Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,005,219 |
T→C |
V584A (GTT→GCT) |
recQ → |
ATP‑dependent DNA helicase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,005,219 | 0 | T | C | 99.6%
| 772.7
/ ‑5.4
| 246 | V584A (GTT→GCT) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (108/136); total (109/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCA > NC_000913/4005130‑4005307
|
gccgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTgg < 2:2550708/93‑1 (MQ=255)
cgTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGa < 2:705105/93‑1 (MQ=255)
gTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGAt < 1:4299302/93‑1 (MQ=255)
tACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATg > 2:1286149/1‑93 (MQ=255)
aCGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgc < 2:1572648/93‑1 (MQ=255)
gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgcgc < 1:1093710/93‑1 (MQ=255)
gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgcgc > 2:3308052/1‑93 (MQ=255)
gtggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATgcgc > 1:3427835/1‑93 (MQ=255)
tggtgTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCa > 2:261141/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAg > 1:1815274/1‑93 (MQ=255)
gtgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAg > 2:3620659/1‑93 (MQ=255)
tgtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGc < 1:4110046/93‑1 (MQ=255)
gtTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCt > 1:3582497/1‑93 (MQ=255)
tttAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTg > 1:4097308/1‑93 (MQ=255)
tttAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTg < 1:2751788/93‑1 (MQ=255)
ttAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTgg > 2:3018784/1‑93 (MQ=255)
aaCGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCATCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGaa < 2:1151342/93‑1 (MQ=255)
aaCGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGaa < 1:3158021/93‑1 (MQ=255)
aaCGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGaa < 1:4678671/93‑1 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc < 2:3943988/93‑1 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc < 2:3908659/93‑1 (MQ=255)
gacgCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGc < 2:90131/93‑1 (MQ=255)
gCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCttt < 1:3196380/93‑1 (MQ=255)
gCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCttt < 2:293277/93‑1 (MQ=255)
cAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTg < 2:4033203/93‑1 (MQ=255)
cAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTg < 2:4187246/93‑1 (MQ=255)
cAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTg < 1:4235268/93‑1 (MQ=255)
aCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGc > 2:3873941/1‑93 (MQ=255)
aCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGc > 1:3745096/1‑93 (MQ=255)
aCCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGc > 2:3412287/1‑93 (MQ=255)
ccTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCa > 1:4010787/1‑93 (MQ=255)
ccTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCa < 1:1577305/93‑1 (MQ=255)
cTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCaa > 1:3754890/1‑93 (MQ=255)
cTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCaa > 2:3793533/1‑93 (MQ=255)
ttgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCaaa > 2:2132812/1‑93 (MQ=255)
tgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAc < 2:3227572/93‑1 (MQ=255)
tgattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAc < 2:4648229/93‑1 (MQ=255)
gattgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAAcc < 2:4478995/93‑1 (MQ=255)
ttgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGt > 2:2775561/1‑93 (MQ=255)
ttgaGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGt < 1:3096021/93‑1 (MQ=255)
gagaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGttt < 2:2809784/93‑1 (MQ=255)
agaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTa > 1:2812332/1‑93 (MQ=255)
agaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTa < 1:1983702/93‑1 (MQ=255)
agaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTa < 1:83600/93‑1 (MQ=255)
gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAt > 1:1903703/1‑93 (MQ=255)
gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAt > 2:1243415/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATgg > 1:4555419/1‑93 (MQ=255)
ggCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGgc > 1:2595469/1‑93 (MQ=255)
tGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCt > 2:3759546/1‑93 (MQ=255)
tGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCt > 1:3284492/1‑93 (MQ=255)
aaCAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGa < 2:3581099/93‑1 (MQ=255)
aaCAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGa < 2:4317391/93‑1 (MQ=255)
aaCAGAAGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGa > 2:2642791/1‑93 (MQ=255)
aCAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGTCGCTGAt > 2:1862991/1‑93 (MQ=255)
aCAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGAt < 2:798535/93‑1 (MQ=255)
aGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTc > 1:4351347/1‑93 (MQ=255)
aTGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGt > 1:3936524/1‑93 (MQ=255)
gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgc > 2:1485314/1‑93 (MQ=255)
ccGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgcg > 2:574852/1‑93 (MQ=255)
cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTgcgc > 2:2457871/1‑93 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa < 1:2624197/93‑1 (MQ=255)
gATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCa > 2:1965581/1‑93 (MQ=255)
aTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAt < 1:1446960/93‑1 (MQ=255)
tCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATg > 2:1758618/1‑93 (MQ=255)
tCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATg > 2:3993837/1‑93 (MQ=255)
cACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGt < 1:702927/93‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGtt < 2:2326502/93‑1 (MQ=255)
aCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGAGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCTCTGATTCGTGCGCATGtt < 2:3062488/93‑1 (MQ=255)
ccGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTg > 1:1686473/1‑93 (MQ=255)
ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATg < 1:1022118/93‑1 (MQ=255)
ccAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATg < 2:2855400/93‑1 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg > 1:1197754/1‑93 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg > 2:3510922/1‑93 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg < 2:3339701/93‑1 (MQ=255)
cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATgg < 1:2280539/93‑1 (MQ=255)
gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt < 2:4052102/93‑1 (MQ=255)
gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt < 1:3601942/93‑1 (MQ=255)
gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt < 2:2686623/93‑1 (MQ=255)
gAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGAt < 1:561852/93‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg < 1:1147234/93‑1 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg > 2:4618703/1‑93 (MQ=255)
aaaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATg < 1:925452/93‑1 (MQ=255)
aaTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGa > 1:2009213/1‑93 (MQ=255)
aTGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAc > 1:3370741/1‑93 (MQ=255)
tGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACg < 1:3031206/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGaa < 2:616085/93‑1 (MQ=255)
cTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGaa < 2:2700165/93‑1 (MQ=255)
tCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAag < 1:4343287/93‑1 (MQ=255)
cAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAaga < 1:2971161/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAagag < 2:1622143/93‑1 (MQ=255)
aGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAagag < 1:2100698/93‑1 (MQ=255)
gCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagt < 2:2365709/93‑1 (MQ=255)
gCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagt > 2:4500729/1‑93 (MQ=255)
cGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagta < 1:1526636/93‑1 (MQ=255)
cGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGagta > 2:3137195/1‑93 (MQ=255)
tAACGGCGCTGTGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTc < 2:182049/93‑1 (MQ=255)
tAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTc < 1:3268796/93‑1 (MQ=255)
aCGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag > 1:2242071/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 1:2134378/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 1:2882959/93‑1 (MQ=255)
|
GCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCA > NC_000913/4005130‑4005307
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > NC_000913/4005126‑4005311
|
TCCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTTAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGC < SRR4302535.1282254/94‑1 (MQ=60)
TCCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGC > SRR4302535.1842127/1‑94 (MQ=60)
CCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCT < SRR4302535.2023945/94‑1 (MQ=60)
CCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCT < SRR4302535.1486537/94‑1 (MQ=60)
CCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTG < SRR4302535.264558/94‑1 (MQ=60)
CGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGAT < SRR4302535.3427262/94‑1 (MQ=60)
GTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATG < SRR4302535.4328725/94‑1 (MQ=60)
ACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCG > SRR4302535.2035049/1‑94 (MQ=60)
CGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGC > SRR4302535.3451663/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCA < SRR4302535.955675/94‑1 (MQ=60)
GTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCA < SRR4302535.1101497/94‑1 (MQ=60)
TGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAA > SRR4302535.3246786/1‑94 (MQ=60)
GGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAG > SRR4302535.1828399/1‑94 (MQ=60)
GTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGC < SRR4302535.313304/94‑1 (MQ=60)
TGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCT > SRR4302535.3607347/1‑94 (MQ=60)
TGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCT < SRR4302535.4138183/94‑1 (MQ=60)
TGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCT > SRR4302535.172702/1‑94 (MQ=60)
GTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTG > SRR4302535.4125352/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGG > SRR4302535.3735894/1‑94 (MQ=60)
TTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGG < SRR4302535.2771402/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.3179941/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.2065749/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.4051821/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.70572/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.4710246/94‑1 (MQ=60)
AACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAAC < SRR4302535.1582831/94‑1 (MQ=60)
ACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACG < SRR4302535.2892906/94‑1 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT < SRR4302535.2909037/94‑1 (MQ=60)
GACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCT > SRR4302535.3166445/1‑94 (MQ=60)
GCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTG > SRR4302535.2865902/1‑94 (MQ=60)
GCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTG < SRR4302535.3218499/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGG < SRR4302535.3803368/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGG < SRR4302535.4002619/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGG < SRR4302535.4264256/94‑1 (MQ=60)
CAACCTTGATTGAGATAGCTGAACAGATGCAGAAAACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGAAGATGGGATGCGCAAGCTGGAACGATTTGG < SRR4302535.4712677/94‑1 (MQ=60)
AACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGC > SRR4302535.3771006/1‑94 (MQ=60)
AACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGC > SRR4302535.2637830/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCA > SRR4302535.4038225/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCA > SRR4302535.4288770/1‑94 (MQ=60)
ACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCA > SRR4302535.175407/1‑94 (MQ=60)
CCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAA < SRR4302535.1588688/94‑1 (MQ=60)
CCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAA > SRR4302535.3780865/1‑94 (MQ=60)
GATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCG > SRR4302535.2757269/1‑94 (MQ=60)
TTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTT > SRR4302535.3054843/1‑94 (MQ=60)
TTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTT < SRR4302535.3117583/94‑1 (MQ=60)
GAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTA < SRR4302535.2168666/94‑1 (MQ=60)
GAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTA > SRR4302535.2832318/1‑94 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCCCCGTCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCTCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302535.2286209/94‑1 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302535.84189/94‑1 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT > SRR4302535.3283110/1‑94 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302535.1997984/94‑1 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT > SRR4302535.1917404/1‑94 (MQ=60)
AGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTAT < SRR4302535.4128041/94‑1 (MQ=60)
GATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATG < SRR4302535.1938529/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGG > SRR4302535.4586533/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGC > SRR4302535.2614114/1‑94 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG < SRR4302535.3012485/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG < SRR4302535.3371385/94‑1 (MQ=60)
GGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCG > SRR4302535.4502803/1‑94 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT > SRR4302535.4449633/1‑94 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT < SRR4302535.3471493/94‑1 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT < SRR4302535.1396410/94‑1 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT < SRR4302535.4245309/94‑1 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT > SRR4302535.3307323/1‑94 (MQ=60)
CTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCT > SRR4302535.1960384/1‑94 (MQ=60)
AACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGAC < SRR4302535.745681/94‑1 (MQ=60)
CAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTC > SRR4302535.4381120/1‑94 (MQ=60)
GATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGT > SRR4302535.3963376/1‑94 (MQ=60)
gtgtcgatcttCGCCAGCTAAATGCGGAGCGTGAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGTTGATTCGTG < SRR4302535.2333945/83‑1 (MQ=60)
ATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTG > SRR4302535.113393/1‑94 (MQ=60)
ATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTG < SRR4302535.914933/94‑1 (MQ=60)
CCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGC > SRR4302535.115669/1‑94 (MQ=60)
CCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGC > SRR4302535.3836022/1‑94 (MQ=60)
CCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGC > SRR4302535.1998313/1‑94 (MQ=60)
CGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCA < SRR4302535.3637821/94‑1 (MQ=60)
CGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCA > SRR4302535.4374505/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT > SRR4302535.3191164/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT < SRR4302535.2643005/94‑1 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT > SRR4302535.2504061/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT > SRR4302535.2127935/1‑94 (MQ=60)
GATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAT < SRR4302535.1551072/94‑1 (MQ=60)
ATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATG < SRR4302535.1457308/94‑1 (MQ=60)
TCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGT > SRR4302535.1077078/1‑94 (MQ=60)
CACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTT < SRR4302535.707856/94‑1 (MQ=60)
ACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTG > SRR4302535.3305035/1‑94 (MQ=60)
ACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTG > SRR4302535.1698682/1‑94 (MQ=60)
CGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGAT < SRR4302535.1424850/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGG < SRR4302535.159546/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGG > SRR4302535.1206333/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGG < SRR4302535.1029380/94‑1 (MQ=60)
CCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGG < SRR4302535.1857911/94‑1 (MQ=60)
CAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGC < SRR4302535.520842/94‑1 (MQ=60)
CAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGC < SRR4302535.3777743/94‑1 (MQ=60)
CAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGC < SRR4302535.2296832/94‑1 (MQ=60)
CAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGC > SRR4302535.4663900/1‑94 (MQ=60)
GCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGA < SRR4302535.1118299/94‑1 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG < SRR4302535.3626938/94‑1 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG < SRR4302535.4368415/94‑1 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG < SRR4302535.565780/94‑1 (MQ=60)
GAAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATG > SRR4302535.1511456/1‑94 (MQ=60)
AAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGA < SRR4302535.2758408/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGA < SRR4302535.1155408/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGA < SRR4302535.932008/94‑1 (MQ=60)
AAATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGA > SRR4302535.2023681/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGCC > SRR4302535.794881/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAC > SRR4302535.3394192/1‑94 (MQ=60)
AATGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGAC < SRR4302535.3657669/94‑1 (MQ=60)
TGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGA > SRR4302535.302124/1‑94 (MQ=60)
TGCTCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGA < SRR4302535.3052428/94‑1 (MQ=60)
TCAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGA < SRR4302535.4372991/94‑1 (MQ=60)
CAGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAG < SRR4302535.2992014/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGT < SRR4302535.2115846/94‑1 (MQ=60)
AGCGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGT < SRR4302535.4085551/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAG < SRR4302535.1537636/94‑1 (MQ=60)
CGTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAG > SRR4302535.3382982/1‑94 (MQ=60)
GTTAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGT < SRR4302535.4168843/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCA < SRR4302535.4351153/94‑1 (MQ=60)
TAACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCA < SRR4302535.3291505/94‑1 (MQ=60)
AACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAG > SRR4302535.2197636/1‑94 (MQ=60)
AACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAG > SRR4302535.2258021/1‑94 (MQ=60)
AACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAG > SRR4302535.3458394/1‑94 (MQ=60)
AACGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAG < SRR4302535.3611033/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCA > SRR4302535.2288325/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG < SRR4302535.2149758/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG < SRR4302535.2821637/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAG < SRR4302535.2903364/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > SRR4302535.700632/1‑94 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT < SRR4302535.3989599/94‑1 (MQ=60)
GCTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT < SRR4302535.3916106/94‑1 (MQ=60)
|
TCCCGCCGTACGTGGTGTTTAACGACGCAACCTTGATTGAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAT > NC_000913/4005126‑4005311
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
