Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,874,785 |
T→C |
G363G (GGT→GGC) |
yeaN → |
putative amino acid/amine transport protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,874,785 | 0 | T | C | 99.5%
| 589.8
/ NA
| 188 | G363G (GGT→GGC) | yeaN | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (89/98); minor base G (0/1); total (89/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCG > NC_000913/1874695‑1874874
|
ggcggcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCaa < 2:5542173/93‑1 (MQ=255)
ggcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTg > 1:1070733/1‑93 (MQ=255)
ggcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTg > 2:5763029/1‑93 (MQ=255)
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg > 1:7077865/1‑93 (MQ=255)
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg < 2:4148543/93‑1 (MQ=255)
gcACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTgg < 1:3967952/93‑1 (MQ=255)
cACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGt < 2:2009038/93‑1 (MQ=255)
cctctCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTc < 1:3270619/92‑1 (MQ=255)
aCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTc < 1:3813982/93‑1 (MQ=255)
ctctCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCt > 1:2251614/1‑93 (MQ=255)
tcGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAACCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTa < 2:3385062/93‑1 (MQ=255)
gggggATGGCAAAGGCCGTGGAGTATTTGTTGGCAGCCGGTGGGCCTCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAc < 1:1528659/92‑1 (MQ=255)
ggggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAcc < 1:5938356/93‑1 (MQ=255)
ggggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAcc < 2:5346935/93‑1 (MQ=255)
ggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAc < 1:1054233/93‑1 (MQ=255)
ggATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCAc < 2:2823845/93‑1 (MQ=255)
gATGGCACAATCTGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGATGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACt < 2:7922512/93‑1 (MQ=255)
tGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTa > 2:4736418/1‑93 (MQ=255)
tGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTa > 1:698657/1‑93 (MQ=255)
gCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATg > 2:7262571/1‑93 (MQ=255)
gCAAAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATg < 1:765262/93‑1 (MQ=255)
cacaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATgg < 2:756476/93‑1 (MQ=255)
cacaATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATgg < 2:2632482/93‑1 (MQ=255)
caATCCGTCGGGTTTTTGTTGGCATCCTGTGGGCCGCCGCCGATTGGTAAAATACACGTTGCTAATGGCAACTGGTCTGTACCACGTATGGgt > 2:6995216/1‑93 (MQ=255)
caATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgt < 1:2169008/93‑1 (MQ=255)
aaTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtg < 2:417782/93‑1 (MQ=255)
aTCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGgtgt < 1:2115356/93‑1 (MQ=255)
tCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGtt < 1:1831017/93‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGc < 2:5049123/93‑1 (MQ=255)
cGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGc < 1:7758160/93‑1 (MQ=255)
tCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCa > 1:7594994/1‑93 (MQ=255)
cGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCAt < 2:4494782/93‑1 (MQ=255)
cGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCAt < 1:2749858/93‑1 (MQ=255)
ggTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATAc > 2:5507098/1‑93 (MQ=255)
ggTATTTGTTGGCACCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATAc < 1:6101118/93‑1 (MQ=255)
gTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACt > 1:1666404/1‑93 (MQ=255)
tATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACtt > 1:4153132/1‑93 (MQ=255)
tATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACtt > 2:564743/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTc > 2:1776909/1‑93 (MQ=255)
tttGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTc < 2:5745451/93‑1 (MQ=255)
ttgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCacta < 1:2805612/93‑1 (MQ=255)
tgGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactac < 1:529443/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactact < 2:1185072/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCactact > 1:3014555/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa < 1:1029962/93‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa < 1:799307/93‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa > 2:7457689/1‑93 (MQ=255)
cAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGa < 1:5873391/93‑1 (MQ=255)
aGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAt < 1:3147687/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATg < 1:4442239/93‑1 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATg > 1:3680208/1‑93 (MQ=255)
gCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATg > 2:1240378/1‑93 (MQ=255)
ccTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAtag < 1:3402221/93‑3 (MQ=255)
ccTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATgg < 2:6472546/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGc > 1:1903581/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGCCCTCCGCTGATGGTTAAAGTACACGATGCTAACGGGAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGc < 2:6782570/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg < 1:5953949/93‑1 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg > 1:210127/1‑93 (MQ=255)
tgtgGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCg > 1:126471/1‑93 (MQ=255)
gccgccGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAtttt < 2:3765616/93‑1 (MQ=255)
gccgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCgg > 2:61599/1‑93 (MQ=255)
cgcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGAc < 1:3595835/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACt > 2:1449400/1‑93 (MQ=255)
cTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACtt < 1:452187/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt > 1:2517237/1‑93 (MQ=255)
tGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACttt < 2:3650171/93‑1 (MQ=255)
gATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTg < 2:3564374/93‑1 (MQ=255)
tGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcg > 2:1559859/1‑93 (MQ=255)
tGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTgcg > 2:5311721/1‑93 (MQ=255)
ggTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATGCTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGcc < 2:2169078/93‑1 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg < 2:980951/93‑1 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg > 2:6294124/1‑93 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg > 1:5173721/1‑93 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg < 1:985343/93‑1 (MQ=255)
gTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCg < 1:7339972/93‑1 (MQ=255)
tAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGGACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCgg > 2:5491874/1‑93 (MQ=255)
aaaaTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCggg < 1:4373438/93‑1 (MQ=255)
aaaTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGga > 1:4967712/1‑93 (MQ=255)
aaaTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGga > 1:6695688/1‑93 (MQ=255)
aTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGGGCCGGgaga < 2:7672718/93‑1 (MQ=255)
aTACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgaga > 2:2963838/1‑93 (MQ=255)
tACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagag > 2:2938270/1‑93 (MQ=255)
acacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagaga < 1:549411/93‑1 (MQ=255)
acacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGgagaga < 2:5967977/93‑1 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc < 2:4418854/93‑1 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc > 2:1714247/1‑93 (MQ=255)
cacGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAc > 2:1409405/1‑93 (MQ=255)
acGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGCACTTTGCGCGGGGAGAGACa > 1:1094864/1‑93 (MQ=255)
gATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACaaa < 1:625519/93‑1 (MQ=255)
tGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGa < 2:5179244/93‑1 (MQ=255)
tGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGa < 1:4642006/93‑1 (MQ=255)
gCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGaa < 1:5714218/93‑1 (MQ=255)
cTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGaaa > 2:4391874/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGGGGGACAAAAAAAt > 2:3097303/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAt > 1:6371837/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt > 2:4641283/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt > 1:7481941/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAtt > 1:7481940/1‑93 (MQ=255)
aCGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTc > 1:4383955/1‑93 (MQ=255)
cGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCg > 2:7808172/1‑93 (MQ=255)
|
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCG > NC_000913/1874695‑1874874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874695‑1874878
|
GGCGGCCCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAAC < SRR4302543.2225081/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAAC > SRR4302543.5307348/1‑94 (MQ=60)
CGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTG > SRR4302543.1080357/1‑94 (MQ=60)
GGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGG > SRR4302543.7146601/1‑94 (MQ=60)
GCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGT < SRR4302543.737375/94‑1 (MQ=60)
GCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGT < SRR4302543.4003121/94‑1 (MQ=60)
CACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTC < SRR4302543.5709576/94‑1 (MQ=60)
CACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTC > SRR4302543.5429213/1‑94 (MQ=60)
CCTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCT < SRR4302543.3300163/94‑1 (MQ=60)
ACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCT < SRR4302543.3847605/94‑1 (MQ=60)
ACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCT > SRR4302543.3929295/1‑94 (MQ=60)
ACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCT > SRR4302543.2272083/1‑94 (MQ=60)
TCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTAC < SRR4302543.3155360/94‑1 (MQ=60)
gggggatggcaaaggccgtggaGTATTTGTTGGCAGCCGGTGGGCCTCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACC < SRR4302543.1542374/72‑1 (MQ=60)
CGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACC < SRR4302543.445853/94‑1 (MQ=60)
GGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCA < SRR4302543.5992687/94‑1 (MQ=60)
GGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACT < SRR4302543.1063688/94‑1 (MQ=60)
ATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTA > SRR4302543.705047/1‑94 (MQ=60)
TGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCTTATGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTAT < SRR4302543.7683748/94‑1 (MQ=60)
GCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGG < SRR4302543.771996/94‑1 (MQ=60)
GCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGG < SRR4302543.2423987/94‑1 (MQ=60)
GCAAAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGG < SRR4302543.771995/94‑1 (MQ=60)
CAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTG < SRR4302543.2188442/94‑1 (MQ=60)
CAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTG < SRR4302543.6325989/94‑1 (MQ=60)
ATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTT < SRR4302543.2134292/94‑1 (MQ=60)
tccgtgtgggattgtttggggtgttggtgcccgcaGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTG < SRR4302543.2212339/59‑1 (MQ=60)
TCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTG < SRR4302543.1847476/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCC < SRR4302543.7831382/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCA > SRR4302543.7667151/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCA > SRR4302543.1989806/1‑94 (MQ=60)
GTCGGGGATTTGTTGGCAGCCTGCGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATCCACGCTGCTAACGCGAACTGGTCTGGACCACTTATGGGTGTcacca > SRR4302543.1989805/1‑89 (MQ=60)
CGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATA < SRR4302543.2774868/94‑1 (MQ=60)
GGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACT > SRR4302543.1681329/1‑94 (MQ=60)
GGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACT > SRR4302543.3742709/1‑94 (MQ=60)
GGTATTTGTTGGCACCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACT < SRR4302543.6158924/94‑1 (MQ=60)
GTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTT > SRR4302543.4190680/1‑94 (MQ=60)
GTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTT > SRR4302543.5989953/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCA > SRR4302543.6762742/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCAC < SRR4302543.965341/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCAC > SRR4302543.10990/1‑94 (MQ=60)
tgtgtGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACT < SRR4302543.5031438/89‑1 (MQ=60)
TTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTAC < SRR4302543.2831282/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACT < SRR4302543.534341/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACT > SRR4302543.3041834/1‑94 (MQ=60)
CAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAT < SRR4302543.5926890/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAT < SRR4302543.1039097/94‑1 (MQ=60)
CAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAT < SRR4302543.806337/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATG < SRR4302543.3175993/94‑1 (MQ=60)
AGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATG > SRR4302543.3499965/1‑94 (MQ=60)
AGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATG > SRR4302543.3712542/1‑94 (MQ=60)
GCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATGG < SRR4302543.4482466/94‑1 (MQ=60)
GCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGG > SRR4302543.2787977/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGC > SRR4302543.1920712/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATAGC < SRR4302543.3432695/94‑1 (MQ=60)
CTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCG > SRR4302543.211918/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCG > SRR4302543.127612/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGGCCGCCGCTGATGGGGAAAATACACGATGGTAACGGCAACTGGTCTCTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGAgcgcc > SRR4302543.3110020/1‑89 (MQ=60)
TGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGA < SRR4302543.6008444/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCCGCCGCTGATGGGTAACCTACACGATGCTAACGGCGACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTCCTGATGGCGAT < SRR4302543.7079733/94‑1 (MQ=60)
GTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGAT > SRR4302543.4590069/1‑94 (MQ=60)
GGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTT < SRR4302543.1076451/94‑1 (MQ=60)
GGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTT > SRR4302543.3184488/1‑94 (MQ=60)
GCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTC > SRR4302543.215753/1‑94 (MQ=60)
CGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGG > SRR4302543.2943760/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACT > SRR4302543.7622010/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACT > SRR4302543.1189087/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACT < SRR4302543.3627572/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTT > SRR4302543.6553310/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTT < SRR4302543.1725228/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTT < SRR4302543.456405/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTT > SRR4302543.2540102/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCG > SRR4302543.1453126/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCG > SRR4302543.2647471/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCC > SRR4302543.7850989/1‑94 (MQ=60)
GGTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCG > SRR4302543.5220440/1‑94 (MQ=60)
GTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGG < SRR4302543.7410585/94‑1 (MQ=60)
GTAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGG < SRR4302543.994043/94‑1 (MQ=60)
TAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGG < SRR4302543.3635864/94‑1 (MQ=60)
TAAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGG < SRR4302543.4307737/94‑1 (MQ=60)
AAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGA > SRR4302543.6758885/1‑94 (MQ=60)
AAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGA < SRR4302543.4413053/94‑1 (MQ=60)
AAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGA < SRR4302543.4413057/94‑1 (MQ=60)
AAAATACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGA > SRR4302543.5012931/1‑94 (MQ=60)
ACACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGAC < SRR4302543.554471/94‑1 (MQ=60)
CACGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGCACTTTGCGCGGGGAGAGACA > SRR4302543.1104715/1‑94 (MQ=60)
CGATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAA < SRR4302543.629608/94‑1 (MQ=60)
GATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAG < SRR4302543.631245/94‑1 (MQ=60)
GATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAG > SRR4302543.155028/1‑94 (MQ=60)
GATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAG > SRR4302543.5773115/1‑94 (MQ=60)
ATGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGA > SRR4302543.5154448/1‑94 (MQ=60)
TGCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAA < SRR4302543.4684234/94‑1 (MQ=60)
GCTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAA < SRR4302543.5766355/94‑1 (MQ=60)
CTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTTCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAT < SRR4302543.6143426/94‑1 (MQ=60)
CTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAT > SRR4302543.4081948/1‑94 (MQ=60)
CTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAT < SRR4302543.185931/94‑1 (MQ=60)
CTAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAAT > SRR4302543.6431773/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATT > SRR4302543.7553556/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATT > SRR4302543.7553557/1‑94 (MQ=60)
TAACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATT > SRR4302543.7553558/1‑94 (MQ=60)
AACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTC < SRR4302543.4708156/94‑1 (MQ=60)
AACGGCAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTC > SRR4302543.4423700/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > SRR4302543.7368096/1‑94 (MQ=60)
CAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > SRR4302543.5359348/1‑94 (MQ=60)
|
GGCGGCACTCTCGGGGATGGCACAATCCGTCGGGTATTTGTTGGCAGCCTGTGGGCCGCCGCTGATGGGTAAAATACACGATGCTAACGGTAACTGGTCTGTACCACTTATGGGTGTTGCCATACTTTCACTACTGATGGCGATTTTCGGACTTTGCGCCGGGAGAGACAAAGAAATTCGCTAA > NC_000913/1874695‑1874878
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
