Sample Resequencing Stats

Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate Predicted Mutations Mean Coverage Total Reads Percent Mapped Mapped Reads Average Read Length
A1 F1 I1 R1 1696 279.3 15874187 97.8% 15524954 93.0

Breseq alignment

BRESEQ :: Evidence
Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 4,004,812 T→C R448R (CGT→CGC recQ → ATP‑dependent DNA helicase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009134,004,8120TC99.4% 1096.8 / ‑3.6 356R448R (CGT→CGCrecQATP‑dependent DNA helicase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (1/1);  new base C (162/190);  total (164/192)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.39e-01

Only 100 of 371 total aligned reads displayed.

TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901
                                                                                          |                                                                                         
tCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAt                                                                                         >  2:6621658/1‑93 (MQ=255)
 cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc                                                                                        >  1:660988/1‑93 (MQ=255)
 cAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATc                                                                                        <  1:2808585/93‑1 (MQ=255)
      tGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGa                                                                                   >  2:3431105/1‑93 (MQ=255)
      tGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGa                                                                                   >  1:2908612/1‑93 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa                                                                                <  2:6483525/93‑1 (MQ=255)
         ccTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGGTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTa                                                                                >  1:7094517/1‑93 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               >  1:4283873/1‑93 (MQ=255)
          cTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAt                                                                               <  1:3983220/93‑1 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              <  2:4966617/93‑1 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              <  1:2668991/93‑1 (MQ=255)
           tttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATg                                                                              >  2:784385/1‑93 (MQ=255)
            ttCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATgg                                                                             <  2:6857569/93‑1 (MQ=255)
             tCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGt                                                                            <  2:4845602/93‑1 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          <  1:5659708/93‑1 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          <  2:1120219/93‑1 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          <  2:1544590/93‑1 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          >  2:3158435/1‑93 (MQ=255)
               caccaTTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCa                                                                          <  1:3483125/93‑1 (MQ=255)
                    ttGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACa                                                                     >  2:4724393/1‑93 (MQ=255)
                      ggTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaaa                                                                   <  2:2327104/93‑1 (MQ=255)
                       gTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAc                                                                  <  1:6769149/93‑1 (MQ=255)
                        tCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGTTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACaaaat                                                                 >  1:6455491/1‑91 (MQ=255)
                         cGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTg                                                                <  2:2830507/93‑1 (MQ=255)
                          gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa                                                               >  2:5870371/1‑93 (MQ=255)
                          gtgtGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGa                                                               <  2:1409629/93‑1 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGGGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  1:3573530/1‑93 (MQ=255)
                           tgtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaa                                                              >  1:838532/1‑93 (MQ=255)
                            gtgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGaaa                                                             <  2:1609310/93‑1 (MQ=255)
                             tgAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAg                                                            <  2:6168715/93‑1 (MQ=255)
                              gAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGt                                                           >  2:5632695/1‑93 (MQ=255)
                              gAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGt                                                           >  1:109568/1‑93 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        >  2:90965/1‑93 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        >  2:6117664/1‑93 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        >  2:4271494/1‑93 (MQ=255)
                                 tCAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTa                                                        <  1:793262/93‑1 (MQ=255)
                                  cAGCTGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTTGTGCTAATAACCAGCGCATCAGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAt                                                       <  1:3199711/93‑1 (MQ=255)
                                  cAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAt                                                       <  1:579024/93‑1 (MQ=255)
                                  cAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAt                                                       >  1:4787951/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      >  2:7169356/1‑93 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      <  1:974831/93‑1 (MQ=255)
                                   aGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATg                                                      <  1:4890883/93‑1 (MQ=255)
                                    gCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATgg                                                     >  2:3676910/1‑93 (MQ=255)
                                      ggTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCa                                                   >  1:4602662/1‑93 (MQ=255)
                                        tttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATg                                                 >  1:3322249/1‑93 (MQ=255)
                                         ttGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATgg                                                >  2:2655383/1‑93 (MQ=255)
                                            ggATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGcc                                             <  1:2201626/93‑1 (MQ=255)
                                              aTGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGt                                           <  2:1872043/93‑1 (MQ=255)
                                               tGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTg                                          >  1:1348479/1‑93 (MQ=255)
                                                gggTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGa                                         <  2:2755642/93‑1 (MQ=255)
                                                  gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa                                       <  2:2993942/93‑1 (MQ=255)
                                                  gTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATa                                       <  2:6201140/93‑1 (MQ=255)
                                                   ttATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaa                                      >  1:7849847/1‑93 (MQ=255)
                                                   ttATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaa                                      >  1:557487/1‑93 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     <  1:6162283/93‑1 (MQ=255)
                                                    tATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaa                                     >  1:1769889/1‑93 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  1:1484549/93‑1 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  1:5882241/93‑1 (MQ=255)
                                                     aTGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaa                                    <  1:3015018/93‑1 (MQ=255)
                                                      tgtgGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATaaaac                                   >  1:2324135/1‑92 (MQ=255)
                                                      tgtgGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAg                                   >  1:7255354/1‑93 (MQ=255)
                                                        tggtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGcc                                 >  2:2847645/1‑93 (MQ=255)
                                                          gtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAt                               <  1:7159038/93‑1 (MQ=255)
                                                          gtggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAt                               <  2:6549512/93‑1 (MQ=255)
                                                           tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              <  2:303876/93‑1 (MQ=255)
                                                           tggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              >  2:7657712/1‑93 (MQ=255)
                                                           gggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATg                              <  1:6266185/92‑1 (MQ=255)
                                                            ggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGa                             <  1:3110864/93‑1 (MQ=255)
                                                            ggAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAGCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCCATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGa                             >  1:7003564/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            >  2:5114738/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            <  1:114580/93‑1 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            >  2:1306584/1‑93 (MQ=255)
                                                             gAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGaa                            >  2:1158279/1‑93 (MQ=255)
                                                              aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc                           <  1:5970869/93‑1 (MQ=255)
                                                              aaGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAc                           <  2:7053384/93‑1 (MQ=255)
                                                                gTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAt                         <  1:7689233/93‑1 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  2:4049276/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        >  2:3393585/1‑93 (MQ=255)
                                                                 tGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAtt                        <  1:1233708/93‑1 (MQ=255)
                                                                  gATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTg                       >  1:368220/1‑93 (MQ=255)
                                                                    ttCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTggg                     >  1:4474050/1‑93 (MQ=255)
                                                                     tCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGt                    <  2:1082499/93‑1 (MQ=255)
                                                                       gtggtgCTAATAACCCGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGa                  <  1:1633897/93‑1 (MQ=255)
                                                                       gtggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGa                  >  2:3488352/1‑93 (MQ=255)
                                                                       gtggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGa                  <  1:5264836/93‑1 (MQ=255)
                                                                        tggtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAg                 <  2:7533736/93‑1 (MQ=255)
                                                                          gtgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCg               <  1:1528895/93‑1 (MQ=255)
                                                                           tgCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGt              >  2:2947002/1‑93 (MQ=255)
                                                                            gCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTg             <  2:3907239/93‑1 (MQ=255)
                                                                              taataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAt           >  1:1977640/1‑93 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATc          >  2:5727772/1‑93 (MQ=255)
                                                                               aataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTAATc          >  2:730681/1‑93 (MQ=255)
                                                                                ataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGTTcc         >  2:6425847/1‑93 (MQ=255)
                                                                                ataaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATcc         >  1:3711627/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  aaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGTCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGc       <  1:171683/93‑1 (MQ=255)
                                                                                  aaCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGc       <  2:5516864/93‑1 (MQ=255)
                                                                                   aCCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATTAACATTGGGTGAGCGTGATCCGcc      <  2:4571041/93‑1 (MQ=255)
                                                                                      aGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGc   <  1:255241/93‑1 (MQ=255)
                                                                                       gcgcATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCt  <  1:5017790/93‑1 (MQ=255)
                                                                                       gcgcATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCt  >  2:4500870/1‑93 (MQ=255)
                                                                                          |                                                                                         
TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT  >  NC_000913/4004722‑4004901

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 

GATK/CNVnator alignment

BRESEQ :: bam2aln output Only 200 of 205 total aligned reads displayed.
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  >  NC_000913/4004719‑4004905
                                                                                             |                                                                                             
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGC                                                                                               >  SRR4302543.6643669/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGC                                                                                               >  SRR4302543.6643672/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGC                                                                                               <  SRR4302543.6794933/94‑1 (MQ=60)
 GCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCA                                                                                              >  SRR4302543.1126452/1‑94 (MQ=60)
 GCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCA                                                                                              <  SRR4302543.1765601/94‑1 (MQ=60)
  CTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAT                                                                                             <  SRR4302543.3327502/94‑1 (MQ=60)
   ttagcttggcaTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATC                                                                                            <  SRR4302543.5375266/83‑1 (MQ=60)
   TCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATC                                                                                            >  SRR4302543.667060/1‑94 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                           <  SRR4302543.2834292/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                           <  SRR4302543.1887965/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                           <  SRR4302543.7436316/94‑1 (MQ=60)
    CAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCC                                                                                           <  SRR4302543.7243023/94‑1 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                          >  SRR4302543.5677645/1‑94 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                          >  SRR4302543.139935/1‑94 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCG                                                                                          >  SRR4302543.1218751/1‑94 (MQ=60)
     AGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGCGATTCGTGGTGCTAATAACCAACGCATCCG                                                                                          >  SRR4302543.3717604/1‑94 (MQ=60)
        TTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGA                                                                                       >  SRR4302543.2935053/1‑94 (MQ=60)
         TGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGAC                                                                                      >  SRR4302543.5960116/1‑94 (MQ=60)
          GCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGTATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACT                                                                                     >  SRR4302543.1154234/1‑94 (MQ=60)
           CCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTA                                                                                    >  SRR4302543.7132412/1‑94 (MQ=60)
           CCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGGTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTA                                                                                    >  SRR4302543.7163411/1‑94 (MQ=60)
            CCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTAT                                                                                   >  SRR4302543.4322807/1‑94 (MQ=60)
             CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                  <  SRR4302543.4018552/94‑1 (MQ=60)
             CTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATG                                                                                  >  SRR4302543.7622160/1‑94 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                 <  SRR4302543.2693192/94‑1 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                 <  SRR4302543.3066794/94‑1 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                 <  SRR4302543.4957048/94‑1 (MQ=60)
              TTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGG                                                                                 <  SRR4302543.6573134/94‑1 (MQ=60)
               TTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGT                                                                                <  SRR4302543.2150910/94‑1 (MQ=60)
                 CCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCA                                                                              >  SRR4302543.4767228/1‑94 (MQ=60)
                  CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT                                                                             <  SRR4302543.8002071/94‑1 (MQ=60)
                  CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT                                                                             >  SRR4302543.2548309/1‑94 (MQ=60)
                  CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT                                                                             <  SRR4302543.3514321/94‑1 (MQ=60)
                  CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT                                                                             <  SRR4302543.2277133/94‑1 (MQ=60)
                  CACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCAT                                                                             <  SRR4302543.5711329/94‑1 (MQ=60)
                   CCCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG                                                                            <  SRR4302543.1764468/94‑1 (MQ=60)
                   ACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATG                                                                            >  SRR4302543.2291322/1‑94 (MQ=60)
                    CCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGA                                                                           >  SRR4302543.3172576/1‑94 (MQ=60)
                     CATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAC                                                                          >  SRR4302543.4567771/1‑94 (MQ=60)
                     CATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAC                                                                          >  SRR4302543.6242169/1‑94 (MQ=60)
                     CATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGAC                                                                          >  SRR4302543.6656542/1‑94 (MQ=60)
                      ATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACA                                                                         <  SRR4302543.6350050/94‑1 (MQ=60)
                       TTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAA                                                                        <  SRR4302543.3750214/94‑1 (MQ=60)
                       TTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAA                                                                        <  SRR4302543.130291/94‑1 (MQ=60)
                        TGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAA                                                                       >  SRR4302543.415935/1‑94 (MQ=60)
                         GGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAC                                                                      >  SRR4302543.3699976/1‑94 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGTTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAAAT                                                                     >  SRR4302543.6516316/1‑94 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                     <  SRR4302543.6833081/94‑1 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                     >  SRR4302543.3584761/1‑94 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                     <  SRR4302543.1199889/94‑1 (MQ=60)
                          GTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACT                                                                     >  SRR4302543.5000844/1‑94 (MQ=60)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA                                                                   <  SRR4302543.594223/94‑1 (MQ=60)
                            CGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGA                                                                   >  SRR4302543.988787/1‑94 (MQ=60)
                             GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGGGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA                                                                  >  SRR4302543.3605117/1‑94 (MQ=60)
                             GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA                                                                  >  SRR4302543.845931/1‑94 (MQ=60)
                             GTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGCGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAA                                                                  >  SRR4302543.601191/1‑94 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                               >  SRR4302543.110568/1‑94 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                               >  SRR4302543.5110419/1‑94 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                               <  SRR4302543.1533687/94‑1 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                               <  SRR4302543.6655378/94‑1 (MQ=60)
                                TGAATCAGCGGTTTGGGATGGGGTATGCGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGT                                                               >  SRR4302543.7259870/1‑94 (MQ=60)
                                  AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT                                                             <  SRR4302543.5023234/94‑1 (MQ=60)
                                  AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT                                                             >  SRR4302543.1513024/1‑94 (MQ=60)
                                  AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT                                                             >  SRR4302543.3060907/1‑94 (MQ=60)
                                  AATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCT                                                             <  SRR4302543.7487479/94‑1 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                            <  SRR4302543.4480481/94‑1 (MQ=60)
                                   ATCAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTA                                                            <  SRR4302543.4480480/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.6189917/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.8010914/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.3287588/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.2573368/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           >  SRR4302543.4831714/1‑94 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.800235/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTTGGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAAGAACCAGCGCATCCGCGGCTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.4046640/94‑1 (MQ=60)
                                    TCAGCGGTGTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAT                                                           <  SRR4302543.800234/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCTGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTTGTGCTAATAACCAGCGCATCAGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.3228563/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.1237464/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.584318/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.2518714/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.3390910/94‑1 (MQ=60)
                                     CAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATG                                                          <  SRR4302543.785738/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                         <  SRR4302543.4935468/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                         <  SRR4302543.2623550/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                         <  SRR4302543.983415/94‑1 (MQ=60)
                                      AGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGG                                                         <  SRR4302543.983417/94‑1 (MQ=60)
                                        CGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCA                                                       >  SRR4302543.4644477/1‑94 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                      <  SRR4302543.4515350/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                      >  SRR4302543.1750120/1‑94 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                      <  SRR4302543.6338455/94‑1 (MQ=60)
                                         GGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCAT                                                      >  SRR4302543.5832870/1‑94 (MQ=60)
                                          GTTTGGGATGGTTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG                                                     <  SRR4302543.5478720/94‑1 (MQ=60)
                                          GTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG                                                     <  SRR4302543.5492848/94‑1 (MQ=60)
                                          GTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG                                                     >  SRR4302543.3352218/1‑94 (MQ=60)
                                          GTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATG                                                     <  SRR4302543.6714935/94‑1 (MQ=60)
                                           TTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGG                                                    <  SRR4302543.1605272/94‑1 (MQ=60)
                                            TTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGG                                                   <  SRR4302543.7998309/94‑1 (MQ=60)
                                             TGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGC                                                  >  SRR4302543.311733/1‑94 (MQ=60)
                                               GGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCG                                                <  SRR4302543.2221440/94‑1 (MQ=60)
                                                GATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGAATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGT                                               <  SRR4302543.1316673/94‑1 (MQ=60)
                                                 ATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTG                                              >  SRR4302543.1360536/1‑94 (MQ=60)
                                                 ATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTG                                              >  SRR4302543.1723392/1‑94 (MQ=60)
                                                  TGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGA                                             >  SRR4302543.472258/1‑94 (MQ=60)
                                                     GTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAA                                          >  SRR4302543.562599/1‑94 (MQ=60)
                                                     GTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAA                                          >  SRR4302543.895964/1‑94 (MQ=60)
                                                     GTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAA                                          >  SRR4302543.7923819/1‑94 (MQ=60)
                                                      TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA                                         >  SRR4302543.6309802/1‑94 (MQ=60)
                                                      TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA                                         >  SRR4302543.1785715/1‑94 (MQ=60)
                                                      TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA                                         >  SRR4302543.715913/1‑94 (MQ=60)
                                                      TTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAA                                         <  SRR4302543.370912/94‑1 (MQ=60)
                                                      GTATGTGGTGGAATTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTAGGGCATGGGCCGTGATAAA                                         <  SRR4302543.370911/94‑1 (MQ=60)
                                                       TATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAA                                        <  SRR4302543.6220603/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       >  SRR4302543.7325494/1‑94 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       <  SRR4302543.5935850/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       <  SRR4302543.5935851/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       <  SRR4302543.3042300/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       <  SRR4302543.1497919/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAG                                       <  SRR4302543.4459829/94‑1 (MQ=60)
                                                        ATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAC                                       >  SRR4302543.2345258/1‑94 (MQ=60)
                                                          GTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCC                                     >  SRR4302543.7770717/1‑94 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                   <  SRR4302543.3012678/94‑1 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                   >  SRR4302543.1144674/1‑94 (MQ=60)
                                                            GGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCAT                                   <  SRR4302543.2605073/94‑1 (MQ=60)
                                                             GTGTAAGTGATTCGTGTTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG                                  <  SRR4302543.72227/94‑1 (MQ=60)
                                                             GTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG                                  <  SRR4302543.7228606/94‑1 (MQ=60)
                                                             GTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG                                  <  SRR4302543.5769464/94‑1 (MQ=60)
                                                             GTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG                                  <  SRR4302543.2013694/94‑1 (MQ=60)
                                                             GTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATG                                  <  SRR4302543.1977368/94‑1 (MQ=60)
                                                              TGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCAGCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCCATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGA                                 >  SRR4302543.7070056/1‑94 (MQ=60)
                                                              GGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGA                                 <  SRR4302543.6325269/94‑1 (MQ=60)
                                                               GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA                                <  SRR4302543.3138846/94‑1 (MQ=60)
                                                               GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA                                <  SRR4302543.5630091/94‑1 (MQ=60)
                                                               GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA                                <  SRR4302543.2940755/94‑1 (MQ=60)
                                                               GGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAA                                <  SRR4302543.1572244/94‑1 (MQ=60)
                                                                GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC                               <  SRR4302543.1514582/94‑1 (MQ=60)
                                                                GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC                               <  SRR4302543.5875139/94‑1 (MQ=60)
                                                                GAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAAC                               <  SRR4302543.115619/94‑1 (MQ=60)
                                                                 AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA                              <  SRR4302543.6025547/94‑1 (MQ=60)
                                                                 AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA                              <  SRR4302543.7082989/94‑1 (MQ=60)
                                                                 AAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACA                              <  SRR4302543.7183997/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             >  SRR4302543.2725028/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             >  SRR4302543.6117910/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             <  SRR4302543.391002/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             >  SRR4302543.2973006/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             <  SRR4302543.1278535/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             <  SRR4302543.4221057/94‑1 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACAT                             >  SRR4302543.3234811/1‑94 (MQ=60)
                                                                  AGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGAATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTCATAAAAGCCATGAACAT                             >  SRR4302543.3234810/1‑94 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                            <  SRR4302543.7762042/94‑1 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                            <  SRR4302543.6078565/94‑1 (MQ=60)
                                                                   GTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATT                            >  SRR4302543.5218499/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                           <  SRR4302543.3367863/94‑1 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                           >  SRR4302543.2898408/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                           >  SRR4302543.371619/1‑94 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                           <  SRR4302543.1244820/94‑1 (MQ=60)
                                                                    TGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTG                           >  SRR4302543.371620/1‑94 (MQ=60)
                                                                     GATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGG                          <  SRR4302543.648155/94‑1 (MQ=60)
                                                                      ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACCTTGGG                         >  SRR4302543.2759698/1‑94 (MQ=60)
                                                                      ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGG                         >  SRR4302543.4514652/1‑94 (MQ=60)
                                                                      ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGG                         >  SRR4302543.147112/1‑94 (MQ=60)
                                                                      ATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGG                         >  SRR4302543.7996187/1‑94 (MQ=60)
                                                                       TTCGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGT                        <  SRR4302543.3139886/94‑1 (MQ=60)
                                                                         CGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGA                      <  SRR4302543.3399040/94‑1 (MQ=60)
                                                                         CGTGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGA                      >  SRR4302543.2896113/1‑94 (MQ=60)
                                                                          GTGGTGCTAATAACCCGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG                     <  SRR4302543.1648463/94‑1 (MQ=60)
                                                                          GTGGGGTTAATACCCAGCCTATCCGAGACTATGGTCATGACACCGTGAAGTTGTATGGCATGGGCCGTTATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAG                     <  SRR4302543.3727688/94‑1 (MQ=28)
                                                                           TGGTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGC                    <  SRR4302543.5125100/94‑1 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                  <  SRR4302543.1542610/94‑1 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                  >  SRR4302543.2850197/1‑94 (MQ=60)
                                                                             GTGCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGT                  <  SRR4302543.1902767/94‑1 (MQ=60)
                                                                               GCTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGA                >  SRR4302543.4549052/1‑94 (MQ=60)
                                                                                CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT               <  SRR4302543.7085242/94‑1 (MQ=60)
                                                                                CTAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGAT               >  SRR4302543.1995371/1‑94 (MQ=60)
                                                                                 TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC              <  SRR4302543.1722680/94‑1 (MQ=60)
                                                                                 TAATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATC              >  SRR4302543.6914058/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC             >  SRR4302543.3744263/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC             >  SRR4302543.6944796/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC             >  SRR4302543.4856437/1‑94 (MQ=60)
                                                                                  AATAACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCC             >  SRR4302543.782913/1‑94 (MQ=60)
                                                                                     AACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGTCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCC          <  SRR4302543.173150/94‑1 (MQ=60)
                                                                                     AACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCC          <  SRR4302543.2617516/94‑1 (MQ=60)
                                                                                      ACCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCA         <  SRR4302543.6814503/94‑1 (MQ=60)
                                                                                       CCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAG        >  SRR4302543.5752509/1‑94 (MQ=60)
                                                                                       CCAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAG        >  SRR4302543.4877132/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        CAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGC       >  SRR4302543.3836685/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        CAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGC       >  SRR4302543.1735893/1‑94 (MQ=60)
                                                                                        CAGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGC       >  SRR4302543.877844/1‑94 (MQ=60)
                                                                                         AGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT      <  SRR4302543.257467/94‑1 (MQ=60)
                                                                                         AGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT      >  SRR4302543.1594366/1‑94 (MQ=60)
                                                                                         AGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT      <  SRR4302543.4888351/94‑1 (MQ=60)
                                                                                         AGCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCT      <  SRR4302543.5684033/94‑1 (MQ=60)
                                                                                          GCGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTG     <  SRR4302543.5063450/94‑1 (MQ=60)
                                                                                           CGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGA    >  SRR4302543.7888210/1‑94 (MQ=60)
                                                                                           CGCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGA    <  SRR4302543.1628488/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            GCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT   <  SRR4302543.5486676/94‑1 (MQ=60)
                                                                                            GCATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGAT   <  SRR4302543.6054654/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  >  SRR4302543.6847783/1‑94 (MQ=60)
                                                                                             CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  <  SRR4302543.1989939/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  <  SRR4302543.1939732/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  >  SRR4302543.6847782/1‑94 (MQ=60)
                                                                                             CATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  <  SRR4302543.673654/94‑1 (MQ=60)
                                                                                             |                                                                                             
TGCTCAGATTGCCCTTTCCACCATTGGTCGTGTGAATCAGCGGTTTGGGATGGGTTATGTGGTGGAAGTGATTCGTGGTGCTAATAACCAGCGTATCCGCGACTATGGTCATGACAAACTGAAAGTCTATGGCATGGGCCGTGATAAAAGCCATGAACATTGGGTGAGCGTGATCCGCCAGCTGATT  >  NC_000913/4004719‑4004905

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: