Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,544,971 |
T→C |
G259G (GGT→GGC) |
gntT → |
gluconate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,544,971 | 0 | T | C | 99.1%
| 693.8
/ ‑3.7
| 225 | G259G (GGT→GGC) | gntT | gluconate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (105/118); total (107/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.25e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
ggTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGa > 1:947242/1‑93 (MQ=255)
gTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAc < 1:208764/93‑1 (MQ=255)
gCCGGTATTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCTAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGAccc < 2:3054488/93‑1 (MQ=255)
cGGTAGTATTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCAAATTGATCCTGCCAAAAGTTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCgg < 2:3979413/93‑1 (MQ=255)
ggTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCgga > 1:3253482/1‑92 (MQ=255)
tagtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTaa > 1:597502/1‑93 (MQ=255)
agtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGAGCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAAt < 2:3363429/93‑1 (MQ=255)
gtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATg < 1:419725/93‑1 (MQ=255)
gtaCTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATg < 1:2352353/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCaa < 1:3382564/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCaa < 1:1584414/93‑1 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCaa > 2:3658582/1‑93 (MQ=255)
tGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGAGGAGATCCTCGTCCCCCCGGTAATGCCaa > 2:2216203/1‑93 (MQ=255)
gATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGGCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGCGTTCCTCGGCGCACCGGTAATGGCAAc > 1:1623311/1‑93 (MQ=255)
tGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGc < 1:4599198/93‑1 (MQ=255)
gggCGATGCTTGCGATTCCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGc < 2:755328/92‑1 (MQ=255)
gCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTg > 1:2168646/1‑93 (MQ=255)
cGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGa < 2:455279/93‑1 (MQ=255)
gaggcgtgcgATTGCAGAAATGATCCTGCAGAAAGCTCACGCTTCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt < 1:363794/90‑1 (MQ=255)
gATGCGTGCGTTTCCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt < 2:649915/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGTGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt < 1:4670096/93‑1 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt > 1:2471356/1‑93 (MQ=255)
gATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAt < 2:330272/93‑1 (MQ=255)
aTGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTCATGGCAACGCTGAtt > 2:3558005/1‑93 (MQ=255)
aTGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAtt < 2:160488/93‑1 (MQ=255)
aTGCGTGCGATTGCCAAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAtt < 1:4050795/93‑1 (MQ=255)
gcgtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGc < 1:2120319/93‑1 (MQ=255)
gtgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGCGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCCACGATGATTGCCg > 2:1736813/1‑93 (MQ=255)
tgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGt < 2:2650265/93‑1 (MQ=255)
tgcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGt < 1:4541830/93‑1 (MQ=255)
gcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTg > 1:3797024/1‑93 (MQ=255)
gcgATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTg < 1:1683048/93‑1 (MQ=255)
gATTGACGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCt < 1:2386270/93‑1 (MQ=255)
gCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGAtt < 2:2387240/93‑1 (MQ=255)
cGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGc < 1:204247/93‑1 (MQ=255)
gAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCg < 1:2626540/93‑1 (MQ=255)
aaaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGa > 2:2089464/1‑93 (MQ=255)
aaggATCCTGCGAAAAGGTCACGTTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt < 2:4244401/90‑1 (MQ=255)
aaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCTGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt < 2:3163563/93‑1 (MQ=255)
aaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt < 2:852278/93‑1 (MQ=255)
aaTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAt > 1:3272472/1‑93 (MQ=255)
aTGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATg > 1:81866/1‑93 (MQ=255)
tGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGt > 1:3955820/1‑93 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGtt > 2:1198220/1‑93 (MQ=255)
gATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGAAGCGGAGTTCCTCGGGGCCCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAtttt > 2:4410014/1‑93 (MQ=255)
aTCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc > 1:2128784/1‑93 (MQ=255)
aTCCGGCCGAAAGGTCACGCTTCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTc < 2:1816437/93‑1 (MQ=255)
cTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCAcc < 2:3698359/93‑1 (MQ=255)
tGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCt > 1:4325115/1‑93 (MQ=255)
gCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCGTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCtt < 2:696763/93‑1 (MQ=255)
ccGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCttt < 1:580312/93‑1 (MQ=255)
cGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTg > 1:1141271/1‑93 (MQ=255)
gAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTgg > 1:4445652/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTc > 1:1888744/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTc > 1:3475680/1‑93 (MQ=255)
aaGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTc > 1:3547411/1‑93 (MQ=255)
agctCACGCTTCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCt < 1:959600/90‑1 (MQ=255)
ggTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTa < 2:172163/93‑1 (MQ=255)
tCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTaaa < 1:1010373/93‑1 (MQ=255)
cACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAc < 2:392955/93‑1 (MQ=255)
aCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAcc > 1:716236/1‑93 (MQ=255)
cGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCg < 2:612388/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt > 2:2277262/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt > 2:2851484/1‑93 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt < 2:4328363/93‑1 (MQ=255)
gCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGt > 1:4628173/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCTGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 2:2126170/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg < 2:4081718/93‑1 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 1:1316669/1‑93 (MQ=255)
tttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTgg > 1:3715096/1‑93 (MQ=255)
ttCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGt < 2:1084095/93‑1 (MQ=255)
tcccTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGt < 1:292028/91‑1 (MQ=255)
tcccTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGt < 2:1397580/91‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGt < 1:2266309/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGtt > 2:515240/1‑93 (MQ=255)
ccGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCa > 1:2843863/1‑93 (MQ=255)
cGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCaa > 1:841307/1‑93 (MQ=255)
ggTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAt < 2:2748734/93‑1 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGTTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg < 1:2796992/93‑1 (MQ=255)
gTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATg < 1:4138015/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATgg < 2:4129775/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATgg < 2:3435877/93‑1 (MQ=255)
tAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATgg < 2:1965020/93‑1 (MQ=255)
accGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCTTGCTGATTGCGTTGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGa < 2:2529836/91‑1 (MQ=255)
gCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAt < 1:1233185/93‑1 (MQ=255)
cGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATc > 2:1266718/1‑93 (MQ=255)
ggAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGCTCAATGGATCa > 2:1574781/1‑93 (MQ=255)
gAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAg < 2:3466088/93‑1 (MQ=255)
aGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGa < 2:879624/93‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt > 1:2450456/1‑93 (MQ=255)
gTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAt < 1:196422/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGCTTa > 1:52712/1‑93 (MQ=255)
gcTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTaa > 1:4424293/2‑93 (MQ=255)
ccTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTaa < 1:3058983/93‑1 (MQ=255)
ccTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTaa < 2:746633/93‑1 (MQ=255)
cTCGGCGCCCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAc < 2:2354006/93‑1 (MQ=255)
tCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACg > 1:1512638/1‑93 (MQ=255)
tCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACg > 2:785499/1‑93 (MQ=255)
tCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAATAACg < 2:2625855/93‑1 (MQ=255)
cGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGa < 2:2997089/93‑1 (MQ=255)
|
GGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA > NC_000913/3544881‑3545060
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544879‑3545064
|
CTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCG < SRR4302535.1645008/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCG > SRR4302535.836265/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGA > SRR4302535.953954/1‑94 (MQ=60)
GTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACC < SRR4302535.210198/94‑1 (MQ=60)
GTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGATCCTCGGCGACC > SRR4302535.2141526/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGA > SRR4302535.3276086/1‑94 (MQ=60)
GTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAA > SRR4302535.601684/1‑94 (MQ=60)
AGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATG > SRR4302535.3639937/1‑94 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG > SRR4302535.3530917/1‑94 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG < SRR4302535.422659/94‑1 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG < SRR4302535.2377256/94‑1 (MQ=60)
GTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGG < SRR4302535.2369217/94‑1 (MQ=60)
ACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCA < SRR4302535.948502/94‑1 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCCA > SRR4302535.487207/1‑94 (MQ=60)
CTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAA > SRR4302535.2488318/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAAC < SRR4302535.3406079/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAAC < SRR4302535.2808641/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAAC > SRR4302535.4701241/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAAC < SRR4302535.1595845/94‑1 (MQ=60)
TGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGGCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGCGTTCCTCGGCGCACCGGTAATGGCAAC > SRR4302535.1635029/1‑94 (MQ=60)
GATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACG > SRR4302535.458481/1‑94 (MQ=60)
TGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCT < SRR4302535.4630484/94‑1 (MQ=60)
GGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTG > SRR4302535.2617163/1‑94 (MQ=60)
GGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTG > SRR4302535.2184184/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT < SRR4302535.772949/94‑1 (MQ=60)
CGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT > SRR4302535.2489171/1‑94 (MQ=60)
CGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGAT > SRR4302535.2592450/1‑94 (MQ=60)
GATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGTGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302535.4701643/94‑1 (MQ=60)
GATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302535.2875676/94‑1 (MQ=60)
GATGCGTGCGATTGCATAAATGATCCGCCCGAAAGGTCAGGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302535.2269722/94‑1 (MQ=60)
GAGGCGTGCGATTGCAGAAATGATCCTGCAGAAAGCTCACGCTTCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATT < SRR4302535.366302/94‑1 (MQ=60)
ATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTG > SRR4302535.2057056/1‑94 (MQ=60)
ATGCGTGCGATTGCCAAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTG < SRR4302535.4078526/94‑1 (MQ=60)
TGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGC < SRR4302535.385517/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCC < SRR4302535.2135612/94‑1 (MQ=60)
GCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCC < SRR4302535.4464703/94‑1 (MQ=60)
CGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCG > SRR4302535.3307386/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTG > SRR4302535.3823199/1‑94 (MQ=60)
TGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTG < SRR4302535.1301796/94‑1 (MQ=60)
TGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTG < SRR4302535.4572898/94‑1 (MQ=60)
TGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTG > SRR4302535.117030/1‑94 (MQ=60)
GCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGC < SRR4302535.1695240/94‑1 (MQ=60)
GCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGC > SRR4302535.2245565/1‑94 (MQ=60)
CGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCT < SRR4302535.3586491/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCTGCGACACGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG > SRR4302535.66913/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG > SRR4302535.3457280/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG > SRR4302535.2134692/1‑94 (MQ=60)
GATTGACGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTG < SRR4302535.2403419/94‑1 (MQ=60)
GCCGAAATGAGCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTG < SRR4302535.904680/94‑1 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG > SRR4302535.228542/1‑94 (MQ=60)
CGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCG < SRR4302535.205646/94‑1 (MQ=60)
GAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGA < SRR4302535.2645360/94‑1 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302535.3754827/94‑1 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302535.1768463/94‑1 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT > SRR4302535.3295205/1‑94 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT < SRR4302535.3071061/94‑1 (MQ=60)
AAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGAT > SRR4302535.4259917/1‑94 (MQ=60)
AATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATG > SRR4302535.82450/1‑94 (MQ=60)
AATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATG > SRR4302535.1565/1‑94 (MQ=60)
ATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGT > SRR4302535.3982833/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGCCCCGGTAATGGCCACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302535.840328/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302535.2095729/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302535.2144132/1‑94 (MQ=60)
GATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTC > SRR4302535.1600774/1‑94 (MQ=60)
ATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA < SRR4302535.4391533/94‑1 (MQ=60)
ATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCAGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA > SRR4302535.1530239/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCA < SRR4302535.57382/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACC < SRR4302535.165480/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCT > SRR4302535.4354694/1‑94 (MQ=60)
TGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTT < SRR4302535.593036/94‑1 (MQ=60)
CCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG < SRR4302535.584391/94‑1 (MQ=60)
CCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTG > SRR4302535.1149406/1‑94 (MQ=60)
CGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGG > SRR4302535.4476140/1‑94 (MQ=60)
GAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGT > SRR4302535.3912044/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTC > SRR4302535.1902349/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTC > SRR4302535.3499834/1‑94 (MQ=60)
AAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTC > SRR4302535.3572038/1‑94 (MQ=60)
AGCTCACGCTTCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTA < SRR4302535.966413/94‑1 (MQ=60)
GTCGCGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAA < SRR4302535.4560842/94‑1 (MQ=60)
GTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAA > SRR4302535.956443/1‑94 (MQ=60)
GTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAA > SRR4302535.4655722/1‑94 (MQ=60)
TCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAC < SRR4302535.2431059/94‑1 (MQ=60)
TCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAC < SRR4302535.1017550/94‑1 (MQ=60)
GCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAAC < SRR4302535.2141722/94‑1 (MQ=60)
CACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACC > SRR4302535.721269/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCG > SRR4302535.4216028/1‑94 (MQ=60)
CGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGT < SRR4302535.788998/94‑1 (MQ=60)
CGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGT > SRR4302535.4659587/1‑94 (MQ=60)
GCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTG > SRR4302535.2449003/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302535.3740833/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302535.1284082/1‑94 (MQ=60)
CTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGG > SRR4302535.1326076/1‑94 (MQ=60)
TTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGT > SRR4302535.348894/1‑94 (MQ=60)
TTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC < SRR4302535.3293839/94‑1 (MQ=60)
TCCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTC < SRR4302535.294069/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTT > SRR4302535.2875160/1‑94 (MQ=60)
CTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTT < SRR4302535.2282459/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCA > SRR4302535.2864028/1‑94 (MQ=60)
GCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCA < SRR4302535.4662752/94‑1 (MQ=60)
CCGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAA > SRR4302535.847209/1‑94 (MQ=60)
CGGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAAT < SRR4302535.2048246/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG < SRR4302535.3682398/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG < SRR4302535.319554/94‑1 (MQ=60)
GGTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATG > SRR4302535.4539039/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGTTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGG < SRR4302535.2816895/94‑1 (MQ=60)
GTAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGG < SRR4302535.4166353/94‑1 (MQ=60)
TAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGGTGATTGCCGTCCTGATTGCGATGTTCCCCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGA < SRR4302535.533611/94‑1 (MQ=60)
TAGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGA < SRR4302535.4033542/94‑1 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTGACCTTTGGTCTAAACCGTGGCCGTTCAATGGAC > SRR4302535.2571143/1‑94 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT > SRR4302535.407928/1‑94 (MQ=60)
AGCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGAT > SRR4302535.4166292/1‑94 (MQ=60)
GCGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATC < SRR4302535.1242003/94‑1 (MQ=60)
CGGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCA < SRR4302535.1464427/94‑1 (MQ=60)
GGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAG > SRR4302535.1089780/1‑94 (MQ=60)
GGAGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAG > SRR4302535.2166206/1‑94 (MQ=60)
AGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAT > SRR4302535.1905330/1‑94 (MQ=60)
AGTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGAT > SRR4302535.2468112/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT > SRR4302535.2830090/1‑94 (MQ=60)
GTTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATT < SRR4302535.197773/94‑1 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGCTTA > SRR4302535.53097/1‑94 (MQ=60)
TTCCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTA > SRR4302535.441467/1‑94 (MQ=60)
TGCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAA > SRR4302535.4454593/1‑94 (MQ=60)
CCTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAAC < SRR4302535.3080379/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACG < SRR4302535.3141157/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACG > SRR4302535.1523534/1‑94 (MQ=60)
TCGGCGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGA < SRR4302535.1859854/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG < SRR4302535.4072578/94‑1 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > SRR4302535.1124715/1‑94 (MQ=60)
CGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > SRR4302535.1606265/1‑94 (MQ=60)
|
CTGGTGCCGGTAGTACTGATGGCGATGCGTGCGATTGCCGAAATGATCCTGCCGAAAGGTCACGCTTTCCTGCCGGTAGCGGAGTTCCTCGGTGACCCGGTAATGGCAACGCTGATTGCCGTGCTGATTGCGATGTTCACCTTTGGTCTAAACCGTGGTCGTTCAATGGATCAGATTAACGACACG > NC_000913/3544879‑3545064
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
