Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,925,742 |
T→C |
A320A (GCT→GCC) |
asnA → |
asparagine synthetase A |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,925,742 | 0 | T | C | 99.5%
| 667.7
/ NA
| 213 | A320A (GCT→GCC) | asnA | asparagine synthetase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (121/91); minor base A (1/0); total (122/91) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > NC_000913/3925652‑3925831
|
cATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAgccgc < 2:2274539/93‑1 (MQ=255)
cATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAgccgc > 2:555380/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAgccgct > 1:2333268/1‑93 (MQ=255)
cggcgggtgTATCCGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTTCTTCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTTGAGTATGGCCAGCCGCTGt < 2:4187060/93‑1 (MQ=255)
cggcggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTACAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGt > 2:4393841/1‑93 (MQ=255)
gcggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTc < 1:459600/93‑1 (MQ=255)
ggcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTcgc < 1:3624134/93‑1 (MQ=255)
gcggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTcgcg > 1:2676735/1‑93 (MQ=255)
cggTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCga < 2:181687/93‑1 (MQ=255)
gTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGGATGGCCAGCCGCTGTTCGCgaga > 1:1635185/1‑93 (MQ=255)
tATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGagag < 1:1479295/93‑1 (MQ=255)
tATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCAAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGagag < 2:4628519/93‑1 (MQ=255)
aTCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGc > 2:4387802/1‑93 (MQ=255)
aTCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGc > 2:3380891/1‑93 (MQ=255)
tCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCg > 2:2891784/1‑93 (MQ=255)
gCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTcc > 2:1960872/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCt > 2:3139864/1‑93 (MQ=255)
cAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCt > 2:1468611/1‑93 (MQ=255)
gTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtc < 1:513078/93‑1 (MQ=255)
gTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtc > 1:4535363/1‑93 (MQ=255)
gTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtc < 1:2299934/93‑1 (MQ=255)
ctcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTtctc < 2:3875077/93‑1 (MQ=255)
tcGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTctct > 2:2825961/1‑93 (MQ=255)
tttGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTctgct < 2:5894/93‑1 (MQ=255)
tttGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTctgct > 1:3255846/1‑93 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaat < 2:2298021/93‑1 (MQ=255)
cTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaat > 1:1032508/1‑93 (MQ=255)
tATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaata > 1:3913/1‑93 (MQ=255)
tATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaata > 1:1450375/1‑93 (MQ=255)
aTGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGtaataa < 2:1621419/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTaataat > 1:3331469/1‑93 (MQ=255)
ctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAttt < 2:2567152/93‑1 (MQ=255)
ctgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAttt < 2:913336/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTa < 2:4296736/93‑1 (MQ=255)
tgctgctgcAACTGCCGCATAGCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTa < 1:3180949/93‑1 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt > 2:3451216/1‑93 (MQ=255)
gctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAt < 1:2243429/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 2:3247821/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 2:1355259/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 1:2867565/93‑1 (MQ=255)
ctgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATc < 1:2126151/93‑1 (MQ=255)
tgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcg > 2:277197/1‑93 (MQ=255)
tgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcg > 2:870874/1‑93 (MQ=255)
tgctgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcg > 1:928521/1‑93 (MQ=255)
tgcAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATcgccg > 1:1274160/1‑93 (MQ=255)
cAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCgccgcc < 2:1208434/93‑1 (MQ=255)
aaCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCa > 1:3017010/1‑93 (MQ=255)
aaCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCa < 1:780015/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAg < 2:2417313/93‑1 (MQ=255)
aCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCAGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAg > 1:2521337/1‑93 (MQ=255)
tGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCg > 2:3418414/1‑93 (MQ=255)
gCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGt > 2:890847/1‑93 (MQ=255)
gCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTg > 1:1620880/1‑93 (MQ=255)
gCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTg > 2:1501933/1‑93 (MQ=255)
gCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTg > 2:2628797/1‑93 (MQ=255)
gCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTg < 1:1137836/93‑1 (MQ=255)
cATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGa < 1:3442150/93‑1 (MQ=255)
atatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAg > 2:4570897/1‑93 (MQ=255)
atatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAg < 1:2900259/93‑1 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 2:4114342/1‑93 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 1:2505351/1‑93 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 1:4251654/1‑93 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 1:3107627/1‑93 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc < 1:355400/93‑1 (MQ=255)
tatCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGc > 2:1701877/1‑93 (MQ=255)
atCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCa < 2:1382118/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAg < 2:1644191/93‑1 (MQ=255)
tCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAg > 2:3172188/1‑93 (MQ=255)
gCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcg > 2:3572519/1‑93 (MQ=255)
gCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCCCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcg > 1:2180786/1‑93 (MQ=255)
cgaGGTTCAGTGTGGAGTATGCCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcgg < 2:3231496/91‑1 (MQ=255)
cAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcggc > 2:474533/1‑93 (MQ=255)
cAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAggcggc > 2:2181467/1‑93 (MQ=255)
gTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTc > 2:2511441/1‑93 (MQ=255)
tCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGc < 1:3549126/93‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGATTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCa < 1:4194259/93‑1 (MQ=255)
cAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCa < 2:2796946/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATc > 1:4655288/1‑93 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATc < 1:1387914/93‑1 (MQ=255)
gtgtGGAGTATGCCCAGCCGCTGTTCCCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATc < 2:1069353/93‑1 (MQ=255)
tgtgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATcc < 1:3926485/93‑1 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg > 2:3667616/1‑93 (MQ=255)
tgGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCg > 1:1531244/1‑93 (MQ=255)
ggTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTa < 2:657075/92‑1 (MQ=255)
aGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTa < 2:2951320/93‑1 (MQ=255)
aGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTa < 1:1976952/93‑1 (MQ=255)
aGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTa < 1:3792338/93‑1 (MQ=255)
gTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAt > 1:4111139/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAt > 1:731969/1‑93 (MQ=255)
gTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGGAt > 1:1852646/1‑93 (MQ=255)
tGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaa > 2:1738066/1‑93 (MQ=255)
tGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaa < 2:2728812/93‑1 (MQ=255)
ggCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCaaa < 1:3359585/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAg < 1:1941872/93‑1 (MQ=255)
gCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAg > 1:2382755/1‑93 (MQ=255)
ccAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgc < 1:2495182/93‑1 (MQ=255)
cAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcg > 1:1144257/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc > 2:3773242/1‑93 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc < 2:2664593/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAgcgc > 2:2673377/1‑93 (MQ=255)
|
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > NC_000913/3925652‑3925831
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGA > NC_000913/3925649‑3925835
|
GACCATCGGCGGCTGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCC < SRR4302535.360025/94‑1 (MQ=60)
GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCC < SRR4302535.1668134/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCG < SRR4302535.1864790/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCG < SRR4302535.3574206/94‑1 (MQ=60)
ACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCG < SRR4302535.1981136/94‑1 (MQ=60)
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCT > SRR4302535.2349964/1‑94 (MQ=60)
CATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCT > SRR4302535.3460810/1‑94 (MQ=60)
ATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTG > SRR4302535.2291832/1‑94 (MQ=60)
CGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTT < SRR4302535.2353799/94‑1 (MQ=60)
GCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCG < SRR4302535.462812/94‑1 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG > SRR4302535.2695884/1‑94 (MQ=60)
GGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCG < SRR4302535.3649256/94‑1 (MQ=60)
GGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGGATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGA > SRR4302535.1647000/1‑94 (MQ=60)
TATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGC < SRR4302535.1489880/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGC > SRR4302535.874260/1‑94 (MQ=60)
GCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGGTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCCCTGTTCGCGAGAGCGTCCC > SRR4302535.3561795/1‑94 (MQ=60)
CCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCT > SRR4302535.290174/1‑94 (MQ=60)
AGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTC > SRR4302535.4566396/1‑94 (MQ=60)
GTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCT < SRR4302535.516664/94‑1 (MQ=60)
GTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCT < SRR4302535.2316392/94‑1 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCATCTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT < SRR4302535.3562413/94‑1 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT > SRR4302535.3254231/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT > SRR4302535.2520710/1‑94 (MQ=60)
CTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCT > SRR4302535.995351/1‑94 (MQ=60)
TCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTG < SRR4302535.2550750/94‑1 (MQ=60)
CGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGC > SRR4302535.2117331/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCT > SRR4302535.3278468/1‑94 (MQ=60)
GTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCT < SRR4302535.3176654/94‑1 (MQ=60)
GTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGACCGGGTTCAGGGTGGAGTATGGCCCGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCT > SRR4302535.45872/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAAT < SRR4302535.2068607/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAAT > SRR4302535.1039844/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATA > SRR4302535.1460749/1‑94 (MQ=60)
CTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATA > SRR4302535.3948/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAA > SRR4302535.4190336/1‑94 (MQ=60)
TATGCTGCTGCTGCAACTGACGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAA < SRR4302535.3367525/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAT > SRR4302535.3354658/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAT > SRR4302535.136855/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAAT < SRR4302535.163715/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTA > SRR4302535.307753/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTA < SRR4302535.1924580/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCTGCAACTGCCGCATAGCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTAT < SRR4302535.3202937/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATC < SRR4302535.2259384/94‑1 (MQ=60)
GCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGGTCAGTGTGGAGTACGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGGCCCTTCTCTGCTGCAATAATTTATC > SRR4302535.2533486/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302535.4449309/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG > SRR4302535.935094/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302535.2887876/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCG < SRR4302535.2141475/94‑1 (MQ=60)
TGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGC > SRR4302535.2298985/1‑94 (MQ=60)
GCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCC < SRR4302535.4300369/94‑1 (MQ=60)
CTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCG > SRR4302535.3576764/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCG > SRR4302535.1283255/1‑94 (MQ=60)
CTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCG > SRR4302535.3949770/1‑94 (MQ=60)
TGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGC > SRR4302535.734711/1‑94 (MQ=60)
TGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGC > SRR4302535.480584/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302535.2340419/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302535.1407012/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302535.3317691/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302535.3680549/1‑94 (MQ=60)
CAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCA > SRR4302535.3038147/1‑94 (MQ=60)
AACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTGATAATTTATCGCCGCCAG < SRR4302535.11480/94‑1 (MQ=60)
AACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAG < SRR4302535.785490/94‑1 (MQ=60)
AACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCAGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAG > SRR4302535.2539504/1‑94 (MQ=60)
TGCCGCATATCGGCCAGTTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGT < SRR4302535.1467428/94‑1 (MQ=60)
CCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCT < SRR4302535.4657175/94‑1 (MQ=60)
CCGCATATCGGCCAGGTCCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCT < SRR4302535.24831/94‑1 (MQ=60)
CGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTG > SRR4302535.1194668/1‑94 (MQ=60)
CGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTG > SRR4302535.1632575/1‑94 (MQ=60)
CGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTG > SRR4302535.2762962/1‑94 (MQ=60)
GCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGA < SRR4302535.1145951/94‑1 (MQ=60)
GCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGA > SRR4302535.747874/1‑94 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG > SRR4302535.383896/1‑94 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG > SRR4302535.2448105/1‑94 (MQ=60)
CATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAG < SRR4302535.3466086/94‑1 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC > SRR4302535.3129263/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC > SRR4302535.4280785/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC > SRR4302535.2523412/1‑94 (MQ=60)
ATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGC < SRR4302535.2920762/94‑1 (MQ=60)
TATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCA < SRR4302535.357851/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCCCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCG > SRR4302535.2196347/1‑94 (MQ=60)
GCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGG < SRR4302535.3636731/94‑1 (MQ=60)
GCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGACAGCGTCTGAGCAGGCGG > SRR4302535.2676679/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT > SRR4302535.4279000/1‑94 (MQ=60)
CAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCT > SRR4302535.40942/1‑94 (MQ=60)
GGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTT < SRR4302535.1116823/94‑1 (MQ=60)
AGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTT > SRR4302535.3340430/1‑94 (MQ=60)
GGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTC < SRR4302535.4081008/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCA < SRR4302535.3573761/94‑1 (MQ=60)
TCAGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCA > SRR4302535.1680019/1‑94 (MQ=60)
CAGTGTGGATTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCAT < SRR4302535.4222960/94‑1 (MQ=60)
AGTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATC > SRR4302535.4686795/1‑94 (MQ=60)
GTGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCC < SRR4302535.1397818/94‑1 (MQ=60)
TGTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCC < SRR4302535.3953310/94‑1 (MQ=60)
GTGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCG > SRR4302535.1542275/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGG > SRR4302535.1518771/1‑94 (MQ=60)
TGGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGG > SRR4302535.154823/1‑94 (MQ=60)
GGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGT > SRR4302535.789627/1‑94 (MQ=60)
GGAGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGT > SRR4302535.369283/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAT < SRR4302535.3818483/94‑1 (MQ=60)
AGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAT < SRR4302535.1991190/94‑1 (MQ=60)
AGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAT > SRR4302535.4139281/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTAT > SRR4302535.737107/1‑94 (MQ=60)
AGTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGGAT > SRR4302535.1865992/1‑94 (MQ=60)
GTATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATC < SRR4302535.470266/94‑1 (MQ=60)
TATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCA > SRR4302535.1967958/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAA > SRR4302535.214915/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGGATCAA > SRR4302535.2200812/1‑94 (MQ=60)
TGGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAA < SRR4302535.2935503/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAG < SRR4302535.2972484/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAG < SRR4302535.3382970/94‑1 (MQ=60)
GGCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAG > SRR4302535.2399867/1‑94 (MQ=60)
GCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGC < SRR4302535.1353308/94‑1 (MQ=60)
GCCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGC < SRR4302535.1955859/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCG < SRR4302535.2513186/94‑1 (MQ=60)
CCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCG > SRR4302535.1152417/1‑94 (MQ=60)
CCAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCG < SRR4302535.1541106/94‑1 (MQ=60)
CAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > SRR4302535.4591817/1‑94 (MQ=60)
CAGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGC > SRR4302535.1787988/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCC > SRR4302535.3825818/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCA < SRR4302535.2512531/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG > SRR4302535.1209014/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG < SRR4302535.1895952/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAG > SRR4302535.1141116/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGA < SRR4302535.3619704/94‑1 (MQ=60)
CGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGA > SRR4302535.1648700/1‑94 (MQ=60)
CGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGA < SRR4302535.2511493/94‑1 (MQ=60)
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GACCATCGGCGGCGGTATCGGCCAGTCTCGTTTGACTATGCTGCTGCTGCAACTGCCGCATATCGGCCAGGTTCAGTGTGGAGTATGGCCAGCTGCTGTTCGCGAGAGCGTCCCTTCTCTGCTGTAATAATTTATCGCCGCCAGCGTCTGAGCAGGCGGCTTCGCATCCCGGTATCAAAGCGCCAGA > NC_000913/3925649‑3925835
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
