Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,004,812 |
T→C |
R448R (CGT→CGC) |
recQ → |
ATP‑dependent DNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,004,812 | 0 | T | C | 99.6%
| 764.0
/ NA
| 245 | R448R (CGT→CGC) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (130/114); minor base A (0/1); total (130/115) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT > NC_000913/4004722‑4004901
|
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt < 1:1455238/93‑1 (MQ=255)
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt > 1:2821934/1‑93 (MQ=255)
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt < 1:276584/93‑1 (MQ=255)
cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc < 1:804019/93‑1 (MQ=255)
aGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATcc > 2:1592167/1‑93 (MQ=255)
gATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcg > 1:2881907/1‑93 (MQ=255)
ttGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgcg < 2:533566/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCcgcg > 1:2843686/1‑93 (MQ=255)
ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa > 2:51219/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCCTCCGCGACTAt > 1:2036718/1‑93 (MQ=255)
cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt > 2:2326412/1‑93 (MQ=255)
cTTGCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt < 1:207463/93‑1 (MQ=255)
tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg > 1:873394/1‑93 (MQ=255)
tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg < 1:3482287/93‑1 (MQ=255)
caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa > 1:2250776/1‑93 (MQ=255)
caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa < 1:1512541/93‑1 (MQ=255)
caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa > 1:1212325/1‑93 (MQ=255)
accaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAt < 2:3971305/93‑1 (MQ=255)
accaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAt > 2:603750/1‑93 (MQ=255)
ccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATg > 2:2153190/1‑93 (MQ=255)
ccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATg > 2:3145416/1‑93 (MQ=255)
caTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGa < 2:2088535/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc > 2:2512785/1‑93 (MQ=255)
aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc < 2:2649083/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAc < 1:2372632/93‑1 (MQ=255)
aTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGAGCATCCGCGACTATGGTCATGAc > 2:2893953/1‑93 (MQ=255)
ttGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACa > 1:3081329/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATAGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaa < 1:751171/93‑1 (MQ=255)
gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAc < 2:3360591/93‑1 (MQ=255)
tCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACt > 1:549710/1‑93 (MQ=255)
gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa < 2:1330665/93‑1 (MQ=255)
gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa < 1:3971629/93‑1 (MQ=255)
gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa < 2:4556903/93‑1 (MQ=255)
tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa > 1:3207243/1‑93 (MQ=255)
tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa > 2:3436429/1‑93 (MQ=255)
gtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaaa < 2:3915002/93‑1 (MQ=255)
gtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaaa < 2:671445/93‑1 (MQ=255)
aTCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCt < 2:932429/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa < 1:3273781/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa < 1:2525183/93‑1 (MQ=255)
cAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATCACAAACTGAAAGTCTAt < 1:3816557/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg > 2:3572486/1‑93 (MQ=255)
aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg < 1:4074497/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATgg > 1:3170674/1‑93 (MQ=255)
ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCa > 2:3097872/1‑93 (MQ=255)
gTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAt < 1:1884191/93‑1 (MQ=255)
tttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATg < 2:1489581/93‑1 (MQ=255)
tGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATggg > 1:1805204/1‑93 (MQ=255)
ggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGcc > 2:4656267/1‑93 (MQ=255)
gATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCg > 1:1694090/1‑93 (MQ=255)
tGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTg > 1:4322019/1‑93 (MQ=255)
gggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGa < 2:1111266/93‑1 (MQ=255)
ggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGAt > 2:2360333/1‑93 (MQ=255)
gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa < 2:4596820/93‑1 (MQ=255)
gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa < 2:1068125/93‑1 (MQ=255)
gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa > 2:1253558/1‑93 (MQ=255)
gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa > 1:4529505/1‑93 (MQ=255)
ttATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaa > 1:3648068/1‑93 (MQ=255)
tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa < 1:1154442/93‑1 (MQ=255)
aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa < 2:796274/93‑1 (MQ=255)
aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa < 1:2499545/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGc > 2:1453148/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGc > 2:3807126/1‑93 (MQ=255)
ggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCa < 1:3002706/93‑1 (MQ=255)
gcggAAGTGATTGGTGCTGTTAATACCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGGATATGGCATGGGCCGTGATAAAGGCCAt < 2:2974481/91‑1 (MQ=255)
gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa > 1:1015617/1‑93 (MQ=255)
aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc > 1:3524250/1‑93 (MQ=255)
aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc < 1:4377984/93‑1 (MQ=255)
aGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACCGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACa < 1:3312332/93‑1 (MQ=255)
gTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAt > 1:1547985/1‑93 (MQ=255)
gTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAt < 2:3281030/93‑1 (MQ=255)
tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt > 2:2762237/1‑93 (MQ=255)
tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt > 1:3953676/1‑93 (MQ=255)
gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg > 2:4345512/1‑93 (MQ=255)
gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg > 2:1561046/1‑93 (MQ=255)
aTTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACCAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGCTAAAAGCCATGAACATTgg > 2:1931694/1‑93 (MQ=255)
aTTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTgg < 1:3743445/93‑1 (MQ=255)
ttCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg < 1:1233019/93‑1 (MQ=255)
gtggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGa < 1:1379831/93‑1 (MQ=255)
tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg > 1:3943988/1‑93 (MQ=255)
tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg > 1:4468747/1‑93 (MQ=255)
tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg > 2:4245938/1‑93 (MQ=255)
ggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGc < 2:749828/93‑1 (MQ=255)
ggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGc > 1:4040203/1‑93 (MQ=255)
ggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGc > 2:3839777/1‑93 (MQ=255)
tgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGt > 1:1203372/1‑93 (MQ=255)
tgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGt > 1:3615270/1‑93 (MQ=255)
cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa > 1:4606914/1‑93 (MQ=255)
cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa < 2:1550229/93‑1 (MQ=255)
cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa < 2:4648136/93‑1 (MQ=255)
cTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGa > 1:2933418/1‑93 (MQ=255)
taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt < 2:4481949/93‑1 (MQ=255)
taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt > 2:292572/1‑93 (MQ=255)
taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt > 2:2751788/1‑93 (MQ=255)
aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc > 1:1027596/1‑93 (MQ=255)
ataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATcc < 1:959140/93‑1 (MQ=255)
taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGCGCGTGATCCg > 1:933122/1‑93 (MQ=255)
taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCg > 2:43871/1‑93 (MQ=255)
taaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCg < 2:170986/93‑1 (MQ=255)
aaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGc < 2:4146220/93‑1 (MQ=255)
|
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT > NC_000913/4004722‑4004901
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT > NC_000913/4004719‑4004905
|
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGC > SRR4302535.1763537/1‑94 (MQ=60)
CTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAT > SRR4302535.2841971/1‑94 (MQ=60)
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATC < SRR4302535.278516/94‑1 (MQ=60)
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATC < SRR4302535.1465652/94‑1 (MQ=60)
CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC < SRR4302535.809664/94‑1 (MQ=60)
AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG > SRR4302535.3420276/1‑94 (MQ=60)
AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG > SRR4302535.2902304/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCG > SRR4302535.2863851/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCG > SRR4302535.3517576/1‑94 (MQ=60)
TGCCCTTTCCCCCAGTGTTCGTGTGAATCAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC < SRR4302535.1217593/94‑1 (MQ=60)
GCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACT < SRR4302535.855378/94‑1 (MQ=60)
CCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTA > SRR4302535.964307/1‑94 (MQ=60)
CCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTA > SRR4302535.1529044/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCCTCCGCGACTAT > SRR4302535.2051385/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT > SRR4302535.3976769/1‑94 (MQ=60)
CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT < SRR4302535.3718349/94‑1 (MQ=60)
CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT < SRR4302535.4666718/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG < SRR4302535.2438104/94‑1 (MQ=60)
CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG > SRR4302535.879584/1‑94 (MQ=60)
CTTGCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG < SRR4302535.208886/94‑1 (MQ=60)
TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG < SRR4302535.1471693/94‑1 (MQ=60)
TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG < SRR4302535.3506469/94‑1 (MQ=60)
TCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTC < SRR4302535.3169288/94‑1 (MQ=60)
TCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA > SRR4302535.1221023/1‑94 (MQ=60)
CCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA > SRR4302535.2266804/1‑94 (MQ=60)
CCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA > SRR4302535.1901546/1‑94 (MQ=60)
CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT < SRR4302535.1523436/94‑1 (MQ=60)
ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG < SRR4302535.1196731/94‑1 (MQ=60)
ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG > SRR4302535.2594527/1‑94 (MQ=60)
CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA > SRR4302535.2277695/1‑94 (MQ=60)
ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACA < SRR4302535.2389674/94‑1 (MQ=60)
ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACA > SRR4302535.3102808/1‑94 (MQ=60)
TGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATAGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAA < SRR4302535.756463/94‑1 (MQ=60)
GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT > SRR4302535.553554/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA < SRR4302535.3306096/94‑1 (MQ=60)
CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA < SRR4302535.2936754/94‑1 (MQ=60)
GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA < SRR4302535.3259938/94‑1 (MQ=60)
GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA > SRR4302535.3229456/1‑94 (MQ=60)
GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA < SRR4302535.2787587/94‑1 (MQ=60)
GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA < SRR4302535.3998756/94‑1 (MQ=60)
TTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG < SRR4302535.986882/94‑1 (MQ=60)
GTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG > SRR4302535.638525/1‑94 (MQ=60)
GTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAG < SRR4302535.286141/94‑1 (MQ=60)
TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT < SRR4302535.2491986/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT < SRR4302535.2909439/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT < SRR4302535.2858115/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA > SRR4302535.1118720/1‑94 (MQ=60)
TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT < SRR4302535.3296518/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT < SRR4302535.2543379/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT < SRR4302535.2666458/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT < SRR4302535.4264601/94‑1 (MQ=60)
CAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATCACAAACTGAAAGTCTATG < SRR4302535.3842892/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG < SRR4302535.4102374/94‑1 (MQ=60)
AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG > SRR4302535.3665437/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG > SRR4302535.3192630/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG > SRR4302535.810530/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG > SRR4302535.3997031/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCA < SRR4302535.1692719/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT > SRR4302535.2993677/1‑94 (MQ=60)
GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT < SRR4302535.3947716/94‑1 (MQ=60)
GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT > SRR4302535.4171243/1‑94 (MQ=60)
GTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG < SRR4302535.1897771/94‑1 (MQ=60)
TTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG < SRR4302535.3597372/94‑1 (MQ=60)
TTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGG > SRR4302535.1818248/1‑94 (MQ=60)
TGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGC < SRR4302535.2535909/94‑1 (MQ=60)
GGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCG > SRR4302535.1706341/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTG > SRR4302535.4351587/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTG > SRR4302535.4552981/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTG > SRR4302535.1220077/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGA < SRR4302535.1287092/94‑1 (MQ=60)
GGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATA > SRR4302535.4560517/1‑94 (MQ=60)
GGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATA < SRR4302535.4008969/94‑1 (MQ=60)
GTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAA > SRR4302535.3673328/1‑94 (MQ=60)
TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA < SRR4302535.1029358/94‑1 (MQ=60)
TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA < SRR4302535.2125881/94‑1 (MQ=60)
TATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAA < SRR4302535.1162694/94‑1 (MQ=60)
ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG < SRR4302535.2517577/94‑1 (MQ=60)
TGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGC > SRR4302535.1956819/1‑94 (MQ=60)
TGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGC < SRR4302535.2099697/94‑1 (MQ=60)
TGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCA < SRR4302535.4065244/94‑1 (MQ=60)
GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT < SRR4302535.3023753/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGTGATTCGTGTTGCTAATACCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG < SRR4302535.1432824/94‑1 (MQ=60)
GTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG < SRR4302535.1081118/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCGGTGATAAAAGACATGA > SRR4302535.183309/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA > SRR4302535.1022837/1‑94 (MQ=60)
GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA > SRR4302535.3991618/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC > SRR4302535.3548727/1‑94 (MQ=60)
GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC > SRR4302535.2066460/1‑94 (MQ=60)
AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA > SRR4302535.3244641/1‑94 (MQ=60)
AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA > SRR4302535.3563624/1‑94 (MQ=60)
AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA < SRR4302535.4407939/94‑1 (MQ=60)
AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT < SRR4302535.3037847/94‑1 (MQ=60)
AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT > SRR4302535.1559136/1‑94 (MQ=60)
AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT < SRR4302535.3185619/94‑1 (MQ=60)
AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACCGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT < SRR4302535.3335380/94‑1 (MQ=60)
GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT < SRR4302535.1496689/94‑1 (MQ=60)
GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT > SRR4302535.3980666/1‑94 (MQ=60)
TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG < SRR4302535.939118/94‑1 (MQ=60)
TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGGGATAAAAGCCATGAACATTG > SRR4302535.3893692/1‑94 (MQ=60)
TATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGG < SRR4302535.3224717/94‑1 (MQ=60)
GATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGG > SRR4302535.2870447/1‑94 (MQ=60)
ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGG < SRR4302535.3769344/94‑1 (MQ=60)
TTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGT < SRR4302535.1241837/94‑1 (MQ=60)
TTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGT < SRR4302535.3340663/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG < SRR4302535.4096517/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG < SRR4302535.1389672/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG > SRR4302535.3970917/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG > SRR4302535.4499409/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC > SRR4302535.4067860/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC > SRR4302535.911744/1‑94 (MQ=60)
TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC < SRR4302535.1842496/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCG < SRR4302535.3730423/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCG > SRR4302535.4599343/1‑94 (MQ=60)
GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT > SRR4302535.3640334/1‑94 (MQ=60)
GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT > SRR4302535.1212009/1‑94 (MQ=60)
TGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTG > SRR4302535.4499165/1‑94 (MQ=60)
TGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTG < SRR4302535.4620077/94‑1 (MQ=60)
TGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTG < SRR4302535.1727289/94‑1 (MQ=60)
GCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGA > SRR4302535.2954065/1‑94 (MQ=60)
GCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGA > SRR4302535.4638222/1‑94 (MQ=60)
CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT > SRR4302535.612267/1‑94 (MQ=60)
CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT > SRR4302535.4367034/1‑94 (MQ=60)
CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT > SRR4302535.3051720/1‑94 (MQ=60)
CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGACATGAACATTGGGTGAGCGTGAT > SRR4302535.1239300/1‑94 (MQ=60)
TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC < SRR4302535.3795092/94‑1 (MQ=60)
TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC > SRR4302535.1034894/1‑94 (MQ=60)
ATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGCGCGTGATCCG > SRR4302535.939722/1‑94 (MQ=60)
ATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCTG > SRR4302535.796296/1‑94 (MQ=60)
ATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCG < SRR4302535.965952/94‑1 (MQ=60)
ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA > SRR4302535.863159/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAG > SRR4302535.1361750/1‑94 (MQ=60)
GCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTG < SRR4302535.1689098/94‑1 (MQ=60)
GCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTG < SRR4302535.4469493/94‑1 (MQ=60)
CGCATCCGCGGCTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGA > SRR4302535.3201378/1‑94 (MQ=60)
CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT < SRR4302535.1751338/94‑1 (MQ=60)
|
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT > NC_000913/4004719‑4004905
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
