Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,289,431 |
T→C |
G150G (GGT→GGC) |
yraK → |
putative fimbrial protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,289,431 | 0 | T | C | 100.0%
| 625.9
/ NA
| 200 | G150G (GGT→GGC) | yraK | putative fimbrial protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (101/99); total (101/99) |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT > NC_000913/3289341‑3289520
|
cGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGa > 1:3730234/1‑93 (MQ=255)
cGACCAGGTTGCTCCTGTTACCCCCCGATCCACACAGATAAAAAACACCCGGGTATATCCTCCTGCAACCCAAACGGGGTTTTGCCAGGGCGa < 2:418945/93‑1 (MQ=255)
aCCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATa > 2:3566381/1‑93 (MQ=255)
cAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACg > 2:1500030/1‑93 (MQ=255)
aGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGt < 2:2967558/93‑1 (MQ=255)
ggTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtc < 2:882125/93‑1 (MQ=255)
ttGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGtctc > 1:3199688/1‑93 (MQ=255)
tGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCg > 1:3234893/1‑93 (MQ=255)
tctcTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGtt > 2:3788036/1‑93 (MQ=255)
ctctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTa < 1:4368441/93‑1 (MQ=255)
tctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAt > 1:1444183/1‑93 (MQ=255)
tctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAt > 1:202979/1‑93 (MQ=255)
tctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGGCTCGTTAt < 2:4580658/93‑1 (MQ=255)
ctGTTATCACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATg < 1:2139644/93‑1 (MQ=255)
ctGTTAACACCCGATTCACACAGATAGAAAACAACGCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATg < 2:1727333/93‑1 (MQ=255)
ctGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATg < 1:629504/93‑1 (MQ=255)
tGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATgg < 1:4541216/93‑1 (MQ=255)
tAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAcc < 2:4139280/93‑1 (MQ=255)
tAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAcc < 1:3469366/93‑1 (MQ=255)
tAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGAAcc < 2:732709/93‑1 (MQ=255)
aaCACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAccc < 1:3159983/93‑1 (MQ=255)
acacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCg < 1:4114917/93‑1 (MQ=255)
cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGt > 1:3929210/1‑93 (MQ=255)
cacCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGCTATGGACCCGt > 2:623497/1‑93 (MQ=255)
acCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTATGCTGCAACCCAAACGGGTGATTGCCAGGGAGATACGTCTCGTTATGGACCCGtt > 2:3661811/1‑93 (MQ=255)
ccGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTaa < 1:1685785/93‑1 (MQ=255)
ccGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTaa > 1:4357265/1‑93 (MQ=255)
cGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAat > 2:811331/1‑93 (MQ=255)
cGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAat > 1:1254174/1‑93 (MQ=255)
gATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAata < 2:924410/93‑1 (MQ=255)
gATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAata < 1:2338238/93‑1 (MQ=255)
aTTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAatat < 1:4203798/93‑1 (MQ=255)
ttCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATAtt < 1:3508246/93‑1 (MQ=255)
ttCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATAtt < 2:673462/93‑1 (MQ=255)
cacacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTgg < 1:1394013/93‑1 (MQ=255)
cacacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTgg < 1:1534673/93‑1 (MQ=255)
acacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGt > 1:3083862/1‑93 (MQ=255)
cacaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTg > 1:1405968/1‑93 (MQ=255)
acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc < 1:1746847/93‑1 (MQ=255)
acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc < 2:2356259/93‑1 (MQ=255)
acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc > 2:3240549/1‑93 (MQ=255)
acaGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGc > 1:2759214/1‑93 (MQ=255)
caGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCg > 2:3588234/1‑93 (MQ=255)
aGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGa > 2:4012079/1‑93 (MQ=255)
gATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGaa < 1:4231689/93‑1 (MQ=255)
gATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGaa < 1:2173395/93‑1 (MQ=255)
gATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGaa < 2:2399694/93‑1 (MQ=255)
tAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAaca > 1:366640/1‑93 (MQ=255)
tAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAaca > 1:4644229/1‑93 (MQ=255)
aaaaCAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAcacca < 2:1565426/93‑1 (MQ=255)
aacaacACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACaccacc < 2:2259006/93‑1 (MQ=255)
aacaacACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACaccacc < 2:4323223/93‑1 (MQ=255)
acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt < 1:434917/93‑1 (MQ=255)
acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt > 2:2701021/1‑93 (MQ=255)
acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt > 2:1785366/1‑93 (MQ=255)
acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt > 2:4041689/1‑93 (MQ=255)
acaacaCGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCt > 1:2151019/1‑93 (MQ=255)
acacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTa > 2:2015489/1‑93 (MQ=255)
acacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTa < 1:457278/93‑1 (MQ=255)
cacGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAc < 2:53668/93‑1 (MQ=255)
acGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAcc > 1:1343706/1‑93 (MQ=255)
cGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAccc < 1:65887/93‑1 (MQ=255)
cGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAccc < 1:325242/93‑1 (MQ=255)
ggTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCt > 1:2841912/1‑93 (MQ=255)
ggTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCt > 1:3858713/1‑93 (MQ=255)
gTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTg > 1:3346685/1‑93 (MQ=255)
gTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTg > 1:2627602/1‑93 (MQ=255)
tataTTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGt < 2:3842326/93‑1 (MQ=255)
atatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTa > 2:3078043/1‑93 (MQ=255)
atatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTa > 1:1111495/1‑93 (MQ=255)
tatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACATCACCTTTACCCTGTAt > 2:3988547/1‑93 (MQ=255)
tatTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTAt > 2:3217825/1‑93 (MQ=255)
atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg < 2:2795344/93‑1 (MQ=255)
atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg > 2:2293921/1‑93 (MQ=255)
atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg > 1:1194060/1‑93 (MQ=255)
atTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATg > 2:3907121/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTc > 1:4599305/1‑93 (MQ=255)
ctgctgCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCa > 2:4627401/1‑93 (MQ=255)
gctgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCAcc > 2:3287065/1‑93 (MQ=255)
gctgcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCAcc > 1:4559402/1‑93 (MQ=255)
gcAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAg > 1:2997422/1‑93 (MQ=255)
cccAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAt > 2:3685102/1‑93 (MQ=255)
cccAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAt < 2:1209242/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAttt < 2:4278733/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtc < 2:1080783/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtc > 2:3442353/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATGGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtc < 1:1494383/93‑1 (MQ=255)
aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 2:2676344/93‑1 (MQ=255)
aCGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTtctc < 1:4323652/93‑1 (MQ=255)
cGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCg < 1:1669789/93‑1 (MQ=255)
gggTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCgg < 2:985389/93‑1 (MQ=255)
ggTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGc < 2:2208944/93‑1 (MQ=255)
gtgtTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCt > 1:790064/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCt > 1:1060987/1‑93 (MQ=255)
tgtTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTAATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTc < 2:1979915/93‑1 (MQ=255)
aGGGGGATACGTCTTGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCa < 1:1709233/93‑1 (MQ=255)
aGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCa > 1:4000626/1‑93 (MQ=255)
aGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCa > 1:3578366/1‑93 (MQ=255)
gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt < 1:3224288/93‑1 (MQ=255)
gggCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAt < 2:1308406/93‑1 (MQ=255)
|
CGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT > NC_000913/3289341‑3289520
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATTCCG > NC_000913/3289338‑3289524
|
AACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGC < SRR4302535.2180925/94‑1 (MQ=60)
ACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAAAACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCG < SRR4302535.2531993/94‑1 (MQ=60)
CCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGA > SRR4302535.3756065/1‑94 (MQ=60)
CGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGAT < SRR4302535.435305/94‑1 (MQ=60)
CGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGAT < SRR4302535.5679/94‑1 (MQ=60)
CCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACG < SRR4302535.3878133/94‑1 (MQ=60)
CAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGT > SRR4302535.1624975/1‑94 (MQ=60)
GGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCT > SRR4302535.1264540/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTC > SRR4302535.4379097/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTC < SRR4302535.4201157/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTC > SRR4302535.3221840/1‑94 (MQ=60)
TTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCG > SRR4302535.3257344/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAT > SRR4302535.204364/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAT > SRR4302535.1454511/1‑94 (MQ=60)
CTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTAT < SRR4302535.4398337/94‑1 (MQ=60)
CTGTTATCACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGG < SRR4302535.2155052/94‑1 (MQ=60)
CTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGG < SRR4302535.633893/94‑1 (MQ=60)
TGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGA < SRR4302535.4572275/94‑1 (MQ=60)
TGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGA > SRR4302535.1510436/1‑94 (MQ=60)
TGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGA < SRR4302535.1152008/94‑1 (MQ=60)
GTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAC > SRR4302535.3600602/1‑94 (MQ=60)
GTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGAC < SRR4302535.4585591/94‑1 (MQ=60)
TAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCC < SRR4302535.3493475/94‑1 (MQ=60)
AACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCG < SRR4302535.3181909/94‑1 (MQ=60)
ACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGT > SRR4302535.3956046/1‑94 (MQ=60)
ACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGT < SRR4302535.4143084/94‑1 (MQ=60)
CACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTT < SRR4302535.1734950/94‑1 (MQ=60)
CACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTT < SRR4302535.1211364/94‑1 (MQ=60)
CACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATGCTGGTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTT < SRR4302535.3248158/94‑1 (MQ=60)
ACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTA > SRR4302535.2766277/1‑94 (MQ=60)
ACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTA > SRR4302535.436456/1‑94 (MQ=60)
CCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAA > SRR4302535.4387095/1‑94 (MQ=60)
CCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAAT < SRR4302535.4046642/94‑1 (MQ=60)
CCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAAT > SRR4302535.1263144/1‑94 (MQ=60)
CCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAAT < SRR4302535.1697990/94‑1 (MQ=60)
CGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATA < SRR4302535.1697180/94‑1 (MQ=60)
GATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATAT < SRR4302535.3651800/94‑1 (MQ=60)
GATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATAT < SRR4302535.2354969/94‑1 (MQ=60)
ATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATT > SRR4302535.1706862/1‑94 (MQ=60)
ATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATT < SRR4302535.4232569/94‑1 (MQ=60)
TTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTG < SRR4302535.3532627/94‑1 (MQ=60)
CACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGT < SRR4302535.1403968/94‑1 (MQ=60)
CACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGT > SRR4302535.3105350/1‑94 (MQ=60)
CACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGT < SRR4302535.1805599/94‑1 (MQ=60)
CACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGT < SRR4302535.1545729/94‑1 (MQ=60)
ACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTG > SRR4302535.1416015/1‑94 (MQ=60)
ACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGCTAATATTGGTG > SRR4302535.1605052/1‑94 (MQ=60)
CACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGC > SRR4302535.2778875/1‑94 (MQ=60)
ACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCG < SRR4302535.3498848/94‑1 (MQ=60)
ACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCG < SRR4302535.1759482/94‑1 (MQ=60)
AGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAA > SRR4302535.1412921/1‑94 (MQ=60)
GATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAC > SRR4302535.6410/1‑94 (MQ=60)
GATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAC < SRR4302535.4260650/94‑1 (MQ=60)
GATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAC < SRR4302535.2188943/94‑1 (MQ=60)
GATAAAAAACAACACGGTATATGCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAAC < SRR4302535.2166477/94‑1 (MQ=60)
ATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACA > SRR4302535.369170/1‑94 (MQ=60)
ATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACA > SRR4302535.4675705/1‑94 (MQ=60)
AAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCC > SRR4302535.3953648/1‑94 (MQ=60)
AAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCA > SRR4302535.3718136/1‑94 (MQ=60)
AACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCT > SRR4302535.2166484/1‑94 (MQ=60)
ACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTT < SRR4302535.437947/94‑1 (MQ=60)
ACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAC < SRR4302535.4410259/94‑1 (MQ=60)
ACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTAC < SRR4302535.460473/94‑1 (MQ=60)
CACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACC > SRR4302535.1353296/1‑94 (MQ=60)
CGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCT > SRR4302535.2862069/1‑94 (MQ=60)
CGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCT < SRR4302535.327491/94‑1 (MQ=60)
CGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCT > SRR4302535.2280925/1‑94 (MQ=60)
CGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCT > SRR4302535.3885270/1‑94 (MQ=60)
CGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCT < SRR4302535.66381/94‑1 (MQ=60)
GGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTG > SRR4302535.2646433/1‑94 (MQ=60)
GGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTG > SRR4302535.3369999/1‑94 (MQ=60)
GGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTG < SRR4302535.754621/94‑1 (MQ=60)
GTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGT > SRR4302535.3995415/1‑94 (MQ=60)
GTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGT < SRR4302535.4644180/94‑1 (MQ=60)
TATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTA > SRR4302535.3138843/1‑94 (MQ=60)
TATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTA > SRR4302535.1119427/1‑94 (MQ=60)
TATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATG > SRR4302535.1202614/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGT > SRR4302535.3404940/1‑94 (MQ=60)
ATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGT > SRR4302535.3209155/1‑94 (MQ=60)
TTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTC < SRR4302535.1110491/94‑1 (MQ=60)
TTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTC > SRR4302535.4630591/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACC < SRR4302535.4259893/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACC > SRR4302535.2404941/1‑94 (MQ=60)
TGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACC > SRR4302535.4590528/1‑94 (MQ=60)
TGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAG > SRR4302535.3018442/1‑94 (MQ=60)
TGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAG < SRR4302535.2903112/94‑1 (MQ=60)
CAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCC < SRR4302535.1489689/94‑1 (MQ=60)
AACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCA < SRR4302535.2760139/94‑1 (MQ=60)
ACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCAT < SRR4302535.4387634/94‑1 (MQ=60)
CCAAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTT < SRR4302535.1360473/94‑1 (MQ=60)
AAACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATGGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCT < SRR4302535.1505126/94‑1 (MQ=60)
AACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTC > SRR4302535.4254803/1‑94 (MQ=60)
ACGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCG < SRR4302535.4353227/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGG < SRR4302535.1681871/94‑1 (MQ=60)
CGGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGG < SRR4302535.2829668/94‑1 (MQ=60)
GGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGC > SRR4302535.3234666/1‑94 (MQ=60)
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GGGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGC > SRR4302535.3056314/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCT > SRR4302535.795607/1‑94 (MQ=60)
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GGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCT > SRR4302535.1068539/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCT < SRR4302535.3266774/94‑1 (MQ=60)
TGTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCG > SRR4302535.3468055/1‑94 (MQ=60)
GTTTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGG > SRR4302535.579097/1‑94 (MQ=60)
tgcCCAGGGCGATCCGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATG < SRR4302535.2111386/91‑1 (MQ=60)
TTGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATG < SRR4302535.4594556/94‑1 (MQ=60)
TGGCCAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGCGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATG < SRR4302535.941864/94‑1 (MQ=60)
CAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCA > SRR4302535.4027995/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCA > SRR4302535.3603173/1‑94 (MQ=60)
CAGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCA < SRR4302535.3287165/94‑1 (MQ=60)
AGGGGGATACGTCTTGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT < SRR4302535.1721590/94‑1 (MQ=60)
AGGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCAT > SRR4302535.2184601/1‑94 (MQ=60)
GGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCCCTTTTCCCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATT < SRR4302535.1653436/94‑1 (MQ=60)
GGGCGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATT < SRR4302535.3246640/94‑1 (MQ=60)
CGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATTCCG > SRR4302535.641165/1‑94 (MQ=60)
CGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATTCCG < SRR4302535.1958023/94‑1 (MQ=60)
|
AACCGACCAGGTTGTCTCTGTTAACACCCGATTCACACAGATAAAAAACAACACGGTATATTCTGCTGCAACCCAAACGGGTGTTTGCCAGGGTGATACGTCTCGTTATGGACCCGTTAATATTGGTGCGAACACCACCTTTACCCTGTATGTCACCAAGCCATTTCTCGGCTCGATGACCATTCCG > NC_000913/3289338‑3289524
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
