Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,064,004 |
T→G |
intergenic (‑229/‑32) |
cbpA ← / → yccE |
DnaK co‑chaperone; curved DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,064,004 | 0 | T | G | 98.6%
| 752.7
/ ‑4.7
| 219 | intergenic (‑229/‑32) | cbpA/yccE | DnaK co‑chaperone; curved DNA‑binding protein/uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base G (112/103); total (115/104) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
CGCCATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAACGATAT > NC_000913/1063907‑1064103
|
gCCATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCat > 2:2112234/1‑100 (MQ=255)
ccATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCatt > 1:2314834/1‑100 (MQ=255)
ccATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCatt > 2:1251862/1‑100 (MQ=255)
cAAGATGGGTTGCTGAACATATTAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattt < 2:2611033/100‑1 (MQ=255)
aaGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTCAGTGTAACTAGGGCGGCAttattta > 2:5196971/1‑100 (MQ=255)
aaGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGATGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttattta > 2:42401/1‑100 (MQ=255)
aGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttatttat > 1:5027723/1‑100 (MQ=255)
aGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttatttat < 2:3448680/100‑1 (MQ=255)
aGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCAttatttat < 1:1945168/100‑1 (MQ=255)
gATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATtatttatt > 2:751666/1‑100 (MQ=255)
aTGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATttatta > 1:180499/1‑100 (MQ=255)
aTGGGTTGCTGAACATATTGTAAACAGGTGAAAAAGTGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATttatta < 2:2477453/100‑1 (MQ=255)
tGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGCGCGATTTTTGATTGTTGAACCAGGCACTTTGAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTaa < 1:5472911/100‑1 (MQ=255)
tGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTaa > 1:4224974/1‑100 (MQ=255)
gggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTaaa < 2:4708597/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt > 2:1700122/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt > 2:5147478/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt < 1:2451472/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt < 1:2453528/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAAt < 1:4742956/100‑1 (MQ=255)
cTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtat > 1:1101580/1‑100 (MQ=255)
cTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtat > 1:2806986/1‑100 (MQ=255)
tGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTtata < 2:1634873/100‑1 (MQ=255)
naaCATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAg > 1:4435551/2‑100 (MQ=255)
gAACATATTTTAAACAGGTGAAAACGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCTTTATTTATTAAATTTTATAg > 2:1139155/1‑100 (MQ=255)
gAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTGGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAg > 1:5074621/1‑100 (MQ=255)
aCATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGAc > 2:1298351/1‑100 (MQ=255)
aCATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGAc > 1:3546499/1‑100 (MQ=255)
cATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTTATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACg > 2:3560999/1‑100 (MQ=255)
cATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACg < 1:4158362/100‑1 (MQ=255)
cATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACg > 1:1586426/1‑100 (MQ=255)
atatTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGc > 2:1541905/1‑100 (MQ=255)
tatTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCt < 1:1404592/100‑1 (MQ=255)
atTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCta > 2:4879504/1‑100 (MQ=255)
ttAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCtatat > 1:1477879/1‑100 (MQ=255)
aaaCAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTatatat > 2:1447919/1‑100 (MQ=255)
aaCAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATg < 1:5516894/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCATGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg < 2:2975647/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg > 1:1510685/1‑100 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg < 1:3664930/100‑1 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg > 1:10765/1‑100 (MQ=255)
cAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATggg > 2:3749684/1‑100 (MQ=255)
aGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTCAACCAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGGCGCTATATATGGgt < 1:4891859/100‑1 (MQ=255)
ggTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgta > 1:2934416/1‑100 (MQ=255)
ggTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgta > 1:2701062/1‑100 (MQ=255)
ggTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgta < 1:761470/100‑1 (MQ=255)
tGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgtagt < 1:1268696/100‑1 (MQ=255)
gAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGgtagta > 1:1849028/1‑100 (MQ=255)
aaaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTaa < 2:2384792/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTaa < 1:919353/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTaa < 1:3999931/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTaa < 1:3382022/100‑1 (MQ=255)
aaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAatat > 2:2942875/1‑100 (MQ=255)
aaGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAatat < 1:1154517/100‑1 (MQ=255)
gggTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATAc > 1:4617109/1‑100 (MQ=255)
gggTGACCGCTTTTTGATACTTGCACCAGGCACTTTAAGTTGAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTTTAGACGCTATATATGGGTACTAATATAc < 1:3784431/100‑1 (MQ=255)
tGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATg < 2:4559948/100‑1 (MQ=255)
tGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATg < 2:1987511/100‑1 (MQ=255)
gAGCGATTTTTTATATTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATgg > 2:3668389/1‑100 (MQ=255)
gAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATgg > 1:4581990/1‑100 (MQ=255)
tttGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGtt < 1:42824/100‑1 (MQ=255)
ttGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTg > 1:224134/1‑100 (MQ=255)
tGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGc < 1:2152593/100‑1 (MQ=255)
tGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGc < 2:2771528/100‑1 (MQ=255)
tGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGc < 2:285700/100‑1 (MQ=255)
aTAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCAc < 2:1222473/100‑1 (MQ=255)
aTAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCAc < 2:2451557/100‑1 (MQ=255)
tAGTTGAACCAGGCACTTGAAGTTTATGTAGGGGGGCATGATTTGTTAAATTTTATGGACGCTATATATGGGTGGTAATATACATGGAGTTAGTTGCACt < 2:801986/100‑1 (MQ=255)
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tGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCaa < 1:1541987/100‑1 (MQ=255)
tGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCaa > 1:2665027/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGGCACTTTGAGTTTAACTAGGGCGGCGTTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaat < 2:4299242/100‑1 (MQ=255)
aCCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaata > 2:1304708/1‑100 (MQ=255)
aCCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaata < 1:4948801/100‑1 (MQ=255)
ccAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTCGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaataa > 2:578331/1‑100 (MQ=255)
ccAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAaataa > 2:2251610/1‑100 (MQ=255)
agacACTTTAAGTGTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTCGTTGCACTGCAAATAatt > 2:3033888/4‑100 (MQ=255)
aCTTTAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTAttt > 2:2336219/1‑100 (MQ=255)
tttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGa < 2:4377313/100‑1 (MQ=255)
tttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGa > 2:2158636/1‑100 (MQ=255)
ttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACCTGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGaa > 2:4036669/1‑100 (MQ=255)
ttAAGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGaa > 2:2414705/1‑100 (MQ=255)
ttAAGTTTAACTAAGGCGGCATTATTTAATAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGaa < 2:3317369/100‑1 (MQ=255)
aaGTGTAACTAGGGGGGCAGTAAGTTGTAAAGTTTATAGACGCTAGACAGGGGAAGTAATATGCATGGAATTAGTTGCACTGCAAAGACTTATTTGAAAc < 2:3214566/100‑1 (MQ=255)
aGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACa > 2:1848507/1‑100 (MQ=255)
aGTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACa > 1:3871544/1‑100 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGTAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg > 2:3835516/1‑100 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg < 1:3635151/100‑1 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg > 2:2530814/1‑100 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg > 1:3467681/1‑100 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAACATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg < 1:5264387/100‑1 (MQ=255)
gTTTAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCGATATATGCGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAg > 1:5290476/1‑100 (MQ=255)
ttAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGc < 1:5225671/100‑1 (MQ=255)
tAACTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGcc < 1:3172694/100‑1 (MQ=255)
aaCTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCt > 2:1997991/1‑100 (MQ=255)
aCTAGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTg < 2:1458911/100‑1 (MQ=255)
aGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGaa > 2:719436/1‑100 (MQ=255)
aGGGCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTCGCACTGCAAATAATTATTTGAAATAGGCCTGGaa < 2:5075341/100‑1 (MQ=255)
gggCGGCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAAc > 2:4062926/1‑100 (MQ=255)
ggcggcATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAACg > 2:1600547/1‑100 (MQ=255)
|
CGCCATCAAGATGGGTTGCTGAACATATTTTAAACAGGTGAAAAAGGGTGAGCGATTTTTGATAGTTGAACCAGGCACTTTAAGTTTAACTAGGGCGTCATTATTTATTAAATTTTATAGACGCTATATATGGGTAGTAATATACATGGAATTAGTTGCACTGCAAATAATTATTTGAAACAGGCCTGGAACGATAT > NC_000913/1063907‑1064103
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
