Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F412 I3 R1
|
53 |
201.3 |
10250884 |
92.1% |
9441064 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,304,838 |
A→G |
intergenic (+445/+270) |
eco → / ← mqo |
ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,304,838 | 0 | A | G | 98.1%
| 426.4
/ ‑4.8
| 159 | intergenic (+445/+270) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base G (77/77); total (81/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.45e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAT > NC_000913/2304741‑2304897
|
gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCggg > 1:1020172/1‑100 (MQ=255)
aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCTGTTACGCAGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGc < 2:3293126/100‑1 (MQ=255)
ggggCTCCCCCCCGAAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:4530645/97‑1 (MQ=14)
aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc > 1:2800690/1‑100 (MQ=255)
aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:656797/100‑1 (MQ=255)
aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 1:5133953/100‑1 (MQ=255)
aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc > 2:4770420/1‑100 (MQ=255)
aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGcc < 2:2895933/100‑1 (MQ=255)
gTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCt < 2:2931437/100‑1 (MQ=255)
ncTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac > 1:88462/2‑100 (MQ=255)
gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCGACGGCAAAAGCGGCTGGCTGAGGCAACGCGGGCGCGCCTGATCAGGccggc > 2:4118825/1‑97 (MQ=2)
gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac > 1:1010408/1‑100 (MQ=255)
gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTac < 1:3811621/100‑1 (MQ=255)
cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTaca > 2:4596390/1‑100 (MQ=255)
cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTaca > 2:765635/1‑100 (MQ=255)
cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGCCCTaca > 2:4945609/1‑100 (MQ=255)
tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacac > 2:3132400/1‑100 (MQ=255)
tCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacac > 1:5125290/1‑100 (MQ=255)
ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTacacn < 1:4104610/100‑2 (MQ=255)
ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACAcc > 2:25043/1‑100 (MQ=255)
cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg < 1:558404/100‑1 (MQ=255)
cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg > 2:2852832/1‑100 (MQ=255)
cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCg > 1:311714/1‑100 (MQ=255)
ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACCCCGCt > 2:2263738/1‑100 (MQ=255)
ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCt > 2:2811870/1‑100 (MQ=255)
ccccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCt > 1:3331291/1‑100 (MQ=255)
cccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtg < 1:2601821/100‑1 (MQ=255)
cccGCAGGTTGGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtg < 2:4260204/100‑1 (MQ=14)
cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtgtg < 1:1728040/100‑1 (MQ=255)
cGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCtgtg < 1:4369213/100‑1 (MQ=255)
gTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGa < 1:316217/100‑1 (MQ=255)
tAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGaa > 1:3264132/1‑100 (MQ=255)
aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:2649734/100‑1 (MQ=255)
aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 2:2564104/100‑1 (MQ=255)
aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:694081/100‑1 (MQ=255)
aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:2013076/100‑1 (MQ=255)
ggTTGGATAAGGCGGTTACGTCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCCGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGt > 2:5066302/1‑100 (MQ=255)
ttGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGc < 2:3949319/100‑1 (MQ=255)
tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTAGACCGCTGTGGAGTGcc > 2:371755/1‑99 (MQ=14)
tGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:2190806/100‑1 (MQ=255)
ngATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGGAGttccc > 1:4122422/2‑96 (MQ=14)
ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGGGCtg > 2:2726381/1‑99 (MQ=14)
aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCa < 1:3951495/100‑1 (MQ=255)
tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTCCCCCGCTGTGAAGTGCCCCAc > 2:3154505/1‑100 (MQ=14)
tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 2:2002988/100‑1 (MQ=255)
aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcc > 1:4180357/1‑100 (MQ=255)
aGGCGGTTACGCCGCTTTCGATAACCCACGGCCGAGCGGGTTGCCTGAGGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:106991/100‑1 (MQ=11)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 1:1290774/1‑100 (MQ=255)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:74530/1‑100 (MQ=255)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2870351/100‑1 (MQ=255)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:21903/100‑1 (MQ=255)
aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCCCCAccc > 2:3416235/1‑100 (MQ=255)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:1918347/1‑100 (MQ=255)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc < 2:1284031/100‑1 (MQ=255)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:705127/1‑100 (MQ=255)
ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:253915/1‑100 (MQ=255)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTCCACCGCTGTGACGTGCCCCACCCCGt > 2:3257163/1‑100 (MQ=11)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:1896255/1‑100 (MQ=37)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 1:1962054/100‑1 (MQ=255)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:2101967/1‑100 (MQ=255)
cGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 1:1037164/100‑1 (MQ=255)
ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:109629/100‑1 (MQ=255)
ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTCGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCCGTGAAGTGCTCCACCCCGtc > 2:3649294/1‑99 (MQ=11)
ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 1:4983675/100‑1 (MQ=25)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 2:4657475/100‑1 (MQ=21)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 2:2341147/1‑100 (MQ=18)
cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTCATCGGGCCTCCACCGCTGCGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 1:1906934/1‑100 (MQ=11)
cgccgcATCCGACAGCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGATGCTCGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGTGCTCCCCCCCGTAGGTCg > 1:4524635/1‑100 (MQ=11)
gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg > 2:3775732/1‑100 (MQ=21)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:2079158/1‑100 (MQ=21)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa > 1:2458707/1‑100 (MQ=21)
ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 1:3506340/100‑1 (MQ=18)
gcATCCAACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAACGTGCCTACGCCGCTGTGAAGTGCTCCATCCCGTAGGTCGCATa > 2:4842680/1‑100 (MQ=11)
aTCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAg < 1:5055766/100‑1 (MQ=18)
ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:4774099/1‑100 (MQ=18)
ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:469541/100‑1 (MQ=18)
ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 1:4649770/100‑1 (MQ=21)
gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCGTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2849676/100‑1 (MQ=255)
gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGTAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:4141249/100‑1 (MQ=255)
gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:3517036/100‑1 (MQ=18)
gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 1:2626350/100‑1 (MQ=18)
cATCCAGCGTCCGAGCCGATTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:4299734/1‑100 (MQ=11)
aTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTa > 1:1526189/1‑100 (MQ=21)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc < 1:1725533/100‑1 (MQ=18)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2829732/1‑100 (MQ=21)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGGTAc > 2:2213315/1‑100 (MQ=255)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTACTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 2:2391094/1‑100 (MQ=255)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCCCTGTGAAGTACACCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:1794656/1‑100 (MQ=11)
tCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGAAGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTATGTCGGATAAGGCGGTTAc > 1:2352350/1‑100 (MQ=255)
ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGACGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGACGGTTAcg > 2:2618608/1‑100 (MQ=255)
ccAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcg > 1:309526/1‑100 (MQ=18)
cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:3608810/1‑100 (MQ=18)
cAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 2:991048/1‑100 (MQ=21)
aaCGTCCGTGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:1557725/100‑1 (MQ=16)
aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 2:5083732/100‑1 (MQ=16)
aaCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 1:4352557/100‑1 (MQ=18)
aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 2:1578983/100‑1 (MQ=18)
aCGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccg < 1:4058782/100‑1 (MQ=18)
cGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:3313992/1‑100 (MQ=18)
tCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCGGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAt < 1:4196971/100‑1 (MQ=14)
|
GAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAT > NC_000913/2304741‑2304897
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
