| ALE, Flask, Isolate | Predicted Mutations | Mean Coverage | Total Reads | Percent Mapped | Mapped Reads | Average Read Length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A1 F1 I2 R1 | 1873 | 183.1 | 9376148 | 98.2% | 9207377 | 93.0 |
| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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yhfY ← yhfZ ← |
hypothetical protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,509,089 | 0 | T | C | 100.0% | 719.9 / NA | 228 | N5S (AAC→AGC) E225E (GAA→GAG) | yhfY yhfZ | hypothetical protein hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (131/97); total (131/97) | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > NC_000913/3508997‑3509181 | TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCT < SRR4302535.1269288/94‑1 (MQ=60) CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCC > SRR4302535.371027/1‑94 (MQ=60) CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCC > SRR4302535.1885419/1‑94 (MQ=60) CCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCAGCTCC > SRR4302535.4339412/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302535.2217928/1‑94 (MQ=60) CTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCT > SRR4302535.1259802/1‑94 (MQ=60) TTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTG < SRR4302535.189974/94‑1 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT < SRR4302535.3510906/94‑1 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT > SRR4302535.4228012/1‑94 (MQ=60) TTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGGTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGT > SRR4302535.1844473/1‑94 (MQ=60) TGCAGATGTCTTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT < SRR4302535.1251966/94‑1 (MQ=60) TGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT < SRR4302535.1021420/94‑1 (MQ=60) TGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTT < SRR4302535.4297409/94‑1 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302535.3902003/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGGTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302535.1682189/1‑94 (MQ=60) AGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTACATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCC > SRR4302535.1737787/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302535.3768852/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302535.4098483/1‑94 (MQ=60) GATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCC > SRR4302535.1441147/1‑94 (MQ=60) TGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCCC > SRR4302535.1075144/1‑94 (MQ=60) TGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCAC > SRR4302535.3830838/1‑94 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT < SRR4302535.391213/94‑1 (MQ=60) GTCCTTATCAATAACGCATGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACT < SRR4302535.2344994/94‑1 (MQ=60) TCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTC < SRR4302535.4103440/94‑1 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA > SRR4302535.1531188/1‑94 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA < SRR4302535.302488/94‑1 (MQ=60) CCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCA > SRR4302535.2385180/1‑94 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCTGCTCCTGCTCCCCACTCAC > SRR4302535.1210896/1‑94 (MQ=60) CTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCAC > SRR4302535.1382237/1‑94 (MQ=60) TTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACT < SRR4302535.4647275/94‑1 (MQ=60) TATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTC > SRR4302535.4536187/1‑94 (MQ=60) ATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTAC < SRR4302535.2745960/94‑1 (MQ=60) TCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGCTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACC > SRR4302535.2221759/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302535.775404/1‑94 (MQ=60) CAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCC > SRR4302535.410854/1‑94 (MQ=60) ATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGT > SRR4302535.4384183/1‑94 (MQ=60) ACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGT > SRR4302535.4594316/1‑94 (MQ=60) ACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGT < SRR4302535.3864543/94‑1 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT > SRR4302535.2427990/1‑94 (MQ=60) CGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTT > SRR4302535.4310961/1‑94 (MQ=60) CCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGA > SRR4302535.3952370/1‑94 (MQ=60) CCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCAATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGA > SRR4302535.2018590/1‑94 (MQ=60) CTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGAT < SRR4302535.2306690/94‑1 (MQ=60) TGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATG > SRR4302535.2062561/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302535.1498133/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302535.1953374/1‑94 (MQ=60) CTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGC > SRR4302535.3663395/1‑94 (MQ=60) TCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCG < SRR4302535.3763080/94‑1 (MQ=60) CGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGA < SRR4302535.4508658/94‑1 (MQ=60) CAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGC > SRR4302535.4149865/1‑94 (MQ=60) CAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGC > SRR4302535.3506585/1‑94 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302535.3189359/1‑94 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302535.835542/1‑94 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA < SRR4302535.1700283/94‑1 (MQ=60) AAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302535.4292635/1‑94 (MQ=60) AAACCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCA > SRR4302535.4008708/1‑94 (MQ=60) AGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGG < SRR4302535.1447471/94‑1 (MQ=60) AGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGG > SRR4302535.2557082/1‑94 (MQ=60) AGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGG < SRR4302535.161720/94‑1 (MQ=60) AGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGG > SRR4302535.3109817/1‑94 (MQ=60) GCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGG < SRR4302535.3824447/94‑1 (MQ=60) CAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGC > SRR4302535.3078304/1‑94 (MQ=60) GGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGT < SRR4302535.579822/94‑1 (MQ=60) GAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTT > SRR4302535.983654/1‑94 (MQ=60) GAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTT < SRR4302535.2640155/94‑1 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA < SRR4302535.4277987/94‑1 (MQ=60) AGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTA > SRR4302535.4633450/1‑94 (MQ=60) GTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTAT < SRR4302535.4648220/94‑1 (MQ=60) TCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATC > SRR4302535.3340795/1‑94 (MQ=60) TCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATC < SRR4302535.1874831/94‑1 (MQ=60) ttgggTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCT < SRR4302535.1319311/89‑1 (MQ=60) CTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTCTCT > SRR4302535.1383641/1‑94 (MQ=60) GGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAC > SRR4302535.1635074/1‑94 (MQ=60) GGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAC > SRR4302535.2401874/1‑94 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA < SRR4302535.1691167/94‑1 (MQ=60) GTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACA < SRR4302535.2139902/94‑1 (MQ=60) TTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAA < SRR4302535.3645718/94‑1 (MQ=60) CCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGG > SRR4302535.3041782/1‑94 (MQ=60) CATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGC < SRR4302535.2421292/94‑1 (MQ=60) CATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGC < SRR4302535.3594330/94‑1 (MQ=60) ATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCC > SRR4302535.812207/1‑94 (MQ=60) ATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCA < SRR4302535.4355595/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC < SRR4302535.2635124/94‑1 (MQ=60) TATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCAC > SRR4302535.4449618/1‑94 (MQ=60) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACG > SRR4302535.672834/1‑94 (MQ=60) ATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTAACACGGCACG > SRR4302535.909874/1‑94 (MQ=60) AGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAG > SRR4302535.3826974/1‑94 (MQ=60) GATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTTCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGC > SRR4302535.743329/1‑94 (MQ=60) GATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGC < SRR4302535.4470550/94‑1 (MQ=60) GATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGC > SRR4302535.1351302/1‑94 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA < SRR4302535.3955614/94‑1 (MQ=60) ATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCA > SRR4302535.25804/1‑94 (MQ=60) TGCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAG < SRR4302535.144071/94‑1 (MQ=60) GCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGT > SRR4302535.80982/1‑94 (MQ=60) GCCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGT > SRR4302535.3545981/1‑94 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATACCTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302535.4334330/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT > SRR4302535.4247167/1‑94 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302535.3968881/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT < SRR4302535.3655564/94‑1 (MQ=60) CCTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTT > SRR4302535.783483/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTTCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG < SRR4302535.2165542/94‑1 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG > SRR4302535.2882157/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG > SRR4302535.1466203/1‑94 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTG < SRR4302535.3207698/94‑1 (MQ=60) CTTTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACACGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAAAGGCACGCAGCAGTTG > SRR4302535.1859097/1‑94 (MQ=60) TTCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTT > SRR4302535.3655342/1‑94 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCTCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG < SRR4302535.297011/94‑1 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG < SRR4302535.1469745/94‑1 (MQ=60) TCGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTG < SRR4302535.923023/94‑1 (MQ=60) CGTTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGC > SRR4302535.1842946/1‑94 (MQ=60) TTTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCAT > SRR4302535.139750/1‑94 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATT < SRR4302535.1313708/94‑1 (MQ=60) TTAATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATT > SRR4302535.1819709/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG > SRR4302535.3840709/1‑94 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG < SRR4302535.269741/94‑1 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG < SRR4302535.3068638/94‑1 (MQ=60) AATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGG > SRR4302535.3447859/1‑94 (MQ=60) ATAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGG > SRR4302535.1989540/1‑94 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT < SRR4302535.1539136/94‑1 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT < SRR4302535.3679645/94‑1 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT < SRR4302535.1947048/94‑1 (MQ=60) TAACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGT < SRR4302535.1211664/94‑1 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA > SRR4302535.1100349/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA > SRR4302535.4169528/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA > SRR4302535.3407925/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA > SRR4302535.3354915/1‑94 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA < SRR4302535.3129548/94‑1 (MQ=60) AACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTA < SRR4302535.2856383/94‑1 (MQ=60) ACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAT > SRR4302535.1586472/1‑94 (MQ=60) ACTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAA > SRR4302535.3508326/1‑94 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT > SRR4302535.1079998/1‑94 (MQ=60) CTCGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAAT > SRR4302535.2217628/1‑94 (MQ=60) CGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCA > SRR4302535.1854119/1‑94 (MQ=60) CGGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCA < SRR4302535.2065068/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT < SRR4302535.1568984/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT < SRR4302535.19410/94‑1 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT > SRR4302535.913470/1‑94 (MQ=60) GGCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCAT < SRR4302535.2858126/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCCCTCACTCCCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC < SRR4302535.3060330/94‑1 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > SRR4302535.4230179/1‑94 (MQ=60) GCTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > SRR4302535.1757908/1‑94 (MQ=60) | TGCCTTTGCAGATGTCCTTATCAATAACGCCTGCCTCGCAAAGCAGGTTGAGTCTGGTTTCCATATCAGATGCCTTTCGTTTAATAACTCGGTTCCTGTTCCCCACTCACTACCCGTTGTTGATGGGCGAGCAGGGCGTGTTTATCTACAACGGCACGCAGCAGTTGTTGCATTGGGTAATCATC > NC_000913/3508997‑3509181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |