Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1873 |
183.1 |
9376148 |
98.2% |
9207377 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,236,786 |
A→G |
Y525C (TAC→TGC) |
yjbH → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,236,786 | 0 | A | G | 100.0%
| 702.0
/ NA
| 219 | Y525C (TAC→TGC) | yjbH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (111/108); total (111/108) |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT > NC_000913/4236696‑4236874
|
gcgcGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCgg > 2:737474/1‑93 (MQ=255)
gcgcGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCgg < 1:2546736/93‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCgg < 1:2061070/93‑1 (MQ=255)
aGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGtt > 2:3081539/1‑93 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa > 2:499520/1‑93 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTa < 2:3561393/93‑1 (MQ=255)
gTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGGCAGGTCTGCGGTGGTTa > 2:3878248/1‑93 (MQ=255)
tATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAt > 1:3891704/1‑93 (MQ=255)
tATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAt < 2:1272681/93‑1 (MQ=255)
tATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAt < 1:2812126/93‑1 (MQ=255)
tgtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtct > 1:2536307/1‑93 (MQ=255)
gtgCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAtctc < 2:257475/93‑1 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaaa < 1:2401997/93‑1 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaaa < 2:1149328/93‑1 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGaaa > 2:1861761/1‑93 (MQ=255)
aGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGGGGTTATCTCGaaa > 2:1876357/1‑93 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc > 1:4211940/1‑93 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc > 1:2469749/1‑93 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc > 1:1580387/1‑93 (MQ=255)
gAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAc > 1:1012830/1‑93 (MQ=255)
aaCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAcc < 2:3017024/93‑1 (MQ=255)
aaCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAcc > 2:4504800/1‑93 (MQ=255)
aCGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCa > 2:3218022/1‑93 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt > 1:3531637/1‑93 (MQ=255)
cGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAt < 2:84503/93‑1 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt > 1:3114323/1‑93 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt < 2:2020017/93‑1 (MQ=255)
aTGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGt < 1:825009/93‑1 (MQ=255)
tGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGtt > 2:4161668/1‑93 (MQ=255)
gTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGttt > 2:2773291/1‑93 (MQ=255)
gTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGttt < 1:985052/93‑1 (MQ=255)
gTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGttt < 2:1548456/93‑1 (MQ=255)
cTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTgg > 2:1476762/1‑93 (MQ=255)
cTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTgg < 1:515328/93‑1 (MQ=255)
cTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTgg < 1:173696/93‑1 (MQ=255)
tATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGc > 2:3144139/1‑93 (MQ=255)
gtgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGt > 2:372666/1‑93 (MQ=255)
tgAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGTCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTg < 1:192744/93‑1 (MQ=255)
aaTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCg > 2:3592356/1‑93 (MQ=255)
aTAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCgg < 1:1602922/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 2:2873868/93‑1 (MQ=255)
tAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAGCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggg < 1:3867419/93‑1 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg > 2:2046572/1‑93 (MQ=255)
aCCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCggggg > 1:4197512/1‑93 (MQ=255)
ccTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGTAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGc > 2:768950/1‑93 (MQ=255)
cTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCa > 2:2182171/1‑93 (MQ=255)
tGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAg > 2:2469494/1‑93 (MQ=255)
gCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGa > 1:4159509/1‑93 (MQ=255)
cAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGaa < 1:3255110/93‑1 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCGTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCTGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg < 1:574940/93‑1 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg > 1:1090717/1‑93 (MQ=255)
aaGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAg > 1:876026/1‑93 (MQ=255)
aGCCAACTTCTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgt < 2:4319579/93‑1 (MQ=255)
aGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgg > 1:217934/1‑92 (MQ=255)
gCCAACTACTTCCAGCATCTGGTCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtg < 2:4025343/93‑1 (MQ=255)
gCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtg > 2:1989520/1‑93 (MQ=255)
ccAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 2:2920895/93‑1 (MQ=255)
ccAACTACTCCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAgtgt < 2:3301731/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt < 1:4333686/93‑1 (MQ=255)
cAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgtt > 2:2796857/1‑93 (MQ=255)
aaCTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttg > 2:2972166/1‑93 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt < 1:3647020/93‑1 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt > 1:2904301/1‑93 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt > 2:2500171/1‑93 (MQ=255)
actactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGtgttgt > 1:2327927/1‑93 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa > 1:4642087/1‑93 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa < 2:1717881/93‑1 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa < 2:2758434/93‑1 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa < 2:2693137/93‑1 (MQ=255)
ctactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTa < 1:2695221/93‑1 (MQ=255)
tactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAt < 1:2434398/93‑1 (MQ=255)
tactTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAt > 2:2287110/1‑93 (MQ=255)
actTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATc < 2:1060869/93‑1 (MQ=255)
tCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGTTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAACCCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGcc < 2:422915/93‑1 (MQ=255)
ccAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGccc < 1:3483969/93‑1 (MQ=255)
gCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCt > 1:241422/1‑93 (MQ=255)
aTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTgg < 2:2808102/93‑1 (MQ=255)
tCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGa > 2:3546748/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGAc < 1:2100448/93‑1 (MQ=255)
tGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCTGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACa < 1:682262/93‑1 (MQ=255)
gggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAg > 2:1081466/1‑93 (MQ=255)
ggCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGc < 2:1767036/93‑1 (MQ=255)
gCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCa < 1:4247442/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg < 1:1718575/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg < 2:66931/93‑1 (MQ=255)
ggCTTCGACGGTCAGGTCTGCCGTGGTTATCGCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTgg < 2:2371291/93‑1 (MQ=255)
cTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGc < 1:3736/93‑1 (MQ=255)
cTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGtt < 1:1299932/93‑1 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt < 2:3755772/93‑1 (MQ=255)
tACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGttt > 1:1305226/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTg > 2:1169659/1‑93 (MQ=255)
aCGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTg > 2:4082690/1‑93 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGTGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:1583471/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc < 2:4489002/93‑1 (MQ=255)
gTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTc > 1:2634587/1‑93 (MQ=255)
tCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCt < 1:1400323/93‑1 (MQ=255)
cAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATAGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTg > 2:3469010/1‑93 (MQ=255)
aGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGGCAGCAACTGGGCGTTTGGTCTgg > 2:2723068/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGa < 2:2637652/93‑1 (MQ=255)
gTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAt > 2:4621737/1‑93 (MQ=255)
|
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT > NC_000913/4236696‑4236874
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAA > NC_000913/4236693‑4236879
|
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTG > SRR4302535.2185598/1‑94 (MQ=60)
TGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGC < SRR4302535.2041779/94‑1 (MQ=60)
GTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCG < SRR4302535.1189983/94‑1 (MQ=60)
TGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGG < SRR4302535.2943956/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGT < SRR4302535.2565062/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGT < SRR4302535.2075923/94‑1 (MQ=60)
CGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGT > SRR4302535.630807/1‑94 (MQ=60)
GAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTT < SRR4302535.2237324/94‑1 (MQ=60)
GTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAT < SRR4302535.178246/94‑1 (MQ=60)
GTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAT > SRR4302535.3918388/1‑94 (MQ=60)
TATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATC < SRR4302535.2832112/94‑1 (MQ=60)
ATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCT > SRR4302535.2554576/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC > SRR4302535.2487555/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC > SRR4302535.1591794/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC > SRR4302535.1020032/1‑94 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC < SRR4302535.2419275/94‑1 (MQ=60)
AGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAAC > SRR4302535.4240767/1‑94 (MQ=60)
GAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACC > SRR4302535.3271195/1‑94 (MQ=60)
AACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCA > SRR4302535.2527094/1‑94 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302535.4262677/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302535.713968/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT < SRR4302535.134174/94‑1 (MQ=60)
ACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCAT > SRR4302535.3556155/1‑94 (MQ=60)
GATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGT > SRR4302535.3136004/1‑94 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT < SRR4302535.4078962/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT > SRR4302535.2432877/1‑94 (MQ=60)
ATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTT < SRR4302535.830792/94‑1 (MQ=60)
TGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTT < SRR4302535.4024010/94‑1 (MQ=60)
GTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTG < SRR4302535.389936/94‑1 (MQ=60)
GTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTG < SRR4302535.992051/94‑1 (MQ=60)
TCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGG < SRR4302535.2152306/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC > SRR4302535.3857822/1‑94 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC < SRR4302535.174895/94‑1 (MQ=60)
CTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGC < SRR4302535.518929/94‑1 (MQ=60)
ATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGG < SRR4302535.2852834/94‑1 (MQ=60)
TGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGTCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGC < SRR4302535.194071/94‑1 (MQ=60)
AATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGG > SRR4302535.2701170/1‑94 (MQ=60)
AATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGG > SRR4302535.4237850/1‑94 (MQ=60)
ATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGG < SRR4302535.1614486/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302535.3688751/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302535.1733926/94‑1 (MQ=60)
TAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAGCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGG < SRR4302535.3894009/94‑1 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG > SRR4302535.3519193/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG > SRR4302535.4226235/1‑94 (MQ=60)
AACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGG > SRR4302535.1313091/1‑94 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA < SRR4302535.4346371/94‑1 (MQ=60)
CCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATGTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCA > SRR4302535.2594713/1‑94 (MQ=60)
CTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCCTGTTTGGCGGTGCGGGGGCAG > SRR4302535.1483020/1‑94 (MQ=60)
TGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGA > SRR4302535.4187975/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG > SRR4302535.1098489/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG > SRR4302535.882231/1‑94 (MQ=60)
CAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAG < SRR4302535.3277725/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCGTCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCTGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGT < SRR4302535.578975/94‑1 (MQ=60)
AAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGG > SRR4302535.219434/1‑94 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT > SRR4302535.532139/1‑94 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302535.1749427/94‑1 (MQ=60)
CCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTT < SRR4302535.2420023/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG < SRR4302535.4363323/94‑1 (MQ=60)
CAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTG < SRR4302535.3588626/94‑1 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT > SRR4302535.683539/1‑94 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT > SRR4302535.2924833/1‑94 (MQ=60)
AACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGT > SRR4302535.2344581/1‑94 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302535.945801/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA > SRR4302535.4673553/1‑94 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302535.3672272/94‑1 (MQ=60)
ACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTAGCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTA < SRR4302535.3053413/94‑1 (MQ=60)
CTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTAT < SRR4302535.2714486/94‑1 (MQ=60)
TACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATC < SRR4302535.2451935/94‑1 (MQ=60)
TACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATC < SRR4302535.1594225/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG > SRR4302535.4211147/1‑94 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302535.2466223/94‑1 (MQ=60)
ACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCG < SRR4302535.4519741/94‑1 (MQ=60)
CTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGC > SRR4302535.2345901/1‑94 (MQ=60)
CCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCG < SRR4302535.3508159/94‑1 (MQ=60)
AGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCT > SRR4302535.243079/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA > SRR4302535.508453/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA > SRR4302535.1388966/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGA > SRR4302535.835218/1‑94 (MQ=60)
ATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGGTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGG > SRR4302535.2107013/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA < SRR4302535.2115595/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACA < SRR4302535.2777082/94‑1 (MQ=60)
TGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCTGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAG < SRR4302535.687038/94‑1 (MQ=60)
GCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAA > SRR4302535.1978100/1‑94 (MQ=60)
GCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAA < SRR4302535.4276532/94‑1 (MQ=60)
CGGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGCGGGTATCTCGAAACAATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCGACTGG > SRR4302535.3989436/1‑94 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302535.4356398/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGG < SRR4302535.1731006/94‑1 (MQ=60)
CTTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCG < SRR4302535.3770/94‑1 (MQ=60)
TTCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGT > SRR4302535.2438518/1‑94 (MQ=60)
TTC‑ACGGTCAGGTCTGCGGTGATTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTT < SRR4302535.2571413/94‑1 (MQ=60)
TCTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTT > SRR4302535.255493/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT > SRR4302535.1043767/1‑94 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT < SRR4302535.1309198/94‑1 (MQ=60)
CTACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTT > SRR4302535.1314544/1‑94 (MQ=60)
TACGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTG > SRR4302535.1636547/1‑94 (MQ=60)
CGGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGT < SRR4302535.3434442/94‑1 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC > SRR4302535.2653468/1‑94 (MQ=60)
GGTCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTC < SRR4302535.1178855/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTG < SRR4302535.1410319/94‑1 (MQ=60)
AGGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGA > SRR4302535.3562062/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGAT < SRR4302535.2180191/94‑1 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302535.2759325/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302535.3750732/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCC > SRR4302535.2149765/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAA > SRR4302535.2673844/1‑94 (MQ=60)
|
ATGTGCGCGAGTATGTGCAGAACGATGTCTATGTGAATAACCTGCAAGCCAACTACTTCCAGCATCTGGGCAACGGCTTCTACGGTCAGGTCTACGGTGGTTATCTCGAAACCATGTTTGGCGGTGCGGGGGCAGAAGTGTTGTATCGCCCGCTGGACAGCAACTGGGCGTTTGGTCTGGATGCCAA > NC_000913/4236693‑4236879
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
