Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,713,746 |
C→T |
P56P (CCG→CCA) |
pdxY ← |
pyridoxal kinase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,713,746 | 0 | C | T | 99.6%
| 882.6
/ ‑5.5
| 263 | P56P (CCG→CCA) | pdxY | pyridoxal kinase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (160/101); total (161/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.88e-01 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCG > NC_000913/1713656‑1713835
|
cgATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGggtgg > 2:4724839/1‑93 (MQ=255)
aTCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCa > 2:1969892/1‑93 (MQ=255)
aTCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCa > 1:3398082/1‑93 (MQ=255)
tCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCAt > 1:7045094/1‑93 (MQ=255)
ccAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCa > 1:2524046/1‑93 (MQ=255)
ccAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCa > 2:9805298/1‑93 (MQ=255)
ccAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCa > 2:4934572/1‑93 (MQ=255)
cAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCAc < 1:4987118/93‑1 (MQ=255)
aGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACg > 1:6680278/1‑93 (MQ=255)
aGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACg > 1:3770483/1‑93 (MQ=255)
aGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACg > 2:3555655/1‑93 (MQ=255)
aTAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCa < 1:6150307/93‑1 (MQ=255)
aTAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCa > 1:5673117/1‑93 (MQ=255)
tAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAg > 1:9787611/1‑93 (MQ=255)
tAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAg > 1:1000430/1‑93 (MQ=255)
gCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGcc < 1:2253811/93‑1 (MQ=255)
ccACTTACTACGGCATCACAGGTGTGTAATTAATCCATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGACATCACGCAGCCa < 2:8925794/93‑1 (MQ=255)
ccACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCa > 1:7786016/1‑93 (MQ=255)
ccACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCa < 1:297541/93‑1 (MQ=255)
aCTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGt > 1:4481545/1‑93 (MQ=255)
aCTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGt > 2:6424699/1‑93 (MQ=255)
cTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTc > 1:1255081/1‑93 (MQ=255)
cTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTc < 2:3409495/93‑1 (MQ=255)
cTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTc > 1:5894380/1‑93 (MQ=255)
ttAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTcc < 2:2768181/93‑1 (MQ=255)
aaTACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCAt > 1:4371663/1‑93 (MQ=255)
aTACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCAtt < 1:2622305/93‑1 (MQ=255)
ggCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGcc < 2:258780/93‑1 (MQ=255)
ggCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGcc < 2:6042368/93‑1 (MQ=255)
ggCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGcc > 2:9409107/1‑93 (MQ=255)
ggCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGcc < 1:8766688/93‑1 (MQ=255)
gCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCg > 1:7298488/1‑93 (MQ=255)
cATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGt > 2:6766480/1‑93 (MQ=255)
aTCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTa > 1:5772621/1‑93 (MQ=255)
aTCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTa > 2:8019223/1‑93 (MQ=255)
aTCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTa > 2:6651195/1‑93 (MQ=255)
tCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTACATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCCGTCCATTTGCCGTAt > 1:1027740/1‑93 (MQ=255)
tCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTAt > 2:9477136/1‑93 (MQ=255)
tCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTAt < 2:501933/93‑1 (MQ=255)
cacaGGTTTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTAtt < 2:602945/93‑1 (MQ=255)
cacaGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTAtt < 1:963779/93‑1 (MQ=255)
acaGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTg > 2:5386776/1‑93 (MQ=255)
caGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTgg > 1:5682238/1‑93 (MQ=255)
caGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTgg < 1:1442994/93‑1 (MQ=255)
aGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTggg > 1:9879094/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTgtgt > 2:5119289/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGgt > 2:7481161/1‑93 (MQ=255)
ggTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGgt < 2:1214907/93‑1 (MQ=255)
tgtgtAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGgtgt < 2:8282355/93‑1 (MQ=255)
tgtgtAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGgtgt < 2:2368144/93‑1 (MQ=255)
tgtAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGa > 1:6948173/1‑93 (MQ=255)
tgtAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGa > 1:8250442/1‑93 (MQ=255)
gtAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGAt > 2:1615356/1‑93 (MQ=255)
tAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGGGTGAtt > 2:7332911/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTa > 1:2030080/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTa > 1:8904701/1‑93 (MQ=255)
aaTTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTa > 1:9507194/1‑93 (MQ=255)
tttATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGa > 2:4632239/1‑93 (MQ=255)
tATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGaaa > 2:6528375/1‑93 (MQ=255)
tATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGaaa > 2:5840279/1‑93 (MQ=255)
cAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTACATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAAtt > 2:6368811/1‑93 (MQ=255)
cAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAAtt > 1:4128306/1‑93 (MQ=255)
aaTGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCCTCACGCAGCCAGTCCCTTTGCCGTACTGGGTGTGATTAGAAAATTg > 2:5206568/1‑93 (MQ=255)
aTGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGTGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGa < 1:8015094/93‑1 (MQ=255)
aTGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGGGTGATTAGAAAATTGa > 2:312396/1‑93 (MQ=255)
tGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTTGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGaa < 1:3338553/93‑1 (MQ=255)
ggcAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGgt > 2:3914006/1‑93 (MQ=255)
gcAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGgtg < 1:4662307/93‑1 (MQ=255)
cAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGgtgt > 1:9117738/1‑93 (MQ=255)
aaTGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGtt > 1:6419366/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCa < 1:3458398/93‑1 (MQ=255)
tGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCa < 2:1532407/93‑1 (MQ=255)
tGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCa < 1:6975962/93‑1 (MQ=255)
tGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCa > 2:4542241/1‑93 (MQ=255)
tGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACACAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCa < 1:8355089/93‑1 (MQ=255)
gCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAg > 2:4122215/1‑93 (MQ=255)
ccTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGc < 1:9418004/93‑1 (MQ=255)
cTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATCAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCg > 2:5504417/1‑93 (MQ=255)
gCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGcc < 1:2700972/93‑1 (MQ=255)
cacaATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCa < 1:4004253/93‑1 (MQ=255)
cacaATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCa < 1:9269235/93‑1 (MQ=255)
aaTTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGAc > 1:955853/1‑93 (MQ=255)
aTTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACg > 1:5379984/1‑93 (MQ=255)
aTTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACg > 2:5564372/1‑93 (MQ=255)
tttCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGt > 1:1337628/1‑93 (MQ=255)
ttCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGtt > 2:6441451/1‑93 (MQ=255)
tCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTc < 2:134300/93‑1 (MQ=255)
tCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTc > 2:5313825/1‑93 (MQ=255)
ggTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTcgc > 2:9075273/1‑93 (MQ=255)
ggTTAAATGGCCGGGTGGCATCACGCAGCCATTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGATGTTCAGCGGCCAGACGTTcgc < 2:8711236/93‑1 (MQ=255)
aaTGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCa < 1:6881195/93‑1 (MQ=255)
aTGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAg < 1:5532279/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAgg < 1:3057564/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAgg > 1:5191696/1‑93 (MQ=255)
tGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAgg < 2:2460895/93‑1 (MQ=255)
tGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAgg < 1:1699095/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAggc < 2:7856246/93‑1 (MQ=255)
ggCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAggc < 1:9402956/93‑1 (MQ=255)
gggTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGgcggcg > 2:1114217/1‑93 (MQ=255)
gggTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGgcggcg > 2:1009548/1‑93 (MQ=255)
|
CGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCG > NC_000913/1713656‑1713835
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGCCGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCATC > NC_000913/1713653‑1713839
|
CGCCGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGT < SRR4302540.639256/94‑1 (MQ=60)
GCCGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTG > SRR4302540.3594507/1‑94 (MQ=60)
GCCGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTG < SRR4302540.8838125/94‑1 (MQ=60)
GATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCA > SRR4302540.9991699/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCA > SRR4302540.5863842/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCA > SRR4302540.6878106/1‑94 (MQ=60)
GATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCA > SRR4302540.3435136/1‑94 (MQ=60)
ATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCAT > SRR4302540.7123434/1‑94 (MQ=60)
CCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCA > SRR4302540.1084576/1‑94 (MQ=60)
CCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCA > SRR4302540.2551296/1‑94 (MQ=60)
CCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCAC < SRR4302540.3047854/94‑1 (MQ=60)
CAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACG < SRR4302540.5041116/94‑1 (MQ=60)
CAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACG > SRR4302540.5780369/1‑94 (MQ=60)
CAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACG > SRR4302540.3811615/1‑94 (MQ=60)
CAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACG > SRR4302540.6754070/1‑94 (MQ=60)
CAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACG > SRR4302540.10152684/1‑94 (MQ=60)
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CATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTA > SRR4302540.5836387/1‑94 (MQ=60)
ATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTACATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCCGTCCATTTGCCGTAT > SRR4302540.1038163/1‑94 (MQ=60)
ATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCGAGTCCATTTGCCGTAT > SRR4302540.5510857/1‑94 (MQ=60)
ATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTAT > SRR4302540.2703012/1‑94 (MQ=60)
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CACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTG < SRR4302540.973736/94‑1 (MQ=60)
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ACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGG > SRR4302540.5744797/1‑94 (MQ=60)
ACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGG < SRR4302540.1903957/94‑1 (MQ=60)
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CAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGG < SRR4302540.1458672/94‑1 (MQ=60)
AGGTGGGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGCCCATTTGCCGTATTGGGG > SRR4302540.257097/1‑94 (MQ=60)
TGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTG < SRR4302540.1104748/94‑1 (MQ=60)
GTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGA > SRR4302540.8346341/1‑94 (MQ=60)
GTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGA > SRR4302540.7025493/1‑94 (MQ=60)
TGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGAT > SRR4302540.6355643/1‑94 (MQ=60)
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TAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTA > SRR4302540.9007800/1‑94 (MQ=60)
TAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTA > SRR4302540.2051993/1‑94 (MQ=60)
AATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAG < SRR4302540.40336/94‑1 (MQ=60)
AATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAG > SRR4302540.3435158/1‑94 (MQ=60)
AATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAG < SRR4302540.4685924/94‑1 (MQ=60)
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TTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAA < SRR4302540.7453589/94‑1 (MQ=60)
TTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAA < SRR4302540.6648889/94‑1 (MQ=60)
TTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAA > SRR4302540.5216919/1‑94 (MQ=60)
TTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAA > SRR4302540.5216918/1‑94 (MQ=60)
ATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAAT > SRR4302540.10094583/1‑94 (MQ=60)
TCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATT > SRR4302540.4172926/1‑94 (MQ=60)
CAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTG < SRR4302540.5665633/94‑1 (MQ=60)
CAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTG < SRR4302540.2441516/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGTGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAA < SRR4302540.8108320/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAA < SRR4302540.9415874/94‑1 (MQ=60)
ATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAA > SRR4302540.6661513/1‑94 (MQ=60)
ATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAA < SRR4302540.9703303/94‑1 (MQ=60)
TGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTTGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAAC < SRR4302540.3375207/94‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACG < SRR4302540.9851999/94‑1 (MQ=60)
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CAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTT > SRR4302540.6490814/1‑94 (MQ=60)
CAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTT < SRR4302540.9528882/94‑1 (MQ=60)
AATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTC > SRR4302540.1984305/1‑94 (MQ=60)
ATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCA < SRR4302540.136875/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAG < SRR4302540.7053478/94‑1 (MQ=60)
TGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAG < SRR4302540.7103542/94‑1 (MQ=60)
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CTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGG > SRR4302540.3031245/1‑94 (MQ=60)
CTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGG > SRR4302540.2895922/1‑94 (MQ=60)
TTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGC < SRR4302540.9920756/94‑1 (MQ=60)
TGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCC > SRR4302540.218693/1‑94 (MQ=60)
GCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCA < SRR4302540.2730118/94‑1 (MQ=60)
CACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAG < SRR4302540.9380083/94‑1 (MQ=60)
CACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAG < SRR4302540.4047358/94‑1 (MQ=60)
CACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAG > SRR4302540.8961494/1‑94 (MQ=60)
CAATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGAC > SRR4302540.965761/1‑94 (MQ=60)
AATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACG > SRR4302540.5439152/1‑94 (MQ=60)
AATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACG < SRR4302540.4084267/94‑1 (MQ=60)
AATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACG < SRR4302540.4334702/94‑1 (MQ=60)
ATTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGT > SRR4302540.1351630/1‑94 (MQ=60)
TTTCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTT < SRR4302540.7177269/94‑1 (MQ=60)
TCGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCG > SRR4302540.8456330/1‑94 (MQ=60)
CGGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGC > SRR4302540.3603742/1‑94 (MQ=60)
GGTTAAATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCG < SRR4302540.490739/94‑1 (MQ=60)
AATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAG < SRR4302540.9395365/94‑1 (MQ=60)
AATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAG < SRR4302540.6957475/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGG > SRR4302540.6048697/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGG < SRR4302540.5593205/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGG > SRR4302540.5248228/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGC < SRR4302540.3091110/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGC > SRR4302540.8883603/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGC < SRR4302540.1717497/94‑1 (MQ=60)
GGCTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCG < SRR4302540.9514805/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGC < SRR4302540.3592332/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGC > SRR4302540.7824426/1‑94 (MQ=60)
GGTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCA > SRR4302540.5443097/1‑94 (MQ=60)
GTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCAT < SRR4302540.10132112/94‑1 (MQ=60)
GTGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCAT > SRR4302540.3647844/1‑94 (MQ=60)
TGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCATC > SRR4302540.3466222/1‑94 (MQ=60)
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CGCCGATCCCAGATAGCCACTTAATACGGCATCACAGGTGTGTAATTTATCAATGGCGGCAATGCCTTGCACAATTTCGGTTAAATGGCTGGGCGGCATCACGCAGCCAGTCCATTTGCCGTATTGGGTGTGATTAGAAAATTGAACGGTGTTCAGCGGCCAGACGTTCGCGCCCAGGCGGCGCATC > NC_000913/1713653‑1713839
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
