Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,819,792 |
A→G |
V20V (GTA→GTG) |
rpoZ → |
RNA polymerase omega subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,819,792 | 0 | A | G | 100.0%
| 786.6
/ NA
| 249 | V20V (GTA→GTG) | rpoZ | RNA polymerase omega subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (119/130); total (119/130) |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819703‑3819881
|
tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg < 1:1174182/93‑1 (MQ=255)
tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg > 1:2675267/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 2:3618295/1‑93 (MQ=255)
aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 2:4045009/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc < 2:3555280/93‑1 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 2:764126/1‑93 (MQ=255)
tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 1:3025458/1‑93 (MQ=255)
tcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgc < 2:2032607/93‑1 (MQ=255)
ttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgccg > 2:498456/1‑93 (MQ=255)
aCCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcgc < 2:1966497/93‑1 (MQ=255)
cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt > 1:3397826/1‑93 (MQ=255)
cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt > 1:993001/1‑93 (MQ=255)
tgtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTc < 1:2651684/93‑1 (MQ=255)
tgtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTc > 1:4200256/1‑93 (MQ=255)
tgtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTc > 2:3226793/1‑93 (MQ=255)
tgtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTGCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTACCCGTTTGGTCCTGGTGCTGGTCGGCCCGCGTc < 2:3965177/93‑1 (MQ=255)
tgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgc > 1:1167949/1‑93 (MQ=255)
tgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgc > 1:3233781/1‑93 (MQ=255)
ggAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgcg > 1:2618931/1‑93 (MQ=255)
gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgcgc < 1:4474480/93‑1 (MQ=255)
gCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTc > 1:2579066/1‑93 (MQ=255)
ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc > 1:213697/1‑93 (MQ=255)
ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTc < 2:1630802/93‑1 (MQ=255)
tttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCa > 1:700899/1‑93 (MQ=255)
tttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCa > 2:1262023/1‑93 (MQ=255)
ttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAg < 2:1487668/93‑1 (MQ=255)
tAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGa > 1:882706/1‑93 (MQ=255)
aGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATg > 2:4349243/1‑93 (MQ=255)
aGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATg > 2:3059061/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGc < 2:1659881/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGc < 1:4684586/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGc > 2:4070834/1‑93 (MQ=255)
tATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa > 1:4293960/1‑93 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:1496894/93‑1 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa > 2:2714608/1‑93 (MQ=255)
gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:3925482/93‑1 (MQ=255)
cACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAg < 1:2087408/93‑1 (MQ=255)
cACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAg < 2:2252324/93‑1 (MQ=255)
aCGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAgg < 1:1347740/93‑1 (MQ=255)
cgcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGc > 1:3970473/1‑93 (MQ=255)
gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCg > 2:92272/1‑93 (MQ=255)
gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCg > 2:735595/1‑93 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 2:2343105/1‑93 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:666788/1‑93 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa < 1:1964595/93‑1 (MQ=255)
tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCACGTACGCggca > 2:282223/1‑91 (MQ=255)
aCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAg < 1:160727/93‑1 (MQ=255)
cTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAgg > 1:2870066/1‑93 (MQ=255)
cTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGAGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAgg > 1:3815319/1‑93 (MQ=255)
tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa < 1:2900500/93‑1 (MQ=255)
tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa < 2:3110731/93‑1 (MQ=255)
tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa > 2:4437152/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAt > 1:1029073/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAt < 2:3952128/93‑1 (MQ=255)
ttCAGTACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:272520/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGGCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 2:3127640/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGCAAGGGTc > 2:4244188/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:1659230/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 1:856694/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:1033535/93‑1 (MQ=255)
aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc > 2:1703319/1‑93 (MQ=255)
aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc < 2:334776/93‑1 (MQ=255)
cGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGt > 1:3631069/1‑93 (MQ=255)
cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAATGATCCGCTGGTAc < 1:230377/93‑1 (MQ=255)
cTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc < 1:3871383/93‑1 (MQ=255)
cTGGAGAGAAAATTGGTACCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAc < 1:1138602/93‑1 (MQ=255)
tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 2:3770928/1‑93 (MQ=255)
tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 2:2547115/1‑93 (MQ=255)
gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 1:4016073/1‑93 (MQ=255)
agaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaag < 1:250964/93‑1 (MQ=255)
agaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaag < 1:4097735/93‑1 (MQ=255)
gaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaaga < 1:189774/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGaaaa > 2:1795123/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGaaaa > 1:2346789/1‑93 (MQ=255)
aaTTCGTAACCGTTTAGCCGTGGTGCTGCTCGCTGCGCGTCGCGCTAGTCGAAGGCAGGTAGGCGGAAATGATCCCCTGGTACGGGAAGaaaa < 2:664672/93‑1 (MQ=255)
ttGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACg < 2:2849442/93‑1 (MQ=255)
ggTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAt < 1:764126/93‑1 (MQ=255)
gTAGCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATa < 2:214546/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaa < 2:3207110/93‑1 (MQ=255)
aaCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATaaa < 1:3271522/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAcc < 1:1856397/93‑1 (MQ=255)
cGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAAcc < 1:1411510/93‑1 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc > 1:2196350/1‑93 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 2:3814881/93‑1 (MQ=255)
ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:3652202/93‑1 (MQ=255)
gtttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:3132147/92‑1 (MQ=255)
ttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTg < 2:4444117/93‑1 (MQ=255)
ttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTg > 2:2650728/1‑93 (MQ=255)
tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt > 1:3580775/1‑93 (MQ=255)
tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt < 2:1129268/93‑1 (MQ=255)
tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt < 2:4611346/93‑1 (MQ=255)
taCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTa < 2:3865592/92‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt < 2:4410997/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt < 1:4424260/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt < 1:4520954/93‑1 (MQ=255)
ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt > 1:534185/1‑93 (MQ=255)
cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTTGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc < 2:1321345/93‑1 (MQ=255)
cTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATc > 2:1280362/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc < 1:3178559/93‑1 (MQ=255)
ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc < 2:1589090/93‑1 (MQ=255)
|
TCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819703‑3819881
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > NC_000913/3819699‑3819885
|
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302535.1173016/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTG < SRR4302535.2353311/94‑1 (MQ=60)
CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCATTTTGACCTGGTG > SRR4302535.4330736/1‑94 (MQ=60)
CAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGC > SRR4302535.1452013/1‑94 (MQ=60)
AGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCT < SRR4302535.3824038/94‑1 (MQ=60)
AGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCT < SRR4302535.505569/94‑1 (MQ=60)
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTG > SRR4302535.2694408/1‑94 (MQ=60)
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTG > SRR4302535.1503165/1‑94 (MQ=60)
TCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGG < SRR4302535.1182564/94‑1 (MQ=60)
ATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTC > SRR4302535.3046637/1‑94 (MQ=60)
TTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCG < SRR4302535.3745264/94‑1 (MQ=60)
TTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGC > SRR4302535.2744089/1‑94 (MQ=60)
TTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGC > SRR4302535.1602216/1‑94 (MQ=60)
CACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGC > SRR4302535.2683148/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCG > SRR4302535.4331262/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGT > SRR4302535.1000053/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGT > SRR4302535.2664661/1‑94 (MQ=60)
CCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGT > SRR4302535.3421469/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTC > SRR4302535.4228999/1‑94 (MQ=60)
CTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTC < SRR4302535.1414315/94‑1 (MQ=60)
TGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCG < SRR4302535.2670679/94‑1 (MQ=60)
TGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCG < SRR4302535.2622801/94‑1 (MQ=60)
TGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCG < SRR4302535.1720032/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGC > SRR4302535.3256221/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGC > SRR4302535.260319/1‑94 (MQ=60)
GTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGC > SRR4302535.1176288/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCG > SRR4302535.3633158/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCG < SRR4302535.2177088/94‑1 (MQ=60)
TGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCG > SRR4302535.2637709/1‑94 (MQ=60)
TGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCG < SRR4302535.4079938/94‑1 (MQ=60)
GGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGC > SRR4302535.3397200/1‑94 (MQ=60)
GAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCT < SRR4302535.4505181/94‑1 (MQ=60)
AGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTC > SRR4302535.2597596/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTC > SRR4302535.2597597/1‑94 (MQ=60)
AGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTC > SRR4302535.4225770/1‑94 (MQ=60)
CTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGT > SRR4302535.3667591/1‑94 (MQ=60)
TTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTC > SRR4302535.215161/1‑94 (MQ=60)
TTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCA > SRR4302535.2267546/1‑94 (MQ=60)
TTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCA > SRR4302535.705813/1‑94 (MQ=60)
TTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAG < SRR4302535.824125/94‑1 (MQ=60)
TTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGA > SRR4302535.888956/1‑94 (MQ=60)
TAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGAT < SRR4302535.1766487/94‑1 (MQ=60)
AAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATG > SRR4302535.2410423/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGTTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGC < SRR4302535.598888/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCA < SRR4302535.2099846/94‑1 (MQ=60)
GTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCA > SRR4302535.4323340/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCA < SRR4302535.4716283/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG < SRR4302535.2273214/94‑1 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG > SRR4302535.3604929/1‑94 (MQ=60)
TATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAG < SRR4302535.3223090/94‑1 (MQ=60)
TGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGGAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGT < SRR4302535.3882283/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302535.3952305/94‑1 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG > SRR4302535.2768895/1‑94 (MQ=60)
GCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAG < SRR4302535.1507659/94‑1 (MQ=60)
CACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGG < SRR4302535.2102440/94‑1 (MQ=60)
CACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGG < SRR4302535.1362306/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGC > SRR4302535.3997595/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGC < SRR4302535.1899071/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGC < SRR4302535.1357360/94‑1 (MQ=60)
CGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCG > SRR4302535.1967428/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302535.671438/1‑94 (MQ=60)
GTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAA > SRR4302535.2919851/1‑94 (MQ=60)
TAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAA < SRR4302535.319926/94‑1 (MQ=60)
TAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAA < SRR4302535.1978757/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGG < SRR4302535.161854/94‑1 (MQ=60)
ACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGG > SRR4302535.2890397/1‑94 (MQ=60)
ACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGAGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGG > SRR4302535.3841643/1‑94 (MQ=60)
CTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGA > SRR4302535.1161758/1‑94 (MQ=60)
TGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAT > SRR4302535.1036379/1‑94 (MQ=60)
TGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAT < SRR4302535.2921003/94‑1 (MQ=60)
TTCAGTACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302535.274416/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302535.1671224/94‑1 (MQ=60)
TTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCC < SRR4302535.4557094/94‑1 (MQ=60)
TCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCG < SRR4302535.3171088/94‑1 (MQ=60)
TCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCG < SRR4302535.862731/94‑1 (MQ=60)
CAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGC > SRR4302535.2964366/1‑94 (MQ=60)
AGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCT > SRR4302535.1152787/1‑94 (MQ=60)
GACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGG < SRR4302535.498932/94‑1 (MQ=60)
ACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGT > SRR4302535.3656241/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTA < SRR4302535.336490/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTAGAGAAAAGTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTA < SRR4302535.3748579/94‑1 (MQ=60)
GCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAC > SRR4302535.290395/1‑94 (MQ=60)
GCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAC < SRR4302535.3108179/94‑1 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAATGATCCGCTGGTACC < SRR4302535.231965/94‑1 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC > SRR4302535.1554987/1‑94 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC < SRR4302535.3897986/94‑1 (MQ=60)
CTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGCCGCGCTCGTCAGATGCAGGTCGGCGGAAAGGATTCGCTGGTACC > SRR4302535.901325/1‑94 (MQ=60)
CTGGAGAGAAAATTGGTACCCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACC < SRR4302535.1146719/94‑1 (MQ=60)
TGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCG > SRR4302535.4043541/1‑94 (MQ=60)
TAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGA < SRR4302535.1668340/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCTGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302535.4246478/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302535.3913489/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302535.760317/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302535.252691/94‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGA < SRR4302535.4125783/94‑1 (MQ=60)
GAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAA < SRR4302535.191083/94‑1 (MQ=60)
GAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAA < SRR4302535.1177795/94‑1 (MQ=60)
AAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAA < SRR4302535.4096564/94‑1 (MQ=60)
AAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAA > SRR4302535.2363611/1‑94 (MQ=60)
AATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAAC < SRR4302535.3876546/94‑1 (MQ=60)
AATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAAC < SRR4302535.1337133/94‑1 (MQ=60)
AATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAAC < SRR4302535.2194340/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG < SRR4302535.2330665/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACG < SRR4302535.3286790/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAT < SRR4302535.4681420/94‑1 (MQ=60)
TGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAA > SRR4302535.3952779/1‑94 (MQ=60)
GGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATA < SRR4302535.769509/94‑1 (MQ=60)
GTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAA > SRR4302535.362284/1‑94 (MQ=60)
GTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAA > SRR4302535.1065718/1‑94 (MQ=60)
TAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAA < SRR4302535.626582/94‑1 (MQ=60)
AACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAA > SRR4302535.4494056/1‑94 (MQ=60)
AACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAA < SRR4302535.703902/94‑1 (MQ=60)
AACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAA > SRR4302535.438379/1‑94 (MQ=60)
AACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAA < SRR4302535.3294248/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA < SRR4302535.1869767/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA > SRR4302535.4201115/1‑94 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA < SRR4302535.2644663/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA < SRR4302535.874241/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA < SRR4302535.1421587/94‑1 (MQ=60)
CGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCA > SRR4302535.3952710/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAC > SRR4302535.2212005/1‑94 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302535.917248/94‑1 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT > SRR4302535.4511186/1‑94 (MQ=60)
TTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302535.3677490/94‑1 (MQ=60)
GTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACT < SRR4302535.3153960/94‑1 (MQ=60)
TTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTG < SRR4302535.247769/94‑1 (MQ=60)
TTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGT > SRR4302535.3605596/1‑94 (MQ=60)
TTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGT < SRR4302535.2112502/94‑1 (MQ=60)
TGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTA > SRR4302535.1871595/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAA > SRR4302535.2001508/1‑94 (MQ=60)
GACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAA > SRR4302535.3839670/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT > SRR4302535.537921/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT > SRR4302535.780325/1‑94 (MQ=60)
ACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAT < SRR4302535.2742837/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302535.4519380/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302535.1295278/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC < SRR4302535.721052/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC > SRR4302535.4013291/1‑94 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC < SRR4302535.4454560/94‑1 (MQ=60)
CCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATC < SRR4302535.4551937/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCG < SRR4302535.2995066/94‑1 (MQ=60)
CTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCG < SRR4302535.3277939/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCG < SRR4302535.3200541/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGC > SRR4302535.2516239/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCT < SRR4302535.2005493/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG < SRR4302535.312416/94‑1 (MQ=60)
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CCAGTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGCGCTG > NC_000913/3819699‑3819885
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
