Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,930,677 |
+G |
intergenic (+175/‑264) |
kup → / → rbsD |
low affinity potassium transport system/RbsD |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 100.0%
| 697.7
/ NA
| 218 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (113/105); total (113/105) |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc < 2:734997/93‑1 (MQ=255)
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc > 2:1253443/1‑93 (MQ=255)
gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc < 1:4017203/93‑1 (MQ=255)
agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑gg > 2:2038679/1‑92 (MQ=255)
gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTTGCATGAGGCGTTGATCCTC‑ggt > 2:3655084/1‑91 (MQ=255)
gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc > 2:1812884/1‑91 (MQ=255)
agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggcaa > 2:1907842/1‑89 (MQ=255)
aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAAc < 1:4511827/93‑1 (MQ=255)
aagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAAc > 2:1849238/1‑93 (MQ=255)
agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACg > 2:2348921/1‑93 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc < 1:205319/93‑1 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc > 1:3992491/1‑93 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc > 1:4066730/1‑93 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc > 2:1299820/1‑93 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc < 1:1388988/93‑1 (MQ=255)
ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGcc < 1:109967/93‑1 (MQ=255)
tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGccc < 2:3866187/93‑1 (MQ=255)
tCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGt < 1:1409687/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTgg < 1:3893181/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTgg < 1:2723887/93‑1 (MQ=255)
cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTgg > 2:549907/1‑93 (MQ=255)
aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGt < 2:3001672/93‑1 (MQ=255)
aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGt > 2:1635623/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTa > 1:2308184/1‑93 (MQ=255)
cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTAt < 2:2293419/93‑1 (MQ=255)
tGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:3620097/1‑93 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:2390439/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 1:3675088/93‑1 (MQ=255)
gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:2915649/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc < 1:3319080/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc < 2:2783952/93‑1 (MQ=255)
tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt > 2:1391187/1‑93 (MQ=255)
ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 2:472829/1‑93 (MQ=255)
gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 2:939865/1‑93 (MQ=255)
gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 2:3772421/1‑93 (MQ=255)
aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:1446915/93‑1 (MQ=255)
tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc < 2:3387179/93‑1 (MQ=255)
aaGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 1:4268380/1‑93 (MQ=255)
aGTTGCCGGATGATGTAATCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGTTCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTg < 2:3299526/93‑1 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 1:879280/1‑93 (MQ=255)
gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 2:1509152/1‑93 (MQ=255)
ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 2:2829117/93‑1 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 1:379038/1‑93 (MQ=255)
gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:266274/93‑1 (MQ=255)
tgatgGAACCCTCCTTCTTAATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 2:4584674/1‑93 (MQ=255)
tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 1:2743799/1‑93 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 2:1186313/1‑93 (MQ=255)
gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 2:964646/1‑93 (MQ=255)
gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCaa > 1:242139/1‑93 (MQ=255)
gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGAGCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCaa < 1:550178/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc < 2:4206519/93‑1 (MQ=255)
cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:3205884/93‑1 (MQ=255)
ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa < 1:2911439/93‑1 (MQ=255)
ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa < 1:2922684/93‑1 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTCAt > 1:1215868/1‑93 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 1:151872/93‑1 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 2:1012790/1‑93 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 1:2394597/1‑93 (MQ=255)
tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt > 1:3431008/1‑93 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc > 2:4150793/1‑93 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 1:3159595/93‑1 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 1:3506215/93‑1 (MQ=255)
cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc > 1:4580419/1‑93 (MQ=255)
ttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcg < 1:446157/93‑1 (MQ=255)
ttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcg > 1:2996225/1‑93 (MQ=255)
tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 1:4668340/93‑1 (MQ=255)
tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc < 1:3041596/93‑1 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTTGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 1:215792/93‑1 (MQ=255)
cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt > 1:1690579/1‑93 (MQ=255)
ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGc > 2:665553/1‑93 (MQ=255)
tATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCg > 1:264309/1‑93 (MQ=255)
aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 2:2662162/93‑1 (MQ=255)
tGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTg < 1:1122304/93‑1 (MQ=255)
tGTCGCATGAGTCGCTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTACGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTTCAACGCAATGCGCTGCgcg > 1:1935613/1‑91 (MQ=255)
gCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 1:2808570/93‑1 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa < 1:3860902/93‑1 (MQ=255)
cATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa < 2:1472771/93‑1 (MQ=255)
aTGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 1:199974/1‑93 (MQ=255)
tGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCGACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa > 1:1625699/1‑93 (MQ=255)
tGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa < 1:434075/93‑1 (MQ=255)
tGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa < 1:1318916/93‑1 (MQ=255)
tGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa > 1:982750/1‑93 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt > 2:1727286/1‑93 (MQ=255)
gAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 2:786629/93‑1 (MQ=255)
gTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCa > 1:690887/1‑93 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa < 2:3549658/93‑1 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa < 2:3260785/93‑1 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa < 2:2446639/93‑1 (MQ=255)
tCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCaa > 2:4026994/1‑93 (MQ=255)
gTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:652299/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 1:1006349/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 2:2721554/1‑93 (MQ=255)
ttGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 2:4421111/1‑93 (MQ=255)
tGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTg < 2:3698848/93‑1 (MQ=255)
gATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa < 1:4103436/93‑1 (MQ=255)
gATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 2:2112054/1‑93 (MQ=255)
aTCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaa > 1:2559670/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa < 1:1565410/93‑1 (MQ=255)
tCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:80973/1‑93 (MQ=255)
tCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCAACGCGGCAAGCTATCCATGCAACTACAACGTAATGCAATGCGTGCACCAGCACAATATGaac < 2:4686002/93‑2 (MQ=255)
|
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > NC_000913/3930584‑3930770
|
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G > SRR4302535.3886439/1‑94 (MQ=60)
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G < SRR4302535.4044679/94‑1 (MQ=60)
GAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑Ggca > SRR4302535.3981845/1‑91 (MQ=60)
AAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAA > SRR4302535.138189/1‑94 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCTGCAAA > SRR4302535.335448/1‑94 (MQ=60)
AGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAA > SRR4302535.667684/1‑94 (MQ=60)
AAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACG < SRR4302535.4542772/94‑1 (MQ=60)
GTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCC > SRR4302535.4019801/1‑94 (MQ=60)
GTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCC > SRR4302535.4094557/1‑94 (MQ=60)
TTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCC < SRR4302535.110744/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCC < SRR4302535.1398902/94‑1 (MQ=60)
TTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCC < SRR4302535.206726/94‑1 (MQ=60)
TTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCG < SRR4302535.502892/94‑1 (MQ=60)
TGCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTG < SRR4302535.1339095/94‑1 (MQ=60)
TCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTG < SRR4302535.1419752/94‑1 (MQ=60)
CCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGG > SRR4302535.320697/1‑94 (MQ=60)
CACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGT < SRR4302535.2743341/94‑1 (MQ=60)
CACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGT < SRR4302535.3919869/94‑1 (MQ=60)
ACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTA > SRR4302535.2324699/1‑94 (MQ=60)
CCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTAT > SRR4302535.329112/1‑94 (MQ=60)
CGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATT < SRR4302535.1207429/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTG > SRR4302535.3645191/1‑94 (MQ=60)
TGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGC > SRR4302535.2329236/1‑94 (MQ=60)
GCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCG < SRR4302535.3700532/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTC < SRR4302535.2703423/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTC < SRR4302535.3912877/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302535.2616586/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302535.3342173/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT > SRR4302535.1646987/1‑94 (MQ=60)
GTATGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGACCCCTCCTTATTTATGTCGCATGAGTCGTAGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCT < SRR4302535.1113813/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC < SRR4302535.3668579/94‑1 (MQ=60)
GGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGC > SRR4302535.2751494/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302535.4632274/1‑94 (MQ=60)
AGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGC > SRR4302535.4630480/1‑94 (MQ=60)
GGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCA < SRR4302535.4096174/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG < SRR4302535.1457263/94‑1 (MQ=60)
ATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAG > SRR4302535.1178801/1‑94 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCT > SRR4302535.4297606/1‑94 (MQ=60)
TAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCT < SRR4302535.1093329/94‑1 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG > SRR4302535.1427207/1‑94 (MQ=60)
AAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTG > SRR4302535.363637/1‑94 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGT < SRR4302535.1618842/94‑1 (MQ=60)
AGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGT > SRR4302535.885508/1‑94 (MQ=60)
GTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTA < SRR4302535.2688766/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTA < SRR4302535.3710196/94‑1 (MQ=60)
TGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT > SRR4302535.3125730/1‑94 (MQ=60)
TGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACT < SRR4302535.153983/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGATGTAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTT < SRR4302535.1998588/94‑1 (MQ=60)
GCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTT < SRR4302535.887264/94‑1 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT > SRR4302535.2404829/1‑94 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT < SRR4302535.2995162/94‑1 (MQ=60)
GGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCT > SRR4302535.381663/1‑94 (MQ=60)
GATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTG < SRR4302535.268124/94‑1 (MQ=60)
GATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTG > SRR4302535.4073192/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGC > SRR4302535.586771/1‑94 (MQ=60)
ATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGC > SRR4302535.2763359/1‑94 (MQ=60)
ATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTTGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGC > SRR4302535.4346160/1‑94 (MQ=60)
TGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCA < SRR4302535.4224662/94‑1 (MQ=60)
GGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAA > SRR4302535.243799/1‑94 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302535.1948676/94‑1 (MQ=60)
GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGAGCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAC < SRR4302535.554028/94‑1 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG > SRR4302535.4522279/1‑94 (MQ=60)
AAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACG > SRR4302535.1419161/1‑94 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT > SRR4302535.2827289/1‑94 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT > SRR4302535.1628809/1‑94 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT < SRR4302535.756484/94‑1 (MQ=60)
AACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGT > SRR4302535.3055516/1‑94 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA < SRR4302535.2801758/94‑1 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA < SRR4302535.3228085/94‑1 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA > SRR4302535.252843/1‑94 (MQ=60)
CCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAA > SRR4302535.3073373/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTTTGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302535.3572752/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTCAT > SRR4302535.1224590/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.1295336/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.3454853/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302535.2943296/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT < SRR4302535.2932005/94‑1 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.286777/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.147607/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.2411809/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAT > SRR4302535.219360/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATG < SRR4302535.1465687/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATG < SRR4302535.152934/94‑1 (MQ=60)
TCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATG < SRR4302535.2120205/94‑1 (MQ=60)
CCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC < SRR4302535.449444/94‑1 (MQ=60)
CCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC > SRR4302535.4548102/1‑94 (MQ=60)
CCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGC > SRR4302535.4611616/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG < SRR4302535.3530582/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG > SRR4302535.833462/1‑94 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG < SRR4302535.3181520/94‑1 (MQ=60)
CTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCG > SRR4302535.3017231/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGC < SRR4302535.449278/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302535.4699883/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302535.595462/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT < SRR4302535.3062906/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302535.2156700/1‑94 (MQ=60)
TCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCT > SRR4302535.1702812/1‑94 (MQ=60)
CTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTTGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTG < SRR4302535.217272/94‑1 (MQ=60)
TTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCG > SRR4302535.266142/1‑94 (MQ=60)
ATGTCGCATGAGTCGCTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTACGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTTCAACGCAATGCGCTGCGCG > SRR4302535.1949555/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGC < SRR4302535.1130311/94‑1 (MQ=60)
TGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGC > SRR4302535.3459709/1‑94 (MQ=60)
TGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGC > SRR4302535.4487851/1‑94 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA > SRR4302535.3261577/1‑94 (MQ=60)
GCATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCA < SRR4302535.2828538/94‑1 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG < SRR4302535.2978615/94‑1 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG > SRR4302535.201344/1‑94 (MQ=60)
CATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAG < SRR4302535.3887469/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCGACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGA > SRR4302535.1637437/1‑94 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGA < SRR4302535.4045091/94‑1 (MQ=60)
ATGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGA > SRR4302535.989732/1‑94 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAT < SRR4302535.1328344/94‑1 (MQ=60)
TGAGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAT < SRR4302535.437098/94‑1 (MQ=60)
AGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCA > SRR4302535.695728/1‑94 (MQ=60)
AGTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCA < SRR4302535.3743420/94‑1 (MQ=60)
GTCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAA > SRR4302535.2018152/1‑94 (MQ=60)
TCGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAT > SRR4302535.2675335/1‑94 (MQ=60)
CGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT < SRR4302535.2587448/94‑1 (MQ=60)
CGTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATT < SRR4302535.2413346/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT < SRR4302535.962992/94‑1 (MQ=60)
GTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT > SRR4302535.293761/1‑94 (MQ=60)
GTTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTT > SRR4302535.1013501/1‑94 (MQ=60)
TTGATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTG < SRR4302535.4192908/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA > SRR4302535.2578098/1‑94 (MQ=60)
GATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA < SRR4302535.4035429/94‑1 (MQ=60)
GATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAA < SRR4302535.4131528/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > SRR4302535.81550/1‑94 (MQ=60)
TCCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAAT < SRR4302535.1576713/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATC < SRR4302535.4077145/94‑1 (MQ=60)
CCTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATC < SRR4302535.877901/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC < SRR4302535.313507/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC < SRR4302535.2901034/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC < SRR4302535.956015/94‑1 (MQ=60)
CTCGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCC > SRR4302535.3408294/1‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC < SRR4302535.1381656/91‑1 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302535.880830/4‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302535.893326/4‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC > SRR4302535.2545099/4‑94 (MQ=60)
tcgGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGATGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCC < SRR4302535.3329326/91‑1 (MQ=60)
GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > SRR4302535.2060334/1‑94 (MQ=60)
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GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAATCCCGCC > NC_000913/3930584‑3930770
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
