑100 (MQ=255)
aTTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAt > 1:5292075/1‑100 (MQ=255)
aTTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAt > 2:700981/1‑100 (MQ=255)
gCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAttttt > 2:2281418/1‑100 (MQ=255)
gCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAttttt > 2:2562050/1‑100 (MQ=255)
gCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAttttt < 2:878541/100‑1 (MQ=255)
gCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACCGCGTAAGTGCGCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAttttt < 1:5376527/100‑1 (MQ=255)
cTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAtttttt > 1:4934350/1‑100 (MQ=255)
cTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAtttttt < 2:4357321/100‑1 (MQ=255)
tGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGTGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTg < 2:2208951/100‑1 (MQ=255)
tGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTg < 2:449696/100‑1 (MQ=255)
gTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGa > 2:3359730/1‑100 (MQ=255)
tACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAATAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAc < 2:5005240/100‑1 (MQ=255)
tACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAc < 2:3709641/100‑1 (MQ=255)
tACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAc > 1:2398692/1‑100 (MQ=255)
ncTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa > 2:5276322/2‑100 (MQ=255)
aCTTTATTGTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCACTTATATAAATAGCGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa > 2:5261225/1‑100 (MQ=255)
aCTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa < 1:2132610/100‑1 (MQ=255)
aCTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa < 1:2587431/100‑1 (MQ=255)
aCTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa > 1:208278/1‑100 (MQ=255)
tttATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATg < 1:1644250/100‑1 (MQ=255)
tATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTa < 2:3546823/100‑1 (MQ=255)
tATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTa < 2:4709240/100‑1 (MQ=255)
tATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAAATGTa > 1:4629554/1‑100 (MQ=255)
aTTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTAt < 1:3004263/100‑1 (MQ=255)
aTTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTAt < 2:3629150/100‑1 (MQ=255)
tctcTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATca < 2:4526533/100‑1 (MQ=255)
tctcTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATca > 2:4024406/1‑100 (MQ=255)
tctTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATcaca > 2:3211675/1‑100 (MQ=255)
cATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAAttt < 2:3037633/100‑1 (MQ=255)
cATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAAttt > 1:2565772/1‑100 (MQ=255)
tGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGaa > 1:3910552/1‑100 (MQ=255)
tGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGaa < 1:4691842/100‑1 (MQ=255)
ggTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGaan < 1:4424216/100‑2 (MQ=255)
ggTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAAt > 1:1136622/1‑100 (MQ=255)
ggTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAAt < 2:3466358/100‑1 (MQ=255)
gTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATa < 2:1777696/100‑1 (MQ=255)
tACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAg > 1:4183326/1‑100 (MQ=255)
cTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGAt > 1:5559540/1‑100 (MQ=255)
ttCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATg < 1:3831944/100‑1 (MQ=255)
tCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGt < 2:4986091/100‑1 (MQ=255)
ccTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTa > 1:27544/1‑100 (MQ=255)
ccTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTa < 1:1788690/100‑1 (MQ=255)
tCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTAtt < 1:5531459/100‑1 (MQ=255)
cGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTa < 1:818139/100‑1 (MQ=255)
cGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTa < 2:1819529/100‑1 (MQ=255)
cGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTa < 2:2503518/100‑1 (MQ=255)
cTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACa > 1:4089410/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACa > 2:1883162/1‑100 (MQ=255)
tttAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACAt > 2:2688134/1‑100 (MQ=255)
ttAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATc > 1:2352823/1‑100 (MQ=255)
aaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTa > 1:1058211/1‑100 (MQ=255)
aaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTAt < 1:124588/100‑1 (MQ=255)
agagTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATc < 1:3656875/100‑1 (MQ=255)
gTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCttt < 2:2621439/100‑1 (MQ=255)
gTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCttt < 2:4865152/100‑1 (MQ=255)
tGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCcttt < 2:3886436/100‑1 (MQ=255)
gCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTa < 1:2810580/100‑1 (MQ=255)
gCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTa > 2:5189872/1‑100 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt > 1:1825337/1‑100 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt < 1:2461034/100‑1 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt < 1:4035286/100‑1 (MQ=255)
aCTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAtt < 1:2233071/100‑1 (MQ=255)
aCTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTAGTGCATCAACTATCTTTTAtt > 1:5220794/1‑100 (MQ=255)
|
ATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATT > NC_000913/313178‑313371
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
