Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,185,017 |
Δ1 bp |
coding (38/339 nt) |
b2107 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,185,014 | 0 | T | . | 99.3%
| 659.2
/ ‑3.4
| 146 | coding (35/339 nt) | b2107 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base . (84/61); minor base C (0/1); total (84/62) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.25e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TATTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAG > NC_000913/2184922‑2185101
|
tatTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCt > 1:1899027/1‑93 (MQ=255)
atTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtt > 1:1246279/1‑93 (MQ=255)
atTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCtt > 1:4564529/1‑93 (MQ=255)
cAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTa > 1:3779562/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAc > 1:3536156/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAc < 1:4659808/93‑1 (MQ=255)
ggAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAcc > 2:2582885/1‑93 (MQ=255)
ggAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAcc > 1:1450898/1‑93 (MQ=255)
agAAAGATATGCGTCTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTAATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAcc < 2:4409307/92‑1 (MQ=255)
gAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCa > 2:1369217/1‑93 (MQ=255)
aaGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGt < 1:1391512/93‑1 (MQ=255)
atatGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgcc < 2:3170792/93‑1 (MQ=255)
tatGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTgccg > 1:2244918/1‑93 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTgg > 2:2827892/1‑93 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTgg < 1:2492745/93‑1 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTgg > 2:1529138/1‑93 (MQ=255)
gACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGGATATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑CTTGCTGGCTACCAGTGCCGCCTgg > 2:2827891/1‑93 (MQ=255)
cTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGc > 1:534793/1‑93 (MQ=255)
cTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGc > 1:4424726/1‑93 (MQ=255)
cTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATAACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGc < 2:2772430/93‑1 (MQ=255)
tGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGcc > 2:3435336/1‑93 (MQ=255)
gATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCg > 1:319048/1‑93 (MQ=255)
gATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCg > 1:3482369/1‑93 (MQ=255)
atatTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGc < 1:3551088/93‑1 (MQ=255)
atTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCAc > 2:3967717/1‑93 (MQ=255)
atTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCAc > 2:1794130/1‑93 (MQ=255)
tACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCa < 1:1521292/93‑1 (MQ=255)
tACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCa < 1:994648/93‑1 (MQ=255)
gATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGACa > 2:1755559/1‑93 (MQ=255)
aTCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAc < 1:4272047/93‑1 (MQ=255)
aTCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAc > 1:4177826/1‑93 (MQ=255)
ccccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcg < 2:966847/93‑1 (MQ=255)
cccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcgc > 2:2282552/1‑93 (MQ=255)
ccAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACcgcg > 2:4261760/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCggg > 2:1667241/1‑93 (MQ=255)
aaaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCggg > 2:744909/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt > 1:2225565/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt < 1:849036/93‑1 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt > 1:4317018/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt > 1:700337/1‑93 (MQ=255)
aaGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGt < 2:162804/93‑1 (MQ=255)
tGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCg > 1:3949443/1‑93 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGa > 2:1574253/1‑93 (MQ=255)
ggAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGa < 1:3847430/93‑1 (MQ=255)
agagTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGAcc > 2:1165969/1‑93 (MQ=255)
agagTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGAcc > 2:3804170/1‑93 (MQ=255)
gTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAt > 2:2147636/1‑93 (MQ=255)
tttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATa < 1:4285668/93‑1 (MQ=255)
tttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATa < 2:81689/93‑1 (MQ=255)
ttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATAc < 2:3537235/93‑1 (MQ=255)
ttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATAc < 1:1004865/93‑1 (MQ=255)
ttATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATAc > 2:3293581/1‑93 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCt > 1:242400/1‑93 (MQ=255)
aTGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGCCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGCACAAtccac > 1:351721/1‑89 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTc > 1:4545038/1‑93 (MQ=255)
tGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTc > 2:3060636/1‑93 (MQ=255)
aCCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCgg > 1:2754749/1‑93 (MQ=255)
ccATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCggg > 2:684650/1‑93 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGa < 2:2944713/93‑1 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGa > 1:3441067/1‑93 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGa > 2:3048062/1‑93 (MQ=255)
cATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGa > 2:112430/1‑93 (MQ=255)
aTTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGaa < 2:4325368/93‑1 (MQ=255)
aTTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGC‑CCTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGaa < 1:3273569/93‑1 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAt < 1:4126353/93‑1 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAt > 2:3713423/1‑93 (MQ=255)
ttAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAt > 1:3403058/1‑93 (MQ=255)
tAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAtt < 2:298779/93‑1 (MQ=255)
tAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAtt < 2:2330691/93‑1 (MQ=255)
aaaaGAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTc < 2:2792253/93‑1 (MQ=255)
aaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTa > 1:634142/1‑93 (MQ=255)
aaTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTa > 1:1268396/1‑93 (MQ=255)
aTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTaa < 1:170116/93‑1 (MQ=255)
aTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTaa > 1:4673032/1‑93 (MQ=255)
aTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTaa < 1:4129248/93‑1 (MQ=255)
aTAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTGGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTaa > 2:3781441/1‑93 (MQ=255)
tAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGAGCAATACCTCCGGAATTTCTAAg > 2:4068321/1‑93 (MQ=255)
tAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAg > 2:1429686/1‑93 (MQ=255)
tAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAg > 1:4421292/1‑93 (MQ=255)
aaGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGt > 1:3154584/1‑93 (MQ=255)
aaGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGt > 1:2590373/1‑93 (MQ=255)
aGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTa < 1:3389203/93‑1 (MQ=255)
aGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTa < 2:769932/93‑1 (MQ=255)
gATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAt < 1:1710114/93‑1 (MQ=255)
aTGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATg > 2:3933380/1‑93 (MQ=255)
aTGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATg < 1:2418203/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAg < 1:3886237/93‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAg > 2:1083012/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGt > 2:2397666/1‑93 (MQ=255)
ttGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGt < 1:1488519/93‑1 (MQ=255)
ttGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGt < 2:4351194/93‑1 (MQ=255)
tGCGGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGtt < 2:3199016/93‑1 (MQ=255)
cTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTaa < 1:543112/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAag < 1:2502115/93‑1 (MQ=255)
tGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAag > 1:1051677/1‑93 (MQ=255)
tGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAAGACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAag > 2:4603127/1‑93 (MQ=255)
gggTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagc < 1:2329446/93‑2 (MQ=255)
gTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagcag > 1:1883718/1‑93 (MQ=255)
gTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagcag > 1:3983575/1‑93 (MQ=255)
gTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAagcag < 2:3239885/93‑1 (MQ=255)
|
TATTGTATGGCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAG > NC_000913/2184922‑2185101
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGC > NC_000913/2184931‑2185110
|
GCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTA > SRR4302535.3805648/1‑94 (MQ=60)
CAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTAC > SRR4302535.3560703/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC < SRR4302535.4691327/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC > SRR4302535.4305188/1‑94 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC < SRR4302535.1479904/94‑1 (MQ=60)
AGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACC > SRR4302535.1461276/1‑94 (MQ=60)
AAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGT > SRR4302535.2485736/1‑94 (MQ=60)
AAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTG < SRR4302535.1401444/94‑1 (MQ=60)
AAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTG < SRR4302535.4157600/94‑1 (MQ=60)
AGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGC > SRR4302535.3963507/1‑94 (MQ=60)
ATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCG > SRR4302535.2260882/1‑94 (MQ=60)
TATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGC > SRR4302535.2291468/1‑94 (MQ=60)
ATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCC > SRR4302535.4018500/1‑94 (MQ=60)
GACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGG < SRR4302535.2510734/94‑1 (MQ=60)
ACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGC > SRR4302535.4455032/1‑94 (MQ=60)
ACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGC > SRR4302535.442995/1‑94 (MQ=60)
ACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGC > SRR4302535.538532/1‑94 (MQ=60)
CTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCC > SRR4302535.4608201/1‑94 (MQ=60)
CTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCC > SRR4302535.1352885/1‑94 (MQ=60)
TGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCG > SRR4302535.3506552/1‑94 (MQ=60)
TGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCG > SRR4302535.321256/1‑94 (MQ=60)
GATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGC > SRR4302535.677098/1‑94 (MQ=60)
ATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCA < SRR4302535.3575730/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAG < SRR4302535.1001711/94‑1 (MQ=60)
TACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAG < SRR4302535.1532250/94‑1 (MQ=60)
GATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCAC > SRR4302535.4206424/1‑94 (MQ=60)
ATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACC < SRR4302535.4301293/94‑1 (MQ=60)
CAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGG < SRR4302535.3670175/94‑1 (MQ=60)
AAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGT > SRR4302535.4346549/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGT > SRR4302535.2241400/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGT > SRR4302535.705248/1‑94 (MQ=60)
AAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTT < SRR4302535.855008/94‑1 (MQ=60)
AAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTT < SRR4302535.937994/94‑1 (MQ=60)
AGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTC > SRR4302535.2101858/1‑94 (MQ=60)
AGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTC < SRR4302535.3886922/94‑1 (MQ=60)
AGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTC < SRR4302535.3423705/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCG > SRR4302535.3976408/1‑94 (MQ=60)
GGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGAC < SRR4302535.3873915/94‑1 (MQ=60)
GAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACC < SRR4302535.3481856/94‑1 (MQ=60)
TTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATAC < SRR4302535.4314986/94‑1 (MQ=60)
TTATGACGATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACC < SRR4302535.1713330/94‑1 (MQ=60)
TTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACC < SRR4302535.1012004/94‑1 (MQ=60)
TATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCT < SRR4302535.3101359/94‑1 (MQ=60)
TATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCT > SRR4302535.244062/1‑94 (MQ=60)
TATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGCCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGcacaatccac > SRR4302535.354147/1‑84 (MQ=60)
ATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTC > SRR4302535.4576122/1‑94 (MQ=60)
ATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTC > SRR4302535.111586/1‑94 (MQ=60)
GACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGG > SRR4302535.2774386/1‑94 (MQ=60)
taccatgaaaaataatagtgtgctggttgcgcTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGG < SRR4302535.490536/62‑1 (MQ=60)
CCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGA > SRR4302535.3464996/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAT < SRR4302535.1772862/94‑1 (MQ=60)
ATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAT > SRR4302535.3426741/1‑94 (MQ=60)
ATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGC‑CCTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAAT < SRR4302535.3296306/94‑1 (MQ=60)
TTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATT < SRR4302535.4154589/94‑1 (MQ=60)
TTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTGGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATT < SRR4302535.571928/94‑1 (MQ=60)
TAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTT < SRR4302535.2549666/94‑1 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA > SRR4302535.1277467/1‑94 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA < SRR4302535.3272565/94‑1 (MQ=60)
AAATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTA > SRR4302535.638562/1‑94 (MQ=60)
AATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAA > SRR4302535.4572267/1‑94 (MQ=60)
AATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAA > SRR4302535.4704588/1‑94 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG < SRR4302535.171295/94‑1 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG > SRR4302535.4451569/1‑94 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG < SRR4302535.2438922/94‑1 (MQ=60)
ATAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAG < SRR4302535.4157502/94‑1 (MQ=60)
TAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGT > SRR4302535.2608974/1‑94 (MQ=60)
TAAGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGT > SRR4302535.3176498/1‑94 (MQ=60)
AGATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTAT < SRR4302535.3412781/94‑1 (MQ=60)
GATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATG < SRR4302535.1722477/94‑1 (MQ=60)
ATGTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGA < SRR4302535.2435613/94‑1 (MQ=60)
GTTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGT < SRR4302535.3912894/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTT < SRR4302535.1499192/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAG > SRR4302535.3543065/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAG < SRR4302535.546908/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAG > SRR4302535.1059155/1‑94 (MQ=60)
TGGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGC < SRR4302535.2520159/94‑1 (MQ=60)
GGGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCA < SRR4302535.2346108/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAG > SRR4302535.1897295/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAG > SRR4302535.4010794/1‑94 (MQ=60)
TGCGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGcagct > SRR4302535.4451296/1‑89 (MQ=60)
CGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTC > SRR4302535.3778759/1‑94 (MQ=60)
CGC‑TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTC < SRR4302535.1062566/94‑1 (MQ=60)
gcTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCA > SRR4302535.4303056/3‑94 (MQ=60)
CTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCAT < SRR4302535.777938/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTCTCAT > SRR4302535.3113606/1‑94 (MQ=60)
TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATT < SRR4302535.2289679/94‑1 (MQ=60)
TTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATT < SRR4302535.977818/94‑1 (MQ=60)
TTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTG > SRR4302535.382789/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGCAGTTTCATTGC > SRR4302535.3562232/1‑94 (MQ=60)
|
GCAGGAAAGATATGCGACTGATATTACAGATCCCCAAAGTGGAGAGTTTATGACCATTAAAAATAAGATGTTGCTGGGTGCGCTTTTGCTGGTTACCAGTGCCGCCTGGGCCGCACCAGCCACCGCGGGTTCGACCAATACCTCGGGAATTTCTAAGTATGAGTTAAGTAGTTTCATTGC > NC_000913/2184931‑2185110
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
