Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,008,642 |
C→T |
A198A (GCC→GCT) |
b2873 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,008,642 | 0 | C | T | 100.0%
| 1068.0
/ NA
| 297 | A198A (GCC→GCT) | b2873 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (141/156); total (141/156) |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACA > NC_000913/3008552‑3008731
|
aTTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATcgctgc < 1:3901039/93‑1 (MQ=255)
aTTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGCGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATcgctgc > 2:3768062/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa > 2:4747019/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa < 1:5679716/93‑1 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa > 1:6125240/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa > 2:5515515/1‑93 (MQ=255)
ttACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCa > 1:6200908/1‑93 (MQ=255)
gccgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGt < 2:4360413/93‑1 (MQ=255)
ccgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGtt < 2:7708137/93‑1 (MQ=255)
ccgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGtt > 2:2233458/1‑93 (MQ=255)
cgcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTa > 1:4422348/1‑93 (MQ=255)
gcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTaa < 2:1961957/93‑1 (MQ=255)
gcTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTaa < 1:1393856/93‑1 (MQ=255)
gttGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAc < 1:2791340/92‑1 (MQ=255)
ttGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTCAcc > 2:1545126/1‑93 (MQ=255)
ttGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAcc < 1:7479553/93‑1 (MQ=255)
ttGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAcc < 1:1019921/93‑1 (MQ=255)
tGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGGGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccg > 1:1871444/1‑93 (MQ=255)
gCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgc < 2:1849911/93‑1 (MQ=255)
gCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgc > 1:1570636/1‑93 (MQ=255)
aTGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgcgc > 2:1221250/1‑93 (MQ=255)
tGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgcgcc < 2:2629545/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAccgcgccgcg > 2:7145422/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTa < 2:3517266/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTAt < 2:3412831/93‑1 (MQ=255)
ggCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTAt > 2:685586/1‑93 (MQ=255)
cgcgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCa < 1:4061832/93‑1 (MQ=255)
gcgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAt > 2:4916402/1‑93 (MQ=255)
cgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATg > 2:4633032/1‑93 (MQ=255)
cgcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATg < 1:5520124/93‑1 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 1:4859184/1‑93 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 1:3599797/1‑93 (MQ=255)
gcTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGc > 2:597200/1‑93 (MQ=255)
cTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGcc < 2:41737/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGcc < 1:3379089/93‑1 (MQ=255)
cTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGcc > 2:3306606/1‑93 (MQ=255)
tGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCt > 2:905489/1‑93 (MQ=255)
gACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCtt < 1:2961017/93‑1 (MQ=255)
gcaccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGa < 1:7800062/92‑1 (MQ=255)
ccaccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGa < 1:6704593/93‑1 (MQ=255)
ccaccGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGa > 1:2173328/1‑93 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGTAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAgc > 2:2720300/1‑92 (MQ=255)
accGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTgtgt > 1:6377714/1‑93 (MQ=255)
cGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCg > 2:70276/1‑93 (MQ=255)
gTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGc < 1:2239318/93‑1 (MQ=255)
cACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGACTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCct > 1:3767783/1‑93 (MQ=255)
cACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCct > 2:4105299/1‑93 (MQ=255)
aCCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctc > 1:4155149/1‑93 (MQ=255)
cccGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCctct < 1:7703149/93‑1 (MQ=255)
cGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTgg > 1:78998/1‑93 (MQ=255)
gAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGaa < 1:660690/93‑1 (MQ=255)
gAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGaa < 2:7321896/93‑1 (MQ=255)
gAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGaa < 2:4885614/93‑1 (MQ=255)
gAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGaa < 2:5123298/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAt < 2:4195550/93‑1 (MQ=255)
aaaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAt < 2:758295/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATg > 1:6877876/1‑93 (MQ=255)
aaaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATg < 2:2957074/93‑1 (MQ=255)
aaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGc < 2:578358/93‑1 (MQ=255)
aaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGc < 2:2549222/93‑1 (MQ=255)
aaTGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGc > 2:516197/1‑93 (MQ=255)
aaTGATCCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGAAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGc > 2:3965702/1‑93 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa < 1:4986896/93‑1 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa > 1:2915796/1‑93 (MQ=255)
gatgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGATAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGaa > 2:7907700/1‑93 (MQ=255)
atgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAg < 1:2045901/93‑1 (MQ=255)
atgCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAg < 2:6754530/93‑1 (MQ=255)
gCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGaa < 1:993961/93‑1 (MQ=255)
gCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGaa < 2:360948/93‑1 (MQ=255)
gCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGaa > 1:269306/1‑93 (MQ=255)
gCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGaa > 2:3066348/1‑93 (MQ=255)
cTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAg > 1:185345/1‑93 (MQ=255)
cTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAg > 1:7095180/1‑93 (MQ=255)
tCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCa > 1:122973/1‑93 (MQ=255)
tCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCa > 1:3234315/1‑93 (MQ=255)
cGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCAt < 2:137419/93‑1 (MQ=255)
ccAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCg > 2:2885487/1‑93 (MQ=255)
cAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGc < 1:6559501/93‑1 (MQ=255)
aGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGcc > 2:3467136/1‑93 (MQ=255)
aGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGcc > 2:1770311/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGccc > 1:4516466/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGccc > 1:5434030/1‑93 (MQ=255)
aGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCa < 2:2380673/93‑1 (MQ=255)
ggcggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAt > 1:7461596/1‑93 (MQ=255)
ggcggAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAt < 2:6065754/93‑1 (MQ=255)
ggAATTTATCGCTGCAGGGCTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGAGGAAGCCATCGCGCGCATGATTaa > 1:7550606/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc < 1:169182/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc < 1:3726107/93‑1 (MQ=255)
aaTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAcc < 1:5874594/93‑1 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg > 1:5610944/1‑93 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg < 2:1727204/93‑1 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg < 2:2397334/93‑1 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg > 1:306418/1‑93 (MQ=255)
tttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTg > 2:7844896/1‑93 (MQ=255)
ttATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTACCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTgg > 1:2400948/1‑93 (MQ=255)
tATCTCTGCAGGCTTAACCGCGCCGCACTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc < 2:4764791/93‑1 (MQ=255)
tATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc < 2:6200059/93‑1 (MQ=255)
tATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc > 2:528790/1‑93 (MQ=255)
tATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGc > 2:3629325/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGca < 1:4772845/93‑1 (MQ=255)
|
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACA > NC_000913/3008552‑3008731
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > NC_000913/3008552‑3008734
|
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA > SRR4302543.3412315/1‑94 (MQ=60)
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA < SRR4302543.3935484/94‑1 (MQ=60)
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA > SRR4302543.6183251/1‑94 (MQ=60)
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA > SRR4302543.6259477/1‑94 (MQ=60)
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA < SRR4302543.2965639/94‑1 (MQ=60)
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGCGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCA > SRR4302543.311065/1‑94 (MQ=60)
TTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAG < SRR4302543.5731561/94‑1 (MQ=60)
CGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGT > SRR4302543.7901282/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTA < SRR4302543.92884/94‑1 (MQ=60)
CCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTA > SRR4302543.3958197/1‑94 (MQ=60)
CCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTA > SRR4302543.4462431/1‑94 (MQ=60)
CGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAA < SRR4302543.2387621/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAC < SRR4302543.1406414/94‑1 (MQ=60)
GCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAC < SRR4302543.7757486/94‑1 (MQ=60)
GTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302543.2816830/94‑1 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC > SRR4302543.4190086/1‑94 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC > SRR4302543.7385318/1‑94 (MQ=60)
CTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACC < SRR4302543.3350363/94‑1 (MQ=60)
TTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGGGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCG > SRR4302543.1888256/1‑94 (MQ=60)
TTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGGGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAAACG > SRR4302543.1888255/1‑94 (MQ=60)
TTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCG < SRR4302543.7551154/94‑1 (MQ=60)
TTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCG < SRR4302543.1028945/94‑1 (MQ=60)
TGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGC > SRR4302543.1584658/1‑94 (MQ=60)
TGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGC > SRR4302543.5010664/1‑94 (MQ=60)
GCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCG < SRR4302543.3024525/94‑1 (MQ=60)
GCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCG > SRR4302543.2958604/1‑94 (MQ=60)
CATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGC > SRR4302543.331140/1‑94 (MQ=60)
ATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCC > SRR4302543.6305561/1‑94 (MQ=60)
ATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCC < SRR4302543.2106924/94‑1 (MQ=60)
AATCCGGCGCGCTGGCCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCG < SRR4302543.5584233/94‑1 (MQ=60)
AATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCG > SRR4302543.5708532/1‑94 (MQ=60)
AATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCG < SRR4302543.7467943/94‑1 (MQ=60)
ATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTACCCGCGCCGCGC > SRR4302543.6094351/1‑94 (MQ=60)
CCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTA < SRR4302543.7570249/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCGCTGACCACCGTGCACGCGGAAAATGATGCGGCTATCGGCAGCAAGCTGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTAT < SRR4302543.4180156/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTAT < SRR4302543.5960761/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCA < SRR4302543.204673/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCA < SRR4302543.1885053/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCA < SRR4302543.3893010/94‑1 (MQ=60)
GCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCA < SRR4302543.6765265/94‑1 (MQ=60)
cccggctacccaccgtgcgcagggaaattATGCGTCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.7384043/65‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.5452253/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.5064922/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.4098204/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.488058/94‑1 (MQ=60)
CGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCAT < SRR4302543.3443456/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302543.4216956/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302543.4548301/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC < SRR4302543.2904818/94‑1 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302543.4903492/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC > SRR4302543.3631563/1‑94 (MQ=60)
CGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGC < SRR4302543.5570263/94‑1 (MQ=60)
CTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCT > SRR4302543.3066319/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCT > SRR4302543.7663024/1‑94 (MQ=60)
CTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCT < SRR4302543.3409415/94‑1 (MQ=60)
TGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTT > SRR4302543.6875619/1‑94 (MQ=60)
GACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTG < SRR4302543.2987900/94‑1 (MQ=60)
GACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTG < SRR4302543.7547874/94‑1 (MQ=60)
GCCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTACCCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGA < SRR4302543.5634074/94‑1 (MQ=60)
ACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGA > SRR4302543.2192797/1‑94 (MQ=60)
GCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.7873578/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.7873577/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.5562003/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.5562004/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.7536280/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG < SRR4302543.6767882/94‑1 (MQ=60)
CCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAG > SRR4302543.1882750/1‑94 (MQ=60)
CACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGTGT > SRR4302543.6437718/1‑94 (MQ=60)
ACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTC < SRR4302543.6592211/94‑1 (MQ=60)
ACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTC > SRR4302543.6640473/1‑94 (MQ=60)
CGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGC > SRR4302543.1660095/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC < SRR4302543.4790871/94‑1 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC > SRR4302543.1503317/1‑94 (MQ=60)
GTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCC < SRR4302543.2259606/94‑1 (MQ=60)
TGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCC < SRR4302543.7872074/94‑1 (MQ=60)
GCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGACTTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCT > SRR4302543.3800951/1‑94 (MQ=60)
GCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCT < SRR4302543.2472076/94‑1 (MQ=60)
CACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTC > SRR4302543.4192722/1‑94 (MQ=60)
ACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCT > SRR4302543.2171610/1‑94 (MQ=60)
ACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCT < SRR4302543.7152719/94‑1 (MQ=60)
ACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCT < SRR4302543.3872435/94‑1 (MQ=60)
CCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTG < SRR4302543.7776043/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGG > SRR4302543.79733/1‑94 (MQ=60)
GGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGGATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGAGCCGCGCTATCATGCCTTGATTCGCCCTCTGGAA > SRR4302543.5761012/1‑94 (MQ=60)
GAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAT < SRR4302543.666761/94‑1 (MQ=60)
GAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAT < SRR4302543.1069715/94‑1 (MQ=60)
GAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAAT < SRR4302543.1373934/94‑1 (MQ=60)
AAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATG < SRR4302543.4502361/94‑1 (MQ=60)
AAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATG > SRR4302543.6942611/1‑94 (MQ=60)
AAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGC > SRR4302543.6834887/1‑94 (MQ=60)
TGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAA > SRR4302543.2942290/1‑94 (MQ=60)
TGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAA > SRR4302543.5020940/1‑94 (MQ=60)
gagcgGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAG < SRR4302543.5032288/89‑1 (MQ=60)
GATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAG < SRR4302543.5032289/94‑1 (MQ=60)
GATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAG < SRR4302543.4152080/94‑1 (MQ=60)
ATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGC < SRR4302543.3704202/94‑1 (MQ=60)
ATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGC < SRR4302543.2064240/94‑1 (MQ=60)
ATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGC < SRR4302543.3704201/94‑1 (MQ=60)
TGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGGGAAGCG < SRR4302543.1898111/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGG > SRR4302543.3255367/1‑94 (MQ=60)
GCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGG < SRR4302543.7621712/94‑1 (MQ=60)
GCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGG < SRR4302543.6733510/94‑1 (MQ=60)
GGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAA < SRR4302543.280330/94‑1 (MQ=60)
GGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAA < SRR4302543.280329/94‑1 (MQ=60)
GGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAA > SRR4302543.271674/1‑94 (MQ=60)
GGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAA > SRR4302543.2704222/1‑94 (MQ=60)
GGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAA < SRR4302543.5685647/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCTCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302543.3527169/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG > SRR4302543.7164078/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302543.434243/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302543.1002740/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG > SRR4302543.186922/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG > SRR4302543.2220218/1‑94 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302543.434244/94‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCAGCAAGCGGGAGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAG < SRR4302543.2825432/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCC > SRR4302543.3983641/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCA > SRR4302543.3263570/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCA > SRR4302543.124085/1‑94 (MQ=60)
TCGCCAGCAAGCGGGGGTAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCAT < SRR4302543.6281307/94‑1 (MQ=60)
TCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCAT < SRR4302543.6244267/94‑1 (MQ=60)
TCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCAT < SRR4302543.6281306/94‑1 (MQ=60)
TCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCAT < SRR4302543.3795381/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCG < SRR4302543.6496050/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCG < SRR4302543.2356429/94‑1 (MQ=60)
CCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGC > SRR4302543.7465016/1‑94 (MQ=60)
CAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCCGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCC > SRR4302543.7052228/1‑94 (MQ=60)
CAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCC < SRR4302543.6621220/94‑1 (MQ=60)
CAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCC < SRR4302543.6621221/94‑1 (MQ=60)
AGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCC < SRR4302543.929399/94‑1 (MQ=60)
AGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCC > SRR4302543.4557549/1‑94 (MQ=60)
AGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCC > SRR4302543.5483392/1‑94 (MQ=60)
GCAAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCG < SRR4302543.4773184/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCA > SRR4302543.1599068/1‑94 (MQ=60)
AAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCA < SRR4302543.1333046/94‑1 (MQ=60)
AAGCGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCA > SRR4302543.618630/1‑94 (MQ=60)
CGGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGA > SRR4302543.5799307/1‑94 (MQ=60)
GGGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGAT > SRR4302543.7533069/1‑94 (MQ=60)
GGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATT > SRR4302543.5552336/1‑94 (MQ=60)
GGCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATT > SRR4302543.4841823/1‑94 (MQ=60)
GCGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTA > SRR4302543.1727478/1‑94 (MQ=60)
CGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAA > SRR4302543.7948370/1‑94 (MQ=60)
CGGAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAA > SRR4302543.379261/1‑94 (MQ=60)
CGGAATTTATCGCTGCAGGGCTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGAGGAAGCCATCGCGCGCATGATTAA > SRR4302543.7622526/1‑94 (MQ=60)
GAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACC > SRR4302543.8001449/1‑94 (MQ=60)
GAATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACC < SRR4302543.2247264/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTCACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302543.1144288/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302543.170633/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302543.5928112/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302543.1839546/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCT < SRR4302543.3758874/94‑1 (MQ=60)
ATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTG > SRR4302543.309183/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTG > SRR4302543.5662070/1‑94 (MQ=60)
ATTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGGGGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAAACTG > SRR4302543.2774481/1‑94 (MQ=60)
TTTATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTACCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGG > SRR4302543.2422658/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCAC > SRR4302543.1547013/1‑94 (MQ=60)
ATCGCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCAC < SRR4302543.4816464/94‑1 (MQ=60)
GCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAA > SRR4302543.1969760/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAA < SRR4302543.4340683/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACTGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT < SRR4302543.2501917/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > SRR4302543.5139226/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > SRR4302543.150325/1‑94 (MQ=60)
CTGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > SRR4302543.150324/1‑94 (MQ=60)
|
ATTACGCCGCTTGCATGAATCCGGCGCGCTGACCACCGTGCACCCGGAAAATGATGCGGCTATCGCCAGCAAGCGGGCGGAATTTATCGCCGCAGGGTTAACCGCGCCGCGCTATCATGCCTTGAGTCGCCCTCTGGAATGCGAAGCGGAAGCCATCGCCCGCATGATTAACCTGGCACAAAT > NC_000913/3008552‑3008734
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
