Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,988,480 |
A→G |
L259L (TTA→TTG) |
tyrP → |
tyrosine‑specific transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,988,480 | 0 | A | G | 100.0%
| 429.7
/ NA
| 135 | L259L (TTA→TTG) | tyrP | tyrosine‑specific transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (70/65); total (70/65) |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGG > NC_000913/1988390‑1988569
|
atTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAg > 1:1136450/1‑93 (MQ=255)
atTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAg < 2:2639644/93‑1 (MQ=255)
atTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAg < 2:2288186/93‑1 (MQ=255)
atTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAg < 1:3175591/93‑1 (MQ=255)
ttttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAgg > 1:1480170/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAgg < 1:697899/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCg < 1:93286/93‑1 (MQ=255)
ttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCg > 1:2150919/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGtt < 1:2160136/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGCTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTa < 1:4509437/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTa > 2:1689952/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTa > 1:174127/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAc < 1:1105290/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcg > 1:3108609/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcgc > 1:713126/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcgcg > 1:659081/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGa > 2:3458337/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGa > 1:4010408/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaa > 1:826926/1‑93 (MQ=255)
tGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaaa < 2:2480938/93‑1 (MQ=255)
ggCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAt < 2:3295501/93‑1 (MQ=255)
gACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTACTCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggt > 2:2827862/1‑93 (MQ=255)
gACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggt < 1:1605891/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg > 1:2729140/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtagtg > 2:1579212/1‑93 (MQ=255)
cGCTTGGCAGCATTGATTCAACATCCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAACCGGGCTGTTGCAGTCGTTACGCGAAAtggtgg < 2:2952010/93‑1 (MQ=255)
cTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGcc > 2:3917086/1‑93 (MQ=255)
cTTGGCAGCATTGATTAAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGcc < 1:4219472/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctc < 2:324983/93‑1 (MQ=255)
ggCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctct > 1:636282/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctct > 2:462400/1‑93 (MQ=255)
gcagcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCtctc < 1:3133323/93‑1 (MQ=255)
gagcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTcc < 1:1242556/92‑1 (MQ=255)
cagcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTcc > 1:2874394/1‑93 (MQ=255)
gcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGc > 1:920792/1‑93 (MQ=255)
caTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCa < 1:4449524/93‑1 (MQ=255)
aTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCAt < 2:3746345/93‑1 (MQ=255)
ttGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATg > 1:1046666/1‑93 (MQ=255)
ttGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATg > 2:1926161/1‑93 (MQ=255)
tGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGt < 1:3551501/93‑1 (MQ=255)
tGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGt < 2:1338159/93‑1 (MQ=255)
gATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGtt < 1:56401/93‑1 (MQ=255)
aTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTg > 2:1062615/1‑93 (MQ=255)
aTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTg > 1:4656665/1‑93 (MQ=255)
ttCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGa > 1:3699885/1‑93 (MQ=255)
ttCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGa < 1:4679211/93‑1 (MQ=255)
tCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAg > 1:1570846/1‑93 (MQ=255)
caacaaCCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGc > 1:4671348/1‑93 (MQ=255)
aacaacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCt > 1:3492319/1‑93 (MQ=255)
acaacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTg > 2:134311/1‑93 (MQ=255)
caacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTgg > 2:4438230/1‑93 (MQ=255)
acCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCa > 1:361204/1‑93 (MQ=255)
ccTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAg < 2:4517380/93‑1 (MQ=255)
tttATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTg > 2:691717/1‑93 (MQ=255)
ttATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGc < 2:4528584/93‑1 (MQ=255)
tATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCa < 2:2080144/93‑1 (MQ=255)
tATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCa < 2:4109383/93‑1 (MQ=255)
tATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCa > 1:1987847/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGACATGGTGGACTCTCAGCATGTTGAGATGGCAGGCCatt > 2:1421773/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatt < 2:3612655/93‑1 (MQ=255)
tGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatt > 1:1329682/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCattta < 1:4340122/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCattta < 2:3849805/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAACCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttatt < 1:3045080/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttatt < 1:850776/93‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttatt > 1:3450128/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttatt > 1:2580402/1‑93 (MQ=255)
aTTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttatt < 1:2736576/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGc < 2:1774389/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCAAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGc < 2:274389/93‑1 (MQ=255)
tGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTg > 2:2235939/1‑93 (MQ=255)
tGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCA‑TTATTTGCTGa < 2:783723/93‑1 (MQ=255)
gCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAt < 1:3179078/93‑1 (MQ=255)
tAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAttt > 1:3516518/1‑93 (MQ=255)
tAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAttt < 2:436206/93‑1 (MQ=255)
tAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAttt > 1:3990136/1‑93 (MQ=255)
aaTCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTa < 1:4345171/93‑1 (MQ=255)
aTCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAg > 1:72681/1‑93 (MQ=255)
tCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGc < 2:2038742/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGGTTAAACGGGCTGTTGCCGGCGTTACGCGACCTGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAATGCCTTTATTTGCTGTTTTAcccc > 2:2888459/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc > 1:174826/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc < 1:1770168/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc > 1:4052412/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc > 2:956410/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCt < 1:1790021/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTc < 1:4199635/93‑1 (MQ=255)
cTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCg < 2:309639/93‑1 (MQ=255)
tGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCGCTCGc > 1:973115/1‑93 (MQ=255)
ggATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGcc > 2:1629121/1‑93 (MQ=255)
aTTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCAc > 2:2434574/1‑93 (MQ=255)
aTTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCAc > 1:206167/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTc < 1:4596752/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCa < 1:2676010/93‑1 (MQ=255)
aCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCAt > 2:4126834/1‑93 (MQ=255)
cGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCAtt < 2:4549037/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtc < 2:2261712/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtc > 1:2051617/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtct < 1:2147132/93‑1 (MQ=255)
tGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCg > 1:3796141/1‑93 (MQ=255)
gTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCgg > 2:4398208/1‑93 (MQ=255)
|
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGG > NC_000913/1988390‑1988569
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGGCGTT > NC_000913/1988387‑1988573
|
ATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATTCTGGATTAAACGGGCTGTTG > SRR4302535.2486325/1‑94 (MQ=60)
TATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGC > SRR4302535.3340906/1‑94 (MQ=60)
TATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGC > SRR4302535.2345689/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA > SRR4302535.4093202/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA < SRR4302535.677807/94‑1 (MQ=60)
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAG > SRR4302535.1144552/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG < SRR4302535.3197567/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302535.1490759/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG < SRR4302535.1678076/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG < SRR4302535.724611/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGC < SRR4302535.702797/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCG > SRR4302535.2166384/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGT < SRR4302535.93946/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTA > SRR4302535.175329/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTA < SRR4302535.2175648/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGCTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAC < SRR4302535.4540379/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACG > SRR4302535.3130249/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACG < SRR4302535.1113188/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGC > SRR4302535.718134/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCG > SRR4302535.663679/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGA > SRR4302535.4037842/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAA > SRR4302535.832715/1‑94 (MQ=60)
TGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAT < SRR4302535.3697073/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCCGGCGTTACGCGAAATGGTG > SRR4302535.3405533/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTG < SRR4302535.1617478/94‑1 (MQ=60)
GACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTG > SRR4302535.2748625/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGG < SRR4302535.96565/94‑1 (MQ=60)
CTTGGCAGCATTGATTAAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCT < SRR4302535.4248342/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCT > SRR4302535.640719/1‑94 (MQ=60)
TGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTC < SRR4302535.647374/94‑1 (MQ=60)
GCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCC > SRR4302535.2894762/1‑94 (MQ=60)
GCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCC > SRR4302535.3003250/1‑94 (MQ=60)
GCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCC < SRR4302535.3155140/94‑1 (MQ=60)
GAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCG < SRR4302535.1251432/94‑1 (MQ=60)
AGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGC > SRR4302535.927324/1‑94 (MQ=60)
CATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCAT < SRR4302535.4480043/94‑1 (MQ=60)
ATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATG < SRR4302535.2035597/94‑1 (MQ=60)
ATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATG > SRR4302535.1054086/1‑94 (MQ=60)
TGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTT < SRR4302535.3576146/94‑1 (MQ=60)
GATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTG > SRR4302535.4688174/1‑94 (MQ=60)
GATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTG < SRR4302535.56809/94‑1 (MQ=60)
ATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGA > SRR4302535.3725513/1‑94 (MQ=60)
ATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGA > SRR4302535.840820/1‑94 (MQ=60)
TTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAG > SRR4302535.1582186/1‑94 (MQ=60)
TTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAG < SRR4302535.4710791/94‑1 (MQ=60)
TCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGC > SRR4302535.4702899/1‑94 (MQ=60)
TCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGC < SRR4302535.4000110/94‑1 (MQ=60)
CAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCT > SRR4302535.3516588/1‑94 (MQ=60)
ACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGG < SRR4302535.45417/94‑1 (MQ=60)
AACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCA > SRR4302535.363699/1‑94 (MQ=60)
TTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCA > SRR4302535.2734885/1‑94 (MQ=60)
TTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCA > SRR4302535.2002164/1‑94 (MQ=60)
TATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCAT < SRR4302535.1176782/94‑1 (MQ=60)
ATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATT > SRR4302535.1339165/1‑94 (MQ=60)
TGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTT > SRR4302535.509590/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTAT < SRR4302535.4369808/94‑1 (MQ=60)
GATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATT > SRR4302535.3474111/1‑94 (MQ=60)
GATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATT > SRR4302535.2598938/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAACCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTT < SRR4302535.3066410/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTT < SRR4302535.856766/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTT < SRR4302535.2756098/94‑1 (MQ=60)
TGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGA > SRR4302535.1412892/1‑94 (MQ=60)
TGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGA > SRR4302535.2083313/1‑94 (MQ=60)
GCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATT < SRR4302535.3201060/94‑1 (MQ=60)
CTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTT < SRR4302535.1773363/94‑1 (MQ=60)
CTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTT > SRR4302535.3540952/1‑94 (MQ=60)
CTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTT > SRR4302535.3540834/1‑94 (MQ=60)
CTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTT > SRR4302535.4017427/1‑94 (MQ=60)
AATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAG < SRR4302535.4374899/94‑1 (MQ=60)
AATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAG < SRR4302535.2506198/94‑1 (MQ=60)
AATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAG > SRR4302535.73210/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCC > SRR4302535.4080158/1‑94 (MQ=60)
CATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCC > SRR4302535.176035/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCT < SRR4302535.1782998/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTC < SRR4302535.1802969/94‑1 (MQ=60)
GCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCG < SRR4302535.4228373/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCGCTCGC > SRR4302535.980020/1‑94 (MQ=60)
GATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCAC > SRR4302535.207583/1‑94 (MQ=60)
TTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGT > SRR4302535.4656275/1‑94 (MQ=60)
AAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCA < SRR4302535.4628025/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCAT < SRR4302535.2695156/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTC > SRR4302535.2066390/1‑94 (MQ=60)
GGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCT < SRR4302535.4347439/94‑1 (MQ=60)
GCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTC > SRR4302535.3145522/1‑94 (MQ=60)
GCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTC < SRR4302535.2162577/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCG > SRR4302535.3822309/1‑94 (MQ=60)
GCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGGCGTT > SRR4302535.4617528/1‑94 (MQ=60)
|
ATATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGGCGTT > NC_000913/1988387‑1988573
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
