Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,242,496 |
T→C |
G189G (GGT→GGC) |
yeiG → |
putative esterase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,242,496 | 0 | T | C | 100.0%
| 411.0
/ NA
| 129 | G189G (GGT→GGC) | yeiG | putative esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (77/52); total (77/52) |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
GGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCA > NC_000913/2242406‑2242585
|
gggTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGa < 1:4023941/93‑1 (MQ=255)
gggTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGa > 2:4523541/1‑93 (MQ=255)
gTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAgg > 2:1277643/1‑93 (MQ=255)
aaTACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACa > 2:2644993/1‑93 (MQ=255)
aTACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACaa > 1:957140/1‑93 (MQ=255)
tccacCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAAGCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACaaa < 2:3255644/91‑1 (MQ=255)
acCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAAt > 2:4465096/1‑93 (MQ=255)
cAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGc > 2:1254956/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCa < 1:1219034/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCa > 2:3801372/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATgg > 1:1804313/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATgg > 2:3591099/1‑93 (MQ=255)
gTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATgg < 2:4121407/93‑1 (MQ=255)
tttCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGc < 2:3352351/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGa < 1:1734565/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGa > 2:809825/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGaa > 2:1359321/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGaa > 1:1230361/1‑93 (MQ=255)
ccTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAAt > 2:1969373/1‑93 (MQ=255)
ccTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAAt > 2:534999/1‑93 (MQ=255)
tttGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATgg > 1:4155074/1‑93 (MQ=255)
tGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 1:4344878/93‑1 (MQ=255)
tGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGAAAAAAATGCATGGCTGGAATGGGa < 1:4566816/93‑1 (MQ=255)
gcncCANTNGTGAATCCGTGCANCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGAc < 1:1580952/93‑1 (MQ=255)
gcgcCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGAc < 1:118279/93‑1 (MQ=255)
gcCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCATAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAg < 1:3409693/93‑1 (MQ=255)
ccAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGt < 2:79577/93‑1 (MQ=255)
ccAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGt < 1:1557948/93‑1 (MQ=255)
cAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt > 1:2371094/1‑93 (MQ=255)
cAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt > 2:3327394/1‑93 (MQ=255)
cAATTGTGAAACCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGtt > 2:382628/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgc > 1:1122044/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgc > 2:2998109/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgc > 2:4197151/1‑93 (MQ=255)
aTTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgc < 1:3772225/93‑1 (MQ=255)
ttGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgcg > 1:3514663/1‑93 (MQ=255)
tgtgAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTgcgc > 2:3044573/1‑93 (MQ=255)
tgAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc < 1:2967954/93‑1 (MQ=255)
tgAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCAc > 2:3314112/1‑93 (MQ=255)
aaTCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTg > 1:672647/1‑93 (MQ=255)
tCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGAt > 1:4233158/1‑93 (MQ=255)
gTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTa > 2:2586842/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACGAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTAt > 2:1914415/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTAt > 2:1086018/1‑93 (MQ=255)
gCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCa < 2:2783660/93‑1 (MQ=255)
gCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCa < 1:2298496/93‑1 (MQ=255)
gCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCa > 1:3393456/1‑93 (MQ=255)
cGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcg > 2:3831916/1‑93 (MQ=255)
cGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcg > 1:4052339/1‑93 (MQ=255)
gTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcgc < 1:1533681/93‑1 (MQ=255)
gTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAAcgc > 2:3896761/1‑93 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACgcgc < 1:2516430/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACgcgc < 2:1456875/93‑1 (MQ=255)
ggggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACgcgc > 1:3091743/1‑93 (MQ=255)
gggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCa < 1:558394/93‑1 (MQ=255)
gggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCa < 1:2419130/93‑1 (MQ=255)
gggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCa > 2:1420658/1‑93 (MQ=255)
ggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAg > 1:1320625/1‑93 (MQ=255)
ggAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAg > 1:2193793/1‑93 (MQ=255)
gAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAgg < 1:67420/93‑1 (MQ=255)
aaTCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGa < 1:2886086/93‑1 (MQ=255)
aaTCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGa < 2:4672646/93‑1 (MQ=255)
tCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATg < 2:2198037/93‑1 (MQ=255)
tCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATg < 1:3779956/93‑1 (MQ=255)
cAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGc > 2:4257399/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGa > 2:2016021/1‑93 (MQ=255)
aaGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATATATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGa < 2:2268637/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGAt > 2:1231295/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGAt > 1:1339045/1‑93 (MQ=255)
aGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGAt > 2:2965348/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATc > 2:1483524/1‑93 (MQ=255)
gCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATc < 1:2144713/93‑1 (MQ=255)
gTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATccc > 1:345769/1‑93 (MQ=255)
gTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATccc < 1:400361/93‑1 (MQ=255)
tttAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCg > 2:579613/1‑93 (MQ=255)
tttAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCg > 1:3295654/1‑93 (MQ=255)
ttAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGa < 1:830167/93‑1 (MQ=255)
tAGCAGCTATTTAAGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGAc > 2:4502028/1‑93 (MQ=255)
gcagcTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGc < 2:50131/93‑1 (MQ=255)
cagcTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCt > 1:3265859/1‑93 (MQ=255)
agcTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCtt > 1:279987/1‑93 (MQ=255)
gcTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTa > 2:2287056/1‑93 (MQ=255)
gcTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTa > 1:957808/1‑93 (MQ=255)
cTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTAt < 1:3811406/93‑1 (MQ=255)
cTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTAt < 2:2896223/93‑1 (MQ=255)
tATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATc > 2:2572739/1‑93 (MQ=255)
tATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATc > 2:753154/1‑93 (MQ=255)
tATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATc < 2:368580/93‑1 (MQ=255)
tATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATc > 2:3618790/1‑93 (MQ=255)
tATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATc > 1:3592840/1‑93 (MQ=255)
aTTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCg > 2:629537/1‑93 (MQ=255)
tttAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGa < 1:3035704/93‑1 (MQ=255)
tttAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGa > 1:4564600/1‑93 (MQ=255)
ttAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 1:201132/93‑1 (MQ=255)
ttAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 1:190704/93‑1 (MQ=255)
ttAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAt < 2:2343043/93‑1 (MQ=255)
tAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATc > 1:1773649/1‑93 (MQ=255)
aGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCa < 1:1355903/93‑1 (MQ=255)
aGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCa < 2:648697/93‑1 (MQ=255)
aGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCa < 1:4121327/93‑1 (MQ=255)
|
GGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCA > NC_000913/2242406‑2242585
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGG > NC_000913/2242403‑2242587
|
TCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGC > SRR4302535.4138747/1‑94 (MQ=60)
ACCGGGAAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCACCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGC < SRR4302535.4073132/94‑1 (MQ=60)
CGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGACTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGA > SRR4302535.648765/1‑94 (MQ=60)
GGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAG < SRR4302535.4051472/94‑1 (MQ=60)
GGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGG > SRR4302535.1252084/1‑94 (MQ=60)
AATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAA > SRR4302535.963935/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCAT < SRR4302535.1227778/94‑1 (MQ=60)
CGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGG > SRR4302535.1817354/1‑94 (MQ=60)
TTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTG < SRR4302535.4137513/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAA > SRR4302535.1239156/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAA < SRR4302535.1747104/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAAT > SRR4302535.1852475/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATG < SRR4302535.36728/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGG > SRR4302535.4183520/1‑94 (MQ=60)
TGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGAC < SRR4302535.4374605/94‑1 (MQ=60)
TGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGAAAAAAATGCATGGCTGGAATGGGAC < SRR4302535.4597968/94‑1 (MQ=60)
GCNCCANTNGTGAATCCGTGCANCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACA < SRR4302535.1592364/94‑1 (MQ=60)
GCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACA < SRR4302535.119109/94‑1 (MQ=60)
GCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCATAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGT < SRR4302535.3433420/94‑1 (MQ=60)
CCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTT < SRR4302535.1569180/94‑1 (MQ=60)
CCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTT > SRR4302535.2388119/1‑94 (MQ=60)
AATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGC > SRR4302535.1130050/1‑94 (MQ=60)
ATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCG < SRR4302535.3798245/94‑1 (MQ=60)
ATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCG > SRR4302535.3539087/1‑94 (MQ=60)
TGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACT < SRR4302535.2988782/94‑1 (MQ=60)
GAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTG > SRR4302535.677342/1‑94 (MQ=60)
ATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGAT > SRR4302535.4262126/1‑94 (MQ=60)
AGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCA > SRR4302535.3417067/1‑94 (MQ=60)
GCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAG < SRR4302535.2314941/94‑1 (MQ=60)
CGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGT < SRR4302535.3862022/94‑1 (MQ=60)
CGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGT > SRR4302535.2294899/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACG > SRR4302535.4080084/1‑94 (MQ=60)
GTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCG < SRR4302535.1544730/94‑1 (MQ=60)
TGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGC > SRR4302535.879416/1‑94 (MQ=60)
TGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGC > SRR4302535.3113273/1‑94 (MQ=60)
GGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCA < SRR4302535.2534568/94‑1 (MQ=60)
GGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCA > SRR4302535.4337975/1‑94 (MQ=60)
GGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAG < SRR4302535.2436547/94‑1 (MQ=60)
GGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAG > SRR4302535.1330057/1‑94 (MQ=60)
GGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAG < SRR4302535.562299/94‑1 (MQ=60)
GGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAG > SRR4302535.2209426/1‑94 (MQ=60)
GGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGCACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAG < SRR4302535.2518117/94‑1 (MQ=60)
GAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGA < SRR4302535.67922/94‑1 (MQ=60)
AATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGAT < SRR4302535.2906505/94‑1 (MQ=60)
ATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATG < SRR4302535.3266152/94‑1 (MQ=60)
TCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGC < SRR4302535.3806044/94‑1 (MQ=60)
AAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGAT > SRR4302535.1348599/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATC > SRR4302535.3471337/1‑94 (MQ=60)
AGCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATC > SRR4302535.161483/1‑94 (MQ=60)
GCGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCC < SRR4302535.2160142/94‑1 (MQ=60)
CGTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCC > SRR4302535.348150/1‑94 (MQ=60)
GTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCG < SRR4302535.403165/94‑1 (MQ=60)
GTTTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCG > SRR4302535.3318568/1‑94 (MQ=60)
TTAGCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGAC < SRR4302535.835982/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCT > SRR4302535.3288548/1‑94 (MQ=60)
CAGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTT > SRR4302535.281939/1‑94 (MQ=60)
AGCTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTA > SRR4302535.964608/1‑94 (MQ=60)
CTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATC > SRR4302535.3617758/1‑94 (MQ=60)
CTATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATC < SRR4302535.3837702/94‑1 (MQ=60)
ATTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGA > SRR4302535.4595747/1‑94 (MQ=60)
TTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAT < SRR4302535.2972657/94‑1 (MQ=60)
TTTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGAT < SRR4302535.3056959/94‑1 (MQ=60)
TTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATC < SRR4302535.202504/94‑1 (MQ=60)
TTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATC < SRR4302535.192022/94‑1 (MQ=60)
TTAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATC > SRR4302535.1786500/1‑94 (MQ=60)
TAGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCA > SRR4302535.1385227/1‑94 (MQ=60)
AGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAG < SRR4302535.4149530/94‑1 (MQ=60)
AGGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAG < SRR4302535.1365604/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGG < SRR4302535.2117417/94‑1 (MQ=60)
|
TCCGGGTAAATACACCAGCGTTTCGGCCTTTGCGCCAATTGTGAATCCGTGCAGCGTCCCGTGGGGAATCAAAGCGTTTAGCAGCTATTTAGGTGAGGACAAAAATGCATGGCTGGAATGGGACAGTTGCGCACTGATGTATGCCAGTAACGCGCAGGATGCGATCCCGACGCTTATCGATCAGG > NC_000913/2242403‑2242587
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
