Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,786,415 |
A→G |
T230A (ACG→GCG) |
b3614 → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,786,415 | 0 | A | G | 99.6%
| 823.1
/ ‑5.3
| 258 | T230A (ACG→GCG) | b3614 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (148/109); total (149/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.38e-01 |
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > NC_000913/3786325‑3786504
|
gCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTgcgc < 1:305151/93‑1 (MQ=255)
cAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCt > 1:534511/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTg > 2:1157956/1‑93 (MQ=255)
aaCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTg < 2:2794207/93‑1 (MQ=255)
aCGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTgg > 1:4384868/1‑93 (MQ=255)
cGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGt > 2:703005/1‑93 (MQ=255)
ggTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTg < 2:2874024/93‑1 (MQ=255)
ttCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGaa < 1:3863971/93‑1 (MQ=255)
ttCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGaa > 1:3888744/1‑93 (MQ=255)
tCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGaaa < 2:2974306/93‑1 (MQ=255)
cGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAg > 2:3729959/1‑93 (MQ=255)
cGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAg < 2:2821599/93‑1 (MQ=255)
gACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGc > 2:2688663/1‑93 (MQ=255)
gACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGc > 2:2601192/1‑93 (MQ=255)
aCCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTTCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGcc > 1:2278763/1‑93 (MQ=255)
cattgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcag < 2:3550776/93‑1 (MQ=255)
attgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagc < 1:4583454/93‑1 (MQ=255)
attgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagc > 2:1097563/1‑93 (MQ=255)
ttgccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCcagca < 2:1261738/93‑1 (MQ=255)
ccattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCt < 2:3500916/93‑1 (MQ=255)
cattgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCtt > 1:1023143/1‑93 (MQ=255)
attgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTg > 1:736776/1‑93 (MQ=255)
ttgGGCATCCTCCCCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGc < 1:1259529/93‑1 (MQ=255)
tgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCt < 1:3995028/93‑1 (MQ=255)
tgGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCt < 1:4397959/93‑1 (MQ=255)
gCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaa > 2:2293544/1‑93 (MQ=255)
gCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaa < 1:165157/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatg < 1:3370183/93‑1 (MQ=255)
aTCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatg < 2:479058/93‑1 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga > 1:3205362/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga > 1:1433875/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga > 1:2375923/1‑93 (MQ=255)
tCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatga < 1:2110646/93‑1 (MQ=255)
ccTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatgaa < 1:3533581/93‑1 (MQ=255)
ccTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCtgaatgaa > 1:1266227/1‑93 (MQ=255)
cTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAc > 1:3599117/1‑93 (MQ=255)
tCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAcc < 1:1574715/93‑1 (MQ=255)
tCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGATGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAcc > 1:4509784/1‑93 (MQ=255)
cACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCg > 1:442932/1‑93 (MQ=255)
cACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCg < 1:2554779/93‑1 (MQ=255)
cccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCa < 1:1922544/93‑1 (MQ=255)
ccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAg > 2:871591/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAg < 1:2813962/93‑1 (MQ=255)
cTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAgg > 2:4462211/1‑93 (MQ=255)
cTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAgg > 2:769558/1‑93 (MQ=255)
gCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGtt > 2:59860/1‑93 (MQ=255)
cAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTg > 1:2980838/1‑93 (MQ=255)
aCGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGGTGAt > 1:2849345/1‑93 (MQ=255)
ggTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATAc < 1:3291830/93‑1 (MQ=255)
tACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACtt > 1:2490499/1‑93 (MQ=255)
tACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACtt > 2:2122171/1‑93 (MQ=255)
tACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCCCAGGTTGATACtt > 2:4590797/1‑93 (MQ=255)
aCGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTc < 2:542782/93‑1 (MQ=255)
gcgTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTa < 1:1080202/93‑1 (MQ=255)
cgTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTGTac < 2:3312579/93‑1 (MQ=255)
gtgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTaca > 2:4227922/1‑93 (MQ=255)
gtgtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTaca > 2:3793267/1‑93 (MQ=255)
gtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAcc > 2:3936199/1‑93 (MQ=255)
gtTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAcc > 2:1071508/1‑93 (MQ=255)
attGCAACAGATGGTTTATATCCTGCAGCCAGACATTGCTCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGACTGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAcc < 2:4374745/92‑1 (MQ=255)
tGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgc < 1:2135171/93‑1 (MQ=255)
tGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgc < 1:3720816/93‑1 (MQ=255)
gCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACAccgcc > 2:1815314/1‑93 (MQ=255)
aaCAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGa > 1:3432881/1‑93 (MQ=255)
aGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaa < 1:218696/93‑1 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa > 2:3231098/1‑93 (MQ=255)
gATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGaaaaa > 2:132076/1‑93 (MQ=255)
aTGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAc < 1:994722/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAc < 2:1668558/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAc < 2:3597388/93‑1 (MQ=255)
aTGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAc < 1:136937/93‑1 (MQ=255)
tGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACg > 2:4342522/1‑93 (MQ=255)
tGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACg > 2:150161/1‑93 (MQ=255)
gttttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 2:4647257/91‑1 (MQ=255)
ggTTTATACCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 2:2558800/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 2:2015590/93‑1 (MQ=255)
ggTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGc < 1:4476582/93‑1 (MQ=255)
gTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCt < 1:831445/93‑1 (MQ=255)
ttATACCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATTCTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt < 2:4159990/93‑1 (MQ=255)
ttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt > 2:1768914/1‑93 (MQ=255)
ttATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGGTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgt > 1:4041870/1‑93 (MQ=255)
tataACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCtgtg > 1:266676/1‑93 (MQ=255)
ataACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGc > 1:2630363/1‑93 (MQ=255)
taACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGcc > 2:3981075/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCt > 2:1642813/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAt > 2:832775/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAt > 2:3157231/1‑93 (MQ=255)
cTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAt < 1:3753307/93‑1 (MQ=255)
tGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATg < 1:687751/93‑1 (MQ=255)
gccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAcc < 1:4215111/93‑1 (MQ=255)
ccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcg > 1:1223137/1‑93 (MQ=255)
ccAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcg > 2:235136/1‑93 (MQ=255)
cAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcgc > 2:42406/1‑93 (MQ=255)
cAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACcgc > 1:3416793/1‑93 (MQ=255)
gACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGt > 1:239869/1‑93 (MQ=255)
gACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGt > 1:2145035/1‑93 (MQ=255)
aCATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTa > 2:1973798/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAt > 2:4270451/1‑93 (MQ=255)
aTTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAt < 1:195315/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAt > 1:1447757/1‑93 (MQ=255)
|
CGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > NC_000913/3786325‑3786504
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCCGT > NC_000913/3786322‑3786508
|
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG < SRR4302535.3889998/94‑1 (MQ=60)
CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTG < SRR4302535.3305899/94‑1 (MQ=60)
GTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGC > SRR4302535.1196205/1‑94 (MQ=60)
TCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGCTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCG < SRR4302535.1797574/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCT < SRR4302535.4026007/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCT > SRR4302535.538249/1‑94 (MQ=60)
GCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCT > SRR4302535.1454984/1‑94 (MQ=60)
GCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCT < SRR4302535.307267/94‑1 (MQ=60)
CCAACGGTTCGACCATTGCCAGTCGACATCCTCTCCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCT < SRR4302535.3144684/94‑1 (MQ=60)
AACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGG > SRR4302535.4414869/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTG > SRR4302535.3599877/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTG > SRR4302535.4409592/1‑94 (MQ=60)
CGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTG < SRR4302535.1323124/94‑1 (MQ=60)
GGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGA > SRR4302535.3915310/1‑94 (MQ=60)
GTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAA < SRR4302535.2664511/94‑1 (MQ=60)
GTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAA > SRR4302535.3915412/1‑94 (MQ=60)
GCTCGACCATTCCCATTTGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAA < SRR4302535.1395127/94‑1 (MQ=60)
TTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAA < SRR4302535.3890552/94‑1 (MQ=60)
TCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAG < SRR4302535.4460319/94‑1 (MQ=60)
CGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGC > SRR4302535.2449921/1‑94 (MQ=60)
GACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTTCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCC > SRR4302535.2295038/1‑94 (MQ=60)
CATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGC > SRR4302535.492341/1‑94 (MQ=60)
ATTGCTATGGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCA < SRR4302535.1645382/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCA < SRR4302535.4614669/94‑1 (MQ=60)
TTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAG < SRR4302535.2804616/94‑1 (MQ=60)
TGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGC > SRR4302535.33098/1‑94 (MQ=60)
GCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCT < SRR4302535.3216291/94‑1 (MQ=60)
GCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCT < SRR4302535.1615448/94‑1 (MQ=60)
CCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTT > SRR4302535.1030412/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTG > SRR4302535.741954/1‑94 (MQ=60)
CATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGACGCTTG > SRR4302535.3546844/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGC > SRR4302535.4186780/1‑94 (MQ=60)
ATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGC > SRR4302535.2662257/1‑94 (MQ=60)
TTGGGCATCCTCCCCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCT < SRR4302535.1268544/94‑1 (MQ=60)
TGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTG < SRR4302535.4428062/94‑1 (MQ=60)
TGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTG < SRR4302535.3759883/94‑1 (MQ=60)
TGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTG < SRR4302535.4022362/94‑1 (MQ=60)
GGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGA > SRR4302535.2192697/1‑94 (MQ=60)
GCATCCTCCCCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAAT < SRR4302535.913119/94‑1 (MQ=60)
GCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAAT < SRR4302535.166309/94‑1 (MQ=60)
CATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATG > SRR4302535.3353935/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302535.1947121/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA < SRR4302535.3393630/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302535.4046562/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302535.3227560/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302535.2392992/1‑94 (MQ=60)
ATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGA > SRR4302535.1444112/1‑94 (MQ=60)
TCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAA < SRR4302535.2125871/94‑1 (MQ=60)
TCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAA > SRR4302535.1275284/1‑94 (MQ=60)
CCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAC > SRR4302535.3624093/1‑94 (MQ=60)
CCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAAC < SRR4302535.3558114/94‑1 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC > SRR4302535.341163/1‑94 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC > SRR4302535.4548975/1‑94 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC < SRR4302535.4373161/94‑1 (MQ=60)
CTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGATGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACC > SRR4302535.4540726/1‑94 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG > SRR4302535.446034/1‑94 (MQ=60)
TCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCG < SRR4302535.1586081/94‑1 (MQ=60)
CACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGC < SRR4302535.2573177/94‑1 (MQ=60)
CACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGC < SRR4302535.2861220/94‑1 (MQ=60)
CACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGC > SRR4302535.3559680/1‑94 (MQ=60)
ACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCA > SRR4302535.1005165/1‑94 (MQ=60)
CCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAG < SRR4302535.1936403/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGG < SRR4302535.2833960/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGG > SRR4302535.4536900/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGG < SRR4302535.2398993/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGT > SRR4302535.3330444/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGT < SRR4302535.2195941/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGT < SRR4302535.3443086/94‑1 (MQ=60)
TGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTT > SRR4302535.258175/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTT > SRR4302535.2563778/1‑94 (MQ=60)
TGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTT < SRR4302535.1924455/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTG > SRR4302535.3001747/1‑94 (MQ=60)
CAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGA > SRR4302535.3002746/1‑94 (MQ=60)
AACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGGTGAT > SRR4302535.2869535/1‑94 (MQ=60)
CGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATAC > SRR4302535.4602284/1‑94 (MQ=60)
GGTACTCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACT < SRR4302535.3864363/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAGCCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACT < SRR4302535.1562478/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACT < SRR4302535.607135/94‑1 (MQ=60)
GGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACT < SRR4302535.3314719/94‑1 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT > SRR4302535.2131555/1‑94 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT > SRR4302535.3447269/1‑94 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT > SRR4302535.2386622/1‑94 (MQ=60)
GTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTT > SRR4302535.2508462/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCT < SRR4302535.805164/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCT < SRR4302535.2031039/94‑1 (MQ=60)
CGCGTGTTGCAACAGATGGCTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGACAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTA > SRR4302535.4428366/1‑94 (MQ=60)
GCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTAC < SRR4302535.1087887/94‑1 (MQ=60)
CGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACA < SRR4302535.1751626/94‑1 (MQ=60)
GTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCG < SRR4302535.731391/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCC < SRR4302535.3746593/94‑1 (MQ=60)
TGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCC > SRR4302535.1262382/1‑94 (MQ=60)
TGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCC < SRR4302535.2150555/94‑1 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG > SRR4302535.4132688/1‑94 (MQ=60)
GCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCG > SRR4302535.2917710/1‑94 (MQ=60)
CAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGA > SRR4302535.1085644/1‑94 (MQ=60)
CAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGA > SRR4302535.2482229/1‑94 (MQ=60)
CAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGA > SRR4302535.3456736/1‑94 (MQ=60)
AACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAA > SRR4302535.4002598/1‑94 (MQ=60)
CAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAA > SRR4302535.1313941/1‑94 (MQ=60)
CAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAA > SRR4302535.752984/1‑94 (MQ=60)
AGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAA < SRR4302535.220200/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAC < SRR4302535.114892/94‑1 (MQ=60)
GATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAAC > SRR4302535.1133841/1‑94 (MQ=60)
ATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACG < SRR4302535.137897/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACG < SRR4302535.2568959/94‑1 (MQ=60)
ATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACG < SRR4302535.1001786/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT < SRR4302535.849513/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT > SRR4302535.647280/1‑94 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT < SRR4302535.1566131/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT < SRR4302535.4483036/94‑1 (MQ=60)
GGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCT < SRR4302535.4507315/94‑1 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG > SRR4302535.4446714/1‑94 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG < SRR4302535.3015547/94‑1 (MQ=60)
GTTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTG < SRR4302535.837272/94‑1 (MQ=60)
TTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGT < SRR4302535.1271919/94‑1 (MQ=60)
TTTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGGTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGT > SRR4302535.4069540/1‑94 (MQ=60)
TTATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTG > SRR4302535.268529/1‑94 (MQ=60)
TATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATCCTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGC > SRR4302535.3640351/1‑94 (MQ=60)
TATAACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGC > SRR4302535.2649206/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTG > SRR4302535.50732/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTG > SRR4302535.2131006/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTG > SRR4302535.3907817/1‑94 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302535.2156873/94‑1 (MQ=60)
CCTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGAT < SRR4302535.1242609/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATG < SRR4302535.2734545/94‑1 (MQ=60)
CTGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATG < SRR4302535.3779280/94‑1 (MQ=60)
TGCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGC < SRR4302535.692570/94‑1 (MQ=60)
GCCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCA > SRR4302535.2291182/1‑94 (MQ=60)
CCGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCAC > SRR4302535.1388234/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACC > SRR4302535.3850263/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCG > SRR4302535.2855022/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCG > SRR4302535.1231891/1‑94 (MQ=60)
GCCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCG < SRR4302535.4243959/94‑1 (MQ=60)
CCAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGC > SRR4302535.3440561/1‑94 (MQ=60)
CAGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAACAACGCTGTGCCTGATGCACCGCG > SRR4302535.2013879/1‑94 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302535.2160467/1‑94 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302535.4415753/1‑94 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302535.34085/1‑94 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302535.2228479/1‑94 (MQ=60)
AGACATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGT > SRR4302535.241515/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > SRR4302535.1458108/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > SRR4302535.373130/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAAT > SRR4302535.234854/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATC > SRR4302535.4173004/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATC < SRR4302535.196658/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCCG < SRR4302535.1753913/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCCGT < SRR4302535.2256068/94‑1 (MQ=60)
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CGTCGCAACGGTTCGACCATTGCCATTGGGCATCCTCACCCTGCAACGGTACGCGTGTTGCAACAGATGGTTTATAACCTGCCGCCAGACATTACGCTGGTGAAAGCCAGCAGCTTGCTGAATGAACCGCAGGTTGATACTTCTACACCGCCGAAAAACGCTGTGCCTGATGCACCGCGTAATCCGT > NC_000913/3786322‑3786508
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
