Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,452,800 |
T→G |
I77S (ATC→AGC) |
ytfT → |
putative sugar ABC transporter permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,452,800 | 0 | T | G | 93.9%
| 466.4
/ 12.0
| 148 | I77S (ATC→AGC) | ytfT | putative sugar ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/3); new base G (70/69); total (76/72) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGA > NC_000913/4452703‑4452895
|
gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCg < 2:2651898/100‑1 (MQ=255)
tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAgcgc > 1:2535371/1‑100 (MQ=255)
tggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAgcgc > 1:1849304/1‑100 (MQ=255)
ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGcc > 1:776705/1‑100 (MQ=255)
gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCa > 2:8296/1‑100 (MQ=255)
gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCa > 1:1423949/1‑100 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:2779852/1‑100 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:4069736/1‑100 (MQ=255)
tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCAc > 1:1718156/1‑100 (MQ=255)
cAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTg < 2:619424/100‑1 (MQ=255)
ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTggg > 1:1790451/1‑100 (MQ=255)
gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGa < 2:1481351/100‑1 (MQ=255)
gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGa > 1:526121/1‑100 (MQ=255)
ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGa > 2:1260084/1‑100 (MQ=255)
ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGa > 1:2320613/1‑100 (MQ=255)
gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAt < 2:738274/100‑1 (MQ=255)
gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAt > 2:1531911/1‑100 (MQ=255)
cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtc < 1:2483761/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtc < 1:479422/100‑1 (MQ=255)
ttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 1:3009706/1‑100 (MQ=255)
gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 2:3452844/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc < 1:645669/100‑1 (MQ=255)
gTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc > 1:245718/1‑100 (MQ=255)
tCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGt > 2:2006704/1‑100 (MQ=255)
ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:2589666/1‑100 (MQ=255)
gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:2164368/100‑1 (MQ=255)
gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCGCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 2:1677982/100‑1 (MQ=255)
gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGc > 1:2103422/1‑100 (MQ=255)
cccATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCgg < 2:2737732/100‑1 (MQ=255)
ccaaTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACACTGGTAAGCGAAACCGGTGGGCTTGATATCTCCGTCGGGGAgg > 2:984704/4‑100 (MQ=255)
aTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:2947546/1‑100 (MQ=255)
aTAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:3182669/1‑100 (MQ=255)
tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:2797392/100‑1 (MQ=255)
tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:1377830/100‑1 (MQ=255)
tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:2797923/100‑1 (MQ=255)
tAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:345335/100‑1 (MQ=255)
aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 1:377314/100‑1 (MQ=255)
aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg > 1:3947199/1‑100 (MQ=255)
aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg > 2:1210259/1‑100 (MQ=255)
aGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 2:3794901/100‑1 (MQ=255)
gACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg > 1:1474663/1‑100 (MQ=255)
gACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg < 2:2927151/100‑1 (MQ=255)
gACACTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTTATgg < 1:2873730/100‑1 (MQ=255)
aCATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGc < 1:3523253/100‑1 (MQ=255)
cATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCt > 2:2137461/1‑100 (MQ=255)
tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGCTGGCTATc > 2:3635758/1‑100 (MQ=255)
tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc < 1:1675466/100‑1 (MQ=255)
tCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc > 1:1521461/1‑100 (MQ=255)
cTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg < 1:2528532/100‑1 (MQ=255)
tAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc < 1:1751500/100‑1 (MQ=255)
tAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGcc > 1:398911/1‑100 (MQ=255)
aCCGTGCAGCTCCCGTGGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCgg > 2:702375/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCggn < 2:1514969/100‑2 (MQ=255)
ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGa > 1:2645951/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGa > 2:776836/1‑100 (MQ=255)
ccGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGCGATAGCCATCACCgcc < 1:1044511/100‑3 (MQ=255)
cGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg > 2:2263456/1‑100 (MQ=255)
cGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg < 1:3266628/100‑1 (MQ=255)
cGTGCAGCTCCCGTTGCGTCACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATTTCACCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAg > 2:3312368/1‑100 (MQ=255)
gTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGc < 1:1399746/100‑1 (MQ=255)
gTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGc < 1:297663/100‑1 (MQ=255)
tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGGTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc < 1:2030118/100‑1 (MQ=255)
tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc > 2:1132108/1‑100 (MQ=255)
tGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGcc < 2:2550081/100‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca < 1:3381775/100‑1 (MQ=255)
gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca > 1:887112/1‑100 (MQ=255)
gCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCca > 1:3962289/1‑100 (MQ=255)
aGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCcaca < 1:8398/100‑1 (MQ=255)
gCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACaa > 1:3990101/1‑100 (MQ=255)
cTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAAc > 1:77406/1‑100 (MQ=255)
cGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCt > 1:13671/1‑100 (MQ=255)
ttGCGTTACGGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGc < 2:1974850/100‑1 (MQ=255)
cGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGTCAGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 2:3907370/100‑1 (MQ=255)
cGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 1:3625935/100‑1 (MQ=255)
cGTTACTGGCGATGGGCATGACGCTGGTGAGCGCCTTCAGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGAt < 2:1879996/100‑1 (MQ=255)
gTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATg > 2:1582675/1‑100 (MQ=255)
aCTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACg < 1:1201504/100‑1 (MQ=255)
tGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGt > 2:2577556/1‑100 (MQ=255)
tGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACAGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGCCGGTGATGGCTATCGCTGGAGCCACCACGGCTGCGCTGACGGt > 2:3036256/1‑100 (MQ=255)
ggCGATTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTc > 1:506529/1‑100 (MQ=255)
gATTGGCCTGACGCTGGAGAGCGCCACCGGTGCGATTGATCTCTACGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTcgcg < 1:3744943/100‑1 (MQ=255)
atgggCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:2050828/97‑1 (MQ=255)
aTTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 1:605368/100‑1 (MQ=255)
aTTGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:3121031/100‑1 (MQ=255)
aTTGGCATGACGCTGGGGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATCGCTGTCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCgg < 2:3755875/100‑1 (MQ=255)
tttgCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGTTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGTCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCggg < 2:3125517/97‑1 (MQ=255)
tGGCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGa > 1:1560350/1‑100 (MQ=255)
ggCATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCCCGGGAt > 2:1389647/1‑100 (MQ=255)
gCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGAtt > 2:1920980/1‑100 (MQ=255)
cATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTc < 1:2727907/100‑1 (MQ=255)
cATGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTc > 2:1279946/1‑100 (MQ=255)
aTGACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCa > 2:3238489/1‑100 (MQ=255)
gACGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGc > 1:1905318/1‑100 (MQ=255)
aCGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGcc > 2:3549376/1‑100 (MQ=255)
cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 2:1451392/1‑100 (MQ=255)
cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 1:227814/1‑100 (MQ=255)
cGCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCt > 1:1640682/1‑100 (MQ=255)
gCTGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTg < 2:56117/100‑1 (MQ=255)
tGGTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGcc < 1:3409690/100‑1 (MQ=255)
gTGAGCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTCTCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCCGGATTCAGCCTGCCGa > 2:2498650/1‑100 (MQ=255)
|
GTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCCGGAGCCACAACGGCTGCGATGACGGTCGCGGGATTCAGCCTGCCGA > NC_000913/4452703‑4452895
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
