Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,008,642 |
C→T |
A198A (GCC→GCT) |
b2873 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,008,642 | 0 | C | T | 99.4%
| 637.2
/ ‑5.5
| 178 | A198A (GCC→GCT) | b2873 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (72/105); total (73/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 |
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCAC > NC_000913/3008552‑3008730
|
aTTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATcgctgc > 2:3216497/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa < 2:1471690/93‑1 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa < 2:144077/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAgg < 2:1570628/93‑1 (MQ=255)
aCGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAgg < 2:376294/93‑1 (MQ=255)
gccgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGt < 2:2875255/93‑1 (MQ=255)
gccgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGt < 2:1404148/93‑1 (MQ=255)
cgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTa > 2:1658003/1‑93 (MQ=255)
cgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTa < 1:38522/93‑1 (MQ=255)
cgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGGTa > 1:3332302/1‑93 (MQ=255)
gcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTaa < 1:4059151/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTaa > 2:658482/1‑93 (MQ=255)
cTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAc < 1:1220765/93‑1 (MQ=255)
cTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAc < 1:647623/93‑1 (MQ=255)
ttGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAcc < 1:2669824/93‑1 (MQ=255)
gCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgc < 1:4601725/93‑1 (MQ=255)
aTGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgcgc > 1:606790/1‑93 (MQ=255)
tGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgcgcc < 1:1465524/93‑1 (MQ=255)
gcgcgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATc < 2:2771654/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAt < 2:2125968/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAt < 1:44916/93‑1 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 1:427340/1‑93 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 1:3756406/1‑93 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 1:2676826/1‑93 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 2:2024247/1‑93 (MQ=255)
cTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGcc < 1:2338260/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGcc < 1:1080353/93‑1 (MQ=255)
gACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCtt < 2:2460839/93‑1 (MQ=255)
gACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCtt < 2:2978905/93‑1 (MQ=255)
accaccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTg < 1:2742715/93‑1 (MQ=255)
ccaccGTGCGCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGa < 1:4158334/93‑1 (MQ=255)
caccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAg < 2:4024563/93‑1 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGt > 2:484571/1‑93 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGt > 2:3529952/1‑93 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGt > 1:793915/1‑93 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGt < 1:2248803/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATTGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTc < 2:199772/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTc < 1:3410232/93‑1 (MQ=255)
ccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTc > 1:4324294/1‑93 (MQ=255)
tGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGcc > 1:243103/1‑93 (MQ=255)
tGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGcc > 1:78944/1‑93 (MQ=255)
tGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGcc > 1:201318/1‑93 (MQ=255)
cACCCGGAAGATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCct < 1:3022954/93‑1 (MQ=255)
cACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCct > 2:4115087/1‑93 (MQ=255)
ccccGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctc < 2:4190876/92‑1 (MQ=255)
aCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctc > 2:2321313/1‑93 (MQ=255)
aCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctc < 1:1090869/93‑1 (MQ=255)
aCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGACTTGAGTCGCCctc > 2:1852380/1‑93 (MQ=255)
cccGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctct < 1:3648572/93‑1 (MQ=255)
ccGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTg < 1:414814/93‑1 (MQ=255)
gAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGaa < 2:3380151/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAt < 2:4160680/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATg > 1:2974144/1‑93 (MQ=255)
aaTGATGCGGCTACCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATgg > 2:3150011/1‑92 (MQ=255)
atgatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCg > 1:1335101/1‑93 (MQ=255)
tgatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGa > 1:1558071/1‑93 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa < 1:3788957/93‑1 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa > 2:622569/1‑93 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa < 2:3865656/93‑1 (MQ=255)
atgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAg < 2:2226582/93‑1 (MQ=255)
tgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGc < 2:4545096/93‑1 (MQ=255)
tgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGc > 2:2658096/1‑93 (MQ=255)
tgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGc < 1:2484408/93‑1 (MQ=255)
tgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGc < 1:4514853/93‑1 (MQ=255)
tgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGc < 2:149324/93‑1 (MQ=255)
gCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCg > 2:3506378/1‑93 (MQ=255)
gCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGaa < 1:1983142/93‑1 (MQ=255)
cTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAg > 1:2916731/1‑93 (MQ=255)
cTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAg > 1:2373454/1‑93 (MQ=255)
tATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGc < 1:301254/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATc > 2:671104/1‑93 (MQ=255)
gCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTAAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATc < 2:2594667/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCg < 1:877644/93‑1 (MQ=255)
aGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGcc < 1:3461725/93‑1 (MQ=255)
aGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGcc > 2:1140079/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGccc < 2:4630969/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCa > 1:3208193/1‑93 (MQ=255)
aGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCa < 2:4388323/93‑1 (MQ=255)
aGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCa > 2:1034214/1‑93 (MQ=255)
gggcggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGa < 2:928973/93‑1 (MQ=255)
gggcggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGa < 1:2255045/93‑1 (MQ=255)
ggcggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAt > 1:117965/1‑93 (MQ=255)
cggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTa < 1:3540168/93‑1 (MQ=255)
ggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTaa < 2:1156339/93‑1 (MQ=255)
ggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTaa < 2:1748033/93‑1 (MQ=255)
gAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATTATTAAc > 2:3067822/1‑93 (MQ=255)
gAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAc < 1:2497540/93‑1 (MQ=255)
gAATTTATCGCTGCAGGGGTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCATGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAc > 1:3297197/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc < 1:3955462/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc > 1:3396193/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc > 1:124960/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc > 2:2071534/1‑93 (MQ=255)
aTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCt < 1:1950848/93‑1 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg > 2:3207137/1‑93 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg < 2:1103894/93‑1 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg > 1:1661448/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTgg > 1:2145606/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTgg < 1:3094896/93‑1 (MQ=255)
tATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc > 1:1309632/1‑93 (MQ=255)
tATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc > 1:3322450/1‑93 (MQ=255)
|
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCAC > NC_000913/3008552‑3008730
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGCATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > NC_000913/3008549‑3008734
|
GGCATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCT < SRR4302535.4401182/94‑1 (MQ=60)
ATCACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA < SRR4302535.1218550/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGT > SRR4302535.1851287/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTA < SRR4302535.3455959/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGGTA > SRR4302535.3355493/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAA < SRR4302535.3829647/94‑1 (MQ=60)
CGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAA < SRR4302535.38819/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAC > SRR4302535.771997/1‑94 (MQ=60)
GCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAC < SRR4302535.2383248/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAC < SRR4302535.4086933/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302535.652137/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302535.1581021/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302535.1229514/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302535.3275886/94‑1 (MQ=60)
TTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCG < SRR4302535.2688928/94‑1 (MQ=60)
GCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCG > SRR4302535.1285473/1‑94 (MQ=60)
GCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCG < SRR4302535.4633021/94‑1 (MQ=60)
CATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGC > SRR4302535.611027/1‑94 (MQ=60)
TGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCG < SRR4302535.1476024/94‑1 (MQ=60)
TGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCG < SRR4302535.1237291/94‑1 (MQ=60)
TCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCT < SRR4302535.3422836/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTAT < SRR4302535.3514/94‑1 (MQ=60)
GGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATC < SRR4302535.2405431/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302535.518071/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATG < SRR4302535.45254/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302535.430313/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302535.3782387/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302535.2695976/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCT < SRR4302535.2354992/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCT < SRR4302535.1088039/94‑1 (MQ=60)
TGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTT > SRR4302535.2755073/1‑94 (MQ=60)
ACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGA < SRR4302535.2762263/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCGCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302535.4186799/94‑1 (MQ=60)
CACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGT > SRR4302535.799492/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTC < SRR4302535.2264810/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTC > SRR4302535.4353871/1‑94 (MQ=60)
CCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCG < SRR4302535.3433962/94‑1 (MQ=60)
CGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGC > SRR4302535.2148484/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC > SRR4302535.202693/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC > SRR4302535.244767/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC > SRR4302535.79509/1‑94 (MQ=60)
GCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCT < SRR4302535.4397317/94‑1 (MQ=60)
CACCCGGAAGATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTC < SRR4302535.3044121/94‑1 (MQ=60)
ACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCT < SRR4302535.1098643/94‑1 (MQ=60)
CCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTG < SRR4302535.3673832/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAATGGGGCGGAAGTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGG < SRR4302535.417728/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGG < SRR4302535.417726/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGG > SRR4302535.4059518/1‑94 (MQ=60)
GGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAA < SRR4302535.2815472/94‑1 (MQ=60)
GGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAA < SRR4302535.2453473/94‑1 (MQ=60)
AAAATTATGCGGCTATCGCCAGCAAGCTGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATG < SRR4302535.1441026/94‑1 (MQ=60)
AAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATG > SRR4302535.2995019/1‑94 (MQ=60)
AATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCG > SRR4302535.1344625/1‑94 (MQ=60)
AATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCG < SRR4302535.3678634/94‑1 (MQ=60)
ATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGA > SRR4302535.1569304/1‑94 (MQ=60)
GATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAG < SRR4302535.3815090/94‑1 (MQ=60)
GATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAG < SRR4302535.1539734/94‑1 (MQ=60)
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TGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCG < SRR4302535.2502319/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCG < SRR4302535.4545809/94‑1 (MQ=60)
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GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG > SRR4302535.2937322/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG > SRR4302535.2390502/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302535.1997421/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCC < SRR4302535.303354/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGCAGCCT > SRR4302535.1893969/1‑94 (MQ=60)
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CCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGC > SRR4302535.642845/1‑94 (MQ=60)
AGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCC > SRR4302535.2629536/1‑94 (MQ=60)
AGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCC < SRR4302535.3485794/94‑1 (MQ=60)
GCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCG < SRR4302535.202634/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCA > SRR4302535.3230413/1‑94 (MQ=60)
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GCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATG < SRR4302535.4554141/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATG < SRR4302535.4331299/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGA > SRR4302535.3811215/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAT > SRR4302535.118795/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAT < SRR4302535.2271099/94‑1 (MQ=60)
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GGAATTTATCGCTGCAGGGGTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCATGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAC > SRR4302535.3320120/1‑94 (MQ=60)
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GAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACC > SRR4302535.3419820/1‑94 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302535.2985843/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302535.2258942/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302535.3982470/94‑1 (MQ=60)
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ATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTG > SRR4302535.2266417/1‑94 (MQ=60)
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TTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGG > SRR4302535.2161042/1‑94 (MQ=60)
TTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGC < SRR4302535.3116446/94‑1 (MQ=60)
TTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGC > SRR4302535.1318992/1‑94 (MQ=60)
TTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGC > SRR4302535.3345565/1‑94 (MQ=60)
TATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCA < SRR4302535.3373109/94‑1 (MQ=60)
TATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCA > SRR4302535.4200938/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAA > SRR4302535.667611/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT < SRR4302535.1307686/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT < SRR4302535.167015/94‑1 (MQ=60)
|
GGCATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > NC_000913/3008549‑3008734
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
