Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,423,570 |
A→C |
intergenic (‑31/+166) |
yfcI ← / ← hisP |
transposase_31 family protein/histidine ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,423,570 | 0 | A | C | 99.3%
| 492.1
/ ‑4.1
| 142 | intergenic (‑31/+166) | yfcI/hisP | transposase_31 family protein/histidine ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (62/79); total (62/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.94e-01 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAC > NC_000913/2423477‑2423665
|
tGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGAc < 2:3485529/100‑1 (MQ=255)
ggATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACa < 1:2955694/100‑1 (MQ=255)
ggATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACa > 1:416609/1‑100 (MQ=255)
ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa > 2:749830/1‑100 (MQ=255)
ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa < 1:3683170/100‑1 (MQ=255)
ggCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATaa < 1:1584237/100‑1 (MQ=255)
cGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAAcc > 2:491788/1‑100 (MQ=255)
gTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCa > 1:26380/1‑100 (MQ=255)
gTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCa > 1:3169601/1‑100 (MQ=255)
aaaaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACg < 2:1927336/100‑1 (MQ=255)
aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:2468285/1‑100 (MQ=255)
aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:2264050/1‑100 (MQ=255)
aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt < 2:2689213/100‑1 (MQ=255)
aaaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAt > 1:1331963/1‑100 (MQ=255)
aaaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGAtt < 2:84799/100‑1 (MQ=255)
aaaGATTCAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCTACAATAACCACGAtt < 2:3035450/100‑1 (MQ=255)
aaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTa < 2:460986/100‑1 (MQ=255)
aaGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTa < 1:1166557/100‑1 (MQ=255)
gATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCTAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAac < 1:3785158/100‑1 (MQ=255)
aTTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACACTAACCACGATTAaca > 2:1201952/1‑100 (MQ=255)
aTTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAaca < 1:3269018/100‑1 (MQ=255)
tttAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAacac < 1:723964/100‑1 (MQ=255)
ttAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAcc > 1:2580547/1‑100 (MQ=255)
tAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAccc > 2:822636/1‑100 (MQ=255)
aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACAcccc > 2:1117343/1‑99 (MQ=255)
aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa > 2:3122674/1‑100 (MQ=255)
aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa > 1:1749006/1‑100 (MQ=255)
aaaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCa < 1:212536/100‑1 (MQ=255)
aaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCaa < 2:2514753/100‑1 (MQ=255)
aaTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCaa > 2:228404/1‑100 (MQ=255)
aTACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAAt > 1:3714292/1‑100 (MQ=255)
aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 2:2729965/100‑1 (MQ=255)
aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 2:2306045/100‑1 (MQ=255)
aCCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgc < 1:1084731/100‑1 (MQ=255)
ccGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgca > 2:2510198/1‑100 (MQ=255)
ccGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgca < 2:1628431/100‑1 (MQ=255)
cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACCATAACCACGCTTAACACCCAATgccg > 2:2100331/1‑98 (MQ=255)
cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcag > 1:1236804/1‑100 (MQ=255)
cGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcag < 1:2313918/100‑1 (MQ=255)
gCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagc < 2:2236912/100‑1 (MQ=255)
gCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagc < 1:1913266/100‑1 (MQ=255)
catcatGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATgcagca < 1:2017261/100‑1 (MQ=255)
tcatGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACACAATGCCgcagg < 2:692205/100‑1 (MQ=255)
catGCGGCGTGGAAGTTGTCGATAGTGACATGGCGTTCCGTCACCCCCCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAgcaggc > 2:1608823/1‑100 (MQ=255)
gcggcgCGGAAGTTTTTGATATTTGAAGGGCGTGCCGTCACCCCGTAAATATAATACCCGGCGTCAACAACCACGATTAACACCCAATGCAgccgccagg < 2:3757795/100‑2 (MQ=255)
ggcgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttt < 1:1030741/100‑1 (MQ=255)
cgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttttt < 2:2043162/100‑1 (MQ=255)
cgTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGttttt > 2:1688779/1‑100 (MQ=255)
gTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTa < 2:3891850/100‑1 (MQ=255)
gTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTa < 1:595935/100‑1 (MQ=255)
ggAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATc < 2:3056972/100‑1 (MQ=255)
ggAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATc > 1:2531975/1‑100 (MQ=255)
aaGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCACTCAAATTTAAGATGCCGCGACACTAACAACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTCTTTATCtt > 2:1774307/1‑100 (MQ=255)
aGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCttt > 2:3358549/1‑100 (MQ=255)
gTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTg < 2:3054317/100‑1 (MQ=255)
ttGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTgg < 2:173641/100‑1 (MQ=255)
gTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGAc > 1:4002183/1‑100 (MQ=255)
gTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACACCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGAc < 1:2163583/100‑1 (MQ=255)
cGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAg > 2:3497786/1‑100 (MQ=255)
gATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGc < 1:3195358/100‑1 (MQ=255)
tGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAAtt > 1:2307494/1‑100 (MQ=255)
ttCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTc < 1:556073/99‑1 (MQ=255)
tCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCa > 2:544885/1‑100 (MQ=255)
tCAGGGCGTACCGTCACCCCTCAACGTTAGGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCa < 2:1844390/100‑1 (MQ=255)
aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa > 1:3908320/1‑100 (MQ=255)
aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa < 2:758016/100‑1 (MQ=255)
aTGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTGAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGa < 2:2815853/100‑1 (MQ=255)
tGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGaa < 2:3586839/100‑1 (MQ=255)
ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:2285372/100‑1 (MQ=255)
ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:46096/100‑1 (MQ=255)
ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 1:1372973/100‑1 (MQ=255)
ggCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCAACAATAACCACGATTAACCCCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAg < 2:2036030/100‑1 (MQ=255)
cGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTa > 2:567529/1‑100 (MQ=255)
ccGTCACCCCTCTAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGACTTCAGAAGTAtgtt > 1:1839817/1‑100 (MQ=255)
cGTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTAttttt > 2:3611512/1‑100 (MQ=255)
gTCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTa > 1:1524979/1‑100 (MQ=255)
tCACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAg < 1:334076/100‑1 (MQ=255)
cACCCCTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGc < 2:1763402/100‑1 (MQ=255)
aCCGCTCAAATTTAAGATGCGGCGACAATAACCAGCATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTCGAGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTcgcg < 2:2479472/100‑1 (MQ=255)
ccccTGAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCGGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCgg < 1:3869119/100‑1 (MQ=255)
cccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGa > 1:3596236/1‑100 (MQ=255)
cccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGa > 1:2230465/1‑100 (MQ=255)
cacTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAAAGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTGTAGCGGa > 2:3711876/3‑100 (MQ=255)
ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACTCAATTGAGCAGGCAGTTTATATCTTTGGACATCGAATTCAGAAGTATCTTTAGCTGAc > 2:3406289/1‑100 (MQ=255)
ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 2:3970720/100‑1 (MQ=255)
ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 1:242873/100‑1 (MQ=255)
ccTCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGAc < 2:2292980/100‑1 (MQ=255)
tCAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTg < 2:2975187/100‑1 (MQ=255)
cAAATTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTGTCTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGt > 1:1590585/1‑100 (MQ=255)
aaaTTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTa < 1:2567163/100‑1 (MQ=255)
aaTTTAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTaa > 2:3982182/1‑100 (MQ=255)
tttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACt < 1:965250/100‑1 (MQ=255)
ttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCCGTCTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtt > 1:3452759/1‑100 (MQ=255)
ttAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtt > 1:1657146/1‑100 (MQ=255)
tAAGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACttt < 1:16101/100‑1 (MQ=255)
aaGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACtttt < 1:2632117/100‑1 (MQ=255)
aGATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTa < 1:1491882/100‑1 (MQ=255)
gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc < 2:3374472/100‑1 (MQ=255)
gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc < 2:3254959/100‑1 (MQ=255)
gATGCCGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAc > 1:17837/1‑100 (MQ=255)
|
TGGATGGCGTAAAAAAGATTTAAATACCGCATCATGCGGCGTGGAAGTTGTCGATATTGTCATGGCGTTCCGTCACCCCTCAAATTTAAGATGACGCGACAATAACCACGATTAACACCCAATGCAGCAGGCAGTTTTTATCTTTGGACAGCGAATTCAGAAGTATTTTTAGCGGACTGTAACTTTTAC > NC_000913/2423477‑2423665
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
