Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,114,328 |
A→T |
G262G (GGT→GGA) |
b2973 ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,114,328 | 0 | A | T | 99.6%
| 824.0
/ NA
| 230 | G262G (GGT→GGA) | b2973 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (111/118); minor base G (0/1); total (111/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
ATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGT > NC_000913/3114238‑3114416
|
aTAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTcc > 1:3441589/1‑93 (MQ=255)
tAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCa > 2:3768141/1‑93 (MQ=255)
aaCGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACCTGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAt > 2:3102568/1‑93 (MQ=255)
aaCGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAt < 2:565922/93‑1 (MQ=255)
aCGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAtt > 2:3470130/1‑93 (MQ=255)
aCGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTAAAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAtt < 2:1643441/93‑1 (MQ=255)
cGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTg > 2:2529245/1‑93 (MQ=255)
gATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTgg > 1:800319/1‑93 (MQ=255)
tAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTc < 2:2042913/93‑1 (MQ=255)
tCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGGCCGGa > 1:1028620/1‑93 (MQ=255)
cGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGaa < 2:2063275/93‑1 (MQ=255)
ttCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTa < 1:4273822/92‑1 (MQ=255)
tCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTag > 1:2892276/1‑93 (MQ=255)
tCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTag > 2:4595334/1‑93 (MQ=255)
cGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTaga > 2:3350015/1‑93 (MQ=255)
gTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTagag > 2:2178805/1‑93 (MQ=255)
gTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTagag > 1:2828196/1‑93 (MQ=255)
gTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTagag > 1:3008953/1‑93 (MQ=255)
gTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGGTTCAGATCGACGCTGCTCAGAAGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTagag > 2:4166569/1‑93 (MQ=255)
ttCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGc > 1:1507358/1‑93 (MQ=255)
ttCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGc < 2:3757535/93‑1 (MQ=255)
cacaGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCa > 2:661721/1‑93 (MQ=255)
cacaGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCa < 2:689433/93‑1 (MQ=255)
cacaGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCa > 1:4672010/1‑93 (MQ=255)
acaGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCAt > 1:1838722/1‑93 (MQ=255)
aGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGc < 1:2169238/93‑1 (MQ=255)
gCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCt > 2:2923493/1‑93 (MQ=255)
ccAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTg > 1:1659585/1‑93 (MQ=255)
cAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGa < 1:2375177/93‑1 (MQ=255)
aGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGAt > 2:4337322/1‑93 (MQ=255)
aGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGAt < 1:147320/93‑1 (MQ=255)
gACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATa < 2:426432/93‑1 (MQ=255)
aCCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATAc > 1:515607/1‑93 (MQ=255)
aCCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATAc < 1:4037616/93‑1 (MQ=255)
aCCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATAc < 2:2871611/93‑1 (MQ=255)
gACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGa > 1:642272/1‑93 (MQ=255)
gACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGa < 1:3916078/93‑1 (MQ=255)
gACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGa > 2:2155502/1‑93 (MQ=255)
gACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGa > 1:2199970/1‑93 (MQ=255)
aCATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGAc > 2:873105/1‑93 (MQ=255)
aCATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGAc > 2:1822051/1‑93 (MQ=255)
aCATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGAc < 2:3208728/93‑1 (MQ=255)
aCATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGAc < 1:3399485/93‑1 (MQ=255)
cATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACg > 2:1328271/1‑93 (MQ=255)
gTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTg < 2:14586/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGaa < 1:3595604/93‑1 (MQ=255)
cTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAAt > 1:4523794/1‑93 (MQ=255)
cTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAAt < 2:1171952/93‑1 (MQ=255)
tGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATg > 1:4224726/1‑93 (MQ=255)
tGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATg < 2:933898/93‑1 (MQ=255)
tGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATg < 2:491621/93‑1 (MQ=255)
tGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATg > 2:3671005/1‑93 (MQ=255)
ggTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGt > 2:2412252/1‑93 (MQ=255)
ggTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGt < 1:1325714/93‑1 (MQ=255)
gTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGtt < 1:2578906/93‑1 (MQ=255)
gTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGtt < 1:2843950/93‑1 (MQ=255)
tACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTg > 1:3636890/1‑93 (MQ=255)
aGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTg > 1:3270095/1‑93 (MQ=255)
gACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGc > 2:1006564/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTa > 1:1930754/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaa > 1:758832/1‑93 (MQ=255)
tCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCTATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACACTGAATGTTGGTGCCTaaa < 2:4577563/93‑1 (MQ=255)
tCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaaa > 2:3889792/1‑93 (MQ=255)
tCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaaa < 1:858610/93‑1 (MQ=255)
tCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTaaa > 1:4474048/1‑93 (MQ=255)
ccAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAAt < 1:3644249/93‑1 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGATGCTCACCTTTGTGTCCATTGGTCCGGAAGTAGTGCTCATGTTGATACATACGCTGTATGTTGTTGCTTAAATcc > 1:4686332/1‑93 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc < 1:1545481/93‑1 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc < 2:1566524/93‑1 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc > 1:1859783/1‑93 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc < 2:2795819/93‑1 (MQ=255)
aGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATcc < 1:2419907/93‑1 (MQ=255)
aTCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGc > 2:3753402/1‑93 (MQ=255)
tCGACGCTGCTCAGACGCTCCCCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCa < 1:666834/93‑1 (MQ=255)
tCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCa > 1:951225/1‑93 (MQ=255)
gACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGc < 1:4062987/93‑1 (MQ=255)
aCGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGcc > 1:2644281/1‑93 (MQ=255)
aCGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGcc < 1:3303550/93‑1 (MQ=255)
cGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCt < 2:3269718/93‑1 (MQ=255)
gctgctCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTg > 1:570254/1‑93 (MQ=255)
ctgctCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGc < 2:2093812/93‑1 (MQ=255)
gctCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCAc > 2:3682141/1‑93 (MQ=255)
tCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCa < 2:2332626/93‑1 (MQ=255)
tCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCa < 1:3158999/93‑1 (MQ=255)
aGACTCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATc < 1:1757266/93‑1 (MQ=255)
cGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCt < 1:4454582/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtt < 1:678509/93‑1 (MQ=255)
gCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtt < 2:4235272/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt < 1:2781672/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt > 1:1058893/1‑93 (MQ=255)
tCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt > 2:395009/1‑93 (MQ=255)
tCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt < 2:2706410/93‑1 (MQ=255)
tCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCtttt > 2:2318215/1‑93 (MQ=255)
cACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTg > 2:171856/1‑93 (MQ=255)
aCCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGc > 1:438051/1‑93 (MQ=255)
tttGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgt < 1:256140/93‑1 (MQ=255)
tttGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgt > 1:2408622/1‑93 (MQ=255)
tttGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgt > 2:726527/1‑93 (MQ=255)
ttGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgtg < 2:3143833/93‑1 (MQ=255)
tGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAgtgt < 2:1791580/93‑1 (MQ=255)
|
ATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGT > NC_000913/3114238‑3114416
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > NC_000913/3114235‑3114419
|
TTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGT > SRR4302535.559901/1‑94 (MQ=60)
TTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGT > SRR4302535.1440996/1‑94 (MQ=60)
CATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCC < SRR4302535.862734/94‑1 (MQ=60)
CATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCC > SRR4302535.2827026/1‑94 (MQ=60)
CATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCC > SRR4302535.3465523/1‑94 (MQ=60)
TAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAT < SRR4302535.3389997/94‑1 (MQ=60)
TAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCAT < SRR4302535.429070/94‑1 (MQ=60)
AACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATT < SRR4302535.2850739/94‑1 (MQ=60)
AACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATT < SRR4302535.1000745/94‑1 (MQ=60)
AACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATT > SRR4302535.4342103/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGG > SRR4302535.233580/1‑94 (MQ=60)
CGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGG > SRR4302535.805941/1‑94 (MQ=60)
ATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTC < SRR4302535.3952728/94‑1 (MQ=60)
CTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGA > SRR4302535.1501750/1‑94 (MQ=60)
CTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGGCCGGA > SRR4302535.1035923/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGT > SRR4302535.2128096/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTA > SRR4302535.1771120/1‑94 (MQ=60)
TATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTA < SRR4302535.820148/94‑1 (MQ=60)
TTCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAG < SRR4302535.4303078/94‑1 (MQ=60)
ATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAG > SRR4302535.2912735/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAG > SRR4302535.3030029/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAG < SRR4302535.1866262/94‑1 (MQ=60)
CGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAG > SRR4302535.2848267/1‑94 (MQ=60)
GTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGC < SRR4302535.364936/94‑1 (MQ=60)
GTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGC > SRR4302535.1518195/1‑94 (MQ=60)
GTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGC < SRR4302535.660527/94‑1 (MQ=60)
GTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGC > SRR4302535.674864/1‑94 (MQ=60)
TCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTC > SRR4302535.3294196/1‑94 (MQ=60)
CCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCA > SRR4302535.4703563/1‑94 (MQ=60)
CCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCA < SRR4302535.2676545/94‑1 (MQ=60)
CCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCA > SRR4302535.2517778/1‑94 (MQ=60)
CACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCAT > SRR4302535.4071352/1‑94 (MQ=60)
CACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCAT < SRR4302535.221133/94‑1 (MQ=60)
CACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCAT < SRR4302535.4710489/94‑1 (MQ=60)
CACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCAT > SRR4302535.1851984/1‑94 (MQ=60)
AGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCT < SRR4302535.2184777/94‑1 (MQ=60)
AGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCT < SRR4302535.4681397/94‑1 (MQ=60)
GCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTG > SRR4302535.1671581/1‑94 (MQ=60)
CCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGA > SRR4302535.1886956/1‑94 (MQ=60)
CAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGAT < SRR4302535.2392242/94‑1 (MQ=60)
CAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGAT < SRR4302535.3134160/94‑1 (MQ=60)
AGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATA < SRR4302535.148350/94‑1 (MQ=60)
GACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATAC > SRR4302535.4522623/1‑94 (MQ=60)
GACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATAC > SRR4302535.519208/1‑94 (MQ=60)
ACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACA < SRR4302535.4065254/94‑1 (MQ=60)
ACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACA < SRR4302535.562588/94‑1 (MQ=60)
CCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAG < SRR4302535.1710250/94‑1 (MQ=60)
CGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGC > SRR4302535.2401263/1‑94 (MQ=60)
CGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGA > SRR4302535.646758/1‑94 (MQ=60)
CGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGA > SRR4302535.2215653/1‑94 (MQ=60)
CGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGA > SRR4302535.1270872/1‑94 (MQ=60)
GACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGAC < SRR4302535.3942876/94‑1 (MQ=60)
ACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACG < SRR4302535.3423139/94‑1 (MQ=60)
ATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCT > SRR4302535.2613689/1‑94 (MQ=60)
ATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCT > SRR4302535.4124814/1‑94 (MQ=60)
TGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTG < SRR4302535.295614/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAAT < SRR4302535.3620558/94‑1 (MQ=60)
TCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAAT > SRR4302535.4554788/1‑94 (MQ=60)
CTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATG > SRR4302535.4253632/1‑94 (MQ=60)
TGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGT < SRR4302535.1423779/94‑1 (MQ=60)
TGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGT < SRR4302535.795610/94‑1 (MQ=60)
TGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGT < SRR4302535.3442872/94‑1 (MQ=60)
GGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTT < SRR4302535.1335177/94‑1 (MQ=60)
GTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTG < SRR4302535.2597436/94‑1 (MQ=60)
GTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTG > SRR4302535.3662093/1‑94 (MQ=60)
GTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTG < SRR4302535.2864115/94‑1 (MQ=60)
TACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGG < SRR4302535.453087/94‑1 (MQ=60)
TACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGG < SRR4302535.692406/94‑1 (MQ=60)
ACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGT < SRR4302535.2876753/94‑1 (MQ=60)
ACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGT < SRR4302535.3897915/94‑1 (MQ=60)
ACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGT > SRR4302535.3059998/1‑94 (MQ=60)
CAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTG > SRR4302535.3292811/1‑94 (MQ=60)
CAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTG > SRR4302535.4424230/1‑94 (MQ=60)
AGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGC > SRR4302535.3238543/1‑94 (MQ=60)
GACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCC < SRR4302535.2591127/94‑1 (MQ=60)
ACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCT > SRR4302535.1401720/1‑94 (MQ=60)
CGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTA > SRR4302535.1944667/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAA > SRR4302535.764177/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAA > SRR4302535.4403368/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAA > SRR4302535.1615454/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAA < SRR4302535.2426276/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAA > SRR4302535.4504748/1‑94 (MQ=60)
TCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCCCCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAAT < SRR4302535.482772/94‑1 (MQ=60)
TCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAAT < SRR4302535.864666/94‑1 (MQ=60)
CCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATC < SRR4302535.4504193/94‑1 (MQ=60)
CCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATC < SRR4302535.3669483/94‑1 (MQ=60)
CCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATC < SRR4302535.2005701/94‑1 (MQ=60)
CCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATC < SRR4302535.3669369/94‑1 (MQ=60)
CAGATCGACGCTGCTCAGATGCTCACCTTTGTGTCCATTGGTCCGGAAGTAGTGCTCATGTTGATACATACGCTGTATGTTGTTGCTTAAATCC > SRR4302535.4718097/1‑94 (MQ=53)
CAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCC > SRR4302535.1873191/1‑94 (MQ=60)
CAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCC < SRR4302535.3556759/94‑1 (MQ=60)
AGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCG < SRR4302535.1556610/94‑1 (MQ=60)
AGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCG > SRR4302535.932529/1‑94 (MQ=60)
AGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCG < SRR4302535.2437331/94‑1 (MQ=60)
ATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCA > SRR4302535.957957/1‑94 (MQ=60)
TCGACGCTGCTCAGACGCTCCCCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAG < SRR4302535.671484/94‑1 (MQ=60)
TCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCGGCAG > SRR4302535.1578664/1‑94 (MQ=60)
GACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCC < SRR4302535.4090792/94‑1 (MQ=60)
GACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCC > SRR4302535.2663218/1‑94 (MQ=60)
ACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCT < SRR4302535.3341760/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCT < SRR4302535.3326523/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCT < SRR4302535.590463/94‑1 (MQ=60)
CGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTG > SRR4302535.420072/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTG > SRR4302535.574260/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTG < SRR4302535.832808/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCAC > SRR4302535.3762895/1‑94 (MQ=60)
GCTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACC > SRR4302535.2904046/1‑94 (MQ=60)
CTCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCA > SRR4302535.152029/1‑94 (MQ=60)
TCAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCAT < SRR4302535.3180920/94‑1 (MQ=60)
CAGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATC < SRR4302535.3540856/94‑1 (MQ=60)
AGACTCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCG < SRR4302535.1769968/94‑1 (MQ=60)
AGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCCGCCTGCACCATCG < SRR4302535.2548966/94‑1 (MQ=60)
AGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCG > SRR4302535.2393370/1‑94 (MQ=60)
AGACGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCG < SRR4302535.1793791/94‑1 (MQ=60)
CGCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTT < SRR4302535.4485131/94‑1 (MQ=60)
GCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTT < SRR4302535.683255/94‑1 (MQ=60)
CCTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTT < SRR4302535.1036924/94‑1 (MQ=60)
CTCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTT > SRR4302535.1066434/1‑94 (MQ=60)
TCACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTG < SRR4302535.2801476/94‑1 (MQ=60)
CACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGC > SRR4302535.441115/1‑94 (MQ=60)
ACCTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCA > SRR4302535.620869/1‑94 (MQ=60)
CTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGT < SRR4302535.2740059/94‑1 (MQ=60)
CTTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGT > SRR4302535.2425962/1‑94 (MQ=60)
TTTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTG < SRR4302535.257905/94‑1 (MQ=60)
TTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGT < SRR4302535.76073/94‑1 (MQ=60)
TTGCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGT > SRR4302535.473549/1‑94 (MQ=60)
GCGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCG > SRR4302535.2771509/1‑94 (MQ=60)
CGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > SRR4302535.1256890/1‑94 (MQ=60)
CGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > SRR4302535.432302/1‑94 (MQ=60)
CGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > SRR4302535.3149453/1‑94 (MQ=60)
CGTCCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > SRR4302535.3473950/1‑94 (MQ=60)
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TTCATAACGATAGCTCGTATCGTTCCACAGCCAGACCGACATGTTCTGGTACAGACGTTCCAGATCGACGCTGCTCAGACGCTCACCTTTGCGACCATTGGTCCGGAAGTAGAGCTCATGCTGATACAGACGCTGAATGTTGGTGCCTAAATCCGCAGCCTGCACCATCGCTTTTGCAGTGTCGG > NC_000913/3114235‑3114419
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
