Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,573,700 |
+C |
intergenic (+403/+997) |
yhgN → / ← gntK |
hypothetical protein/gluconokinase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,573,700 | 1 | . | C | 100.0%
| 520.7
/ NA
| 167 | intergenic (+403/+997) | yhgN/gntK | hypothetical protein/gluconokinase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (93/74); total (93/74) |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
ACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG > NC_000913/3573609‑3573786
|
aGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGTCCCATGCCGGGTAACgctt < 2:4579779/93‑4 (MQ=255)
aGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgctt > 1:3602589/1‑90 (MQ=255)
aGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGGTAACgctt > 2:1821434/1‑90 (MQ=255)
ggCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc > 2:881444/1‑89 (MQ=255)
ggCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc < 2:4623467/93‑5 (MQ=255)
ggCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACgcttc < 2:2336897/93‑5 (MQ=255)
aCGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGccc < 2:1365037/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCACGCCGGTTAACGCTTCGccc > 1:849986/1‑93 (MQ=255)
gTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGt > 1:4356015/1‑93 (MQ=255)
tGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 2:170616/93‑1 (MQ=255)
tGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTg < 1:71730/93‑1 (MQ=255)
gCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc < 2:930191/93‑1 (MQ=255)
gCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGcc < 2:1937151/93‑1 (MQ=255)
aGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCgg > 2:1166127/1‑93 (MQ=255)
aGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCgg > 2:3512011/1‑93 (MQ=255)
gAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCggc > 1:584885/1‑92 (MQ=255)
gAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGa > 1:256976/1‑93 (MQ=255)
aCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCCGTGCCGGAcc > 1:1340403/1‑93 (MQ=255)
aCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGAcc < 2:2736411/93‑1 (MQ=255)
aCCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGAcc > 1:183674/1‑93 (MQ=255)
cccTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGGCCATGCCGGTTAAAGCTTCGCCCAGTGCCGGACCt > 2:1962155/1‑93 (MQ=255)
cccTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCt < 1:3215113/93‑1 (MQ=255)
cTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAc > 1:2858405/1‑93 (MQ=255)
cTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAc < 2:3468840/93‑1 (MQ=255)
cTGAATGAGGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAc < 2:1756663/93‑1 (MQ=255)
gAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGc > 1:44970/1‑93 (MQ=255)
gAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGc > 2:1988240/1‑93 (MQ=255)
gAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGc < 1:1189498/93‑1 (MQ=255)
atgatgCGCACTGCAGCTGCCAGTACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCTGCCAGGGTCGGACCTACGccc > 2:3791346/1‑92 (MQ=255)
gatgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCaga < 2:115571/93‑1 (MQ=255)
atgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCagag < 1:1748848/93‑1 (MQ=255)
tgCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGt > 1:2884039/1‑93 (MQ=255)
gcgcACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTc > 2:2913441/1‑93 (MQ=255)
gcgcACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTc < 1:3608719/93‑1 (MQ=255)
gcACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCaa > 2:3655900/1‑93 (MQ=255)
aCTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAAcc < 1:923547/93‑1 (MQ=255)
cTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCCTGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCACCCa > 2:2446530/1‑93 (MQ=255)
cAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCa > 2:3745552/1‑93 (MQ=255)
gCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCAcc > 2:3290633/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 1:2049279/93‑1 (MQ=255)
tGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg > 2:1729929/1‑93 (MQ=255)
tGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTg < 1:1122725/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGt < 2:74745/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGt < 1:2999935/93‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGtt < 2:1651400/93‑1 (MQ=255)
cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGttt < 2:2391451/93‑1 (MQ=255)
cAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGttt > 1:3657157/1‑93 (MQ=255)
aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg > 2:4340676/1‑93 (MQ=255)
aGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTg < 2:1309926/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAaca < 2:1073079/93‑1 (MQ=255)
cGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAaca < 2:4313963/93‑1 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcg > 2:4426359/1‑93 (MQ=255)
aaGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcg > 2:3522319/1‑93 (MQ=255)
aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgc < 1:3549394/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgc < 2:4594137/93‑1 (MQ=255)
aGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgc > 2:4053915/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAcgcc > 1:1434469/1‑93 (MQ=255)
ggTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACgccgcc > 2:1501590/1‑93 (MQ=255)
gTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgccc > 1:1534716/1‑93 (MQ=255)
gTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgccc < 2:3966410/93‑1 (MQ=255)
tGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgcccg > 1:3264756/1‑93 (MQ=255)
gATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAAGccgcccgc > 1:1944688/1‑93 (MQ=255)
aTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGccgcccgcc > 1:3167399/1‑92 (MQ=255)
aTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCa > 2:4639817/1‑93 (MQ=255)
aTAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCa > 2:4465131/1‑93 (MQ=255)
aGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCAcc < 1:3851838/93‑1 (MQ=255)
gCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCa > 1:493248/1‑93 (MQ=255)
cAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCaa > 2:3044435/1‑93 (MQ=255)
aaTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAt > 1:2737891/1‑93 (MQ=255)
aaTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAt > 1:1701386/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATc < 1:1986669/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAc < 1:4007654/93‑1 (MQ=255)
cGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAc < 2:4634787/93‑1 (MQ=255)
ggCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAcc < 2:2574263/93‑1 (MQ=255)
gCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACca < 1:3091644/93‑1 (MQ=255)
gCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACca > 1:2631241/1‑93 (MQ=255)
gCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACca > 1:2479837/1‑93 (MQ=255)
aGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagc < 1:1275296/93‑1 (MQ=255)
aGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagc > 2:3602836/1‑93 (MQ=255)
aGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagc > 1:986092/1‑93 (MQ=255)
ggCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagca > 2:2224396/1‑93 (MQ=255)
ggCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACcagca > 1:3750166/1‑93 (MQ=255)
cccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGa < 2:330636/93‑1 (MQ=255)
ccATGCCGTTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGCACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGaa > 2:4577927/1‑93 (MQ=255)
ccATGCCGGTTAACGCTTCTCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGaa < 1:1704794/93‑1 (MQ=255)
ccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGaa > 2:2626259/1‑93 (MQ=255)
ccATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGaa < 2:2044974/93‑1 (MQ=255)
cATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAAt > 2:2695561/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg < 2:3723870/93‑1 (MQ=255)
aTGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg > 2:2792974/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATg > 2:2469440/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTTAACGCTTCGTCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGGACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCAGCAGCAGGATGa > 2:2056932/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGa > 2:614633/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGa > 1:2325182/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGa > 1:4072591/1‑93 (MQ=255)
gCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGAt < 2:564747/93‑1 (MQ=255)
ggTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATccc < 2:3420589/93‑1 (MQ=255)
cgTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATccc < 1:3437244/92‑1 (MQ=255)
gTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCCATCACCAGCAGAATGATcccc > 1:1073724/1‑93 (MQ=255)
gTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATcccc < 2:3915630/93‑1 (MQ=255)
|
ACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCG > NC_000913/3573609‑3573786
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTG > NC_000913/3573607‑3573793
|
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG < SRR4302535.3277645/94‑1 (MQ=60)
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG < SRR4302535.2986679/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑CT < SRR4302535.2878313/94‑1 (MQ=60)
ACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑CT < SRR4302535.1304843/94‑1 (MQ=60)
CAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGctt > SRR4302535.3627587/1‑91 (MQ=60)
GGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCG < SRR4302535.4552944/94‑1 (MQ=60)
GGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCG > SRR4302535.554148/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCC > SRR4302535.3398462/1‑94 (MQ=60)
TACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCACGCCGGTTAACGCTTCGCCC > SRR4302535.855973/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGT > SRR4302535.4385831/1‑94 (MQ=60)
GTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTG < SRR4302535.990354/94‑1 (MQ=60)
TGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGC < SRR4302535.72254/94‑1 (MQ=60)
AGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGC > SRR4302535.588985/1‑94 (MQ=60)
AGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGA > SRR4302535.258747/1‑94 (MQ=60)
AGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGA > SRR4302535.377009/1‑94 (MQ=60)
AACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCCGTGCCGGACC > SRR4302535.1349966/1‑94 (MQ=60)
AACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACC > SRR4302535.184938/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCT > SRR4302535.3465667/1‑94 (MQ=60)
CCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTA < SRR4302535.3237381/94‑1 (MQ=60)
CCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAC > SRR4302535.1847559/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAC > SRR4302535.2878656/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAC > SRR4302535.298524/1‑94 (MQ=60)
CCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTAC < SRR4302535.4010924/94‑1 (MQ=60)
TGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGC > SRR4302535.45309/1‑94 (MQ=60)
GAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCC < SRR4302535.1198017/94‑1 (MQ=60)
AATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCA > SRR4302535.2503014/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGT > SRR4302535.2904446/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGT < SRR4302535.1761500/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGT > SRR4302535.3873833/1‑94 (MQ=60)
tccgctgtgcgGCTGCCAGCGCGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTC < SRR4302535.1190007/83‑1 (MQ=60)
GCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCA < SRR4302535.3633745/94‑1 (MQ=60)
GCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCA < SRR4302535.4508265/94‑1 (MQ=60)
CGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAA > SRR4302535.721338/1‑94 (MQ=60)
GCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAAC < SRR4302535.2017596/94‑1 (MQ=60)
CACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACC < SRR4302535.1975174/94‑1 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCA < SRR4302535.930091/94‑1 (MQ=60)
ACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCA < SRR4302535.1236312/94‑1 (MQ=60)
GCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCA < SRR4302535.3207711/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGT < SRR4302535.2064034/94‑1 (MQ=60)
TGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGT < SRR4302535.1130737/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTT < SRR4302535.3020967/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCAAGAGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGAT > SRR4302535.1539399/1‑94 (MQ=60)
CCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTT > SRR4302535.3682470/1‑94 (MQ=60)
CCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTT < SRR4302535.763715/94‑1 (MQ=60)
CAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTG < SRR4302535.3115791/94‑1 (MQ=60)
CAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTG > SRR4302535.1387779/1‑94 (MQ=60)
ACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCATTGCCGGACCCACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACA < SRR4302535.544478/94‑1 (MQ=60)
AAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGC < SRR4302535.1739538/94‑1 (MQ=60)
AGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCC > SRR4302535.1444711/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCC < SRR4302535.3574029/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGC > SRR4302535.1176054/1‑94 (MQ=60)
GGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCC > SRR4302535.1545773/1‑94 (MQ=60)
GGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCC < SRR4302535.1560469/94‑1 (MQ=60)
GTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCG > SRR4302535.3287429/1‑94 (MQ=60)
TGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACAAGCCGCCCGC > SRR4302535.1958689/1‑94 (MQ=60)
GATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCC > SRR4302535.3189344/1‑94 (MQ=60)
GATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCA > SRR4302535.1900874/1‑94 (MQ=60)
AGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCA > SRR4302535.496704/1‑94 (MQ=60)
AGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCA < SRR4302535.3878341/94‑1 (MQ=60)
CAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAT > SRR4302535.1713682/1‑94 (MQ=60)
CAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAT > SRR4302535.2757419/1‑94 (MQ=60)
CAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAAT < SRR4302535.216724/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCA < SRR4302535.2000975/94‑1 (MQ=60)
CGGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACC < SRR4302535.4035072/94‑1 (MQ=60)
GGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCA > SRR4302535.2650092/1‑94 (MQ=60)
GGCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCA > SRR4302535.2497719/1‑94 (MQ=60)
GCAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAG < SRR4302535.3113174/94‑1 (MQ=60)
CAGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGC > SRR4302535.993097/1‑94 (MQ=60)
AGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCA > SRR4302535.3776112/1‑94 (MQ=60)
AGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCA > SRR4302535.2638214/1‑94 (MQ=60)
AGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCA < SRR4302535.1284402/94‑1 (MQ=60)
AGGCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCA > SRR4302535.2899505/1‑94 (MQ=60)
GCCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCCATCACCAGCAGA > SRR4302535.2737056/1‑94 (MQ=60)
CCCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAA < SRR4302535.897850/94‑1 (MQ=60)
CCATGCCGGTTAACGCTTCTCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAAT < SRR4302535.1717118/94‑1 (MQ=60)
CCATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAAT < SRR4302535.324866/94‑1 (MQ=60)
ATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGA > SRR4302535.4100461/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGA > SRR4302535.2341818/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGAT < SRR4302535.4324420/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATC < SRR4302535.4075793/94‑1 (MQ=60)
GCCGGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATC < SRR4302535.3625687/94‑1 (MQ=60)
GGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCCATCACCAGCAGAATGATCCCC > SRR4302535.1081361/1‑94 (MQ=60)
CGTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCC < SRR4302535.3461153/94‑1 (MQ=60)
GTTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCC > SRR4302535.3638242/1‑94 (MQ=60)
TTAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGC > SRR4302535.4285269/1‑94 (MQ=60)
TAACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCC > SRR4302535.4427314/1‑94 (MQ=60)
AACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCACCGCCG > SRR4302535.4426029/1‑94 (MQ=60)
ACGCTTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGG < SRR4302535.3581201/94‑1 (MQ=60)
C‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTG < SRR4302535.2571970/94‑1 (MQ=60)
|
AAACAGGCTACGGTGGCAGAACCCTGAATGATGCGCACTGCAGCTGCCAGCACGAAGCAGGTGATAGCAATCGGCAGGCCCATGCCGGTTAACG‑TTCGCCCAGTGCCGGACCTACGCCAGAGTCAACCAGCACCTGTTTGAACACGCCGCCCGCACCAATCACCAGCAGAATGATCCCCGCCGGTTG > NC_000913/3573607‑3573793
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
