Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,883,067 |
T→C |
D121D (GAT→GAC) |
yidC → |
60 KD inner‑membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,883,067 | 0 | T | C | 100.0%
| 705.0
/ NA
| 227 | D121D (GAT→GAC) | yidC | 60 KD inner‑membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (113/114); total (113/114) |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > NC_000913/3882977‑3883156
|
taaCTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACaa < 2:953055/92‑1 (MQ=255)
gAACTCTCCCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACaa < 2:712813/93‑1 (MQ=255)
gAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACaa < 1:2098363/93‑1 (MQ=255)
gAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACaa > 2:452963/1‑93 (MQ=255)
acctctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAc < 2:3261205/91‑1 (MQ=255)
aaCTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAc > 1:800052/1‑93 (MQ=255)
ctctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAccc > 2:1632672/1‑93 (MQ=255)
tctACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCg > 2:598946/1‑93 (MQ=255)
tACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGc < 1:3208903/93‑1 (MQ=255)
cccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAATCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTa < 2:2112415/93‑1 (MQ=255)
ccAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTaa > 2:3859685/1‑93 (MQ=255)
aGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACg > 2:2328667/1‑93 (MQ=255)
gTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGccc > 2:2608965/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 1:2007017/1‑93 (MQ=255)
ttCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCcg > 2:4615348/1‑93 (MQ=255)
aGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTc < 1:2777866/93‑1 (MQ=255)
tGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGc > 1:1725497/1‑93 (MQ=255)
tGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGc > 1:3050828/1‑93 (MQ=255)
gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt > 2:3031382/1‑93 (MQ=255)
gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt < 2:1899501/93‑1 (MQ=255)
gTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCt < 1:435444/93‑1 (MQ=255)
ttGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTg < 2:4366001/93‑1 (MQ=255)
ggAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGta < 1:639783/93‑1 (MQ=255)
ggAAACTTCACCCCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGta > 2:2749997/1‑93 (MQ=255)
aaCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACACCCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATaa < 2:2967227/93‑1 (MQ=255)
aaCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATaa < 2:4029056/93‑1 (MQ=255)
aCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAc > 2:2477904/1‑93 (MQ=255)
aCTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAAc > 2:798907/1‑93 (MQ=255)
ttCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGt < 1:273706/93‑1 (MQ=255)
tCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGtt < 1:1682361/93‑1 (MQ=255)
cACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTg < 1:4274476/93‑1 (MQ=255)
aCCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGGCAACCCGGCTGACGGCCCGCGTCCGCTGGATAACGTTGa > 2:1044784/1‑93 (MQ=255)
aCCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGa > 2:3313209/1‑93 (MQ=255)
cGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaa < 1:1711498/93‑1 (MQ=255)
gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa > 1:1139561/1‑93 (MQ=255)
gCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaa > 1:3832441/1‑93 (MQ=255)
cAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTGTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaaa < 1:1344515/93‑1 (MQ=255)
cAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGaaaaa > 2:224094/1‑93 (MQ=255)
aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGTCCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGACCCGCGTCTGCTGTATAAAGTTGAAAAAg > 1:2966144/1‑93 (MQ=255)
aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg < 2:3001989/93‑1 (MQ=255)
aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg > 1:2483615/1‑93 (MQ=255)
aGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGGCCGCTGTATAACGTTGAAAAAg > 1:2581636/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa > 1:4641437/1‑93 (MQ=255)
gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa < 1:2237692/93‑1 (MQ=255)
gTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGa > 1:4365882/1‑93 (MQ=255)
tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc > 1:4442780/1‑93 (MQ=255)
tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc < 2:349998/93‑1 (MQ=255)
tttatttaTCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCAGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAc < 1:2685341/93‑1 (MQ=255)
ttatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACg > 1:1816659/1‑93 (MQ=255)
tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 1:3526734/93‑1 (MQ=255)
tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 1:1741957/93‑1 (MQ=255)
tatttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGc < 1:1561852/93‑1 (MQ=255)
ttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTa < 2:1280093/93‑1 (MQ=255)
ttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTa < 2:1773021/93‑1 (MQ=255)
ttatCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTa > 2:855145/1‑93 (MQ=255)
atCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtg < 1:2260381/93‑1 (MQ=255)
atCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtg < 2:4152987/93‑1 (MQ=255)
atCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtg < 2:3214558/93‑1 (MQ=255)
tCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtgt > 1:680082/1‑93 (MQ=255)
tCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtgt < 2:3761548/93‑1 (MQ=255)
aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgc < 1:2900551/93‑1 (MQ=255)
aGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgc > 1:1261072/1‑93 (MQ=255)
ggCAGAGAGCGGTCTGGCCGATCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAtggtct < 2:906589/93‑5 (MQ=255)
gCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctg < 2:1559161/93‑1 (MQ=255)
cacaGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGGCCTGCGTTCGCTGTATAACTTTGAAAAAGACGCTTATGTgctgg > 2:4686127/1‑93 (MQ=255)
acaGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggc > 2:1254639/1‑93 (MQ=255)
caGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTgctggct < 1:341401/93‑1 (MQ=255)
gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa > 2:4421716/1‑93 (MQ=255)
gagCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGa > 1:379714/1‑93 (MQ=255)
agCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGTCAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGaa < 1:1930256/93‑1 (MQ=255)
agCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGaa < 2:4663329/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAg > 2:3083064/1‑93 (MQ=255)
gCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAg < 1:4110617/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAgg > 1:2420391/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAgggc > 1:488940/1‑91 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc > 2:1868809/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc > 2:4405213/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTCTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTc > 1:1057221/1‑93 (MQ=255)
gTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAACCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGta > 2:1174289/1‑92 (MQ=255)
tCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCa > 1:1471275/1‑93 (MQ=255)
tGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTTAAGGTCaaa > 1:3164994/1‑93 (MQ=255)
tGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCaaa < 1:4479981/93‑1 (MQ=255)
gACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGGCaaaa > 2:2527324/1‑93 (MQ=255)
aCCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAAc < 1:2121229/93‑1 (MQ=255)
cGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGa > 2:3506905/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGaa > 1:3908919/1‑93 (MQ=255)
gTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAAc < 1:878285/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGGCAAAACGAAc > 2:2870155/1‑93 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACt > 1:993268/1‑93 (MQ=255)
tCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACt < 2:3791114/93‑1 (MQ=255)
gTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGc > 1:4167441/1‑93 (MQ=255)
gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg > 2:2035908/1‑93 (MQ=255)
gATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAg > 1:403015/1‑93 (MQ=255)
tGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGt < 1:373270/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGt < 2:3631570/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGt < 1:444607/93‑1 (MQ=255)
tGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGt < 1:4253715/93‑1 (MQ=255)
gCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAAACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGc < 1:2572679/93‑1 (MQ=255)
cGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGa < 2:2676082/93‑1 (MQ=255)
ggACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAt > 2:4206464/1‑93 (MQ=255)
|
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > NC_000913/3882977‑3883156
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG > NC_000913/3882975‑3883160
|
CTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACA > SRR4302535.4274255/1‑94 (MQ=60)
TGAACTCTCCCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAA < SRR4302535.354399/94‑1 (MQ=60)
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAC < SRR4302535.2113498/94‑1 (MQ=60)
GAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAAC > SRR4302535.805670/1‑94 (MQ=60)
CTCTCCCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCATTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCG < SRR4302535.4191890/94‑1 (MQ=60)
CTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCG > SRR4302535.1710845/1‑94 (MQ=60)
CTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGGCTTACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACGCG > SRR4302535.4217930/1‑94 (MQ=60)
TCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGG < SRR4302535.174791/94‑1 (MQ=60)
TACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCT < SRR4302535.3231130/94‑1 (MQ=60)
ACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTA > SRR4302535.2937166/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAC < SRR4302535.2263100/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAAC > SRR4302535.2639292/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACG < SRR4302535.2127139/94‑1 (MQ=60)
AGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGG > SRR4302535.1528160/1‑94 (MQ=60)
GCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGC < SRR4302535.787992/94‑1 (MQ=60)
GTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCG > SRR4302535.2021475/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCG > SRR4302535.3642968/1‑94 (MQ=60)
GTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCG > SRR4302535.1201636/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGC < SRR4302535.450442/94‑1 (MQ=60)
TTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGC > SRR4302535.1961078/1‑94 (MQ=60)
TTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGC < SRR4302535.379139/94‑1 (MQ=60)
CCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGT < SRR4302535.992572/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCG > SRR4302535.829678/1‑94 (MQ=60)
AGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCC < SRR4302535.2797641/94‑1 (MQ=60)
AGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCC < SRR4302535.2599989/94‑1 (MQ=60)
CTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGC > SRR4302535.1737975/1‑94 (MQ=60)
CTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGC > SRR4302535.3072199/1‑94 (MQ=60)
TGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCT < SRR4302535.2349131/94‑1 (MQ=60)
TGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCT < SRR4302535.213059/94‑1 (MQ=60)
GTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTG < SRR4302535.438477/94‑1 (MQ=60)
TTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGT < SRR4302535.1983209/94‑1 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT > SRR4302535.3844750/1‑94 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT > SRR4302535.2508913/1‑94 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT < SRR4302535.644254/94‑1 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT > SRR4302535.749974/1‑94 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT < SRR4302535.30099/94‑1 (MQ=60)
GGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTAT < SRR4302535.1694770/94‑1 (MQ=60)
AAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAA < SRR4302535.1775635/94‑1 (MQ=60)
ACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACG < SRR4302535.3831915/94‑1 (MQ=60)
TTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTT < SRR4302535.275613/94‑1 (MQ=60)
TCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTG < SRR4302535.1694546/94‑1 (MQ=60)
CACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGA < SRR4302535.4303733/94‑1 (MQ=60)
CACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGA < SRR4302535.4390928/94‑1 (MQ=60)
CACCGCAGTTTATGTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGA < SRR4302535.511434/94‑1 (MQ=60)
CGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGCCAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAA > SRR4302535.2859852/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAA > SRR4302535.3858870/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAA > SRR4302535.1147682/1‑94 (MQ=60)
CGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAA < SRR4302535.1723876/94‑1 (MQ=60)
GCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAA > SRR4302535.2672845/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTGTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG < SRR4302535.1354114/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGTCCGGTCGTGATGGACCGGACAACCCGGCTAACGACCCGCGTCTGCTGTATAAAGTTGAAAAAG > SRR4302535.2986955/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG < SRR4302535.3299894/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG < SRR4302535.1124041/94‑1 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG > SRR4302535.2501521/1‑94 (MQ=60)
CAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGGCCGCTGTATAACGTTGAAAAAG > SRR4302535.2600183/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGA > SRR4302535.427967/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGA > SRR4302535.4672903/1‑94 (MQ=60)
AGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGA > SRR4302535.4395755/1‑94 (MQ=60)
GTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAC < SRR4302535.2253613/94‑1 (MQ=60)
GTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGAC > SRR4302535.4473249/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACG > SRR4302535.1829789/1‑94 (MQ=60)
TTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCAGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACG < SRR4302535.2704543/94‑1 (MQ=60)
TTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGC > SRR4302535.250237/1‑94 (MQ=60)
TTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGC < SRR4302535.320102/94‑1 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT < SRR4302535.1754548/94‑1 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT < SRR4302535.1573106/94‑1 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT < SRR4302535.3177278/94‑1 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT > SRR4302535.2710399/1‑94 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT < SRR4302535.3551222/94‑1 (MQ=60)
TATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCT > SRR4302535.1285145/1‑94 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAGCCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGGTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302535.4223191/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302535.2442540/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302535.1504548/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302535.4055133/94‑1 (MQ=60)
TTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTAT < SRR4302535.2775894/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGT > SRR4302535.684847/1‑94 (MQ=60)
ATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGT < SRR4302535.2276476/94‑1 (MQ=60)
TCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTG < SRR4302535.3894700/94‑1 (MQ=60)
CAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGC > SRR4302535.1270096/1‑94 (MQ=60)
AGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCT < SRR4302535.2921054/94‑1 (MQ=60)
GCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGG < SRR4302535.4095582/94‑1 (MQ=60)
GCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGG > SRR4302535.1815491/1‑94 (MQ=60)
CACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGC > SRR4302535.1843124/1‑94 (MQ=60)
ACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCT < SRR4302535.350947/94‑1 (MQ=60)
ACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCT < SRR4302535.318778/94‑1 (MQ=60)
CAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTG > SRR4302535.3964322/1‑94 (MQ=60)
CAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTG < SRR4302535.343768/94‑1 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA > SRR4302535.1727955/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA > SRR4302535.382342/1‑94 (MQ=60)
AGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGA > SRR4302535.4462682/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGTCAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAG < SRR4302535.1944167/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAG < SRR4302535.223085/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGG < SRR4302535.4138757/94‑1 (MQ=60)
GCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGG > SRR4302535.2437818/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGT > SRR4302535.435836/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTC > SRR4302535.492238/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGGC > SRR4302535.492366/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTCTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTC > SRR4302535.1064737/1‑94 (MQ=60)
GTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCA > SRR4302535.1481810/1‑94 (MQ=60)
GTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCA < SRR4302535.280284/94‑1 (MQ=60)
GTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCA < SRR4302535.1330103/94‑1 (MQ=60)
CTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTTAAGGTCAAA > SRR4302535.3186935/1‑94 (MQ=60)
CTGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAA < SRR4302535.1472328/94‑1 (MQ=60)
TGACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAA < SRR4302535.4510734/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACG < SRR4302535.1596996/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACG < SRR4302535.4569312/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACG < SRR4302535.2136524/94‑1 (MQ=60)
ACCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACG > SRR4302535.4475582/1‑94 (MQ=60)
CCGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGCAGGTCAAAACGA > SRR4302535.647313/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAA < SRR4302535.2430045/94‑1 (MQ=60)
CGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAA > SRR4302535.3935691/1‑94 (MQ=60)
CGGTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAA > SRR4302535.4644104/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACT > SRR4302535.1000322/1‑94 (MQ=60)
GTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACT < SRR4302535.525224/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACT < SRR4302535.884503/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACT < SRR4302535.4437505/94‑1 (MQ=60)
GTCCTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACT < SRR4302535.3565279/94‑1 (MQ=60)
CGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGC > SRR4302535.2995114/1‑94 (MQ=60)
CGTGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGC > SRR4302535.4195975/1‑94 (MQ=60)
TGATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAG > SRR4302535.405839/1‑94 (MQ=60)
GATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGG < SRR4302535.4346266/94‑1 (MQ=60)
ATGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTTCGCTGCATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGT > SRR4302535.4299397/1‑94 (MQ=60)
TGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTG < SRR4302535.447716/94‑1 (MQ=60)
TGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTG < SRR4302535.4282862/94‑1 (MQ=60)
TGGCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTG < SRR4302535.375854/94‑1 (MQ=60)
GCCCGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAAACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCC < SRR4302535.2591170/94‑1 (MQ=60)
CGGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGAT > SRR4302535.2037390/1‑94 (MQ=60)
GGACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATG > SRR4302535.1504853/1‑94 (MQ=60)
GACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGA > SRR4302535.223964/1‑94 (MQ=60)
ACAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGAC < SRR4302535.3176567/94‑1 (MQ=60)
CAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG < SRR4302535.3580784/94‑1 (MQ=60)
|
CTGAACTCTACCCAGCCGTTCCAGCTGTTGGAAACTTCACCGCAGTTTATTTATCAGGCACAGAGCGGTCTGACCGGTCGTGATGGCCCGGATAACCCGGCTAACGGCCCGCGTCCGCTGTATAACGTTGAAAAAGACGCTTATGTGCTGGCTGAAGGTCAAAACGAACTGCAGGTGCCGATGACG > NC_000913/3882975‑3883160
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
