Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,988,480 |
A→G |
L259L (TTA→TTG) |
tyrP → |
tyrosine‑specific transport system |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,988,480 | 0 | A | G | 99.6%
| 740.3
/ ‑6.5
| 231 | L259L (TTA→TTG) | tyrP | tyrosine‑specific transport system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (129/101); minor base T (1/0); total (130/101) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGG > NC_000913/1988390‑1988569
|
tatTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCa < 1:5628107/93‑1 (MQ=255)
tatTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCa > 1:6075926/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAgg < 2:4908144/93‑1 (MQ=255)
ttttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAgg > 1:4419118/1‑93 (MQ=255)
ttttCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAgg > 1:3076192/1‑93 (MQ=255)
cTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGtt < 1:7380711/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTa > 1:6308963/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTa < 2:88083/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAc > 2:1162130/1‑93 (MQ=255)
ggCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAc < 2:5864678/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcg > 1:7088788/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcgcg > 2:781358/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTAcgcg > 1:7664439/1‑93 (MQ=255)
ggTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGa > 2:257114/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaa > 2:2488685/1‑93 (MQ=255)
gTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaa < 1:2713659/93‑1 (MQ=255)
tGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaaa < 2:5470652/93‑1 (MQ=255)
gggCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGaaa < 2:7690781/92‑1 (MQ=255)
ggCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAt < 2:7933377/93‑1 (MQ=255)
ggCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAt < 2:4380580/93‑1 (MQ=255)
gCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtg > 1:3790135/1‑93 (MQ=255)
cGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtgg < 1:6484734/93‑1 (MQ=255)
gACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggg > 1:1741949/1‑92 (MQ=255)
gACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtgag > 1:1741947/1‑91 (MQ=255)
gACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTGTATGGGATTGGTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggt < 1:2059975/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg > 2:1807410/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg > 2:1418259/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg > 2:6561736/1‑93 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg < 2:2644668/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg < 2:3581478/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtg < 1:3729455/93‑1 (MQ=255)
cGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAtggtgg < 2:7232989/93‑1 (MQ=255)
gCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGc > 2:5187482/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCct > 2:1928127/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCct > 2:7390655/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCct > 1:1767892/1‑93 (MQ=255)
ttGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCct > 2:4998796/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctc < 1:261385/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctc > 1:4143103/1‑93 (MQ=255)
ggCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCctct > 2:7628240/1‑93 (MQ=255)
gcagcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCtctc > 1:932613/1‑93 (MQ=255)
gcagcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCtctc < 1:7926798/93‑1 (MQ=255)
gcaTTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGc > 1:2650638/1‑93 (MQ=255)
ttGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATg > 1:5457899/1‑93 (MQ=255)
ttGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATg < 1:520808/93‑1 (MQ=255)
ttGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATg > 2:6859070/1‑93 (MQ=255)
gATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGtt > 2:5230761/1‑93 (MQ=255)
aTTCAACACCTTTTAGGGGATTGCTGGTTAATCATGCTGGATTAACGGGGTTGTTGCGGGTTTTCCGAAAAAGGGGGCCCTCCCCGCATTTTg < 2:3797418/93‑1 (MQ=255)
aTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTg > 1:124149/1‑93 (MQ=255)
aTTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTg > 1:4792313/1‑93 (MQ=255)
ttCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGa > 1:1749176/1‑93 (MQ=255)
ttCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGa < 2:5316250/93‑1 (MQ=255)
ttCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGa < 2:6107459/93‑1 (MQ=255)
aacaacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCt > 1:7793171/1‑93 (MQ=255)
acagcCTCTATGGGATTTCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACCGGCTGTTGCAGGCGTTGCGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTg < 2:1595376/93‑1 (MQ=255)
acaacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTg > 1:3620343/1‑93 (MQ=255)
acaacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTg < 1:1182398/93‑1 (MQ=255)
caacCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGCAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTgg > 2:4499175/1‑93 (MQ=255)
acCTTTATGGGATTGCTGGCTAAACATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCa < 2:4292876/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAg < 1:7211424/93‑1 (MQ=255)
ccTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAg > 2:3520776/1‑93 (MQ=255)
tttATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAggg > 1:4890771/1‑91 (MQ=255)
tttATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTg > 2:7007139/1‑93 (MQ=255)
tATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCa > 2:575842/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatt > 2:6510889/1‑93 (MQ=255)
tGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatt < 1:6656191/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATTGTGACCTCTACCCATGATGAGCTGGCAGTGCtttta > 1:4060211/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCattta > 2:3089337/1‑93 (MQ=255)
ggATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCattta < 1:6427836/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCTAGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGTTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCattta < 2:2905777/93‑1 (MQ=255)
gATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCatttat > 2:6272734/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTg < 1:5761545/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGc < 1:4023202/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGc < 1:5254936/93‑1 (MQ=255)
cTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCt > 2:5654324/1‑93 (MQ=255)
nggCTAANCATGCTGGATTANNCNGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTg < 1:1849042/92‑1 (MQ=255)
ggCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGa > 2:402463/1‑93 (MQ=255)
cTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAtt < 2:6984434/93‑1 (MQ=255)
cTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAtt > 2:2170305/1‑93 (MQ=255)
tAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAttt < 1:326738/93‑1 (MQ=255)
tAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCAAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAttt < 2:3702878/93‑1 (MQ=255)
aaTCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTa > 1:3154203/1‑93 (MQ=255)
aTCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAg > 2:1257962/1‑93 (MQ=255)
tCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGc > 1:3466173/1‑93 (MQ=255)
cATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGcc < 1:1441107/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc < 1:3148581/93‑1 (MQ=255)
aTGCTGGATGAATCGGGCTGTTGCAGGCGTGACGCGAAATGGTGGCCTGTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGccc < 1:4769506/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCt > 1:4371454/1‑93 (MQ=255)
tGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCt > 1:6215859/1‑93 (MQ=255)
gCTGGATTAAACGGGTTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTc < 1:5525578/93‑1 (MQ=255)
gCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTc > 2:1437054/1‑93 (MQ=255)
tGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGc < 2:1467391/93‑1 (MQ=255)
tAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGt > 2:4774159/1‑93 (MQ=255)
aaCGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCa < 1:3919720/93‑1 (MQ=255)
ggCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtc > 2:2767886/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtc > 1:7056597/1‑93 (MQ=255)
ggCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATGTAGCCCTCGCCACGTCATTtc > 2:7507722/1‑93 (MQ=255)
gCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtct > 1:2331939/1‑93 (MQ=255)
cTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTtctc < 1:2524686/93‑1 (MQ=255)
tGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCg > 2:3107279/1‑93 (MQ=255)
|
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGG > NC_000913/1988390‑1988569
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGGCGTT > NC_000913/1988388‑1988573
|
TATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGC < SRR4302543.1329552/94‑1 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA > SRR4302543.5796086/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA > SRR4302543.6133518/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA > SRR4302543.1761969/1‑94 (MQ=60)
ATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCA > SRR4302543.1777567/1‑94 (MQ=60)
TATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAG < SRR4302543.5679394/94‑1 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302543.4459169/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302543.3103859/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302543.3103858/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302543.6679594/1‑94 (MQ=60)
ATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGG > SRR4302543.4056756/1‑94 (MQ=60)
TTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGC < SRR4302543.6630160/94‑1 (MQ=60)
TTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGC < SRR4302543.6982208/94‑1 (MQ=60)
TTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCG > SRR4302543.4422860/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTT > SRR4302543.5270431/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTA < SRR4302543.7451652/94‑1 (MQ=60)
CTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTA > SRR4302543.6368293/1‑94 (MQ=60)
CTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTA > SRR4302543.6368294/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGTCTGTTGCAGGCGTTACG > SRR4302543.3083006/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACG > SRR4302543.7157627/1‑94 (MQ=60)
CAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCG > SRR4302543.7737087/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGA > SRR4302543.7942455/1‑94 (MQ=60)
GTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAA < SRR4302543.2738318/94‑1 (MQ=60)
TGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAT < SRR4302543.3256929/94‑1 (MQ=60)
TGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAAT < SRR4302543.5535048/94‑1 (MQ=60)
GGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATG > SRR4302543.3823526/1‑94 (MQ=60)
GCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTccgagcactgg > SRR4302543.4084738/1‑83 (MQ=60)
GCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGG > SRR4302543.4084739/1‑94 (MQ=60)
CGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGag > SRR4302543.1757491/1‑92 (MQ=60)
CGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGT < SRR4302543.6545833/94‑1 (MQ=60)
CGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGT > SRR4302543.1757492/1‑94 (MQ=60)
CGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGG > SRR4302543.1757493/1‑94 (MQ=60)
GACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTGTATGGGATTGGTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTG < SRR4302543.2078402/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGG < SRR4302543.3554846/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGG < SRR4302543.3762256/94‑1 (MQ=60)
ACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGG < SRR4302543.3762255/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGC > SRR4302543.6124058/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCT > SRR4302543.6308363/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCT > SRR4302543.1783703/1‑94 (MQ=60)
CTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCT > SRR4302543.886782/1‑94 (MQ=60)
TTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTC > SRR4302543.4180527/1‑94 (MQ=60)
TTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTC > SRR4302543.7862269/1‑94 (MQ=60)
TGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCT < SRR4302543.263672/94‑1 (MQ=60)
GGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTC > SRR4302543.940766/1‑94 (MQ=60)
GCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCC < SRR4302543.8001234/94‑1 (MQ=60)
AGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGC < SRR4302543.567019/94‑1 (MQ=60)
AGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGC > SRR4302543.4105668/1‑94 (MQ=60)
AGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGC > SRR4302543.2674670/1‑94 (MQ=60)
CATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCAT > SRR4302543.2570309/1‑94 (MQ=60)
ATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATG > SRR4302543.5507372/1‑94 (MQ=60)
ATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATG > SRR4302543.5507502/1‑94 (MQ=60)
TTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGT < SRR4302543.525641/94‑1 (MQ=60)
GATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTG > SRR4302543.4501930/1‑94 (MQ=60)
GATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTG > SRR4302543.4836115/1‑94 (MQ=60)
GATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTG > SRR4302543.125270/1‑94 (MQ=60)
ATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGA > SRR4302543.1764801/1‑94 (MQ=60)
ATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGA > SRR4302543.1764800/1‑94 (MQ=60)
CAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCT > SRR4302543.7866618/1‑94 (MQ=60)
AACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTG > SRR4302543.2659002/1‑94 (MQ=60)
AACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTG > SRR4302543.3652243/1‑94 (MQ=60)
ACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGG < SRR4302543.1193084/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGG > SRR4302543.7625185/1‑94 (MQ=60)
CAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGC > SRR4302543.3227007/1‑94 (MQ=60)
AACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCA < SRR4302543.2724524/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAG > SRR4302543.3356828/1‑94 (MQ=60)
CCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGT < SRR4302543.7148514/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGT < SRR4302543.7281330/94‑1 (MQ=60)
CCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGT < SRR4302543.1244531/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTG < SRR4302543.6530828/94‑1 (MQ=60)
CTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGGG > SRR4302543.4935356/1‑94 (MQ=60)
TTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGC > SRR4302543.367842/1‑94 (MQ=60)
ATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATT < SRR4302543.3681776/94‑1 (MQ=60)
TGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTT < SRR4302543.6719035/94‑1 (MQ=60)
GGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATTGTGACCTCTACCCATGATGAGCTGGCAGTGCTTTTA > SRR4302543.4096571/1‑94 (MQ=60)
GGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTA > SRR4302543.4096572/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTAT < SRR4302543.2662681/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTAT < SRR4302543.6488401/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTT > SRR4302543.4872756/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTT < SRR4302543.7847642/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTG < SRR4302543.4257481/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGC < SRR4302543.5814033/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCT < SRR4302543.5302329/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCT < SRR4302543.4059144/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTG < SRR4302543.534641/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTG < SRR4302543.5988199/94‑1 (MQ=60)
NGGCTAANCATGCTGGATTANNCNGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGA < SRR4302543.1865673/94‑1 (MQ=60)
GGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGAT > SRR4302543.2260950/1‑94 (MQ=60)
GCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATT < SRR4302543.6215231/94‑1 (MQ=60)
TAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTA > SRR4302543.3182585/1‑94 (MQ=60)
TAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTA < SRR4302543.329702/94‑1 (MQ=60)
TAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTA > SRR4302543.3182584/1‑94 (MQ=60)
AATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAG > SRR4302543.81505/1‑94 (MQ=60)
AATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAG < SRR4302543.2122629/94‑1 (MQ=60)
ATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGC > SRR4302543.3497219/1‑94 (MQ=60)
ATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGC > SRR4302543.1788811/1‑94 (MQ=60)
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AAACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCA < SRR4302543.1667853/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGTTGCAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCAT < SRR4302543.7236401/94‑1 (MQ=60)
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TATATTTTCTGGCAGGTGGCGACGCTTGGCAGCATTGATTCAACAACCTTTATGGGATTGCTGGCTAATCATGCTGGATTAAACGGGCTGTTACAGGCGTTACGCGAAATGGTGGCCTCTCCGCATGTTGAGCTGGCAGTGCATTTATTTGCTGATTTAGCCCTCGCCACGTCATTTCTCGGCGTT > NC_000913/1988388‑1988573
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
