Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,825,077 |
T→C |
C221C (TGT→TGC) |
srlE → |
PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,825,077 | 0 | T | C | 100.0%
| 750.1
/ NA
| 230 | C221C (TGT→TGC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (105/125); total (105/125) |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
TATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG > NC_000913/2824987‑2825166
|
tATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGGCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctc > 1:18903/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcct > 1:10043680/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcct > 1:3851885/1‑93 (MQ=255)
tGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcct > 2:2549530/1‑93 (MQ=255)
gCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctccttc < 2:6104237/93‑1 (MQ=255)
gCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcctta > 1:2278554/1‑92 (MQ=255)
ttCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTTTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTccc < 2:4214727/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCGATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCa < 2:3133738/93‑1 (MQ=255)
tCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCa > 2:8333797/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCa < 2:7884298/93‑1 (MQ=255)
tGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACt < 1:3603871/93‑1 (MQ=255)
cTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTGCCACTGCtt > 1:5640639/1‑93 (MQ=255)
cTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCtt < 1:4408398/93‑1 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt > 2:5309047/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt > 2:2242165/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt > 2:9616197/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt > 2:80476/1‑93 (MQ=255)
tGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTc > 2:3779232/1‑93 (MQ=255)
ggTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCa > 1:881001/1‑93 (MQ=255)
gTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAc < 1:4780566/93‑1 (MQ=255)
tGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAcc < 1:3948784/93‑1 (MQ=255)
tGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAcc < 1:9742256/93‑1 (MQ=255)
gACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCt < 1:6267486/93‑1 (MQ=255)
aCTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCtt < 1:9904994/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttc < 1:4904615/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCCTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcc > 1:7952176/1‑92 (MQ=255)
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:38763/93‑1 (MQ=255)
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 2:8667670/93‑1 (MQ=255)
tGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCgg < 2:9441265/93‑1 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc > 1:3162806/1‑93 (MQ=255)
cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa < 2:1981661/93‑1 (MQ=255)
cACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCa < 2:2219968/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTTCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg > 2:7208472/1‑93 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg < 2:3680024/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 1:4094408/93‑1 (MQ=255)
ttGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAg > 2:5032753/1‑93 (MQ=255)
tGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGt < 2:2767719/93‑1 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCGAGGCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAGCTTTCCTCGGCCCAGGTGCAGtt > 2:7328210/1‑93 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt > 1:5745207/1‑93 (MQ=255)
ctgcGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 2:6340080/90‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 2:6857287/93‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 2:3880973/93‑1 (MQ=255)
tCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 2:3402868/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGGCATCCGCTCGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 1:3343533/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGc > 1:7457519/1‑93 (MQ=255)
cTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGGGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcc > 1:1909899/1‑92 (MQ=255)
tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 1:8287189/93‑1 (MQ=255)
tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac > 1:8491222/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca > 2:8110275/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:8873975/93‑1 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:1044224/93‑1 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa > 1:5802307/1‑93 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa < 1:6992561/93‑1 (MQ=255)
ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 2:1249493/93‑1 (MQ=255)
ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 2:682570/93‑1 (MQ=255)
ccATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAt < 1:8072515/93‑1 (MQ=255)
cATCCGCTTGGTCTGGTCATGATGGCGCTCAACTGCTCCTTCCCAGTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:5398641/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:9126232/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:846418/93‑1 (MQ=255)
aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg > 1:7229598/1‑93 (MQ=255)
aTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCg > 1:641364/1‑93 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg > 2:1698481/1‑93 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg < 2:1342368/93‑1 (MQ=255)
ccACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGc > 1:9302605/1‑93 (MQ=255)
ccACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGc > 1:5560916/1‑93 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg > 1:9260537/1‑93 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 1:202040/93‑1 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg < 2:7511828/93‑1 (MQ=255)
aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt > 2:4727486/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt < 1:1382616/93‑1 (MQ=255)
aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt > 1:1849498/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGt > 2:1982910/1‑93 (MQ=255)
gTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattga < 2:3838880/93‑1 (MQ=255)
tCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgat < 1:8699013/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgatt < 1:773389/93‑1 (MQ=255)
tgTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGCTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTgg < 1:9764208/92‑1 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg < 1:5013515/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc < 2:9898596/93‑1 (MQ=255)
tGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGc > 1:845177/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:6021978/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 1:2387810/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa > 2:8993952/1‑93 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:4481216/93‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAg > 2:2916787/1‑93 (MQ=255)
ggCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAt < 1:664695/93‑1 (MQ=255)
ggcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTg < 2:1204661/92‑1 (MQ=255)
cgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTg > 2:2958764/1‑93 (MQ=255)
cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt > 1:4056416/1‑93 (MQ=255)
cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 1:8221894/93‑1 (MQ=255)
cATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtct > 1:2891131/1‑93 (MQ=255)
cATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtct > 1:2090638/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc < 1:5648721/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc < 1:4645298/93‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc < 2:1552819/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGGCGATTGGTCTCg > 2:2419334/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg > 1:4342803/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg > 1:288859/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg < 2:9700917/93‑1 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTGCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg > 1:7767454/1‑93 (MQ=255)
cTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCCGATTGGtctctg > 2:7068710/1‑91 (MQ=255)
|
TATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG > NC_000913/2824987‑2825166
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > NC_000913/2824985‑2825169
|
ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCT < SRR4302540.3172777/94‑1 (MQ=60)
TTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGGCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTC > SRR4302540.19106/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGGCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT < SRR4302540.8565555/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT > SRR4302540.10160449/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT > SRR4302540.3893765/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT > SRR4302540.3893764/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT < SRR4302540.8960421/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTC < SRR4302540.4932280/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTA > SRR4302540.2303030/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCC > SRR4302540.4028554/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCC > SRR4302540.820022/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCC > SRR4302540.480628/1‑94 (MQ=60)
TTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCA < SRR4302540.2259209/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTG < SRR4302540.3643251/94‑1 (MQ=60)
GCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCT < SRR4302540.5744564/94‑1 (MQ=60)
CCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTGCCACTGCTT > SRR4302540.5702724/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTT < SRR4302540.1912191/94‑1 (MQ=60)
CTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTT < SRR4302540.4456191/94‑1 (MQ=60)
TTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTC > SRR4302540.5060504/1‑94 (MQ=60)
TGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCA > SRR4302540.890345/1‑94 (MQ=60)
GGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAC > SRR4302540.2290497/1‑94 (MQ=60)
GTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACC > SRR4302540.1905669/1‑94 (MQ=60)
GTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACC < SRR4302540.4831658/94‑1 (MQ=60)
TGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCT < SRR4302540.3991414/94‑1 (MQ=60)
TGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCT < SRR4302540.9856603/94‑1 (MQ=60)
GACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTT < SRR4302540.6337210/94‑1 (MQ=60)
ACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTT < SRR4302540.10020713/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGACTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC > SRR4302540.9771575/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCCTCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCC > SRR4302540.8044871/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCC < SRR4302540.4957391/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302540.5355488/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302540.3529054/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGGTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC > SRR4302540.4902086/1‑94 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302540.1068373/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302540.8506300/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC < SRR4302540.8506301/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302540.5378198/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302540.39160/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302540.5629344/94‑1 (MQ=60)
GCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCC > SRR4302540.8098222/1‑94 (MQ=60)
CCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCC > SRR4302540.3197208/1‑94 (MQ=60)
CCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCA < SRR4302540.9866583/94‑1 (MQ=60)
CCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGG < SRR4302540.4661791/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGG > SRR4302540.1008633/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302540.8896938/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302540.4691109/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302540.4138583/94‑1 (MQ=60)
tctttgtgcgcttgccAGCCATGCACTGGGTCTTGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCA < SRR4302540.2516309/78‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG > SRR4302540.1873163/1‑94 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG < SRR4302540.9985586/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG > SRR4302540.377245/1‑94 (MQ=60)
TTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGT < SRR4302540.4383213/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302540.2353845/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT > SRR4302540.5808556/1‑94 (MQ=60)
GTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAT < SRR4302540.9400180/94‑1 (MQ=60)
cccgcgggccAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302540.293214/84‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302540.293213/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGGCATCCGCTCGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302540.3380220/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG > SRR4302540.3197499/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGC > SRR4302540.7540665/1‑94 (MQ=60)
CGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGC > SRR4302540.7540667/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGGGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCC > SRR4302540.1930766/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCA < SRR4302540.9213334/94‑1 (MQ=60)
CTGGGGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC < SRR4302540.1958625/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC > SRR4302540.8589881/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC > SRR4302540.8789396/1‑94 (MQ=60)
CTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCAC < SRR4302540.4128797/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACA < SRR4302540.8383433/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG < SRR4302540.6159492/94‑1 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA > SRR4302540.5866417/1‑94 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA > SRR4302540.5866418/1‑94 (MQ=60)
GCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAT < SRR4302540.7070173/94‑1 (MQ=60)
CCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATC < SRR4302540.8166183/94‑1 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302540.7310219/1‑94 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302540.7310220/1‑94 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG > SRR4302540.648196/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC > SRR4302540.9413718/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC > SRR4302540.5622157/1‑94 (MQ=60)
CCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCG > SRR4302540.9371321/1‑94 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT > SRR4302540.7929170/1‑94 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT < SRR4302540.204032/94‑1 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT > SRR4302540.1869781/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTA < SRR4302540.1397374/94‑1 (MQ=60)
CTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTAT > SRR4302540.6599558/1‑94 (MQ=60)
GGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCCCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTG > SRR4302540.8768122/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGA > SRR4302540.9970214/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGA > SRR4302540.6524955/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAT > SRR4302540.4427157/1‑94 (MQ=60)
TCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATT < SRR4302540.8799994/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATT < SRR4302540.2689286/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302540.9747565/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302540.7774914/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302540.781612/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302540.6178822/94‑1 (MQ=60)
TGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGCTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC < SRR4302540.9878719/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAAGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG < SRR4302540.6829958/94‑1 (MQ=60)
TCATGCTGGCGCTTATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGT < SRR4302540.8338052/94‑1 (MQ=60)
TCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGT < SRR4302540.5067797/94‑1 (MQ=60)
ATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGC > SRR4302540.854144/1‑94 (MQ=60)
ATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGA > SRR4302540.4034082/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAG < SRR4302540.2413546/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGA < SRR4302540.7111695/94‑1 (MQ=60)
CTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGA < SRR4302540.747121/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAT > SRR4302540.2000356/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATT < SRR4302540.8305937/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATT < SRR4302540.6420061/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATT < SRR4302540.671824/94‑1 (MQ=60)
GCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTG < SRR4302540.4219785/94‑1 (MQ=60)
CGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG > SRR4302540.2073/1‑94 (MQ=60)
GCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGT > SRR4302540.4100150/1‑94 (MQ=60)
GCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGT < SRR4302540.3949621/94‑1 (MQ=60)
CTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC < SRR4302540.8317466/94‑1 (MQ=60)
CTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC > SRR4302540.5706023/1‑94 (MQ=60)
TCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCT > SRR4302540.2113092/1‑94 (MQ=60)
TCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCT > SRR4302540.349095/1‑94 (MQ=60)
TCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCT > SRR4302540.2922638/1‑94 (MQ=60)
TCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCT > SRR4302540.2922637/1‑94 (MQ=60)
CATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTC > SRR4302540.2717165/1‑94 (MQ=60)
CATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTC < SRR4302540.7946562/94‑1 (MQ=60)
CTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCGCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302540.5717371/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302540.291710/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302540.5710896/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302540.4695021/94‑1 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302540.4390075/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302540.7858261/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTGCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302540.7858262/1‑94 (MQ=60)
TCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG < SRR4302540.1716799/94‑1 (MQ=60)
GCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302540.1426661/1‑94 (MQ=60)
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ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > NC_000913/2824985‑2825169
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
