Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,071,598 |
A→G |
R680G (AGG→GGG) |
b2000 → |
outer membrane fluffing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,071,598 | 0 | A | G | 100.0%
| 546.1
/ NA
| 170 | R680G (AGG→GGG) | b2000 | outer membrane fluffing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (77/93); total (77/93) |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
tCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACggg > 1:7842509/1‑93 (MQ=255)
cGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGc < 2:1364401/93‑1 (MQ=255)
ggggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCt > 1:8613396/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 1:7166740/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGc > 1:5455684/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGcg > 2:7200036/1‑92 (MQ=255)
ggCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGc < 1:8854539/93‑1 (MQ=255)
ggCGACCAGCGGTAAGGGGATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGc > 1:7880001/1‑93 (MQ=255)
gCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGcc < 1:2917424/93‑1 (MQ=255)
gCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGcc < 2:170466/93‑1 (MQ=255)
gACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCgg > 1:4015717/1‑93 (MQ=255)
aCCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGt < 2:4221389/93‑1 (MQ=255)
aGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGcc < 2:10018274/93‑1 (MQ=255)
gCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCt > 1:1205217/1‑93 (MQ=255)
gTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa < 2:9402334/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa < 1:9885551/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa < 1:9051482/93‑1 (MQ=255)
gTAAGGGCATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa > 2:9626194/1‑93 (MQ=255)
tAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTaa < 2:2791071/93‑1 (MQ=255)
tAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTaa > 1:6414323/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAac < 1:4644245/93‑1 (MQ=255)
aGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAact > 1:4790873/1‑93 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAacta < 1:10040927/93‑1 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAacta < 1:4365488/93‑1 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGGGCCTTTAacta > 2:2333155/1‑93 (MQ=255)
gTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAactact > 2:4573558/1‑93 (MQ=255)
tATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGGGCCACCGCGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTc < 2:3252834/93‑1 (MQ=255)
tttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc < 2:7674341/92‑1 (MQ=255)
aTTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc > 2:1748704/1‑93 (MQ=255)
aTTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc < 2:5707547/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc > 1:6869743/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc < 2:7055171/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc < 2:8890385/93‑1 (MQ=255)
ggtggtGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCaa > 1:7501357/1‑93 (MQ=255)
ggtggtGGAAGCCATTAACAGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGACCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCaa < 2:823734/93‑1 (MQ=255)
gtggtgGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAc > 1:5274105/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAc < 2:6613422/93‑1 (MQ=255)
tggtggAAGCCATTAACGGGGCCACCACGGAGGAAGGGGACTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAcc > 2:9846998/1‑93 (MQ=255)
ggtggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCg < 1:4259791/93‑1 (MQ=255)
tggAAGCCATTAGCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCggg < 2:9040609/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGTACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAc > 2:4478200/1‑93 (MQ=255)
gAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAc < 1:7797206/93‑1 (MQ=255)
aaGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACa < 2:3045547/93‑1 (MQ=255)
aGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAg > 1:8435163/1‑93 (MQ=255)
aGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGACGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAg > 2:6054168/1‑93 (MQ=255)
aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat < 1:10024571/93‑1 (MQ=255)
aTTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgat < 1:4868788/93‑1 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 2:3386398/1‑93 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 1:7204032/1‑93 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 1:8070023/1‑93 (MQ=255)
tAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatga < 2:2233102/93‑1 (MQ=255)
tAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatga < 1:9650306/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgag > 1:6121020/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga > 1:2578140/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga < 1:9493609/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCGCGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 2:7900009/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 2:1147716/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 1:5925790/93‑1 (MQ=255)
gTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCt > 2:5140750/1‑93 (MQ=255)
tGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTg < 2:6948393/93‑1 (MQ=255)
tGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTg < 1:3879049/93‑1 (MQ=255)
ccaccaCGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGCGCTggg > 1:9754614/1‑92 (MQ=255)
caccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTa < 1:4398515/93‑1 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc < 2:6483032/93‑1 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc > 2:5787706/1‑93 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc < 2:5001808/93‑1 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg > 2:6524740/1‑93 (MQ=255)
gaggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgcgc > 1:9690124/1‑93 (MQ=255)
ggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAg < 2:7179929/93‑1 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt < 2:9213714/93‑1 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt > 2:9471285/1‑93 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt < 2:500623/93‑1 (MQ=255)
aaGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTg > 1:207401/1‑93 (MQ=255)
aaGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTg > 1:6004523/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGa < 2:8211209/93‑1 (MQ=255)
aGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGa > 2:1048153/1‑93 (MQ=255)
gggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaa < 1:3033042/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 1:3272804/93‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 1:9557311/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAt > 2:1646284/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGTAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt > 1:6862939/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt > 1:6701488/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt > 2:3411072/1‑93 (MQ=255)
ttggTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt < 2:2443116/90‑1 (MQ=255)
gTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAt > 2:1896504/1‑93 (MQ=255)
tCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTtctc > 1:401754/1‑93 (MQ=255)
ccAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCg > 2:5568097/1‑93 (MQ=255)
ccAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCg < 2:5692459/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt > 2:4268787/1‑93 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 1:8729020/93‑1 (MQ=255)
ggggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGc < 2:8565659/93‑1 (MQ=255)
gggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCa < 1:1952798/93‑1 (MQ=255)
gggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCa < 1:5809131/93‑1 (MQ=255)
ggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAg < 1:211790/93‑1 (MQ=255)
ggAACGGACTACAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAg < 2:5345277/93‑1 (MQ=255)
gAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACCGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGCGAAAATGCTTATCGTGCAGa > 2:9016073/1‑93 (MQ=255)
gAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGa < 1:877347/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa < 1:339573/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa < 1:8830473/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa < 1:8488858/93‑1 (MQ=255)
|
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTCC > NC_000913/2071505‑2071691
|
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACG > SRR4302540.5220294/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG < SRR4302540.6362572/94‑1 (MQ=60)
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG > SRR4302540.5811064/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG < SRR4302540.2189285/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGG > SRR4302540.7934149/1‑94 (MQ=60)
CGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCT > SRR4302540.8713479/1‑94 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG > SRR4302540.7246642/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAGCGGGCTGC > SRR4302540.5515738/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGC < SRR4302540.6168846/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGC > SRR4302540.5515739/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCA < SRR4302540.7765029/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG < SRR4302540.6692379/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGG > SRR4302540.9814598/1‑94 (MQ=60)
TGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGC > SRR4302540.7972027/1‑94 (MQ=60)
TGGCGACCAGCGGTAAGGGGATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGC > SRR4302540.7972025/1‑94 (MQ=60)
GGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCC < SRR4302540.8956984/94‑1 (MQ=60)
GGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCC < SRR4302540.8956983/94‑1 (MQ=60)
GCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCG < SRR4302540.2949354/94‑1 (MQ=60)
CGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGG > SRR4302540.4058972/1‑94 (MQ=60)
CCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGC > SRR4302540.7484029/1‑94 (MQ=60)
AGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCT > SRR4302540.1217591/1‑94 (MQ=60)
CGGTAAGTGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTT < SRR4302540.4422212/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAA < SRR4302540.10000979/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAA > SRR4302540.6485700/1‑94 (MQ=60)
GTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAA < SRR4302540.1702613/94‑1 (MQ=60)
GTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAA < SRR4302540.9160141/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAAC < SRR4302540.7051309/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAAC < SRR4302540.4248258/94‑1 (MQ=60)
TAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAAC > SRR4302540.6892400/1‑94 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTTGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT < SRR4302540.2083491/94‑1 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT > SRR4302540.3931718/1‑94 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT > SRR4302540.4842112/1‑94 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT < SRR4302540.4693957/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTAC < SRR4302540.10157676/94‑1 (MQ=60)
GGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTAC < SRR4302540.4412933/94‑1 (MQ=60)
ATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCC > SRR4302540.6945897/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCC > SRR4302540.8416955/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAA > SRR4302540.7585179/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAC > SRR4302540.5331686/1‑94 (MQ=60)
GGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGG < SRR4302540.4306129/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACA < SRR4302540.7888348/94‑1 (MQ=60)
AAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAG > SRR4302540.8533094/1‑94 (MQ=60)
AAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAG > SRR4302540.8533093/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG < SRR4302540.10141219/94‑1 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG < SRR4302540.4921012/94‑1 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG > SRR4302540.8163658/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG > SRR4302540.7284345/1‑94 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG < SRR4302540.9763940/94‑1 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG > SRR4302540.6189195/1‑94 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG < SRR4302540.998466/94‑1 (MQ=60)
AACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGA < SRR4302540.9675873/94‑1 (MQ=60)
AACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGA > SRR4302540.2605936/1‑94 (MQ=60)
ACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAG < SRR4302540.9606132/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGGACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT > SRR4302540.2859216/1‑94 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT < SRR4302540.794129/94‑1 (MQ=60)
GGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCT < SRR4302540.5991265/94‑1 (MQ=60)
TGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGG < SRR4302540.3921203/94‑1 (MQ=60)
TGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGG > SRR4302540.8728332/1‑94 (MQ=60)
GCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGCGCTGGG > SRR4302540.9869055/1‑94 (MQ=60)
CCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTA > SRR4302540.7248164/1‑94 (MQ=60)
CACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTAT < SRR4302540.4446222/94‑1 (MQ=60)
GGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGC > SRR4302540.9804098/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG < SRR4302540.5955318/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTG > SRR4302540.6071090/1‑94 (MQ=60)
GAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTG > SRR4302540.209435/1‑94 (MQ=60)
AAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGA > SRR4302540.9419089/1‑94 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAA < SRR4302540.882854/94‑1 (MQ=60)
GGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAA < SRR4302540.3066336/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCTGGACAGGGAGGAGGGCTGGTAGCTGCGCAGTGAGAAT > SRR4302540.718224/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302540.1074923/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302540.3308527/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302540.9670324/94‑1 (MQ=60)
GCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATG > SRR4302540.4890748/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGTAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT > SRR4302540.6939000/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT > SRR4302540.2171328/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT > SRR4302540.6775462/1‑94 (MQ=60)
TGTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTT < SRR4302540.9660624/94‑1 (MQ=60)
TTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTA > SRR4302540.2998884/1‑94 (MQ=60)
TTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTA < SRR4302540.6474184/94‑1 (MQ=60)
GTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTCTC > SRR4302540.405944/1‑94 (MQ=60)
GTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATC > SRR4302540.405943/1‑94 (MQ=60)
GTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATC > SRR4302540.4782272/1‑94 (MQ=60)
CCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGT > SRR4302540.5588116/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG < SRR4302540.3108696/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG < SRR4302540.8830386/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCACAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG < SRR4302540.10114621/94‑1 (MQ=60)
GGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCA > SRR4302540.3634312/1‑94 (MQ=60)
GGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAG < SRR4302540.1974039/94‑1 (MQ=60)
GGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAG < SRR4302540.5873335/94‑1 (MQ=60)
GGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA < SRR4302540.213868/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA < SRR4302540.886661/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302540.8932599/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302540.8932600/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302540.8587491/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302540.343002/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302540.4475369/94‑1 (MQ=60)
CGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTC < SRR4302540.1144380/94‑1 (MQ=60)
GGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGgtc > SRR4302540.4426649/1‑91 (MQ=60)
GGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGGGCAGAAGTCC > SRR4302540.3370861/1‑94 (MQ=60)
|
GCGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTCC > NC_000913/2071505‑2071691
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
