Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,025,676 |
+C |
coding (535/570 nt) |
ygfQ → |
hypothetical protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,025,675 | 1 | . | C | 99.4%
| 1915.6
/ 0.6
| 488 | coding (534/570 nt) | ygfQ | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (253/231); total (255/233) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 552 total aligned reads displayed.
ATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTAC > NC_000913/3025580‑3025765
|
aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑g > 1:13709458/1‑96 (MQ=255)
tCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑c > 1:11612600/1‑96 (MQ=255)
tCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGATAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑c < 2:1075767/96‑1 (MQ=255)
cGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cc < 2:13538694/96‑2 (MQ=255)
cGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAATCCGATTGAAGGCTT‑G‑cc > 2:4138690/1‑95 (MQ=255)
gCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cca > 2:871239/1‑94 (MQ=255)
gCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cca > 1:89880/1‑94 (MQ=255)
cTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccag < 1:6238014/96‑4 (MQ=255)
cTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGCATGGTTATCAAAAACTCGATTGAAGGCTT‑G‑ccag > 1:9931994/1‑93 (MQ=255)
tCACGGTACAGGTATCGGTATCGGTCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt > 2:805284/1‑92 (MQ=255)
tCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt < 1:4995562/96‑5 (MQ=255)
tCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGATTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt > 2:13885278/1‑92 (MQ=255)
aCGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg > 1:8442633/1‑96 (MQ=255)
cGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgc < 2:7883671/96‑1 (MQ=255)
cGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgc < 1:9757392/96‑1 (MQ=255)
ggTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgcg > 2:13776735/1‑96 (MQ=255)
aCAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTc < 1:6972218/96‑1 (MQ=255)
aCAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTc < 1:3849026/96‑1 (MQ=255)
ggtatcggtatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGt < 2:1031440/96‑1 (MQ=255)
tatcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGc > 1:1666153/1‑96 (MQ=255)
atcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCg > 2:92509/1‑96 (MQ=255)
tcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGt < 1:518034/96‑1 (MQ=255)
cggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt < 2:2047217/96‑1 (MQ=255)
cggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt > 1:577388/1‑96 (MQ=255)
cggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt < 2:6651180/96‑1 (MQ=255)
gtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTCTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTC‑GCCAGTGGCGCTCGATGCGTTTa > 2:12639550/1‑96 (MQ=255)
cggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc > 1:11166498/1‑96 (MQ=255)
cggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc < 2:14153922/96‑1 (MQ=255)
gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcc > 2:5869935/1‑96 (MQ=255)
ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct < 2:1800035/96‑1 (MQ=255)
ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct < 2:6535273/96‑1 (MQ=255)
agCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct > 1:11355312/2‑96 (MQ=255)
gCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCtt < 2:10948521/96‑1 (MQ=255)
gTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCATccc < 2:11365114/96‑1 (MQ=255)
tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCg > 2:1457503/1‑96 (MQ=255)
tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCg > 2:3756801/1‑96 (MQ=255)
tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGAGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCg < 2:11625406/96‑1 (MQ=255)
ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg < 1:14194787/96‑1 (MQ=255)
ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg < 2:7162432/96‑1 (MQ=255)
ttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg < 1:3363063/96‑1 (MQ=255)
tCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTTAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGt > 2:5715595/1‑96 (MQ=255)
tCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGt > 1:680397/1‑96 (MQ=255)
gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgat < 2:2391925/96‑1 (MQ=255)
gctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgat > 2:12093968/1‑96 (MQ=255)
gctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgat < 2:8451560/96‑1 (MQ=255)
ctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgatg > 1:9395274/1‑96 (MQ=255)
gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCtgg < 1:7527121/96‑3 (MQ=255)
gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTg < 1:471205/96‑1 (MQ=255)
gctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTg < 1:12898514/96‑1 (MQ=255)
ctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGc > 1:12656712/1‑96 (MQ=255)
ttctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTCCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt > 1:7373572/3‑96 (MQ=255)
tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt < 2:530890/96‑1 (MQ=255)
tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt > 1:11961622/1‑96 (MQ=255)
tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt < 1:5525284/96‑1 (MQ=255)
gctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTg > 2:3461027/1‑96 (MQ=255)
ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTCCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg < 1:3944623/96‑1 (MQ=255)
ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCACTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg < 2:12754146/96‑1 (MQ=255)
tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTggg > 1:414231/1‑96 (MQ=255)
tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTggg > 2:6014779/1‑96 (MQ=255)
cGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCt > 2:3084511/1‑96 (MQ=255)
ggTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTg > 2:2861955/1‑96 (MQ=255)
tgtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc > 1:4470714/1‑96 (MQ=255)
tgtgGCTAATGTTCTCTAATACCTGATTGAAGGCTTCC‑CAGAGGCGCTCGGTGCGCTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTgcc < 1:13143483/96‑3 (MQ=255)
gtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg > 1:2916793/1‑96 (MQ=255)
gtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGATGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg > 2:13371912/1‑96 (MQ=255)
tgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTTGCgg > 1:6535561/1‑96 (MQ=255)
tgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgg > 2:252599/1‑96 (MQ=255)
tgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGGGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgg > 2:6932495/1‑96 (MQ=255)
gggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgat < 1:10718781/96‑3 (MQ=255)
gTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCa > 2:897853/1‑96 (MQ=255)
tATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCAt > 2:9091898/1‑96 (MQ=255)
ggTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCtt < 1:8183094/96‑1 (MQ=255)
gTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc < 1:6066096/96‑1 (MQ=255)
ttAGCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCg > 2:10117693/1‑96 (MQ=255)
tATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCATCTTCgg > 1:2592426/1‑96 (MQ=255)
tCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GTCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc < 1:12535348/96‑1 (MQ=255)
tCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGATCTGGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc > 1:135220/1‑96 (MQ=255)
cAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGccg > 2:3939454/1‑95 (MQ=255)
aaaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTTGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGTGGCTGTCGGTCATCTTCGGCCTg > 1:3114449/1‑96 (MQ=255)
aaaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTg > 1:10013460/1‑96 (MQ=255)
aaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGga > 2:9541790/1‑96 (MQ=255)
aaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGga > 1:9131007/1‑96 (MQ=255)
aaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTGGGCCTGgag > 1:7233591/1‑96 (MQ=255)
aaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgag > 1:10557057/1‑96 (MQ=255)
aaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgag > 1:10903070/1‑96 (MQ=255)
aCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgaga > 1:362314/1‑96 (MQ=255)
aCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgaga > 2:7497834/1‑96 (MQ=255)
cGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgt < 2:4275410/96‑1 (MQ=255)
gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGACTGGAGAAgtg > 1:2422872/1‑96 (MQ=255)
aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt < 1:10311453/96‑1 (MQ=255)
aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt < 1:2038283/96‑1 (MQ=255)
aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt > 2:12411081/1‑96 (MQ=255)
aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt < 2:13046134/96‑1 (MQ=255)
aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGCGGCTGGCGGGCATCTTCGGCCTGGAGGAgggt > 1:12306323/1‑96 (MQ=255)
ttGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTCCCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTc < 2:6205565/96‑1 (MQ=255)
ttGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGCTGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTc < 2:12888824/96‑1 (MQ=255)
ttGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTc < 1:13885278/96‑1 (MQ=255)
tGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCTGCCTAGAGAAGTGTcg > 2:5486328/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTTGAGAAGTGTcg > 2:462408/1‑96 (MQ=255)
tGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcg > 2:4811913/1‑96 (MQ=255)
|
ATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTAC > NC_000913/3025580‑3025765
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 318 total aligned reads displayed.
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGATC > NC_000913/3025576‑3025776
|
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAATAACCCGATTGAAGGC‑TN‑N‑N > SRR4302518.8218732/1‑101 (MQ=60)
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C < SRR4302518.3404567/101‑1 (MQ=60)
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C > SRR4302518.510530/1‑101 (MQ=60)
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C > SRR4302518.5740874/1‑101 (MQ=60)
AGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TN‑N‑N > SRR4302518.13942326/1‑101 (MQ=60)
GGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C‑C < SRR4302518.1782751/101‑1 (MQ=60)
gcataGCTCACGGTACAGGTATTGGTATCGGGCTGTTTCTGATTCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Cca < SRR4302518.116652/96‑3 (MQ=60)
GTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGTCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTACCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAACCCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Cca < SRR4302518.6698974/101‑3 (MQ=60)
GTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑N‑NN > SRR4302518.10486254/1‑101 (MQ=60)
GTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Cca < SRR4302518.403414/101‑3 (MQ=60)
TATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccag < SRR4302518.7196927/101‑4 (MQ=60)
ATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGT < SRR4302518.5255003/101‑1 (MQ=60)
ATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGT > SRR4302518.4131123/1‑101 (MQ=60)
TCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTG < SRR4302518.3039782/101‑1 (MQ=60)
TCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccannn > SRR4302518.12159492/1‑96 (MQ=60)
NNNCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGCAGGC‑TT‑GCC‑AGTG < SRR4302518.11464727/101‑1 (MQ=60)
NNNCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTG < SRR4302518.14244930/101‑1 (MQ=60)
NNNTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGG < SRR4302518.14738823/101‑1 (MQ=60)
CGCTCACGGTACAGGTATCGGGATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTTAAGGC‑TT‑G‑Ccagnnn > SRR4302518.8050337/1‑95 (MQ=60)
NNNCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGC < SRR4302518.10225675/101‑1 (MQ=60)
GCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccagtnnn > SRR4302518.13271411/1‑94 (MQ=60)
nnncaggtaccggttgcggtatcggactgtttacgtTGCTGATTGCTGCTATCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGT‑TT‑GCC‑AGTGGCG < SRR4302518.11912456/65‑1 (MQ=60)
CTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCG < SRR4302518.2415297/101‑1 (MQ=60)
CTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGCATGGTTATCAAAAACTCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccagtgnnn > SRR4302518.10405208/1‑93 (MQ=60)
ATCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccagtgnnn > SRR4302518.11897653/1‑93 (MQ=60)
ATCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑Ccagtgnnn > SRR4302518.11880941/1‑93 (MQ=60)
CACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCT < SRR4302518.877004/101‑1 (MQ=60)
NNNGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTC < SRR4302518.13009668/101‑1 (MQ=60)
ACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGNNN > SRR4302518.8855961/1‑101 (MQ=60)
ACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTC < SRR4302518.7342659/101‑1 (MQ=60)
GGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTNNN > SRR4302518.10156887/1‑101 (MQ=60)
GGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTCCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTNNN > SRR4302518.12461670/1‑101 (MQ=60)
GTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGTTGCTTACGGTATGGGTATGGTTATCAAAAACCGGATTGAATGC‑TT‑G‑Cctgtagtgctannn > SRR4302518.13077378/1‑87 (MQ=60)
TACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTG < SRR4302518.55147/101‑1 (MQ=60)
NNNGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGC < SRR4302518.7631412/101‑1 (MQ=60)
CAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTNNN > SRR4302518.7627183/1‑101 (MQ=60)
AGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGT > SRR4302518.3792110/1‑101 (MQ=60)
GGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTT > SRR4302518.2141900/1‑101 (MQ=60)
GGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGGGCGTT > SRR4302518.5463885/1‑101 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTACCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTT < SRR4302518.385794/101‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTT > SRR4302518.6552946/1‑101 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTT > SRR4302518.3147628/1‑101 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTT < SRR4302518.2689225/101‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTT < SRR4302518.4608710/101‑1 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTA > SRR4302518.5063603/1‑101 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTA < SRR4302518.239402/101‑1 (MQ=60)
NNNCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTA < SRR4302518.11426422/101‑1 (MQ=60)
TCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACC > SRR4302518.402055/1‑101 (MQ=60)
TCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACC > SRR4302518.6044479/1‑101 (MQ=60)
CGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCT > SRR4302518.599765/1‑101 (MQ=60)
GGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACNNN > SRR4302518.7497874/1‑101 (MQ=60)
TATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTNNN > SRR4302518.12411868/1‑101 (MQ=60)
TATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCT < SRR4302518.4998480/101‑1 (MQ=60)
GATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCT < SRR4302518.1208623/101‑1 (MQ=60)
NNNGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTT < SRR4302518.13603638/101‑1 (MQ=60)
ATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTT < SRR4302518.388675/101‑1 (MQ=60)
ATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTT < SRR4302518.6980982/101‑1 (MQ=60)
ATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCNNN > SRR4302518.11386802/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTC < SRR4302518.9529072/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCC < SRR4302518.14475305/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCC < SRR4302518.9679808/101‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCG > SRR4302518.3654766/1‑101 (MQ=60)
GGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCG < SRR4302518.5349291/101‑1 (MQ=60)
GGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TTGG‑C‑AGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCCTTCNNN > SRR4302518.12820736/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGG < SRR4302518.14846305/101‑1 (MQ=60)
GCTGTTTCTGCTGCTGTTTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGCGCGTTTACATCCATCCCGG > SRR4302518.709052/1‑101 (MQ=60)
GCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCNNN > SRR4302518.10060155/1‑101 (MQ=60)
NNNTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGT < SRR4302518.10890749/101‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGT < SRR4302518.3510012/101‑1 (MQ=60)
CTGTTTCTGCTCCTCATCGCTGATAACGGTCTGGTTATGGTTATCAAAAGCCCGATTGAATGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCGCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGT < SRR4302518.1279957/101‑1 (MQ=47)
nnntaCTGCTGATGATTGCTGCTAACAGTGTTGGTATGGTTATCAATAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTAGGTCCGTTTACCTCCTTCCCGGTG < SRR4302518.10714585/96‑1 (MQ=60)
TGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTG > SRR4302518.7353705/1‑101 (MQ=60)
TGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑CAAGTGGCGCTCGGGGCGCTTACCTCCTTCCCGNNN > SRR4302518.9163182/1‑101 (MQ=60)
NNNTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGA < SRR4302518.13438253/101‑1 (MQ=60)
TTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATG < SRR4302518.5130300/101‑1 (MQ=60)
TCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGA > SRR4302518.706834/1‑101 (MQ=60)
TATGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGANNN > SRR4302518.11187792/1‑101 (MQ=60)
TGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGNNN > SRR4302518.10235275/1‑101 (MQ=60)
NNNGCTGATTGCTGCTAGCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATCA < SRR4302518.11608730/101‑1 (MQ=60)
NNNGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATTA < SRR4302518.7918492/101‑1 (MQ=60)
GCTGCTGGTTGCTGCTAGCGGTGTGTGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGCTGA < SRR4302518.4837838/101‑1 (MQ=60)
GCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACtcccttccgggggttgtnnn > SRR4302518.7848220/1‑81 (MQ=60)
GCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGA < SRR4302518.3102814/101‑1 (MQ=60)
GCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGA < SRR4302518.4802560/101‑1 (MQ=60)
TGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGNNN > SRR4302518.11777041/1‑101 (MQ=60)
TGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGC > SRR4302518.4694530/1‑101 (MQ=60)
GGTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGANNN > SRR4302518.11346059/1‑101 (MQ=60)
GCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCT > SRR4302518.4052724/1‑101 (MQ=60)
NNNATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTT < SRR4302518.14260654/101‑1 (MQ=60)
CTGAGTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACGCGATTGAATGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGGGATGATcagnnn > SRR4302518.13203579/1‑95 (MQ=60)
TGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTG < SRR4302518.489785/101‑1 (MQ=60)
TGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCNNN > SRR4302518.15050362/1‑101 (MQ=60)
NNNTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTG < SRR4302518.9848257/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTG < SRR4302518.13497246/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTGG < SRR4302518.7913504/101‑1 (MQ=60)
GATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCTTTCCCGGTGATGATGAGCGTGC > SRR4302518.4842263/1‑101 (MQ=60)
GTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCT < SRR4302518.5806140/101‑1 (MQ=60)
ATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCCTTCCCCGTGATGATGAGCTTNNN > SRR4302518.10187000/1‑101 (MQ=60)
ACTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTNNN > SRR4302518.10770312/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGNNN > SRR4302518.10338609/1‑101 (MQ=60)
TTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTG > SRR4302518.832027/1‑101 (MQ=60)
NNNCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTG < SRR4302518.8734658/101‑1 (MQ=60)
TGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCNNN > SRR4302518.7706408/1‑101 (MQ=60)
TGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTCCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGG < SRR4302518.4132877/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGG < SRR4302518.13140791/101‑1 (MQ=60)
NNNCTAACGGTGTGCGTATGGTTATCAACACCCCGATTGAAGCC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTCTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGG < SRR4302518.13339721/101‑1 (MQ=60)
CTGCTAACGGGGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGGGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGG > SRR4302518.1595305/1‑101 (MQ=60)
CTGCTAACAGTGTGTGTATGCATATCAAAACCCCGACTGAAGGC‑TTCC‑C‑AGTGGCGCTCGCTTCGTATTCCCCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGG < SRR4302518.2003930/101‑1 (MQ=20)
CGGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCCGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGNNN > SRR4302518.9440985/1‑101 (MQ=60)
TTCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTCCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGNNN > SRR4302518.7755753/1‑101 (MQ=60)
TGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGNNN > SRR4302518.12532092/1‑101 (MQ=60)
TGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGNNN > SRR4302518.12639732/1‑101 (MQ=60)
TGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGC > SRR4302518.1283764/1‑101 (MQ=60)
TGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGAATGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGC > SRR4302518.3032053/1‑101 (MQ=60)
NNNAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCT < SRR4302518.8025011/101‑1 (MQ=60)
GCTAACGGGGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCG > SRR4302518.4282637/1‑101 (MQ=60)
GATAACGGTGTGGGTATGTTTATCAAAAACCCGATTGAACGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGNNN > SRR4302518.10633791/1‑101 (MQ=60)
CTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTG > SRR4302518.5286588/1‑101 (MQ=60)
CTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTG < SRR4302518.2719605/101‑1 (MQ=60)
TAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCNNN > SRR4302518.9407166/1‑101 (MQ=60)
TAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCGTGCTGGGGCNNN > SRR4302518.11725767/1‑101 (MQ=60)
tattGTGTGGGTATTGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTTCGTTTCCCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGTTGGGGCTGGC < SRR4302518.6068491/97‑1 (MQ=60)
NNNGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCG < SRR4302518.12893598/101‑1 (MQ=60)
ACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCG < SRR4302518.2651454/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCtc < SRR4302518.9266668/101‑3 (MQ=60)
CGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGG > SRR4302518.669515/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGT < SRR4302518.10400293/101‑1 (MQ=60)
NNNGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGAT < SRR4302518.11222273/101‑1 (MQ=60)
GGTGTGTGTATCGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTTCTGGGGCTGGCGGT < SRR4302518.2694549/101‑1 (MQ=60)
GGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGG‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTCGGGCTtgcnnn > SRR4302518.11059374/1‑95 (MQ=60)
GGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGT > SRR4302518.2794948/1‑101 (MQ=60)
GCTGTGGGTATGTTTATCAAAACCCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGT < SRR4302518.3202694/101‑1 (MQ=60)
TGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGGGACGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCA > SRR4302518.6380156/1‑101 (MQ=60)
NNNGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCA < SRR4302518.14996284/101‑1 (MQ=60)
TGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTTGCGGTCATC > SRR4302518.6870776/1‑101 (MQ=60)
nnntattcttatctaaatcccgcTTGAAGGC‑TT‑GAC‑AGTGGCGCTCGGTGTGTTTGCCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCctgt < SRR4302518.10063394/78‑5 (MQ=60)
NNNATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTT < SRR4302518.8587992/101‑1 (MQ=60)
GGTATGGTTATCCAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTT < SRR4302518.1293761/101‑1 (MQ=60)
GGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATNNN > SRR4302518.13443903/1‑101 (MQ=60)
GTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTC < SRR4302518.3721077/101‑1 (MQ=60)
GTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCCCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTC < SRR4302518.110457/101‑1 (MQ=60)
TATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCATCTTCG > SRR4302518.1324381/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGG < SRR4302518.14460692/101‑1 (MQ=60)
ATGGTTATCAAAAGCCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGG < SRR4302518.4198463/101‑1 (MQ=60)
TGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTCGCGGTCATCTTCCGC > SRR4302518.1487142/1‑101 (MQ=60)
NNNTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GTC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCC < SRR4302518.13123817/101‑1 (MQ=60)
TTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTG < SRR4302518.3496563/101‑1 (MQ=60)
TATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGaggtaaacgcaccgagcg < SRR4302518.6828422/101‑19 (MQ=60)
TATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCCTCTTCGGCCNNN > SRR4302518.7792056/1‑101 (MQ=60)
TATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGG < SRR4302518.6167394/101‑1 (MQ=60)
TCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGATCTGGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGCG > SRR4302518.140820/1‑101 (MQ=60)
NNNAAACCCGATTGAATGCTTT‑C‑C‑AGTGGCCCTCGGTGCGTTTGCCTCCTTCCCGGTGATGATGACCTTGCCGGGGCTGGCGGTTATCTTCGGCCTGGACA < SRR4302518.12065379/101‑1 (MQ=58)
CAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGTGCTGGCGGTCATCTTCGGCGTGGNNN > SRR4302518.10908226/1‑101 (MQ=60)
CAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGA < SRR4302518.638047/101‑1 (MQ=60)
AAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTTGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGTGGCTGTCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAA > SRR4302518.3260503/1‑101 (MQ=60)
AAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGANNN > SRR4302518.10489292/1‑101 (MQ=60)
AAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGggtag > SRR4302518.2939837/1‑96 (MQ=60)
NNNCCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGT < SRR4302518.13760888/101‑1 (MQ=60)
AAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGANNN > SRR4302518.9571690/1‑101 (MQ=60)
AAACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGT < SRR4302518.1101296/101‑1 (MQ=60)
AACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTG < SRR4302518.850375/101‑1 (MQ=60)
NNNCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGT < SRR4302518.14119261/101‑1 (MQ=60)
ACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCCTCTTCGGCCTGGGGAAGNNN > SRR4302518.9729720/1‑101 (MQ=60)
ACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGgagggg > SRR4302518.376638/1‑95 (MQ=60)
ACCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGGCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGG > SRR4302518.4375648/1‑101 (MQ=60)
NNNGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTC < SRR4302518.14520745/101‑1 (MQ=60)
NCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTN < SRR4302518.1167574/101‑1 (MQ=60)
CCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTC < SRR4302518.5401477/101‑1 (MQ=60)
CCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTC < SRR4302518.1780786/101‑1 (MQ=60)
CCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTC < SRR4302518.1456057/101‑1 (MQ=60)
CCCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTACCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTNNN > SRR4302518.13651439/1‑101 (MQ=60)
CCGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCG < SRR4302518.6005429/101‑1 (MQ=60)
CGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGG > SRR4302518.5503120/1‑101 (MQ=60)
CGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGG > SRR4302518.6787190/1‑101 (MQ=60)
CGATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGC > SRR4302518.4199240/1‑101 (MQ=60)
GATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGACTGGAGAAGTGGCGCG > SRR4302518.2540031/1‑101 (MQ=60)
ATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTCCCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGT < SRR4302518.6360135/101‑1 (MQ=60)
ATTGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGT > SRR4302518.6176900/1‑101 (MQ=60)
TGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTAC < SRR4302518.1999258/101‑1 (MQ=60)
TGAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGNNN > SRR4302518.11407089/1‑101 (MQ=60)
NNNAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTAC < SRR4302518.10947043/101‑1 (MQ=60)
GAAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACC < SRR4302518.3650055/101‑1 (MQ=60)
AAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTtnnn > SRR4302518.14320179/1‑97 (MQ=60)
AAGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTANNN > SRR4302518.14341441/1‑101 (MQ=60)
AGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGGAGTGTCGCGTACCCG > SRR4302518.7163252/1‑101 (MQ=60)
AGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACNNN > SRR4302518.13838547/1‑101 (MQ=60)
AGGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCG < SRR4302518.5889254/101‑1 (MQ=60)
GGC‑TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGG > SRR4302518.7244242/1‑101 (MQ=60)
nnnttgcC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGG < SRR4302518.9451364/94‑1 (MQ=60)
nnnttgcC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGG < SRR4302518.14331298/94‑1 (MQ=60)
nnntgcC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGC < SRR4302518.12669081/95‑1 (MQ=60)
TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGGAGTGTCGCGTACCCGGNNN > SRR4302518.8143531/1‑101 (MQ=60)
TT‑GCC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGNNN > SRR4302518.12610701/1‑101 (MQ=60)
tgcC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGG < SRR4302518.2531834/98‑1 (MQ=60)
gcC‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGA < SRR4302518.693913/99‑1 (MQ=60)
C‑C‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGGCGCGTACCCGGCGGGGT > SRR4302518.743033/1‑101 (MQ=60)
G‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGTGGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGGCGCGGACCCGGCGGGNNN > SRR4302518.14807101/1‑101 (MQ=60)
C‑GGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGNNN > SRR4302518.11150264/1‑101 (MQ=60)
C‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGAGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGGCGCGTACCCGGCGGGATC > SRR4302518.1765049/1‑101 (MQ=60)
C‑AGTGGAGCTCGGTGCGTTTTCATCCTTCCCGGTGAAGATGAGCTTGATGGAGCTGGCGGTCCTCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGAGGGATT < SRR4302518.4430778/101‑1 (MQ=60)
|
GGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGC‑TT‑G‑C‑AGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGATC > NC_000913/3025576‑3025776
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |