Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,775,779 |
A→G |
I252V (ATT→GTT) |
lldP → |
L‑lactate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,775,779 | 0 | A | G | 100.0%
| 616.3
/ NA
| 194 | I252V (ATT→GTT) | lldP | L‑lactate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (89/105); total (89/105) |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775689‑3775868
|
gagaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGtt > 2:4005502/1‑93 (MQ=255)
gagaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGtt < 1:2659687/93‑1 (MQ=255)
agaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTGCCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTa < 1:1155551/93‑1 (MQ=255)
agaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTa < 2:2989294/93‑1 (MQ=255)
agaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTa < 2:3443374/93‑1 (MQ=255)
agaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTa > 1:3245577/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtc < 2:2405218/93‑1 (MQ=255)
aCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtc < 1:1793961/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCTGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATctct < 1:587812/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATctct < 1:4064678/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATctct < 1:2341304/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATctct < 1:3774263/93‑1 (MQ=255)
cTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGc > 2:1420350/1‑93 (MQ=255)
cTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGc > 2:4360779/1‑93 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTGTAACTTCATTAGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt > 1:3028641/1‑93 (MQ=255)
cGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTgg < 1:1530105/93‑1 (MQ=255)
cGGGCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTgg < 2:875943/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTa < 1:3640634/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGTGGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTa > 2:4562438/1‑93 (MQ=255)
cgcggTTGCGGGCGGCTCGTTGGCCATCGCTCAGTCCCTTAGCTCTAACTTCACTGGCCCGGACCTGACGGCCGTTATCTCTTCGCTGGCATc < 2:276412/90‑1 (MQ=255)
cGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATc < 2:1105810/93‑1 (MQ=255)
gTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCa > 1:2873744/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc > 2:62235/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc < 1:3195780/93‑1 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc > 2:3095642/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc < 1:668322/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACt < 1:2719571/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACt < 1:3992259/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTg < 2:1339418/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 1:949464/93‑1 (MQ=255)
gggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTg > 2:1781264/1‑93 (MQ=255)
cggcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCt > 2:16398/1‑93 (MQ=255)
cgcGTTTGCCATTGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGAc < 1:1462695/91‑1 (MQ=255)
tCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACg > 1:1223039/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGc > 2:1547958/1‑93 (MQ=255)
cGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGc < 2:4241845/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGc > 2:591889/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCt > 2:2238976/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCt > 1:3963971/1‑93 (MQ=255)
gTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCt > 1:3264774/1‑93 (MQ=255)
ttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGt > 1:1615801/1‑93 (MQ=255)
ttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGt < 2:2068501/93‑1 (MQ=255)
aTCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTTGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTACTc > 2:2701956/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTc > 2:2446123/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTc > 2:1583184/1‑93 (MQ=255)
cGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCaa > 2:2692813/1‑93 (MQ=255)
gCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCaaa > 1:3816748/1‑93 (MQ=255)
cAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGc < 1:3083341/93‑1 (MQ=255)
cAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGc > 2:2910664/1‑93 (MQ=255)
aGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCt > 2:1866355/1‑93 (MQ=255)
gTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTg > 1:1278024/1‑93 (MQ=255)
gTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTg < 2:858300/93‑1 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg > 1:4306837/1‑93 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg < 1:3590508/93‑1 (MQ=255)
ccTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCa < 1:186530/93‑1 (MQ=255)
ccTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCa > 2:3257210/1‑93 (MQ=255)
ccTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCa > 1:4216373/1‑93 (MQ=255)
aGCTCTAACTTCATTGGGCCGCAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCa < 1:1698658/93‑1 (MQ=255)
ctctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGt < 2:2841642/93‑1 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg > 2:3021717/1‑93 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg > 1:26000/1‑93 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg > 2:1044428/1‑93 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg > 1:4373613/1‑93 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc > 2:1889977/1‑93 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc < 2:3214952/93‑1 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc < 2:2308458/93‑1 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:762345/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:972721/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:2132751/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:1199876/1‑93 (MQ=255)
aaCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgt < 1:1008148/93‑1 (MQ=255)
aaCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgt < 2:538160/93‑1 (MQ=255)
ttCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTa < 1:862726/93‑1 (MQ=255)
tCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTAt < 2:2356149/93‑1 (MQ=255)
cATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTAtt < 1:1434450/93‑1 (MQ=255)
ttGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTcc < 2:3485106/93‑1 (MQ=255)
gggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCGGt > 2:1954495/1‑93 (MQ=255)
ggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 2:1240984/93‑1 (MQ=255)
ggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtt < 2:338521/93‑1 (MQ=255)
gCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGttt < 2:2574062/93‑1 (MQ=255)
ccGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtttt < 2:3585735/93‑1 (MQ=255)
ggAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTgg > 2:4302917/1‑93 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt < 1:1144547/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt < 1:4125326/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt < 2:1859345/93‑1 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACACTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt < 2:3755803/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa < 1:2049437/93‑1 (MQ=255)
gCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa > 1:2453694/1‑93 (MQ=255)
gCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGa > 2:3633230/1‑93 (MQ=255)
tGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAtt > 2:3925291/1‑93 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt < 2:3861556/93‑1 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt > 2:1680173/1‑93 (MQ=255)
ccGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTg > 1:1503854/1‑93 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg < 2:2756353/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGTCATCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg < 2:4048714/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg < 2:4440851/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg < 1:3478367/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg < 2:1526628/93‑1 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg > 1:4145486/1‑93 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg < 1:4296395/93‑1 (MQ=255)
|
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775689‑3775868
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > NC_000913/3775686‑3775872
|
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACG > SRR4302535.1987749/1‑94 (MQ=60)
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACG > SRR4302535.509282/1‑94 (MQ=60)
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTA < SRR4302535.2678740/94‑1 (MQ=60)
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTA > SRR4302535.3268115/1‑94 (MQ=60)
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTA > SRR4302535.4100799/1‑94 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTGCCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT < SRR4302535.1163809/94‑1 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT < SRR4302535.3547729/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCT < SRR4302535.1806932/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCTGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTT < SRR4302535.591932/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTT < SRR4302535.2358053/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTT < SRR4302535.4092493/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTT < SRR4302535.3800291/94‑1 (MQ=60)
GCCTGCGGTCGTGGTTGGGGGTGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCG < SRR4302535.3279880/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTGTAACTTCATTAGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCT > SRR4302535.3049842/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGT < SRR4302535.1541128/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTA > SRR4302535.2800041/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTA > SRR4302535.3623095/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTAT < SRR4302535.1521752/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTAT < SRR4302535.3665854/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTAT < SRR4302535.4333624/94‑1 (MQ=60)
GCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATGGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATC < SRR4302535.432125/94‑1 (MQ=60)
CGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCA > SRR4302535.2894106/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCA < SRR4302535.2125458/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT < SRR4302535.407167/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT < SRR4302535.672979/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT < SRR4302535.3217895/94‑1 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT > SRR4302535.1799698/1‑94 (MQ=60)
TGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTGCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACT < SRR4302535.2941623/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTG < SRR4302535.4019567/94‑1 (MQ=60)
GGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTG < SRR4302535.2739000/94‑1 (MQ=60)
GCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCT < SRR4302535.956187/94‑1 (MQ=60)
CGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTG < SRR4302535.376457/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCTCGTTTGCCATCGCGCAGTACCGTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCC < SRR4302535.3248061/94‑1 (MQ=60)
CGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTG > SRR4302535.1696045/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACG > SRR4302535.3087201/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACG > SRR4302535.1231791/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACG > SRR4302535.1936162/1‑94 (MQ=60)
CGCGTTTGCCATTGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACG < SRR4302535.1473173/94‑1 (MQ=60)
TCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGC > SRR4302535.668164/1‑94 (MQ=60)
TCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGC > SRR4302535.1475103/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCT > SRR4302535.3287449/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCT > SRR4302535.3991049/1‑94 (MQ=60)
CGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCT < SRR4302535.434912/94‑1 (MQ=60)
TTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGT > SRR4302535.1627446/1‑94 (MQ=60)
TGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTC > SRR4302535.3872234/1‑94 (MQ=60)
CCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCT < SRR4302535.1162041/94‑1 (MQ=60)
TCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAA > SRR4302535.4010914/1‑94 (MQ=60)
CGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAA > SRR4302535.3843084/1‑94 (MQ=60)
CGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAA < SRR4302535.780128/94‑1 (MQ=60)
CGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAA > SRR4302535.1471127/1‑94 (MQ=60)
CTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACG > SRR4302535.1848633/1‑94 (MQ=60)
CAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCT < SRR4302535.3104826/94‑1 (MQ=60)
AGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTG > SRR4302535.1287153/1‑94 (MQ=60)
AGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTG < SRR4302535.2706189/94‑1 (MQ=60)
AGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTAGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTG > SRR4302535.560904/1‑94 (MQ=60)
GTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGG < SRR4302535.1549162/94‑1 (MQ=60)
GTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGG > SRR4302535.4336302/1‑94 (MQ=60)
TACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGC < SRR4302535.3615413/94‑1 (MQ=60)
ACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCA > SRR4302535.4245226/1‑94 (MQ=60)
ACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCA > SRR4302535.1215031/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG < SRR4302535.187818/94‑1 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG > SRR4302535.2611144/1‑94 (MQ=60)
CCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAG > SRR4302535.2627725/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTAACTTCATTGGGCCGCAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAG < SRR4302535.1710935/94‑1 (MQ=60)
GCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGT < SRR4302535.4229937/94‑1 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302535.4403534/1‑94 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302535.26202/1‑94 (MQ=60)
CTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCG > SRR4302535.3349757/1‑94 (MQ=60)
AACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTG < SRR4302535.1015311/94‑1 (MQ=60)
ACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGT < SRR4302535.3175742/94‑1 (MQ=60)
CTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTA < SRR4302535.1057846/94‑1 (MQ=60)
CTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTA < SRR4302535.388345/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTAT < SRR4302535.868826/94‑1 (MQ=60)
CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC < SRR4302535.1444692/94‑1 (MQ=60)
CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC < SRR4302535.1265653/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCC > SRR4302535.2447906/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGG < SRR4302535.4163227/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG < SRR4302535.4153560/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG < SRR4302535.920197/94‑1 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG < SRR4302535.1152707/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGA > SRR4302535.2471380/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAT < SRR4302535.2064193/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATT > SRR4302535.1400341/1‑94 (MQ=60)
GCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTG > SRR4302535.1514672/1‑94 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG < SRR4302535.3502537/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > SRR4302535.4173874/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG > SRR4302535.2465817/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG < SRR4302535.4325796/94‑1 (MQ=60)
ACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGC < SRR4302535.2645041/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > SRR4302535.4149113/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > SRR4302535.4598055/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > SRR4302535.2761920/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > SRR4302535.2424125/1‑94 (MQ=60)
|
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > NC_000913/3775686‑3775872
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
