Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
623,458 |
T→G |
L387V (TTG→GTG) |
entS → |
enterobactin exporter, iron‑regulated |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 623,458 | 0 | T | G | 99.5%
| 789.4
/ ‑4.3
| 218 | L387V (TTG→GTG) | entS | enterobactin exporter, iron‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (103/114); total (104/114) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCT > NC_000913/623361‑623554
|
cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 1:1000466/1‑100 (MQ=255)
cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 2:1972671/1‑100 (MQ=255)
cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 1:3389065/1‑100 (MQ=255)
aGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgtt < 2:4345014/100‑1 (MQ=255)
gAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgttg > 2:2652606/1‑100 (MQ=255)
cGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGAtt > 2:3160091/1‑100 (MQ=255)
gTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTa < 2:679725/100‑1 (MQ=255)
tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 2:3466123/1‑100 (MQ=255)
tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGACCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:5193457/1‑100 (MQ=255)
cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg < 1:2519514/100‑1 (MQ=255)
cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg < 1:2412127/100‑1 (MQ=255)
ggCGATGCCATAGGCGCGGAGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGATTTTGGTGAGTTGATTATCGGCg > 2:5029378/1‑100 (MQ=255)
gCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCgt < 1:1734839/100‑1 (MQ=255)
aTGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgtt < 1:3025236/100‑1 (MQ=255)
gtcATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGGTTGGGCGCGATGAGGACACCGGTTACTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:5464850/98‑1 (MQ=255)
ccATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTgttgtt < 2:4896831/100‑1 (MQ=255)
cctAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGAGGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:5443768/3‑100 (MQ=255)
cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 1:5551607/1‑100 (MQ=255)
aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt < 2:397637/100‑1 (MQ=255)
aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt > 1:2203216/1‑100 (MQ=255)
tAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAtt < 1:2746383/100‑1 (MQ=255)
ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAttag > 1:282813/1‑98 (MQ=255)
gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:3365669/100‑1 (MQ=255)
gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:1767198/100‑1 (MQ=255)
gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:4595355/100‑1 (MQ=255)
gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 1:3659022/100‑1 (MQ=255)
gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg > 1:1464495/1‑100 (MQ=255)
ggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGGTGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGATTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGATATtgctggtg > 1:4905945/1‑100 (MQ=255)
cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct > 2:2793595/1‑100 (MQ=255)
cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGCTGTTATtgctggtgct > 2:4559374/1‑100 (MQ=255)
tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2092838/100‑1 (MQ=255)
tactgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2633817/98‑1 (MQ=255)
gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 1:1227814/100‑1 (MQ=255)
ctgGGTGGTTGGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCGAGCGCAAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 2:653740/100‑1 (MQ=255)
tgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGa > 1:2473994/1‑100 (MQ=255)
gggTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAg < 1:1815682/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 1:3501769/100‑1 (MQ=255)
ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt > 1:4362191/1‑100 (MQ=255)
ggtTTGGGCGCGATGATGACACCTGTTGCTTCCGCAAGCGCGTGCGGTTTTGGTGTGTTGTTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc < 1:4856726/100‑1 (MQ=255)
ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc < 1:5028390/100‑1 (MQ=255)
ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 2:1417812/1‑100 (MQ=255)
ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 1:381292/1‑100 (MQ=255)
gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 1:1620578/100‑1 (MQ=255)
tttGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGa > 1:3298554/1‑100 (MQ=255)
ttGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGAc < 2:2845669/100‑1 (MQ=255)
ggCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtt > 1:1178645/1‑100 (MQ=255)
ggCGCGATGATGACACCGGTTGCTGCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGGTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtt > 2:3625191/1‑100 (MQ=255)
gcgcGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGagatcg > 2:3843699/1‑95 (MQ=255)
gcgcGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAttt < 2:1853737/100‑1 (MQ=255)
gagggattatGACTCGTGTTGCTTGCGCGAGCGGGGGTGGTTTTGGTGTGTTGGTTATCGGCGTGTTGTTATTTCTGGTGCTGGGGGAGTTGCGACAttt < 2:4694270/96‑1 (MQ=255)
cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:83847/1‑100 (MQ=255)
gcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTc > 2:1172033/1‑100 (MQ=255)
cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 1:3885293/100‑1 (MQ=255)
cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 2:4737735/100‑1 (MQ=255)
cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 1:13351/100‑1 (MQ=255)
gatgatGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGc < 2:3091323/100‑1 (MQ=255)
gatgatGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGc < 1:1363169/100‑1 (MQ=255)
atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc > 1:1257598/1‑100 (MQ=255)
atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 2:2083758/100‑1 (MQ=255)
atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:2866070/100‑1 (MQ=255)
atgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGa > 1:3476329/1‑100 (MQ=255)
tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc < 2:4205757/100‑1 (MQ=255)
gaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcg > 2:4295681/1‑100 (MQ=255)
acacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgc < 2:2392610/100‑1 (MQ=255)
cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 2:394369/1‑100 (MQ=255)
cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:3150052/1‑100 (MQ=255)
acCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccg < 1:3618038/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccgccg > 1:3753542/1‑100 (MQ=255)
tGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAg < 1:5244554/100‑1 (MQ=255)
tGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGATTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGATGTTATTGCTGGTGCTGGTGGCGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCAGCCGCAg > 2:5106985/1‑100 (MQ=255)
cTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGt > 2:3339791/1‑100 (MQ=255)
ttCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTg < 2:1500649/100‑1 (MQ=255)
tCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGAGCGAGTGGATTTGCGATATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGa > 2:5249547/1‑100 (MQ=255)
ccGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGAc > 2:493340/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 1:4965914/1‑100 (MQ=255)
cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:5413503/1‑100 (MQ=255)
gCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAg < 2:1339346/100‑1 (MQ=255)
cAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGc < 1:4764655/100‑1 (MQ=255)
aaGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCg > 1:778149/1‑100 (MQ=255)
gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:124463/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACTCTGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:4751748/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:3548255/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:3962177/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:909650/100‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:1577853/100‑1 (MQ=255)
gcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCg < 1:4234662/100‑1 (MQ=255)
gcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCg < 1:4561724/100‑1 (MQ=255)
gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 1:4599759/100‑1 (MQ=255)
gAGCGGTTTGGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCACGTGACAGCGTCCGAc < 2:4186973/100‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:1145558/100‑1 (MQ=255)
gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:2554281/100‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 1:4692972/100‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa > 1:4523846/1‑100 (MQ=255)
gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 1:5089621/100‑1 (MQ=255)
gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa > 1:3361387/1‑100 (MQ=255)
ttttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTaa < 2:3719088/100‑1 (MQ=255)
tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 2:3282256/100‑1 (MQ=255)
tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:3189588/100‑1 (MQ=255)
tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:1593016/100‑1 (MQ=255)
tGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc > 2:1811874/1‑100 (MQ=255)
|
GCAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCT > NC_000913/623361‑623554
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
