Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
623,458 |
T→G |
L387V (TTG→GTG) |
entS → |
enterobactin exporter, iron‑regulated |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 623,458 | 0 | T | G | 97.8%
| 481.4
/ ‑3.1
| 139 | L387V (TTG→GTG) | entS | enterobactin exporter, iron‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/2); new base G (60/74); total (61/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGC > NC_000913/623363‑623553
|
aGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgtt < 1:3051642/100‑1 (MQ=255)
gAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgttg > 1:2370032/1‑100 (MQ=255)
aaCGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGa > 2:764553/1‑100 (MQ=255)
aCGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGAt > 1:3836713/1‑100 (MQ=255)
tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:681439/1‑100 (MQ=255)
tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGGGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:1673780/1‑100 (MQ=255)
aCGGGAGATGACATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTCGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCg < 2:2195079/100‑1 (MQ=255)
cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg > 1:896036/1‑100 (MQ=255)
ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg < 1:2916346/100‑1 (MQ=255)
ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg < 1:3840161/100‑1 (MQ=255)
ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg > 1:1820715/1‑100 (MQ=255)
ggCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCg > 1:3637187/1‑100 (MQ=255)
cGATGCGATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCgtg < 2:3796825/100‑1 (MQ=255)
tGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttg > 2:699333/1‑100 (MQ=255)
gCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:3857239/100‑1 (MQ=255)
gCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt > 1:4048230/1‑100 (MQ=255)
accATCGGCCCGTCGCTGTTGACTCTTTTGCACGCGATTATGACACCGGTTGGTTACCAAAGCGCGACCGGTTTTCATCTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:479250/99‑1 (MQ=255)
cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:1438443/1‑100 (MQ=255)
cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:1155264/1‑100 (MQ=255)
cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa < 1:340745/100‑1 (MQ=255)
aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt < 1:3441867/100‑1 (MQ=255)
tAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAtt < 1:3511874/100‑1 (MQ=255)
aGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtg < 1:2712860/100‑1 (MQ=255)
aGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtg < 2:742499/100‑1 (MQ=255)
ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc > 1:2755350/1‑100 (MQ=255)
ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc > 1:379079/1‑100 (MQ=255)
ggcgcggcacTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgc < 2:1039809/100‑1 (MQ=255)
cgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctg > 2:2702078/1‑100 (MQ=255)
gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 2:3919964/100‑1 (MQ=255)
gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 2:521234/100‑1 (MQ=255)
gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 1:903341/100‑1 (MQ=255)
cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt > 2:554741/1‑100 (MQ=255)
cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt > 1:2203434/1‑100 (MQ=255)
cggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggt < 1:1998355/100‑1 (MQ=255)
gcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgc > 1:1612130/1‑100 (MQ=255)
cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct < 1:280547/100‑1 (MQ=255)
cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct > 2:709964/1‑100 (MQ=255)
tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2948471/100‑1 (MQ=255)
tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt > 1:1586669/1‑100 (MQ=255)
gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:1234954/100‑1 (MQ=255)
gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:431001/100‑1 (MQ=255)
gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 2:95119/100‑1 (MQ=255)
gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 1:2106343/100‑1 (MQ=255)
ctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 1:608882/100‑1 (MQ=255)
ctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 1:3120934/100‑1 (MQ=255)
gggTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGGGCGGTTTTGGTGTGTTGCTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAg < 1:1992964/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt > 2:543739/1‑100 (MQ=255)
ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 1:2149550/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 2:3131263/100‑1 (MQ=255)
gtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGtt > 2:914339/1‑100 (MQ=255)
tggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTg < 1:1123401/100‑1 (MQ=255)
ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 1:2395927/1‑100 (MQ=255)
gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 1:580102/100‑1 (MQ=255)
gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 2:2177638/100‑1 (MQ=255)
cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:2683248/1‑100 (MQ=255)
cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:500509/1‑100 (MQ=255)
atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGCGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:1317844/100‑1 (MQ=255)
atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:2630753/100‑1 (MQ=255)
gatgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTGGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAg < 1:3844113/100‑1 (MQ=255)
catgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGACCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAg < 2:1620390/99‑1 (MQ=255)
tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 1:2758793/1‑100 (MQ=255)
tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 1:1237641/1‑100 (MQ=255)
tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTGATTGCTGGTGCTGGGGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc > 2:3207975/1‑100 (MQ=255)
tgaCACCGGTTGCTGCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc < 2:3061195/100‑1 (MQ=255)
acacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgc > 1:1176028/1‑100 (MQ=255)
cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:1222039/1‑100 (MQ=255)
cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:3100082/1‑100 (MQ=255)
tccGGCTGCTTCCACAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATTGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGCAGTTGCGACATATTCGCCAGAcgccg < 2:3733870/99‑1 (MQ=255)
acCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccg < 2:1512887/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccgccg > 1:4021088/1‑100 (MQ=255)
gCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAgg > 2:3223474/1‑100 (MQ=255)
cTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGt > 2:1049459/1‑100 (MQ=255)
ccGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGAc > 2:1344927/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:3861209/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:2838878/1‑100 (MQ=255)
gCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAg < 1:12684/100‑1 (MQ=255)
gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:3461053/100‑1 (MQ=255)
gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc > 1:3502359/1‑100 (MQ=255)
gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:2354654/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:1472908/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:190643/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTCTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:3347700/100‑1 (MQ=255)
cgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACCGCGTCCGa > 2:1849114/1‑100 (MQ=255)
cgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGa > 1:452077/1‑100 (MQ=255)
gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 2:2069784/100‑1 (MQ=255)
gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 2:1573386/100‑1 (MQ=255)
gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc > 1:3730456/1‑100 (MQ=255)
gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc > 1:1828426/1‑100 (MQ=255)
gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 1:3279992/100‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg > 2:2324290/1‑100 (MQ=255)
gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:2792552/100‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGt > 2:1801832/1‑100 (MQ=255)
ggTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGtt < 2:506540/100‑1 (MQ=255)
ggTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGtt > 1:2813657/1‑100 (MQ=255)
gTTTTGGTTTGTTGAGTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGATTTGCGACATTTTCGCAAGACGGCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 2:2578650/100‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 2:3533057/100‑1 (MQ=255)
tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:3341283/100‑1 (MQ=255)
ttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATg < 2:2116894/100‑1 (MQ=255)
tGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc < 1:3282785/100‑1 (MQ=255)
tGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc < 1:264032/100‑1 (MQ=255)
|
AGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGC > NC_000913/623363‑623553
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
