Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
88,471 |
C→T |
D148D (GAC→GAT) |
fruR → |
FruR |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 88,471 | 0 | C | T | 100.0%
| 760.9
/ NA
| 208 | D148D (GAC→GAT) | fruR | FruR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (108/100); total (108/100) |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCC > NC_000913/88382‑88560
|
gATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATcgc > 2:4354665/1‑93 (MQ=255)
gATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATcgc < 2:4269749/93‑1 (MQ=255)
gATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATcgc < 2:1307496/93‑1 (MQ=255)
gATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATcgc < 2:2147825/93‑1 (MQ=255)
aTGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATcgcg > 1:2372151/1‑93 (MQ=255)
gcATAATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCGTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGccc < 2:573944/92‑1 (MQ=255)
ccATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGccc < 2:3375821/93‑1 (MQ=255)
cATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCt < 2:2867878/93‑1 (MQ=255)
cATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCt > 2:1871108/1‑93 (MQ=255)
cATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGGTCCCGATTGGCGCGCTGGATCGCGCCCt > 2:2243784/1‑93 (MQ=255)
attattGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTc > 1:2915087/1‑93 (MQ=255)
attaatGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTc > 2:885389/1‑93 (MQ=255)
ttattGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCg > 1:1635823/1‑93 (MQ=255)
tattGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGa > 1:3943674/1‑93 (MQ=255)
tattGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGa < 1:33542/93‑1 (MQ=255)
tattGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGa > 1:3079155/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGt < 2:842673/93‑1 (MQ=255)
ttCGACGTCATTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGa < 2:3975560/93‑1 (MQ=255)
gACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAaca < 1:1632937/93‑1 (MQ=255)
aCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAacac > 2:4423189/1‑93 (MQ=255)
aCGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAacac > 1:1407019/1‑93 (MQ=255)
aCGTCGTTGCATCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAacac < 2:1994631/93‑1 (MQ=255)
gtcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAGCACtt > 1:87327/1‑93 (MQ=255)
gtcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACtt > 1:2419735/1‑93 (MQ=255)
ctcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACtt < 2:3145912/92‑1 (MQ=255)
tcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTc > 2:1510064/1‑93 (MQ=255)
tcgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCCGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTc > 2:243493/1‑93 (MQ=255)
cgtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCa > 1:368070/1‑93 (MQ=255)
gtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAc > 1:529211/1‑93 (MQ=255)
gtTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGCTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGCGAACACTTctc > 1:3511907/1‑91 (MQ=255)
ttGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAcc < 2:449878/93‑1 (MQ=255)
ttGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAcc > 1:2741707/1‑93 (MQ=255)
ttGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAcc > 1:1553375/1‑93 (MQ=255)
tGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCa > 1:3550490/1‑93 (MQ=255)
gCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAg < 2:964010/93‑1 (MQ=255)
cctcctGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGc > 1:4397204/1‑93 (MQ=255)
ctGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtgg < 2:2993613/93‑1 (MQ=255)
tGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt > 1:1566239/1‑93 (MQ=255)
tGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt > 1:830462/1‑93 (MQ=255)
tGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggt < 2:2293800/93‑1 (MQ=255)
gAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggtt < 2:3527097/93‑1 (MQ=255)
gAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGGTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggtg > 2:3047648/1‑92 (MQ=255)
cATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggttggt > 1:750786/1‑93 (MQ=255)
cATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGtggttggt > 2:275443/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg > 2:2706368/1‑93 (MQ=255)
aTCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTg > 1:375717/1‑93 (MQ=255)
ccTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGcc > 2:1560078/1‑93 (MQ=255)
tttttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGa > 1:2401177/1‑93 (MQ=255)
tttttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGa > 2:656455/1‑93 (MQ=255)
tttttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGACTGTCGCGCTGGATCGCGCCCCCGATCGAGCACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGa > 2:3612810/1‑93 (MQ=255)
ttttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGAt > 2:4014999/1‑93 (MQ=255)
ttATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCa < 2:2102261/93‑1 (MQ=255)
tATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAg < 1:174258/93‑1 (MQ=255)
aTCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAgg > 1:2175919/1‑93 (MQ=255)
tCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGga < 2:4114241/93‑1 (MQ=255)
cAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCAACCTGGATCCCGCCCTCGATCGTGCACACTTCACCAGGCTGGTTAGTGGCGATCAGgac > 2:722856/1‑92 (MQ=255)
aaCGCTGGGCTAACGACCCGTTTCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGggtg > 2:2484026/1‑93 (MQ=255)
cGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGgatgat < 2:3734373/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGatgatg < 2:2788839/93‑1 (MQ=255)
gCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGatgatg < 1:4065751/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGc < 2:3424126/93‑1 (MQ=255)
tGGGCTAACGGCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGcc < 1:717832/93‑1 (MQ=255)
gggCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCg > 1:3593210/1‑93 (MQ=255)
tAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt < 2:1807820/93‑1 (MQ=255)
tAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt < 1:1539523/93‑1 (MQ=255)
tAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt > 1:2241969/1‑93 (MQ=255)
tAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt < 2:4648246/93‑1 (MQ=255)
tAACCACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAt < 1:3317025/93‑1 (MQ=255)
cGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCt < 1:2037309/93‑1 (MQ=255)
cGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCt < 2:1171517/93‑1 (MQ=255)
cGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCt < 1:2972529/93‑1 (MQ=255)
gACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTg > 2:1831441/1‑93 (MQ=255)
gACCCGTTCCCAATCGCCGCGCTGGATCGCGGCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCCGGATGATGCCTAAATGCTg < 2:4576716/93‑1 (MQ=255)
aCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTgg > 2:1366579/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTgg > 1:1242319/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTgg > 1:3842216/1‑93 (MQ=255)
aCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTgg > 2:1649520/1‑93 (MQ=255)
cccGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTggg > 1:4110/1‑92 (MQ=255)
cGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGCTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCgg > 1:3711737/1‑93 (MQ=255)
ttCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGaa < 2:3867479/93‑1 (MQ=255)
ttCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGaa > 2:1128243/1‑93 (MQ=255)
ttCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGaa > 2:2520832/1‑93 (MQ=255)
tCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGATATGCTGGCGGAag > 1:1115281/1‑93 (MQ=255)
cccGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAaga < 2:3034795/93‑1 (MQ=255)
cccGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAaga < 1:1522907/93‑1 (MQ=255)
cccGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAaga < 2:810069/93‑1 (MQ=255)
aTTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGTGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTa > 2:636861/1‑93 (MQ=255)
aTTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTa < 1:2522707/93‑1 (MQ=255)
aTTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTa > 1:4546020/1‑93 (MQ=255)
ttGTCTCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCTCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTAc < 1:2333661/93‑1 (MQ=255)
gTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGt > 2:4217063/1‑93 (MQ=255)
cgcgCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTaa < 1:4447141/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAg < 2:876559/93‑1 (MQ=255)
cgcTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGt < 2:3331115/93‑1 (MQ=255)
gcTGGATCGCGGCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGtt < 1:2303668/93‑1 (MQ=255)
gcTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGtt < 2:2532577/93‑1 (MQ=255)
gcTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGtt > 1:1993597/1‑93 (MQ=255)
tGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTc > 1:3009279/1‑93 (MQ=255)
tGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTc < 1:2537395/93‑1 (MQ=255)
ggATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTcc < 1:1663186/93‑1 (MQ=255)
|
GATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCC > NC_000913/88382‑88560
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCC > NC_000913/88378‑88564
|
GGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTGCCGATTGTCGGGCTGGAT > SRR4302535.1378413/1‑94 (MQ=60)
GGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGAT > SRR4302535.115093/1‑94 (MQ=60)
TTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCG < SRR4302535.3577705/94‑1 (MQ=60)
GATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCG > SRR4302535.2389188/1‑94 (MQ=60)
ATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGC > SRR4302535.2333474/1‑94 (MQ=60)
CCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCT > SRR4302535.3616848/1‑94 (MQ=60)
CATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTC > SRR4302535.2935673/1‑94 (MQ=60)
CATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTC < SRR4302535.2555290/94‑1 (MQ=60)
CATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGCCGCGCTGGATCGCGCCCTC > SRR4302535.2813222/1‑94 (MQ=60)
ATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCG > SRR4302535.1565163/1‑94 (MQ=60)
ATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCG > SRR4302535.1647644/1‑94 (MQ=60)
TTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGA > SRR4302535.3100628/1‑94 (MQ=60)
TTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGA > SRR4302535.3970599/1‑94 (MQ=60)
TATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGAT < SRR4302535.2579639/94‑1 (MQ=60)
TATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGAT < SRR4302535.33801/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATC < SRR4302535.4619996/94‑1 (MQ=60)
ATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATC < SRR4302535.3418590/94‑1 (MQ=60)
TTGGTTCGCCGTCGTTCCCTCCTGAGCATCCTTTCTATCAACTCCGGTCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCG < SRR4302535.2052202/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTG < SRR4302535.2334910/94‑1 (MQ=60)
TTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGA > SRR4302535.4567276/1‑94 (MQ=60)
TTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAA > SRR4302535.3536416/1‑94 (MQ=60)
CGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACA < SRR4302535.1544665/94‑1 (MQ=60)
GACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACAC < SRR4302535.1644737/94‑1 (MQ=60)
GACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACAC > SRR4302535.1624285/1‑94 (MQ=60)
GACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACAC > SRR4302535.1417072/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAGCACTT > SRR4302535.87942/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTT > SRR4302535.369683/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTT < SRR4302535.3170603/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTT > SRR4302535.2437158/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTT > SRR4302535.907405/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTT > SRR4302535.179146/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTC > SRR4302535.2229769/1‑94 (MQ=60)
GTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTC < SRR4302535.3648664/94‑1 (MQ=60)
TCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCA > SRR4302535.370611/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAC > SRR4302535.378152/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCAC > SRR4302535.532913/1‑94 (MQ=60)
CGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGCTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGCGAACACTTCTC > SRR4302535.3536306/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACC < SRR4302535.3376742/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACC > SRR4302535.2761248/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACC > SRR4302535.1564569/1‑94 (MQ=60)
TTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCA > SRR4302535.3575129/1‑94 (MQ=60)
GCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGC > SRR4302535.4427300/1‑94 (MQ=60)
CTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGT > SRR4302535.3968031/1‑94 (MQ=60)
TCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTG < SRR4302535.3716845/94‑1 (MQ=60)
CCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGG > SRR4302535.773750/1‑94 (MQ=60)
CTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGT > SRR4302535.1577544/1‑94 (MQ=60)
CTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGT > SRR4302535.836281/1‑94 (MQ=60)
GCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGT > SRR4302535.756077/1‑94 (MQ=60)
GCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCACCGTGGTTGGT > SRR4302535.4066796/1‑94 (MQ=60)
CATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTG < SRR4302535.2949986/94‑1 (MQ=60)
CATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTG > SRR4302535.378322/1‑94 (MQ=60)
ATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGC > SRR4302535.848067/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGA > SRR4302535.2418449/1‑94 (MQ=60)
TTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGAT < SRR4302535.2494455/94‑1 (MQ=60)
TTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATC < SRR4302535.713572/94‑1 (MQ=60)
tttacaaccgcgGGGCTACCGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTGGATCGTGAACACTTCCCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCA < SRR4302535.606411/82‑1 (MQ=60)
TATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGG < SRR4302535.4235819/94‑1 (MQ=60)
TATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGG < SRR4302535.2430431/94‑1 (MQ=60)
TATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGG < SRR4302535.175463/94‑1 (MQ=60)
TATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGG > SRR4302535.2191474/1‑94 (MQ=60)
ATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGA < SRR4302535.151537/94‑1 (MQ=60)
TCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGAT > SRR4302535.155612/1‑94 (MQ=60)
TCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGAT < SRR4302535.1246833/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATG < SRR4302535.1565560/94‑1 (MQ=60)
CAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATG < SRR4302535.617926/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGC < SRR4302535.4093571/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCC > SRR4302535.2098194/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTAACGGCCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCG < SRR4302535.722875/94‑1 (MQ=60)
TGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCG > SRR4302535.3618148/1‑94 (MQ=60)
TGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACAAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCG < SRR4302535.3617037/94‑1 (MQ=60)
CTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAAT > SRR4302535.2257918/1‑94 (MQ=60)
TAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATG < SRR4302535.1550622/94‑1 (MQ=60)
TAACCACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATG < SRR4302535.3340105/94‑1 (MQ=60)
AACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGC < SRR4302535.1665426/94‑1 (MQ=60)
ACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCT < SRR4302535.1313411/94‑1 (MQ=60)
ACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCT < SRR4302535.725954/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTG > SRR4302535.240911/1‑94 (MQ=60)
CGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTG < SRR4302535.2051982/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTG < SRR4302535.2626375/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTG < SRR4302535.2993392/94‑1 (MQ=60)
GACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGG > SRR4302535.3868685/1‑94 (MQ=60)
GACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGG > SRR4302535.1251191/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGG > SRR4302535.4147/1‑94 (MQ=60)
ACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGC < SRR4302535.1737347/94‑1 (MQ=60)
CCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGCTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGG > SRR4302535.3737448/1‑94 (MQ=60)
GTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAA > SRR4302535.2372027/1‑94 (MQ=60)
GTTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAA > SRR4302535.2041264/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGATATGCTGGCGGAAG > SRR4302535.1123230/1‑94 (MQ=60)
TTCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAG > SRR4302535.3846539/1‑94 (MQ=60)
TCCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAG < SRR4302535.1646718/94‑1 (MQ=60)
TCCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGA < SRR4302535.3056622/94‑1 (MQ=60)
CCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAG < SRR4302535.2308185/94‑1 (MQ=60)
CCCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAG < SRR4302535.1533875/94‑1 (MQ=60)
CCGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGT > SRR4302535.4031174/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTT > SRR4302535.4475124/1‑94 (MQ=60)
CGATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTT > SRR4302535.3014395/1‑94 (MQ=60)
GATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTA > SRR4302535.4577104/1‑94 (MQ=60)
tttgcccCGCTGGACCGCCCCCTCGTTCGTGAACCCTCCACAGGGGTGGTT‑GTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACG < SRR4302535.4506095/87‑1 (MQ=47)
ATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTAC > SRR4302535.3278138/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTAC < SRR4302535.2540885/94‑1 (MQ=60)
TTGTCTCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCTCCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACG < SRR4302535.2350359/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAA < SRR4302535.4136881/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAG < SRR4302535.4477639/94‑1 (MQ=60)
CGCTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTT > SRR4302535.2007952/1‑94 (MQ=60)
GCTGGATCGCGGCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTT < SRR4302535.2320147/94‑1 (MQ=60)
CTGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTC > SRR4302535.3030356/1‑94 (MQ=60)
TGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCC < SRR4302535.2555673/94‑1 (MQ=60)
TGGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCC < SRR4302535.1975216/94‑1 (MQ=60)
GGATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCC < SRR4302535.1675203/94‑1 (MQ=60)
GATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCG < SRR4302535.2503600/94‑1 (MQ=60)
GATCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCG < SRR4302535.2074288/94‑1 (MQ=60)
TCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGGTCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCC < SRR4302535.2470369/94‑1 (MQ=60)
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GGTTGATGCCATTATTGTTTCGACGTCGTTGCCTCCTGAGCATCCTTTTTATCAACGCTGGGCTAACGACCCGTTCCCGATTGTCGCGCTGGACCGCGCCCTCGATCGTGAACACTTCACCAGCGTGGTTGGTGCCGATCAGGATGATGCCGAAATGCTGGCGGAAGAGTTACGTAAGTTTCCCGCC > NC_000913/88378‑88564
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
