Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,874,785 |
T→C |
G363G (GGT→GGC) |
yeaN → |
putative amino acid/amine transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,874,785 | 0 | T | C | 100.0%
| 328.2
/ NA
| 103 | G363G (GGT→GGC) | yeaN | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/58); total (45/58) |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTC > NC_000913/1874697‑1874873
|
cggcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACt < 2:3682671/93‑1 (MQ=255)
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg < 1:362017/93‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTc < 2:1670086/93‑1 (MQ=255)
tctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTg > 2:4315873/1‑93 (MQ=255)
tctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTg > 1:1592771/1‑93 (MQ=255)
ctcGTGGATGGCATATTCGTTCGGGTATTGGTTGGCAGCCTGTGGGCCTCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGt < 2:3935913/93‑1 (MQ=255)
ctcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGt < 2:908706/93‑1 (MQ=255)
tcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTa < 1:1435072/93‑1 (MQ=255)
tcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTa > 2:2121120/1‑93 (MQ=255)
ggggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAcc < 2:3721063/93‑1 (MQ=255)
ggggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAcc < 1:2623687/93‑1 (MQ=255)
ggggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAcc < 1:4104790/93‑1 (MQ=255)
gggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCa > 1:1952456/1‑93 (MQ=255)
gggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCa > 1:2085806/1‑93 (MQ=255)
gggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCa > 1:1332860/1‑93 (MQ=255)
gggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCACCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCa < 2:448936/93‑1 (MQ=255)
gATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACt > 1:250446/1‑93 (MQ=255)
tGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCTCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTa < 2:2554054/93‑1 (MQ=255)
tGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTa < 2:1657521/93‑1 (MQ=255)
ggCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAt > 1:922687/1‑93 (MQ=255)
gCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATg > 1:2772953/1‑93 (MQ=255)
gCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATg > 1:722315/1‑93 (MQ=255)
gCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATg < 1:1385362/93‑1 (MQ=255)
cacaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATgg < 1:3996939/93‑1 (MQ=255)
cacaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATgg < 2:3409767/93‑1 (MQ=255)
caATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgt < 2:2172038/93‑1 (MQ=255)
caATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgt > 1:2237222/1‑93 (MQ=255)
aaTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtg < 2:2032099/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt > 1:969685/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt > 1:3322150/1‑93 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt < 2:3491943/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTGGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt < 2:1860841/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGtt > 2:3704512/1‑93 (MQ=255)
cGTCGAGTATTGGGCGGCAGCCGGTGGTCCGCGGCTGATGGGTAAAATACACGAGGCTAACGGCACCTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGc < 1:1304549/93‑1 (MQ=255)
ggTATGTGTAGGCAGCGTGGGGGCCTCTGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATAc < 2:2821965/93‑1 (MQ=255)
gTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACt > 1:2321573/1‑93 (MQ=255)
tATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACtt < 2:1062696/93‑1 (MQ=255)
aTTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACttt < 1:911890/93‑1 (MQ=255)
tttGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTc > 1:2311259/1‑93 (MQ=255)
ttgttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCa > 2:1812841/1‑93 (MQ=255)
tgttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCac > 1:4143973/1‑93 (MQ=255)
gttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCact < 1:1270176/93‑1 (MQ=255)
gttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCact < 1:743467/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 1:2994731/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactact > 2:3876653/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactact < 2:211326/93‑1 (MQ=255)
gCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATTGGTGTTGCCATACTTTCACTACTg > 2:1880397/1‑93 (MQ=255)
gCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTg > 1:2880161/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa < 2:871410/93‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa < 2:3121486/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAt < 2:1491680/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAt < 1:279455/93‑1 (MQ=255)
ccTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATgg < 1:817234/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGc < 1:3913781/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg > 1:1470226/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg > 2:3808915/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg > 2:2796768/1‑93 (MQ=255)
gggCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAtt > 2:1618112/1‑93 (MQ=255)
gccgccGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAtttt < 1:4583517/93‑1 (MQ=255)
cgccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCg < 2:2556374/93‑1 (MQ=255)
gccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGTCGATTTTCgg > 2:3672679/1‑93 (MQ=255)
gccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCgg > 2:4428342/1‑93 (MQ=255)
gccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCgg > 1:3682195/1‑93 (MQ=255)
gccgcTGATGGGTAAAATACACGACGCTAACGGCAACTGGTCTGCACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCgg > 2:1578582/1‑93 (MQ=255)
ccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCGCTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGa > 1:3036282/1‑93 (MQ=255)
ccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGa > 1:3309234/1‑93 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt < 2:3304009/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt < 2:3486111/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt > 1:3595823/1‑93 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt > 2:231910/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt > 1:2742360/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt < 2:4224196/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt > 1:4039302/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt < 1:2684722/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt < 2:3507060/93‑1 (MQ=255)
gATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTg > 2:52581/1‑93 (MQ=255)
aTGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgc < 2:3087957/93‑1 (MQ=255)
aTGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgc < 1:3204733/93‑1 (MQ=255)
gggTAAAATACACGATGCTAACGGCAACGGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcgc < 1:370884/93‑1 (MQ=255)
tAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCgg < 2:662858/93‑1 (MQ=255)
tAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCgg > 2:2609567/1‑93 (MQ=255)
tAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCgg < 2:4065104/93‑1 (MQ=255)
aaaaTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCggg < 1:3920630/93‑1 (MQ=255)
aTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgaga < 2:2809615/93‑1 (MQ=255)
acacGATGCGAACGGCAAGTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATCCTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagaga < 1:1878006/93‑1 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc < 2:1499044/93‑1 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACCACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc < 2:939698/93‑1 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa < 2:688656/93‑1 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa > 1:1138098/1‑93 (MQ=255)
aTGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAg < 1:2859991/93‑1 (MQ=255)
aTGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAg < 1:305862/93‑1 (MQ=255)
cTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGaaa > 1:581785/1‑93 (MQ=255)
cTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGaaa < 2:3858112/93‑1 (MQ=255)
cTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGaaa > 2:3597875/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAt < 1:3224612/93‑1 (MQ=255)
tAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAt > 2:548854/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt < 2:1039311/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt < 1:1964563/93‑1 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt > 2:919657/1‑93 (MQ=255)
aCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTc > 2:3423697/1‑93 (MQ=255)
|
CGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTC > NC_000913/1874697‑1874873
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874699‑1874878
|
GCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGT < SRR4302535.364516/94‑1 (MQ=60)
CTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTG > SRR4302535.1604266/1‑94 (MQ=60)
TCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAC < SRR4302535.1445321/94‑1 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA > SRR4302535.1342366/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA > SRR4302535.1966510/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA < SRR4302535.4132894/94‑1 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA > SRR4302535.2100827/1‑94 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA < SRR4302535.2642489/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACT > SRR4302535.252171/1‑94 (MQ=60)
TGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAT > SRR4302535.929226/1‑94 (MQ=60)
GGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATG > SRR4302535.2792698/1‑94 (MQ=60)
GGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATG > SRR4302535.727387/1‑94 (MQ=60)
GCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGG < SRR4302535.1395250/94‑1 (MQ=60)
CACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGG < SRR4302535.4024283/94‑1 (MQ=60)
ACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGT > SRR4302535.2253138/1‑94 (MQ=60)
AATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGT > SRR4302535.3345263/1‑94 (MQ=60)
AATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGT > SRR4302535.976571/1‑94 (MQ=60)
cgtcgagtattgggcGGCAGCCGGTGGTCCGCGGCTGATGGGTAAAATACACGAGGCTAACGGCACCTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCC < SRR4302535.1313864/79‑1 (MQ=60)
GGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACT > SRR4302535.2338188/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTC > SRR4302535.2327798/1‑94 (MQ=60)
ATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTC < SRR4302535.918373/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCAC > SRR4302535.4172348/1‑94 (MQ=60)
GTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTA < SRR4302535.748684/94‑1 (MQ=60)
GTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTA < SRR4302535.1279253/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACT < SRR4302535.3015726/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTG > SRR4302535.2900552/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATG < SRR4302535.281404/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATG < SRR4302535.2666352/94‑1 (MQ=60)
GCCTGTGGCCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGG < SRR4302535.3811416/94‑1 (MQ=60)
CCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGC < SRR4302535.822966/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCG > SRR4302535.1480756/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCG < SRR4302535.3940569/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTC < SRR4302535.4614732/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGG > SRR4302535.3707677/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCGCTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGA > SRR4302535.3057546/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGA > SRR4302535.3332260/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACT > SRR4302535.3620777/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTT > SRR4302535.4066952/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTT > SRR4302535.2761905/1‑94 (MQ=60)
TGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTG < SRR4302535.2703917/94‑1 (MQ=60)
ATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCG < SRR4302535.3226925/94‑1 (MQ=60)
GGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACGGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCC < SRR4302535.373450/94‑1 (MQ=60)
AAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGA < SRR4302535.3947437/94‑1 (MQ=60)
ACACGATGCGAACGGCAAGTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATCCTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC < SRR4302535.1891537/94‑1 (MQ=60)
CGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAA > SRR4302535.1146214/1‑94 (MQ=60)
ATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGA < SRR4302535.2880249/94‑1 (MQ=60)
ATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGA < SRR4302535.307980/94‑1 (MQ=60)
GCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAA > SRR4302535.585869/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATT < SRR4302535.3246965/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTC < SRR4302535.1978725/94‑1 (MQ=60)
CGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGC > SRR4302535.3356332/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA < SRR4302535.4443277/94‑1 (MQ=60)
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GCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874699‑1874878
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
