Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,064,004 |
T→G |
intergenic (‑229/‑32) |
cbpA ← / → yccE |
DnaK co‑chaperone; curved DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,064,004 | 0 | T | G | 97.7%
| 448.2
/ ‑3.2
| 135 | intergenic (‑229/‑32) | cbpA/yccE | DnaK co‑chaperone; curved DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (55/75); total (58/77) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CGCCATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAACG > NC_000913/1063907‑1064099
|
ccATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCatt > 1:1701273/1‑100 (MQ=255)
aTCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCattat > 2:2647325/1‑100 (MQ=255)
tCAAGATGGATTGCTGAACATATCTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTCGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCattatt < 1:3549281/100‑1 (MQ=255)
cAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattt < 2:1653314/100‑1 (MQ=255)
cAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattt > 1:3698524/1‑100 (MQ=255)
cAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattt < 1:724204/100‑1 (MQ=255)
aaGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattta < 2:700560/100‑1 (MQ=255)
aaGATGGGTTGCTGAACATATAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattta < 2:2477043/100‑1 (MQ=255)
aGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttatttat < 2:3140260/100‑1 (MQ=255)
aTGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATttatta > 1:805114/1‑100 (MQ=255)
aTGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGATGAAAAAGGGTGAGCGATTTCTTTTTTTTTTTTTAAACACTTTAAGTTTAACTAGGTCGGCAttatttttat > 2:3977327/1‑96 (MQ=255)
aTGGGTTGCTGAACATATTATAAACAAGAAAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATttatta < 2:1844564/100‑1 (MQ=255)
tGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTaa > 1:179474/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt > 2:3652633/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCGGAACAGATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt < 1:4004231/100‑1 (MQ=255)
gTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAtt < 2:203587/100‑1 (MQ=255)
ttGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAttt < 2:1909098/100‑1 (MQ=255)
tGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGGTTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTAGTTATTAAAtttt < 2:3853771/100‑1 (MQ=255)
cTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtat > 2:3959992/1‑100 (MQ=255)
cTGAACAGATTTAAAACAAGAAAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTCATGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtat < 2:3904257/100‑1 (MQ=255)
tGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtata < 1:2993000/100‑1 (MQ=255)
tGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtata < 1:3050359/100‑1 (MQ=255)
tGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTCTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtata > 2:1169558/1‑100 (MQ=255)
gAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAg > 2:2350600/1‑100 (MQ=255)
tatTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCt < 1:815920/100‑1 (MQ=255)
tatTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCt > 1:2490607/1‑100 (MQ=255)
tatTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCt < 1:1812447/100‑1 (MQ=255)
atTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCta > 1:2786937/1‑100 (MQ=255)
atTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCta < 1:1318074/100‑1 (MQ=255)
atTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCta < 2:2350646/100‑1 (MQ=255)
atTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATGTTTGATAGATGAACGAGGCACTTTAACTTTAACTAGGGCGGCATTCTTTATTAAATTTTGTAGACGCta > 1:3552468/1‑100 (MQ=255)
ttttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTACATTTTCTAGACTCtat > 2:798156/1‑100 (MQ=255)
ttttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtat < 1:940911/100‑1 (MQ=255)
tttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtata < 2:1034603/100‑1 (MQ=255)
tttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtata < 2:1673211/100‑1 (MQ=255)
tttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtata > 2:3472088/1‑100 (MQ=255)
ttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtatat > 2:2461424/1‑100 (MQ=255)
tAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtatata < 2:2337087/100‑1 (MQ=255)
aaaCAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTatatat < 1:3665764/100‑1 (MQ=255)
aaCAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATg < 2:2573178/100‑1 (MQ=255)
aCAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATgg < 1:303700/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg > 1:1088413/1‑100 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg > 1:1484165/1‑100 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgt < 2:2054725/100‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgt > 1:2721951/1‑100 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgt < 1:1070042/100‑1 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGGGTGAGAGAGTTTTGATAGTTGAACCAGTCAATTTAAGTTTAACTAGGGAGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATgaat < 2:718774/100‑4 (MQ=255)
ggTGAAAAAGGGGGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgta > 2:523769/1‑100 (MQ=255)
gTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgtag < 1:3106314/100‑1 (MQ=255)
gTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgtag > 1:2380860/1‑100 (MQ=255)
tGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGACAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgtagt > 1:1710263/1‑100 (MQ=255)
gatctgggTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATCGACGCTATATATGGGTAGTaa < 1:3858545/95‑1 (MQ=255)
aaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAat < 2:3187145/100‑1 (MQ=255)
aaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAat > 1:682050/1‑100 (MQ=255)
aaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTGAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAat < 1:1119977/100‑1 (MQ=255)
aaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCCGCCACTTTAAGATCAACTAGGGCGGCATTATTTATTACATTTTATAGACGCTACATCCGGATAGTaaca > 2:1779025/1‑98 (MQ=255)
gggTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATAc > 1:3001178/1‑100 (MQ=255)
gggTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTaaagatc > 2:3777522/1‑95 (MQ=255)
ggTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACa > 1:3665225/1‑100 (MQ=255)
gTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGCCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGCTAGTAATATACAt > 1:3678601/1‑100 (MQ=255)
gAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATgg < 1:2606476/100‑1 (MQ=255)
gCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGaa > 2:1856671/1‑100 (MQ=255)
cGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAAt < 2:1149857/100‑1 (MQ=255)
cGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAAt < 2:1560959/100‑1 (MQ=255)
cGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAAt < 1:2149709/100‑1 (MQ=255)
gATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAAtt > 1:3016227/1‑100 (MQ=255)
ttttGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGt < 1:2916060/100‑1 (MQ=255)
ttttGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTCAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATCTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGt > 2:2935777/1‑100 (MQ=255)
tGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGc < 2:1416727/100‑1 (MQ=255)
tGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGACATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGc < 2:2046513/100‑1 (MQ=255)
gATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAGTTAGTTGCa > 2:3625901/1‑100 (MQ=255)
aTAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCAc < 1:3934888/100‑1 (MQ=255)
tAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACt < 1:1605634/100‑1 (MQ=255)
aGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTg > 2:2799488/1‑100 (MQ=255)
gTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGc > 1:3994162/1‑100 (MQ=255)
ttGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCa < 2:363848/100‑1 (MQ=255)
ttGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCa < 2:3044273/100‑1 (MQ=255)
tGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCaa > 2:1415211/1‑100 (MQ=255)
gAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCaaa < 1:4080564/100‑1 (MQ=255)
gAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCaaa > 1:625514/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaat < 1:3777197/100‑1 (MQ=255)
cAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaataat < 2:1016310/100‑1 (MQ=255)
gCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTATTTGCAGTGCAACTAattcc < 1:1918768/100‑3 (MQ=255)
cACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGGATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAattatt < 2:489097/100‑1 (MQ=255)
cACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAattatt > 2:581680/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTg > 1:145355/1‑100 (MQ=255)
cTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTg > 2:3642428/1‑100 (MQ=255)
tttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTgt < 2:3408809/100‑2 (MQ=255)
tttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGa < 1:2387282/100‑1 (MQ=255)
tAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGaaa > 2:1308371/1‑100 (MQ=255)
tAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGaaa > 2:1425429/1‑100 (MQ=255)
aaGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGCCGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAAc < 2:853976/100‑1 (MQ=255)
aaGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAAc < 1:2528015/100‑1 (MQ=255)
aaGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAAc < 2:2473347/100‑1 (MQ=255)
tttAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAgg < 1:2822961/100‑1 (MQ=255)
tttAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAgg < 1:373578/100‑1 (MQ=255)
ttAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGc < 2:2848916/100‑1 (MQ=255)
tAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGcc > 1:2191364/1‑100 (MQ=255)
tAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGcc < 2:176563/100‑1 (MQ=255)
aCTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTg < 2:716828/100‑1 (MQ=255)
|
CGCCATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAACG > NC_000913/1063907‑1064099
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
