Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,743,603 |
Δ1 bp |
coding (1171/1275 nt) |
yiaN → |
putative membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,743,603 | 0 | C | . | 100.0%
| 973.3
/ NA
| 211 | coding (1171/1275 nt) | yiaN | putative membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (83/128); total (83/128) |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCT > NC_000913/3743515‑3743689
|
tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 2:4582132/93‑1 (MQ=255)
tCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAg > 2:3561827/1‑93 (MQ=255)
tCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAg < 1:4136083/93‑1 (MQ=255)
cATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGt > 1:2876131/1‑93 (MQ=255)
aTTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTc > 1:3927994/1‑93 (MQ=255)
aTTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTc > 1:1386217/1‑93 (MQ=255)
ttAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCa > 2:1659129/1‑93 (MQ=255)
aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCGGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag < 1:234973/93‑1 (MQ=255)
aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag > 1:228836/1‑93 (MQ=255)
cTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAgg < 2:532595/93‑1 (MQ=255)
cTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAgg < 1:764941/93‑1 (MQ=255)
atGCTCAATCGGATTAATCACTCCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAgg < 1:921767/92‑1 (MQ=255)
tGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGc > 2:2690113/1‑93 (MQ=255)
tGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGc > 2:1293558/1‑93 (MQ=255)
ctaaaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGt > 1:4247268/4‑93 (MQ=255)
cTCAATCCGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCACATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGt > 1:3591127/1‑93 (MQ=255)
tCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtt < 2:2602732/93‑1 (MQ=255)
cAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGttt > 2:1797954/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc < 1:2837019/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTcc > 2:4078922/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTcc > 2:2480221/1‑93 (MQ=255)
cGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTccc < 2:2825194/93‑1 (MQ=255)
gCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCtt > 1:2173811/1‑93 (MQ=255)
cTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTa > 1:3717864/1‑93 (MQ=255)
cTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTa > 1:1001448/1‑93 (MQ=255)
cTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTa > 1:1086361/1‑93 (MQ=255)
ttAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAc < 1:119778/93‑1 (MQ=255)
tAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACg > 1:4544054/1‑93 (MQ=255)
tAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACg > 2:4427514/1‑93 (MQ=255)
tAATTACACCGCCTATCGGAAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGAGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACg > 1:2256388/1‑93 (MQ=255)
aaTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGt < 1:2988172/93‑1 (MQ=255)
aTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTc > 1:2671897/1‑93 (MQ=255)
aTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTc < 1:1597646/93‑1 (MQ=255)
ttACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTcc < 2:2784541/93‑1 (MQ=255)
tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 1:3117795/93‑1 (MQ=255)
acacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTg < 1:3864517/93‑1 (MQ=255)
acacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTg < 1:4630899/93‑1 (MQ=255)
cacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTgg < 1:317943/93‑1 (MQ=255)
atcGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGt < 1:3025817/91‑1 (MQ=255)
ccGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtt < 2:2641764/93‑1 (MQ=255)
ccGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtt > 2:2959588/1‑93 (MQ=255)
cGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGttt < 2:1192250/93‑1 (MQ=255)
gCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtttt < 1:3370930/93‑1 (MQ=255)
ccTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTta < 1:1369615/93‑1 (MQ=255)
ccTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTta < 2:3696101/93‑1 (MQ=255)
cTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtat < 1:130107/93‑1 (MQ=255)
tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata < 2:3997183/93‑1 (MQ=255)
tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata > 2:1444165/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata > 1:200996/1‑93 (MQ=255)
tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata > 2:1853200/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat > 2:3404894/1‑93 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 2:2203293/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 1:47611/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 2:2510512/93‑1 (MQ=255)
aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 1:3240565/93‑1 (MQ=255)
cGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTc < 1:1426326/93‑1 (MQ=255)
ggTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCa < 2:1612336/93‑1 (MQ=255)
gtgaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCat < 2:2007915/90‑1 (MQ=255)
gTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCat < 2:211696/93‑1 (MQ=255)
gTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGGTTTATATTCat > 2:3836435/1‑93 (MQ=255)
tAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatt < 2:1399730/93‑1 (MQ=255)
tAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatt < 1:252393/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 2:2416425/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta < 2:3324924/93‑1 (MQ=255)
aaTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatta > 1:2749894/1‑93 (MQ=255)
aTGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCattat < 1:1845431/93‑1 (MQ=255)
gTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCAttatta < 2:1236899/93‑1 (MQ=255)
gTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCAttatta < 2:4123599/93‑1 (MQ=255)
tACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAg > 1:4297869/1‑93 (MQ=255)
tcTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGt < 1:3465199/92‑1 (MQ=255)
cTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTc > 2:2335139/1‑93 (MQ=255)
tAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGt > 2:428905/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa < 2:2908463/93‑1 (MQ=255)
aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa > 2:3627536/1‑93 (MQ=255)
aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa < 1:573943/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAtt < 2:4516339/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAtt < 2:662599/93‑1 (MQ=255)
cGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAtt > 1:1709202/1‑93 (MQ=255)
cGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAtt < 2:1175087/93‑1 (MQ=255)
gTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAttt > 2:3305450/1‑93 (MQ=255)
gTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAttt < 1:9728/93‑1 (MQ=255)
ttATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTg > 1:531676/1‑93 (MQ=255)
tttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttt < 2:1401917/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttt < 2:3474388/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGtttt < 2:1968032/93‑1 (MQ=255)
tCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttttt < 1:3952112/93‑1 (MQ=255)
tCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttttt > 1:3662023/1‑93 (MQ=255)
ggggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAtt < 2:1460655/93‑1 (MQ=255)
ggggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAtt > 2:573589/1‑93 (MQ=255)
gggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTc < 1:2757926/93‑1 (MQ=255)
gggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTc < 1:239844/93‑1 (MQ=255)
gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 1:784348/93‑1 (MQ=255)
gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc > 1:329686/1‑93 (MQ=255)
ggCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGa > 2:3794967/1‑93 (MQ=255)
aaaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtct > 2:619757/1‑93 (MQ=255)
aaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtctc > 2:2364126/1‑93 (MQ=255)
tCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatca < 1:4421977/93‑1 (MQ=255)
tCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatca < 1:3557189/93‑1 (MQ=255)
aaTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcc > 2:508611/1‑93 (MQ=255)
aTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcct < 1:3319998/93‑1 (MQ=255)
|
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCT > NC_000913/3743515‑3743689
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > NC_000913/3743510‑3743696
|
ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATG > SRR4302535.1123034/1‑94 (MQ=60)
GTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACGCCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GAT < SRR4302535.4158488/94‑1 (MQ=60)
GTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GAT < SRR4302535.2649733/94‑1 (MQ=60)
TTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATG < SRR4302535.1009753/94‑1 (MQ=60)
TTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGC < SRR4302535.595281/94‑1 (MQ=60)
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCA < SRR4302535.3677632/94‑1 (MQ=60)
TCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGT < SRR4302535.3296318/94‑1 (MQ=60)
TCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGT > SRR4302535.2896504/1‑94 (MQ=60)
TCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGT < SRR4302535.4164403/94‑1 (MQ=60)
CATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTC > SRR4302535.1396111/1‑94 (MQ=60)
CATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTC > SRR4302535.3954825/1‑94 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302535.2885615/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302535.3612952/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG < SRR4302535.4295946/94‑1 (MQ=60)
AACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAG > SRR4302535.230412/1‑94 (MQ=60)
ACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCGGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGG < SRR4302535.236597/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGC < SRR4302535.770329/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGC > SRR4302535.777019/1‑94 (MQ=60)
ATGCTCAATCGGATTAATCACTCCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGC < SRR4302535.928303/94‑1 (MQ=60)
GCTCAATCCGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCACATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGT > SRR4302535.3616035/1‑94 (MQ=60)
GCTAAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGT > SRR4302535.4276357/1‑94 (MQ=60)
TCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTT > SRR4302535.383822/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC < SRR4302535.1045327/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC > SRR4302535.1856206/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC > SRR4302535.1384368/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCC < SRR4302535.2857152/94‑1 (MQ=60)
ATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGGTTTCC > SRR4302535.2450847/1‑94 (MQ=60)
GGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTT > SRR4302535.3021202/1‑94 (MQ=60)
GGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTT > SRR4302535.2189359/1‑94 (MQ=60)
GCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTA > SRR4302535.1094084/1‑94 (MQ=60)
GCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTA > SRR4302535.1008564/1‑94 (MQ=60)
GCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTA > SRR4302535.3743625/1‑94 (MQ=60)
CTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAC < SRR4302535.332289/94‑1 (MQ=60)
CTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAC > SRR4302535.1507509/1‑94 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG < SRR4302535.120617/94‑1 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG < SRR4302535.3382948/94‑1 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG < SRR4302535.484362/94‑1 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG > SRR4302535.4575131/1‑94 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG > SRR4302535.2119896/1‑94 (MQ=60)
TTAATTACACCGCCTATCGGAAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGAGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACG > SRR4302535.2272451/1‑94 (MQ=60)
TAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGT < SRR4302535.978008/94‑1 (MQ=60)
AATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTC < SRR4302535.3009126/94‑1 (MQ=60)
AATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTC > SRR4302535.2691013/1‑94 (MQ=60)
ATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCC < SRR4302535.1609168/94‑1 (MQ=60)
ATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCC < SRR4302535.370619/94‑1 (MQ=60)
TTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCT < SRR4302535.1262955/94‑1 (MQ=60)
TACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTG < SRR4302535.3139499/94‑1 (MQ=60)
TCACCGCCTATCGTTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGCGTGGCAAAACTCAAATGCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGG < SRR4302535.1682396/94‑1 (MQ=60)
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ACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGG < SRR4302535.3891101/94‑1 (MQ=60)
ACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGG < SRR4302535.4662319/94‑1 (MQ=60)
ACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATACGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGG > SRR4302535.2293013/1‑94 (MQ=60)
CACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGT > SRR4302535.4395216/1‑94 (MQ=60)
CACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGT < SRR4302535.320147/94‑1 (MQ=60)
ATCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTT < SRR4302535.3047001/94‑1 (MQ=60)
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CCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTAT < SRR4302535.1379402/94‑1 (MQ=60)
CCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTAT < SRR4302535.311182/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA > SRR4302535.202368/1‑94 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA > SRR4302535.294089/1‑94 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA > SRR4302535.1104727/1‑94 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA < SRR4302535.754921/94‑1 (MQ=60)
CTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATA < SRR4302535.131022/94‑1 (MQ=60)
TATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAT < SRR4302535.3148384/94‑1 (MQ=60)
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ATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATT < SRR4302535.3535178/94‑1 (MQ=60)
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CGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCA < SRR4302535.2395185/94‑1 (MQ=60)
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TAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTA < SRR4302535.254133/94‑1 (MQ=60)
AATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGAGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTAT > SRR4302535.1428105/1‑94 (MQ=60)
ATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATT > SRR4302535.1797308/1‑94 (MQ=60)
ATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATT < SRR4302535.1858731/94‑1 (MQ=60)
GTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAG > SRR4302535.4327281/1‑94 (MQ=60)
GTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTCCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAG < SRR4302535.550709/94‑1 (MQ=60)
TACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGT < SRR4302535.3253511/94‑1 (MQ=60)
TCTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTC < SRR4302535.3489283/94‑1 (MQ=60)
ACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTC < SRR4302535.4008242/94‑1 (MQ=60)
ACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTC < SRR4302535.448416/94‑1 (MQ=60)
TTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGT < SRR4302535.800495/94‑1 (MQ=60)
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ACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATT > SRR4302535.1721559/1‑94 (MQ=60)
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CGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTT > SRR4302535.3958264/1‑94 (MQ=60)
GTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTG < SRR4302535.9805/94‑1 (MQ=60)
GTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTG > SRR4302535.535396/1‑94 (MQ=60)
TATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTT < SRR4302535.4680598/94‑1 (MQ=60)
TTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTT < SRR4302535.4227608/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTT < SRR4302535.3715135/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTT > SRR4302535.3687378/1‑94 (MQ=60)
TTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTT < SRR4302535.2668770/94‑1 (MQ=60)
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CAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAT > SRR4302535.2776502/1‑94 (MQ=60)
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GGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCC > SRR4302535.331973/1‑94 (MQ=60)
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GGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAT < SRR4302535.2344532/94‑1 (MQ=60)
CAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCT > SRR4302535.3187551/1‑94 (MQ=60)
ACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATC < SRR4302535.1326180/94‑1 (MQ=60)
ACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATC < SRR4302535.3455352/94‑1 (MQ=60)
TCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAT < SRR4302535.4452260/94‑1 (MQ=60)
TCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAT < SRR4302535.3581862/94‑1 (MQ=60)
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AATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCT > SRR4302535.939558/1‑94 (MQ=60)
ATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC < SRR4302535.3343099/94‑1 (MQ=60)
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CGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCT < SRR4302535.3960730/94‑1 (MQ=60)
CGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCT < SRR4302535.3787930/94‑1 (MQ=60)
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GAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTT < SRR4302535.1387058/94‑1 (MQ=60)
GAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTT < SRR4302535.1509067/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > SRR4302535.4294906/1‑94 (MQ=60)
TGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG < SRR4302535.208845/94‑1 (MQ=60)
TGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > SRR4302535.4517345/1‑94 (MQ=60)
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ATGTTTATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTCCCTTTG > NC_000913/3743510‑3743696
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
