Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,490,327 |
T→C |
P41P (CCT→CCC) |
yhfC → |
putative transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,490,327 | 0 | T | C | 100.0%
| 655.8
/ NA
| 207 | P41P (CCT→CCC) | yhfC | putative transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (97/110); total (97/110) |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCC > NC_000913/3490237‑3490416
|
aTTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGtt > 1:3872132/1‑93 (MQ=255)
tAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTc > 1:4646758/1‑93 (MQ=255)
aGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTcc > 2:276215/1‑93 (MQ=255)
cTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAg > 1:1956203/1‑93 (MQ=255)
tgctctcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTa < 1:2257623/91‑1 (MQ=255)
tctctcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCCGTAt > 1:2011538/1‑93 (MQ=255)
tctcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGa < 1:3691275/93‑1 (MQ=255)
tctcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGa > 1:761405/1‑93 (MQ=255)
tcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGt < 1:3960130/93‑1 (MQ=255)
tcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGt < 2:2210510/93‑1 (MQ=255)
tcCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGt > 1:2473057/1‑93 (MQ=255)
cTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTaa < 1:3327203/93‑1 (MQ=255)
cTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTaa < 1:1501473/93‑1 (MQ=255)
cTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTaa > 2:3909425/1‑93 (MQ=255)
cTACGCACGGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTaa < 2:3359561/93‑1 (MQ=255)
ccGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATa < 2:519120/92‑1 (MQ=255)
cGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATac < 1:3203683/93‑1 (MQ=255)
gCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATacc < 2:2006822/93‑1 (MQ=255)
gCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATacc < 2:1281585/93‑1 (MQ=255)
cACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATacct < 2:1836511/93‑1 (MQ=255)
actgactgGTGCGTTGGTTGTTGTCATCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATacctt > 2:4584470/1‑93 (MQ=255)
ctgactgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttc < 2:3452096/93‑1 (MQ=255)
ctgactgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttc > 2:4337575/1‑93 (MQ=255)
tgactgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttca < 1:4463709/93‑1 (MQ=255)
tgactgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttca < 2:674721/93‑1 (MQ=255)
actgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcacc > 1:4629417/1‑93 (MQ=255)
actgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGA‑TATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcacct < 2:4459044/93‑1 (MQ=255)
ctgGTGCGTTTGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcacct < 1:2906522/93‑1 (MQ=255)
tgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcacctt < 2:3880165/93‑1 (MQ=255)
tgGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcacctt < 2:1757367/93‑1 (MQ=255)
ggTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcaccttc > 2:2166008/1‑93 (MQ=255)
ggTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATaccttcaccttc < 2:2872295/93‑1 (MQ=255)
gTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTcc < 1:3369890/93‑1 (MQ=255)
gTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTcc < 2:1027410/93‑1 (MQ=255)
gTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTcc < 2:898630/93‑1 (MQ=255)
cGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCa < 1:2411452/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCaa < 2:1440578/93‑1 (MQ=255)
gTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCaa < 1:1974906/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATGCCTTCACCTTCCTAAAc > 1:3535331/1‑93 (MQ=255)
ttGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAAc < 2:1704909/93‑1 (MQ=255)
ttGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAAc < 2:3944149/93‑1 (MQ=255)
tGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACg > 1:3976910/1‑93 (MQ=255)
ggTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGc > 1:704111/1‑93 (MQ=255)
gTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGcc < 1:1047765/93‑1 (MQ=255)
ttATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATAACTTCACCTTCCTCAACGCCg > 2:4377736/1‑93 (MQ=255)
ttGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCa > 1:189972/1‑93 (MQ=255)
ttGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCa > 1:2135262/1‑93 (MQ=255)
ttGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCa > 2:125218/1‑93 (MQ=255)
ttGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCa > 2:4664034/1‑93 (MQ=255)
tGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCAt < 1:2927679/93‑1 (MQ=255)
gTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCAtt > 1:910748/1‑93 (MQ=255)
tCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCAttt < 1:3808967/93‑1 (MQ=255)
cACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCAtttt < 1:1576211/93‑1 (MQ=255)
aCCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTa > 2:3091002/1‑93 (MQ=255)
ccGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTaa < 1:2827859/93‑1 (MQ=255)
cGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAt < 2:3792924/93‑1 (MQ=255)
cGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAt < 2:625486/93‑1 (MQ=255)
gggATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAtc < 2:1169493/93‑1 (MQ=255)
tGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTa < 2:4629417/93‑1 (MQ=255)
tGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTa < 1:2974999/93‑1 (MQ=255)
tGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTa > 1:1313253/1‑93 (MQ=255)
ggTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTAt < 1:4186547/93‑1 (MQ=255)
tGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCt > 1:3018509/1‑93 (MQ=255)
gATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCtt > 2:2032868/1‑93 (MQ=255)
gATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCtt < 2:919016/93‑1 (MQ=255)
gATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCtt < 1:2399168/93‑1 (MQ=255)
gATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCtt < 2:1296692/93‑1 (MQ=255)
tGGGAAATATCGCCTATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTcc < 2:1443746/93‑1 (MQ=255)
gAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCa > 2:2515569/1‑93 (MQ=255)
aaaTATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCac > 2:1643558/1‑92 (MQ=255)
aaaTATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCaa < 1:850768/93‑1 (MQ=255)
atCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGcc > 1:1605767/1‑93 (MQ=255)
tCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCt > 1:2463348/1‑93 (MQ=255)
gCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTgg < 1:4098291/93‑1 (MQ=255)
gCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTgg > 2:2335646/1‑93 (MQ=255)
gCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTgg > 2:3568429/1‑93 (MQ=255)
ccGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGc > 2:4147212/1‑93 (MQ=255)
cGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCt < 1:3729572/93‑1 (MQ=255)
cGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCt > 1:2653968/1‑93 (MQ=255)
cGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGACGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCt > 1:2328395/1‑93 (MQ=255)
gATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTg > 2:2724381/1‑93 (MQ=255)
gATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTg > 1:644656/1‑93 (MQ=255)
gATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTg > 2:3215400/1‑93 (MQ=255)
ttattTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGAt < 1:4514903/93‑1 (MQ=255)
ttattTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGAt > 2:4208097/1‑93 (MQ=255)
tattTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATg < 1:3395048/93‑1 (MQ=255)
tattTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATg > 2:2538412/1‑93 (MQ=255)
tCAATCTTCCCGTTTCCAGTATGAGCAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCCACGCCTGGCTGATGGaat > 1:687046/1‑92 (MQ=255)
tCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGaaa > 2:4562152/1‑93 (MQ=255)
cAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAAt < 1:2309266/93‑1 (MQ=255)
cAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAAt < 1:2078031/93‑1 (MQ=255)
aaTCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATc > 1:1144862/1‑93 (MQ=255)
aaTCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATc > 2:1346765/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCg > 2:2919377/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCCCGTTTCCAGTATAAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCg < 1:3898975/93‑1 (MQ=255)
tCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGt > 2:2634471/1‑93 (MQ=255)
tGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTcc < 1:4366083/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTcc < 2:3854391/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTcc < 1:4670008/93‑1 (MQ=255)
tGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTcc < 1:953833/93‑1 (MQ=255)
|
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCC > NC_000913/3490237‑3490416
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTG > NC_000913/3490237‑3490420
|
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTT < SRR4302535.2937128/94‑1 (MQ=60)
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTT > SRR4302535.3898741/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTT > SRR4302535.4114905/1‑94 (MQ=60)
ATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTT < SRR4302535.3647863/94‑1 (MQ=60)
TTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTC > SRR4302535.4678239/1‑94 (MQ=60)
TAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCC < SRR4302535.894701/94‑1 (MQ=60)
AGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCA > SRR4302535.390668/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAG > SRR4302535.1970282/1‑94 (MQ=60)
CTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGT > SRR4302535.2107445/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCCGTAT > SRR4302535.2026032/1‑94 (MQ=60)
TTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTAT < SRR4302535.68310/94‑1 (MQ=60)
TGCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTAT < SRR4302535.2273693/94‑1 (MQ=60)
CTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGA > SRR4302535.766772/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGA > SRR4302535.797695/1‑94 (MQ=60)
TCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAG < SRR4302535.3716821/94‑1 (MQ=60)
CTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGT > SRR4302535.2440639/1‑94 (MQ=60)
CTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGT > SRR4302535.3938349/1‑94 (MQ=60)
CTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGT > SRR4302535.2490894/1‑94 (MQ=60)
CTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGT < SRR4302535.2977622/94‑1 (MQ=60)
CTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGT > SRR4302535.2897947/1‑94 (MQ=60)
TCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTA < SRR4302535.3987174/94‑1 (MQ=60)
TCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTA < SRR4302535.2746438/94‑1 (MQ=60)
CCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAA < SRR4302535.4397875/94‑1 (MQ=60)
CTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAAT < SRR4302535.3350355/94‑1 (MQ=60)
CTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAAT < SRR4302535.1986766/94‑1 (MQ=60)
CTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAAT < SRR4302535.1512274/94‑1 (MQ=60)
CGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACC < SRR4302535.3225869/94‑1 (MQ=60)
CGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACC > SRR4302535.1613156/1‑94 (MQ=60)
GCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCT < SRR4302535.4649766/94‑1 (MQ=60)
ACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTC > SRR4302535.4396970/1‑94 (MQ=60)
TGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCAC < SRR4302535.4494323/94‑1 (MQ=60)
GACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACC > SRR4302535.4660833/1‑94 (MQ=60)
GACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACC < SRR4302535.1489640/94‑1 (MQ=60)
ACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCT < SRR4302535.4504312/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCGTTTGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTT < SRR4302535.2927066/94‑1 (MQ=60)
TGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTC > SRR4302535.2673382/1‑94 (MQ=60)
GGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCC < SRR4302535.3771250/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCT < SRR4302535.4672959/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCT < SRR4302535.3393335/94‑1 (MQ=60)
CGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAA < SRR4302535.2428810/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATGCCTTCACCTTCCTAAAC > SRR4302535.3559874/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAAC < SRR4302535.1989131/94‑1 (MQ=60)
GTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAAC > SRR4302535.206226/1‑94 (MQ=60)
GTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATAGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTATCCACGATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAAC > SRR4302535.2513511/1‑94 (MQ=60)
TTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACG > SRR4302535.4004080/1‑94 (MQ=60)
GTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACG < SRR4302535.469174/94‑1 (MQ=60)
TGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGC > SRR4302535.709053/1‑94 (MQ=60)
GGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCC > SRR4302535.3030564/1‑94 (MQ=60)
GTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCG < SRR4302535.1055194/94‑1 (MQ=60)
ATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCA > SRR4302535.2150646/1‑94 (MQ=60)
ATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCA > SRR4302535.191283/1‑94 (MQ=60)
TGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATT < SRR4302535.2948312/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATT > SRR4302535.917225/1‑94 (MQ=60)
GTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTT < SRR4302535.3365735/94‑1 (MQ=60)
TCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTT < SRR4302535.3835244/94‑1 (MQ=60)
CACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTA < SRR4302535.1587582/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAT < SRR4302535.2847927/94‑1 (MQ=60)
CCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAT > SRR4302535.3467123/1‑94 (MQ=60)
CCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAAT < SRR4302535.886342/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCT < SRR4302535.527086/94‑1 (MQ=60)
GGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCT < SRR4302535.1063647/94‑1 (MQ=60)
GGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTC < SRR4302535.2417517/94‑1 (MQ=60)
ATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTA > SRR4302535.417120/1‑94 (MQ=60)
ATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTA > SRR4302535.1322641/1‑94 (MQ=60)
TGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTAT < SRR4302535.2995878/94‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTAT < SRR4302535.1931631/94‑1 (MQ=60)
GGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATC < SRR4302535.4215199/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCT > SRR4302535.2003323/1‑94 (MQ=60)
GTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCT < SRR4302535.4242043/94‑1 (MQ=60)
GTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCT > SRR4302535.3039653/1‑94 (MQ=60)
TGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTT > SRR4302535.2311386/1‑94 (MQ=60)
GATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTC < SRR4302535.2416417/94‑1 (MQ=60)
ATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCC > SRR4302535.3875852/1‑94 (MQ=60)
ATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCC < SRR4302535.3393454/94‑1 (MQ=60)
TGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCT > SRR4302535.2623348/1‑94 (MQ=60)
TGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCT > SRR4302535.736780/1‑94 (MQ=60)
GGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCA > SRR4302535.3284908/1‑94 (MQ=60)
AAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAAC < SRR4302535.856758/94‑1 (MQ=60)
TATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCC > SRR4302535.1617351/1‑94 (MQ=60)
ATCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCT > SRR4302535.2481108/1‑94 (MQ=60)
TCGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTG < SRR4302535.2364760/94‑1 (MQ=60)
CGCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGG < SRR4302535.3992470/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGC < SRR4302535.4126346/94‑1 (MQ=60)
GCCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGC > SRR4302535.2068163/1‑94 (MQ=60)
CCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCT > SRR4302535.2490385/1‑94 (MQ=60)
CCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCT > SRR4302535.2672982/1‑94 (MQ=60)
CCGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGACGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCT > SRR4302535.2345049/1‑94 (MQ=60)
CGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTG > SRR4302535.649154/1‑94 (MQ=60)
CGATTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTG < SRR4302535.3755399/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATG < SRR4302535.4545859/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATG < SRR4302535.708614/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATG < SRR4302535.1709263/94‑1 (MQ=60)
TTATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATG > SRR4302535.1189060/1‑94 (MQ=60)
TATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGG > SRR4302535.940451/1‑94 (MQ=60)
TATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGG < SRR4302535.3645102/94‑1 (MQ=60)
TATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGG < SRR4302535.3120122/94‑1 (MQ=60)
TATTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGG < SRR4302535.3418668/94‑1 (MQ=60)
TTTCAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAA > SRR4302535.3742530/1‑94 (MQ=60)
TTCAATCTTCCCGTTTCCAGTATGAGCAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCCACGCCTGGCTGATGGAAT > SRR4302535.691859/1‑94 (MQ=60)
TTCAATCTGCCCGTTTCCAGTCTGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTCTCTTCCACAACGCCTGcctgctcgcac > SRR4302535.2065090/1‑83 (MQ=60)
CAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATC < SRR4302535.221204/94‑1 (MQ=60)
CAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATC < SRR4302535.2093001/94‑1 (MQ=60)
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CAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATC > SRR4302535.1153022/1‑94 (MQ=60)
CAATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATC > SRR4302535.1535510/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGT > SRR4302535.2332110/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCCCGTTTCCAGTATAAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGT < SRR4302535.3925682/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCC < SRR4302535.960591/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCC < SRR4302535.4701555/94‑1 (MQ=60)
TGCCCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCC < SRR4302535.4395957/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTT < SRR4302535.173381/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTT > SRR4302535.3801739/1‑94 (MQ=60)
CCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTT < SRR4302535.3717540/94‑1 (MQ=60)
CCGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTT > SRR4302535.2681891/1‑94 (MQ=60)
CGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCCACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTG > SRR4302535.162477/1‑94 (MQ=60)
|
GATTAGCTTTCTCTCCTACGCACTGACTGGTGCGTTGGTTATTGTCACCGGGATGGTGATGGGAAATATCGCCGATTATTTCAATCTGCCTGTTTCCAGTATGAGTAATACCTTCACCTTCCTCAACGCCGGCATTTTAATCTCTATCTTCCTCAACGCCTGGCTGATGGAAATCGTCCCGTTG > NC_000913/3490237‑3490420
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
