Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1696 |
279.3 |
15874187 |
97.8% |
15524954 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,775,779 |
A→G |
I252V (ATT→GTT) |
lldP → |
L‑lactate permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,775,779 | 0 | A | G | 100.0%
| 1186.5
/ NA
| 371 | I252V (ATT→GTT) | lldP | L‑lactate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (172/199); total (172/199) |
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775689‑3775868
|
gagaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGtt < 1:3653600/93‑1 (MQ=255)
gaCGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAt > 2:7136511/1‑93 (MQ=255)
cGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAtct < 1:2093582/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATctct > 1:7299000/1‑93 (MQ=255)
ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCtt < 2:6359041/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCtt < 1:1836474/93‑1 (MQ=255)
ggCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCtt < 2:3083240/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTc > 2:475995/1‑93 (MQ=255)
ccTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTcc > 2:2442951/1‑92 (MQ=255)
cTGCGGTCGTGGTTGCGGTCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTACATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGc < 2:6002670/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt < 2:6256878/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCt < 2:1107457/93‑1 (MQ=255)
cGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGGCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTgg > 2:640788/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGt < 2:4841741/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTa > 1:4759117/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTa < 1:4516735/93‑1 (MQ=255)
tCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTAt > 2:1893066/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc > 2:5603529/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc > 1:6794263/1‑93 (MQ=255)
tGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCCCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCAc < 1:908677/93‑1 (MQ=255)
ggTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACt < 2:1230304/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTg > 2:304966/1‑93 (MQ=255)
ttGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGc > 2:5108/1‑93 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 1:5398338/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 1:3856120/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 2:5421344/93‑1 (MQ=255)
gcgggcggCTCGTGTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCGGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctc < 2:5543078/93‑1 (MQ=255)
cgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctct < 1:1295733/93‑1 (MQ=255)
cgggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGctct < 2:5707798/93‑1 (MQ=255)
gggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTg > 2:2095455/1‑93 (MQ=255)
gggcggCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTg > 1:2410185/1‑93 (MQ=255)
ggcggcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGc > 1:7848149/1‑93 (MQ=255)
gcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGa < 1:7436175/93‑1 (MQ=255)
gcTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGa < 1:2743980/93‑1 (MQ=255)
cGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGc < 2:4730466/93‑1 (MQ=255)
tttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTg < 1:4678445/93‑1 (MQ=255)
tttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTg > 2:1794726/1‑93 (MQ=255)
tttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTg > 2:3739003/1‑93 (MQ=255)
tttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTg > 1:1928338/1‑93 (MQ=255)
ttGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGt > 1:1102768/1‑93 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc < 1:4974189/93‑1 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc < 2:4103992/93‑1 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc < 1:6484784/93‑1 (MQ=255)
ccATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTcc > 2:435949/1‑93 (MQ=255)
cATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCt < 1:4371205/93‑1 (MQ=255)
cATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCt > 1:59393/1‑93 (MQ=255)
cATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCt > 2:457430/1‑93 (MQ=255)
aTCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTc > 1:2628620/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCa > 1:1683826/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCa > 1:3313575/1‑93 (MQ=255)
tCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCa > 2:1301298/1‑93 (MQ=255)
cGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCaa > 1:4219334/1‑93 (MQ=255)
gCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCaaa > 1:3487717/1‑93 (MQ=255)
cTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAAc > 1:1604382/1‑93 (MQ=255)
cTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAAc > 2:1648112/1‑93 (MQ=255)
tCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACg > 2:7628786/1‑93 (MQ=255)
cAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGc < 2:15639/93‑1 (MQ=255)
aGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCt < 2:858309/93‑1 (MQ=255)
gTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTg < 1:7208173/93‑1 (MQ=255)
gTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTg > 1:353375/1‑93 (MQ=255)
gTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTg > 1:1884407/1‑93 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg < 1:4089973/93‑1 (MQ=255)
tACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTgg > 2:5262434/1‑93 (MQ=255)
aCCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGc > 2:1271956/1‑93 (MQ=255)
ccTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCa < 1:7570483/93‑1 (MQ=255)
ttAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGc > 1:564778/1‑93 (MQ=255)
gCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAg < 2:6831438/93‑1 (MQ=255)
tctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTg < 1:4731015/93‑1 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGGCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc < 2:1714890/93‑1 (MQ=255)
ctAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGc > 2:65409/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:5737012/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 1:6201860/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:2947748/1‑93 (MQ=255)
tAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCg > 2:7553141/1‑93 (MQ=255)
aCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtg > 2:7307741/1‑93 (MQ=255)
aCTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtg < 1:3010650/93‑1 (MQ=255)
aCTTCACTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtg < 2:5149998/93‑1 (MQ=255)
cTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtgt < 1:3247823/93‑1 (MQ=255)
cTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCgtgt > 2:6105385/1‑93 (MQ=255)
cTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCATCAAACGCTGGCAGGCAGTGCgtgt > 2:7849644/1‑93 (MQ=255)
ttCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTa > 1:7093645/1‑93 (MQ=255)
cATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTAtt > 2:2631205/1‑93 (MQ=255)
aTTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTc < 1:6306753/93‑1 (MQ=255)
ttGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTcc > 1:4195725/1‑93 (MQ=255)
tggggCCGGAGCTGCGTGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTcc < 2:4890258/91‑1 (MQ=255)
gggCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGt > 1:5780333/1‑93 (MQ=255)
ccGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGtttt < 2:3404261/93‑1 (MQ=255)
ggAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTgg > 1:3942601/1‑93 (MQ=255)
gAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGt < 2:3622715/93‑1 (MQ=255)
tGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAtt < 1:1966362/93‑1 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt < 1:5089229/93‑1 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt > 2:2186022/1‑93 (MQ=255)
gCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAttt > 2:3792162/1‑93 (MQ=255)
ccGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTg < 1:6611803/93‑1 (MQ=255)
cGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgg > 1:7663308/1‑93 (MQ=255)
cGGACGTTAACTATTCGCTGGTATCACGGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGGATTCGGTTTTGGTGATTTgg < 2:7723813/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg < 2:3960369/93‑1 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg > 1:973090/1‑93 (MQ=255)
ggACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTggg > 1:6858878/1‑93 (MQ=255)
gACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTgggg > 1:6162654/1‑93 (MQ=255)
|
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > NC_000913/3775689‑3775868
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 204 total aligned reads displayed.
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > NC_000913/3775686‑3775872
|
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACG < SRR4302543.2696445/94‑1 (MQ=60)
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACG < SRR4302543.4413097/94‑1 (MQ=60)
AGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTT < SRR4302543.3246862/94‑1 (MQ=60)
GAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTA < SRR4302543.3685695/94‑1 (MQ=60)
AGACGTGGCGTGCAGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT < SRR4302543.6508293/94‑1 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT > SRR4302543.4813090/1‑94 (MQ=60)
AGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTAT < SRR4302543.3930517/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATC < SRR4302543.3573294/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATC < SRR4302543.4791523/94‑1 (MQ=60)
GACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTGGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATC < SRR4302543.4791522/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCT > SRR4302543.74546/1‑94 (MQ=60)
ACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGGACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCT > SRR4302543.74547/1‑94 (MQ=60)
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CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302543.5500874/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302543.569957/1‑94 (MQ=60)
CTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGC > SRR4302543.2858119/1‑94 (MQ=60)
TTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCC < SRR4302543.40613/94‑1 (MQ=60)
TAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCA < SRR4302543.6707489/94‑1 (MQ=60)
AGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAG > SRR4302543.6307151/1‑94 (MQ=60)
AGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAG < SRR4302543.6874457/94‑1 (MQ=60)
GCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGG > SRR4302543.4562501/1‑94 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302543.7454801/1‑94 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG < SRR4302543.5802396/94‑1 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302543.5890770/1‑94 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG < SRR4302543.6878054/94‑1 (MQ=60)
CTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTG > SRR4302543.7687198/1‑94 (MQ=60)
TCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGC < SRR4302543.4774233/94‑1 (MQ=60)
CTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCG > SRR4302543.6260432/1‑94 (MQ=60)
TAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGT < SRR4302543.4221048/94‑1 (MQ=60)
AACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTG > SRR4302543.4729592/1‑94 (MQ=60)
ACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGT < SRR4302543.3037914/94‑1 (MQ=60)
ACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGT < SRR4302543.3882671/94‑1 (MQ=60)
CTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTA > SRR4302543.7162534/1‑94 (MQ=60)
CTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTA < SRR4302543.3277182/94‑1 (MQ=60)
TTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTAT < SRR4302543.6207737/94‑1 (MQ=60)
TCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATT > SRR4302543.6608284/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC > SRR4302543.6225885/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC < SRR4302543.2589095/94‑1 (MQ=60)
CATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTC < SRR4302543.192527/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCC > SRR4302543.4233765/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCC < SRR4302543.6366075/94‑1 (MQ=60)
ATTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCC > SRR4302543.7622402/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCG < SRR4302543.2400960/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCG > SRR4302543.1876777/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCG < SRR4302543.5123796/94‑1 (MQ=60)
TTGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCG < SRR4302543.2826011/94‑1 (MQ=60)
TGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGT < SRR4302543.4815487/94‑1 (MQ=60)
TGGGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGT > SRR4302543.5832939/1‑94 (MQ=60)
GGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTT < SRR4302543.3347576/94‑1 (MQ=60)
GGCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTT > SRR4302543.534177/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTT < SRR4302543.7305264/94‑1 (MQ=60)
GCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTT < SRR4302543.4721429/94‑1 (MQ=60)
GCCGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTT > SRR4302543.5191811/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCTGTCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGG < SRR4302543.7009156/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGG < SRR4302543.2070580/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGG < SRR4302543.3316151/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGG > SRR4302543.3977457/1‑94 (MQ=60)
GGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGT < SRR4302543.7517216/94‑1 (MQ=60)
GGAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGT > SRR4302543.4063648/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTG < SRR4302543.3220016/94‑1 (MQ=60)
AGCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGA > SRR4302543.682280/1‑94 (MQ=60)
GCTGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGAT < SRR4302543.406272/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTT > SRR4302543.6201804/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTT < SRR4302543.1983991/94‑1 (MQ=60)
GCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTG < SRR4302543.166941/94‑1 (MQ=60)
GCCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTG < SRR4302543.5135349/94‑1 (MQ=60)
CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG < SRR4302543.263184/94‑1 (MQ=60)
CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG < SRR4302543.6674127/94‑1 (MQ=60)
CCGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGG > SRR4302543.7735945/1‑94 (MQ=60)
CGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGG > SRR4302543.981660/1‑94 (MQ=60)
CGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGG > SRR4302543.6923533/1‑94 (MQ=60)
CGGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGG < SRR4302543.1974577/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > SRR4302543.6220976/1‑94 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG < SRR4302543.437250/94‑1 (MQ=60)
GGACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGG > SRR4302543.1920359/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG < SRR4302543.1781900/94‑1 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG > SRR4302543.5552924/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG > SRR4302543.5552925/1‑94 (MQ=60)
GACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGG < SRR4302543.6221043/94‑1 (MQ=60)
ACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGC > SRR4302543.7179285/1‑94 (MQ=60)
ACGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGC < SRR4302543.5848292/94‑1 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG > SRR4302543.4813604/1‑94 (MQ=60)
CGTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCG < SRR4302543.7436461/94‑1 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT < SRR4302543.836163/94‑1 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT < SRR4302543.2921077/94‑1 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > SRR4302543.436367/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > SRR4302543.5208935/1‑94 (MQ=60)
GTTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > SRR4302543.129801/1‑94 (MQ=60)
|
AAAGAGACGTGGCCTGCGGTCGTGGTTGCGGGCGGCTCGTTTGCCATCGCTCAGTACCTTAGCTCTAACTTCATTGGGCCGGAGCTGCCGGACATTATCTCTTCGCTGGTATCACTGCTCTGCCTGACGCTGTTCCTCAAACGCTGGCAGCCAGTGCGTGTATTCCGTTTTGGTGATTTGGGGGCGT > NC_000913/3775686‑3775872
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
