Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,071,598 |
A→G |
R680G (AGG→GGG) |
b2000 → |
outer membrane fluffing protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,071,598 | 0 | A | G | 100.0%
| 600.0
/ NA
| 188 | R680G (AGG→GGG) | b2000 | outer membrane fluffing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (91/97); total (91/97) |
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
tCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACggg > 1:1086444/1‑93 (MQ=255)
cGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGc > 2:5339762/1‑93 (MQ=255)
ggggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCt < 2:2802908/93‑1 (MQ=255)
ggggCTGGCGACCAGAGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCt < 1:5752387/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTTAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg < 2:4966788/93‑1 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 1:552083/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 2:5911108/1‑93 (MQ=255)
gggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTg > 1:3088676/1‑93 (MQ=255)
ggCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGc > 2:3015349/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCa > 2:771965/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAg > 1:3523942/1‑93 (MQ=255)
tGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAgg > 1:1137357/1‑93 (MQ=255)
tGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAgg < 2:211673/93‑1 (MQ=255)
ggCGACCAGCGTTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGc < 1:3330827/93‑1 (MQ=255)
ggCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGc < 1:5487338/93‑1 (MQ=255)
gCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGcc > 2:405683/1‑93 (MQ=255)
cGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCg < 2:1718303/93‑1 (MQ=255)
gACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCgg < 1:2886036/93‑1 (MQ=255)
gACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCgg < 1:4784274/93‑1 (MQ=255)
aCCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCggg > 1:4608189/1‑92 (MQ=255)
ggTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCttt > 2:2476637/1‑93 (MQ=255)
gTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTa > 1:2068979/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCCGGCCGGTGCCTTTAac > 2:737160/1‑93 (MQ=255)
aaGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAac < 2:810617/93‑1 (MQ=255)
aGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAact > 1:40245/1‑93 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAacta > 2:5395169/1‑93 (MQ=255)
gggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAacta > 1:2203698/1‑93 (MQ=255)
ggTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAactac < 1:69819/93‑1 (MQ=255)
gTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAactact < 1:732201/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc < 1:3486404/93‑1 (MQ=255)
aTTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTcc < 2:1324724/93‑1 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc > 1:854913/1‑93 (MQ=255)
ttCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTccc < 2:3063782/93‑1 (MQ=255)
tCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCt < 2:1866785/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTc < 2:865188/93‑1 (MQ=255)
cAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTc > 1:2960349/1‑93 (MQ=255)
aGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCa > 2:5866601/1‑93 (MQ=255)
gtggtgGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGCCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAAc < 2:4540788/93‑1 (MQ=255)
tgtggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCg > 1:1642973/2‑93 (MQ=255)
gtggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCgg > 1:1752188/1‑93 (MQ=255)
ggAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGa < 1:2580676/93‑1 (MQ=255)
gAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAc > 1:1488717/1‑93 (MQ=255)
aGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAg < 1:5607856/93‑1 (MQ=255)
gCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGt < 1:1289045/93‑1 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 1:5650472/1‑93 (MQ=255)
ttAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatg > 2:6008862/1‑93 (MQ=255)
tAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGtgatga < 1:4498938/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgag < 2:5218148/93‑1 (MQ=255)
aaCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgag > 1:1847863/1‑93 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTCCTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga < 2:3976199/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga < 2:4283178/93‑1 (MQ=255)
aCGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATgaga > 1:3212388/1‑93 (MQ=255)
cGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGagag < 2:5081999/93‑1 (MQ=255)
ggTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGc < 2:1903082/93‑1 (MQ=255)
gTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCt > 2:3230107/1‑93 (MQ=255)
gCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTgg > 2:4893865/1‑93 (MQ=255)
caccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTa < 1:27571/93‑1 (MQ=255)
caccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTa > 1:4424905/1‑93 (MQ=255)
ccacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATc < 1:5824648/93‑1 (MQ=255)
cacGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCt > 1:4338177/1‑93 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg > 1:6107542/1‑93 (MQ=255)
acGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTg < 2:220251/93‑1 (MQ=255)
cGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgc < 1:2422680/93‑1 (MQ=255)
cGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgc < 1:5189552/93‑1 (MQ=255)
gaggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTgcgc > 2:6270201/1‑93 (MQ=255)
aggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCa > 1:920294/1‑93 (MQ=255)
ggaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAg < 2:230170/93‑1 (MQ=255)
gaAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGt < 2:1099170/93‑1 (MQ=255)
gaGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTGCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTg < 1:5007530/92‑1 (MQ=255)
aaGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTg > 2:2458422/1‑93 (MQ=255)
aGGGGCCTTTGTCCAGGGGGACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTCACTACTCCCTCAACCGGGGCAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCTGTGa > 2:1213917/1‑93 (MQ=255)
ggggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaa > 2:5684298/1‑93 (MQ=255)
ggggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAATGaa < 1:4707972/93‑1 (MQ=255)
gtggcTTGGTCGAGGGTAACGTGCTGCAGTCCGGTGCCTTTAACTACGCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaa < 1:2531057/89‑1 (MQ=255)
ggCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGaaaa < 2:4528113/93‑1 (MQ=255)
gCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAt > 2:5155575/1‑93 (MQ=255)
gCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAt < 2:966489/93‑1 (MQ=255)
ccTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATg < 2:1801373/93‑1 (MQ=255)
ccTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATg > 2:1159443/1‑93 (MQ=255)
ccTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATg < 1:5003976/93‑1 (MQ=255)
cTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGc > 1:2396083/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt > 2:2039579/1‑93 (MQ=255)
tttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCt > 1:447081/1‑93 (MQ=255)
ttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTGCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCtt < 2:1036926/93‑1 (MQ=255)
ttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCtt < 2:1968389/93‑1 (MQ=255)
ttGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCtt < 2:5481504/93‑1 (MQ=255)
tGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTa < 1:5368358/93‑1 (MQ=255)
tCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATc < 1:3802391/93‑1 (MQ=255)
ccAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCg < 2:878218/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 1:1622557/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 2:19944/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 2:2657171/93‑1 (MQ=255)
cAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGt < 2:3455475/93‑1 (MQ=255)
aGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTg > 1:4936071/1‑93 (MQ=255)
aGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACGACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTg < 2:4244884/93‑1 (MQ=255)
gggAACGGTCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCa < 2:604449/93‑1 (MQ=255)
gggAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCa > 1:5735798/1‑93 (MQ=255)
gAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGa < 1:229535/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa < 1:1410390/93‑1 (MQ=255)
aaCGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCCGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGaa > 2:3366134/1‑93 (MQ=255)
|
TCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > NC_000913/2071508‑2071687
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTCC > NC_000913/2071506‑2071691
|
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG > SRR4302533.1310888/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG > SRR4302533.5528184/1‑94 (MQ=60)
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGG < SRR4302533.4538912/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGG < SRR4302533.5107276/94‑1 (MQ=60)
GTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGG > SRR4302533.1092847/1‑94 (MQ=60)
CGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCT > SRR4302533.2755540/1‑94 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG > SRR4302533.555356/1‑94 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG > SRR4302533.3107662/1‑94 (MQ=60)
GGGGCTGGCGACCAGAGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTG < SRR4302533.5787094/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG > SRR4302533.768587/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAG > SRR4302533.3545660/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGG > SRR4302533.1144121/1‑94 (MQ=60)
TGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGGACGGGCTGCAGGC > SRR4302533.4349136/1‑94 (MQ=60)
TGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGC > SRR4302533.2306501/1‑94 (MQ=60)
GGCGACCAGCGTTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCC < SRR4302533.3351417/94‑1 (MQ=60)
GGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCC < SRR4302533.5520419/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT < SRR4302533.1627818/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT < SRR4302533.4813252/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT < SRR4302533.2903785/94‑1 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT > SRR4302533.637143/1‑94 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT > SRR4302533.2488741/1‑94 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGG > SRR4302533.4636097/1‑94 (MQ=60)
GACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTACCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGT > SRR4302533.4459906/1‑94 (MQ=60)
GCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTT > SRR4302533.555161/1‑94 (MQ=60)
GGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTA > SRR4302533.2081722/1‑94 (MQ=60)
TAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAAC > SRR4302533.1440737/1‑94 (MQ=60)
AAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACT > SRR4302533.40518/1‑94 (MQ=60)
AGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTA > SRR4302533.2217281/1‑94 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACT < SRR4302533.70274/94‑1 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACT < SRR4302533.1171737/94‑1 (MQ=60)
GGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACT > SRR4302533.5487163/1‑94 (MQ=60)
GTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTC < SRR4302533.736510/94‑1 (MQ=60)
GTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTC > SRR4302533.1668479/1‑94 (MQ=60)
TATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCC > SRR4302533.5037352/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCC > SRR4302533.859922/1‑94 (MQ=60)
ATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCC < SRR4302533.3507904/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTC < SRR4302533.4376884/94‑1 (MQ=60)
TCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTC > SRR4302533.2978446/1‑94 (MQ=60)
AGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAA > SRR4302533.711904/1‑94 (MQ=60)
GTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACC < SRR4302533.1391907/94‑1 (MQ=60)
TTGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCG > SRR4302533.1652921/1‑94 (MQ=60)
TGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCG < SRR4302533.562019/94‑1 (MQ=60)
GGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGG > SRR4302533.1762860/1‑94 (MQ=60)
GGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGG > SRR4302533.5990088/1‑94 (MQ=60)
GGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGG > SRR4302533.3642570/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGG < SRR4302533.5306563/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAC < SRR4302533.2596555/94‑1 (MQ=60)
GGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGAC > SRR4302533.1497697/1‑94 (MQ=60)
GAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACA < SRR4302533.864784/94‑1 (MQ=60)
AGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGT > SRR4302533.5803715/1‑94 (MQ=60)
AGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGT < SRR4302533.5641741/94‑1 (MQ=60)
GCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTG < SRR4302533.1296803/94‑1 (MQ=60)
CATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAT > SRR4302533.3524072/1‑94 (MQ=60)
ATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATG > SRR4302533.5684628/1‑94 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG < SRR4302533.4526183/94‑1 (MQ=60)
TAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAG > SRR4302533.1859133/1‑94 (MQ=60)
AACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGA > SRR4302533.3232174/1‑94 (MQ=60)
CGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGC < SRR4302533.2417117/94‑1 (MQ=60)
GTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTG > SRR4302533.2403503/1‑94 (MQ=60)
CCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTA > SRR4302533.4451653/1‑94 (MQ=60)
CACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTAT < SRR4302533.27758/94‑1 (MQ=60)
CACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTAT < SRR4302533.3111991/94‑1 (MQ=60)
CCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCT < SRR4302533.5859833/94‑1 (MQ=60)
CCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCT > SRR4302533.4364324/1‑94 (MQ=60)
CCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCT < SRR4302533.470310/94‑1 (MQ=60)
CACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTG > SRR4302533.3301722/1‑94 (MQ=60)
CACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTG > SRR4302533.4982375/1‑94 (MQ=60)
CACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTG > SRR4302533.6144417/1‑94 (MQ=60)
CGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCG < SRR4302533.2437635/94‑1 (MQ=60)
CGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCG < SRR4302533.5220866/94‑1 (MQ=60)
GGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGC > SRR4302533.5666996/1‑94 (MQ=60)
GAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCA > SRR4302533.925697/1‑94 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG < SRR4302533.2791708/94‑1 (MQ=60)
AGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAG > SRR4302533.4558283/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGT > SRR4302533.3017252/1‑94 (MQ=60)
GGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGACTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGT < SRR4302533.3445205/94‑1 (MQ=60)
GAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTG < SRR4302533.2958708/94‑1 (MQ=60)
GAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTGCTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGA < SRR4302533.5037872/94‑1 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAATGAAA < SRR4302533.4736507/94‑1 (MQ=60)
GGGGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGAGGAGAGCTGGGATCTGCGCAGgcaaa > SRR4302533.4852889/1‑89 (MQ=60)
GGCCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAAT < SRR4302533.5745683/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGC > SRR4302533.2410874/1‑94 (MQ=60)
CCTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGC < SRR4302533.5034303/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT > SRR4302533.449755/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCT > SRR4302533.1870312/1‑94 (MQ=60)
TTTGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTT < SRR4302533.1846364/94‑1 (MQ=60)
TGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAT > SRR4302533.4810035/1‑94 (MQ=60)
TGTCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTAT < SRR4302533.5400607/94‑1 (MQ=60)
TCCAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCG < SRR4302533.3825659/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG < SRR4302533.1632388/94‑1 (MQ=60)
CAGGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTG > SRR4302533.4965958/1‑94 (MQ=60)
GGGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCA > SRR4302533.5770420/1‑94 (MQ=60)
GGGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAG < SRR4302533.4853915/94‑1 (MQ=60)
GGAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGA > SRR4302533.1650537/1‑94 (MQ=60)
GAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA < SRR4302533.2117090/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA < SRR4302533.230958/94‑1 (MQ=60)
GAACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAA > SRR4302533.400978/1‑94 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302533.5177305/94‑1 (MQ=60)
AACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAG < SRR4302533.1418918/94‑1 (MQ=60)
ACGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTGCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGT < SRR4302533.6222066/94‑1 (MQ=60)
CGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTC > SRR4302533.2278146/1‑94 (MQ=60)
CGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTC < SRR4302533.1499054/94‑1 (MQ=60)
CGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTC > SRR4302533.1482746/1‑94 (MQ=60)
CGGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTC > SRR4302533.4699136/1‑94 (MQ=60)
GGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTCC > SRR4302533.691806/1‑94 (MQ=60)
|
CGTCGGGGCTGGCGACCAGCGGTAAGGGTATTCAGGTGGTGGAAGCCATTAACGGTGCCACCACGGAGGAAGGGGCCTTTGTCCAGGGGAACAGGCTGCAGGCCGGTGCCTTTAACTACTCCCTCAACCGGGACAGTGATGAGAGCTGGTATCTGCGCAGTGAAAATGCTTATCGTGCAGAAGTCC > NC_000913/2071506‑2071691
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
