Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,825,077 |
T→C |
C221C (TGT→TGC) |
srlE → |
PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,825,077 | 0 | T | C | 100.0%
| 690.3
/ NA
| 215 | C221C (TGT→TGC) | srlE | PTS system glucitol/sorbitol‑specific enzyme IIBC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (80/135); total (80/135) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > NC_000913/2824987‑2825165
|
tATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctc > 1:4463470/1‑93 (MQ=255)
aTGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcc < 1:4653176/93‑1 (MQ=255)
tGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcct > 1:4428700/1‑93 (MQ=255)
ggCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctcctt > 2:1023180/1‑93 (MQ=255)
gCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctccttc > 1:3280718/1‑93 (MQ=255)
cTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGctccttcc > 2:1698093/1‑93 (MQ=255)
ttCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTccc > 1:5955637/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCa > 2:1137241/1‑93 (MQ=255)
tCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCa < 1:3742591/93‑1 (MQ=255)
cTGACCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTcccgc < 2:3126143/93‑3 (MQ=255)
ggCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTg > 1:2469816/1‑93 (MQ=255)
ggCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTg < 1:4078774/93‑1 (MQ=255)
gCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGc > 1:5823779/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGc < 2:5445762/93‑1 (MQ=255)
gCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGc > 2:2332516/1‑93 (MQ=255)
gCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGc < 2:2556975/93‑1 (MQ=255)
cTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCtt > 1:4271531/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt > 1:2106570/1‑93 (MQ=255)
ttGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCttt < 1:4363249/93‑1 (MQ=255)
ggTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCa > 2:4463931/1‑93 (MQ=255)
gTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAc > 1:1370443/1‑93 (MQ=255)
tGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAcc < 2:4667223/93‑1 (MQ=255)
ggACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAcc < 1:1511838/92‑1 (MQ=255)
gACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCt < 1:3237728/93‑1 (MQ=255)
gACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCt > 2:2207561/1‑93 (MQ=255)
gACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCt < 2:2407900/93‑1 (MQ=255)
cTGGATTGCCCACGCTCTTTCTCCGCTGTCGAGCCATCCACTCGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCttt < 1:2841189/93‑1 (MQ=255)
tGGATTGCCCACAGTCTTGCTCCCCTGGCGGGCCATCCACTGGGTCTGGTAATACTCGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttc < 2:1754478/93‑1 (MQ=255)
ggATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcc > 2:1868668/1‑92 (MQ=255)
ggATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcc < 1:337972/93‑2 (MQ=255)
ggATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcc < 1:1263114/93‑2 (MQ=255)
cgATTCCCTACGGTTTCCCTCTGGTGGGGGGCCATCGAGTGGGTCTGGTCATGCTGGGGCGTATCTGCTCCTTCCCACTGCTCTCACCTttcc < 2:602327/92‑2 (MQ=255)
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc > 2:4373132/1‑93 (MQ=255)
aTTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTttcctc < 1:1677883/93‑1 (MQ=255)
ttGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCg < 2:3053552/93‑1 (MQ=255)
tGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCgg < 2:5645864/93‑1 (MQ=255)
gCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGc > 2:2350670/1‑93 (MQ=255)
cccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGcc < 1:5862495/93‑1 (MQ=255)
ccACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGccc < 2:3815614/93‑1 (MQ=255)
aCGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAg < 1:5534762/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg < 1:1057142/93‑1 (MQ=255)
cGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAgg > 1:5429262/1‑93 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 2:5612583/93‑1 (MQ=255)
ggTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgc < 1:3981441/93‑1 (MQ=255)
gTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTAATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcg > 2:5025573/1‑93 (MQ=255)
tCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGgcgc < 1:2316004/93‑1 (MQ=255)
cTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCa < 2:6229081/93‑1 (MQ=255)
tGCTCCGCTGTCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGt < 1:5624896/93‑1 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt > 1:2351337/1‑93 (MQ=255)
gCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGtt > 2:68517/1‑93 (MQ=255)
cTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTa < 1:3672210/93‑1 (MQ=255)
gccGCTGGCGAGACATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 1:3882247/92‑1 (MQ=255)
cccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAt < 2:3668744/92‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 1:130793/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 2:5839470/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc > 1:480734/1‑93 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 1:5764973/93‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATc < 1:5042645/93‑1 (MQ=255)
tGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 2:1190015/93‑1 (MQ=255)
gggCGAGCTATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACGGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcac < 2:713889/92‑1 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca > 1:261856/1‑93 (MQ=255)
ggCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGcaca < 2:607874/93‑1 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg < 1:1091364/93‑1 (MQ=255)
gCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAg < 1:3737082/93‑1 (MQ=255)
gAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGt < 2:1294641/93‑1 (MQ=255)
gCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTa < 1:609451/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCTCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc < 2:5820651/93‑1 (MQ=255)
cATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATc > 2:3551739/1‑93 (MQ=255)
tCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCgg < 1:2732937/93‑1 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCATAGGTTATCGGCg > 1:3150206/1‑93 (MQ=255)
cACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCg > 1:899416/1‑93 (MQ=255)
cTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTa < 1:2171893/93‑1 (MQ=255)
tGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTat > 2:252914/1‑93 (MQ=255)
gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 2:3367575/93‑1 (MQ=255)
gggTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTatt < 2:4880024/93‑1 (MQ=255)
cTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgatt < 1:4907450/93‑1 (MQ=255)
tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg > 2:2133424/1‑93 (MQ=255)
tGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTattgattg < 1:53808/93‑1 (MQ=255)
ggTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTgg > 2:2967549/1‑93 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc > 1:5195070/1‑93 (MQ=255)
gTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGc < 1:6268736/93‑1 (MQ=255)
tCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCg < 1:2448410/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:4965191/93‑1 (MQ=255)
gCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCa < 2:6120972/93‑1 (MQ=255)
tGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGa < 2:4109070/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAt > 1:1655582/1‑93 (MQ=255)
gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:4513870/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:5477932/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:564542/93‑1 (MQ=255)
gcgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAtt < 2:5964456/93‑1 (MQ=255)
cgcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACCGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTg > 1:2907022/1‑93 (MQ=255)
gcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTgg > 1:3440852/1‑93 (MQ=255)
gcTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTgg < 2:550745/93‑1 (MQ=255)
cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGTCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAGTGGCGTGCAGATTggc > 2:3443839/1‑92 (MQ=255)
cTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGt < 2:839251/93‑1 (MQ=255)
tCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGATATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtc > 1:1183824/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 1:1914571/1‑93 (MQ=255)
aTCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGtctc > 1:1167807/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTTGCGTGCAGATTGGTCTCg > 2:482932/1‑93 (MQ=255)
tCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCg < 1:2649381/93‑1 (MQ=255)
|
TATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > NC_000913/2824987‑2825165
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAAT > NC_000913/2824985‑2825170
|
ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCT < SRR4302533.5373580/94‑1 (MQ=60)
ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCT > SRR4302533.1701003/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTC > SRR4302533.4490465/1‑94 (MQ=60)
TTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTC < SRR4302533.420112/94‑1 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT > SRR4302533.4455472/1‑94 (MQ=60)
ATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCT < SRR4302533.4681372/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTC < SRR4302533.1278462/94‑1 (MQ=60)
GGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTC > SRR4302533.3300970/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCC > SRR4302533.1808218/1‑94 (MQ=60)
CTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCC > SRR4302533.5991664/1‑94 (MQ=60)
TCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCAC < SRR4302533.3765546/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTG < SRR4302533.3096241/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTG > SRR4302533.2485052/1‑94 (MQ=60)
TGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTG > SRR4302533.4016198/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGC > SRR4302533.5858957/1‑94 (MQ=60)
GGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGC < SRR4302533.4103603/94‑1 (MQ=60)
GGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGC > SRR4302533.3259620/1‑94 (MQ=60)
GCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTCGGTCTGGCCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCT > SRR4302533.4264521/1‑94 (MQ=60)
CCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTT > SRR4302533.4297238/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTT > SRR4302533.1476390/1‑94 (MQ=60)
CTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTT > SRR4302533.2119560/1‑94 (MQ=60)
TTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTC < SRR4302533.4389587/94‑1 (MQ=60)
TGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCA < SRR4302533.2340035/94‑1 (MQ=60)
GGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCAC > SRR4302533.1378680/1‑94 (MQ=60)
GTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACC < SRR4302533.2460231/94‑1 (MQ=60)
TGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCT > SRR4302533.2780780/1‑94 (MQ=60)
GGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCT < SRR4302533.1520949/94‑1 (MQ=60)
GACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTT < SRR4302533.3257679/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC > SRR4302533.149093/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC > SRR4302533.5801720/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC > SRR4302533.5897274/1‑94 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC < SRR4302533.2868943/94‑1 (MQ=60)
CTGGATTGCCCACGCTCTTTCTCCGCTGTCGAGCCATCCACTCGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTC < SRR4302533.2858674/94‑1 (MQ=60)
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCC > SRR4302533.3761881/1‑94 (MQ=60)
TGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCC > SRR4302533.2282019/1‑94 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302533.1270670/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302533.3287686/94‑1 (MQ=60)
GGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCT < SRR4302533.340035/94‑1 (MQ=60)
GATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTC > SRR4302533.3370052/1‑94 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302533.1180488/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302533.4875605/94‑1 (MQ=60)
ATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCG < SRR4302533.1688043/94‑1 (MQ=60)
TTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGG > SRR4302533.2153392/1‑94 (MQ=60)
TTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGG < SRR4302533.4951705/94‑1 (MQ=60)
TGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGC < SRR4302533.264871/94‑1 (MQ=60)
CCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCC > SRR4302533.38706/1‑94 (MQ=60)
CCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCC < SRR4302533.5897941/94‑1 (MQ=60)
CCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCA < SRR4302533.386883/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGG < SRR4302533.5568177/94‑1 (MQ=60)
ACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGG > SRR4302533.5461962/1‑94 (MQ=60)
ACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGC > SRR4302533.1089343/1‑94 (MQ=60)
CGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGC < SRR4302533.1063358/94‑1 (MQ=60)
CGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGC > SRR4302533.4534554/1‑94 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG < SRR4302533.4005681/94‑1 (MQ=60)
GGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCG > SRR4302533.4531063/1‑94 (MQ=60)
GTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGC > SRR4302533.2483269/1‑94 (MQ=60)
TCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCA < SRR4302533.2330345/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG < SRR4302533.4985895/94‑1 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAG < SRR4302533.1252083/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGTCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302533.5658893/94‑1 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT > SRR4302533.2365883/1‑94 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT > SRR4302533.2025460/1‑94 (MQ=60)
TGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTT < SRR4302533.550604/94‑1 (MQ=60)
GCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTA < SRR4302533.352443/94‑1 (MQ=60)
GCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTA < SRR4302533.1569235/94‑1 (MQ=60)
CTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTAT < SRR4302533.3694778/94‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302533.3759154/94‑1 (MQ=60)
TCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC > SRR4302533.483608/1‑94 (MQ=60)
GCCGCTGGCGAGACATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATC < SRR4302533.3905937/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302533.5799763/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302533.4313328/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302533.5073163/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302533.131612/94‑1 (MQ=60)
CCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCG < SRR4302533.2803319/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCA > SRR4302533.5820584/1‑94 (MQ=60)
GCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTACCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCA < SRR4302533.4474866/94‑1 (MQ=60)
TGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACA > SRR4302533.263443/1‑94 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG < SRR4302533.6300892/94‑1 (MQ=60)
GGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAG < SRR4302533.6094308/94‑1 (MQ=60)
GCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGG < SRR4302533.1097811/94‑1 (MQ=60)
GCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGG < SRR4302533.3760006/94‑1 (MQ=60)
GCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCAAGGCGCAGTTATCGCACAGG < SRR4302533.3188404/94‑1 (MQ=60)
GAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTT < SRR4302533.5397163/94‑1 (MQ=60)
AGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTA < SRR4302533.3437359/94‑1 (MQ=60)
GCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTAT < SRR4302533.613035/94‑1 (MQ=60)
CATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG < SRR4302533.1224920/94‑1 (MQ=60)
CATCCACTGGGGCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCG < SRR4302533.1681245/94‑1 (MQ=60)
ATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGG > SRR4302533.3627519/1‑94 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGTCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302533.2749700/94‑1 (MQ=60)
TCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGC < SRR4302533.2749702/94‑1 (MQ=60)
CCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCATAGGTTATCGGCG > SRR4302533.3169577/1‑94 (MQ=60)
CCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCG > SRR4302533.904695/1‑94 (MQ=60)
CACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGT > SRR4302533.475590/1‑94 (MQ=60)
CTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTAT < SRR4302533.2185247/94‑1 (MQ=60)
GGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTG < SRR4302533.4002062/94‑1 (MQ=60)
GTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGAT < SRR4302533.5711994/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG < SRR4302533.4937183/94‑1 (MQ=60)
CTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTG > SRR4302533.234449/1‑94 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGG < SRR4302533.5598294/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGG < SRR4302533.133078/94‑1 (MQ=60)
TGGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGG < SRR4302533.54171/94‑1 (MQ=60)
GGTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGC > SRR4302533.5226402/1‑94 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG > SRR4302533.5511196/1‑94 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG < SRR4302533.2513435/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG < SRR4302533.6306194/94‑1 (MQ=60)
GTCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCG > SRR4302533.4438034/1‑94 (MQ=60)
TCATGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGT < SRR4302533.2463522/94‑1 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA > SRR4302533.4324733/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA > SRR4302533.6318070/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCA < SRR4302533.6113661/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAG < SRR4302533.1103214/94‑1 (MQ=60)
TGGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGAT > SRR4302533.1665604/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATT < SRR4302533.1859449/94‑1 (MQ=60)
GCGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACCGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTG > SRR4302533.2924870/1‑94 (MQ=60)
CGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG > SRR4302533.3462099/1‑94 (MQ=60)
CGCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGG < SRR4302533.971482/94‑1 (MQ=60)
GCTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGT > SRR4302533.5988512/1‑94 (MQ=60)
CTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC < SRR4302533.5453151/94‑1 (MQ=60)
CTCATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGATATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTC > SRR4302533.1190930/1‑94 (MQ=60)
CATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTC > SRR4302533.1174813/1‑94 (MQ=60)
CATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTC > SRR4302533.1926257/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG > SRR4302533.5145054/1‑94 (MQ=60)
ATCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCG < SRR4302533.2587542/94‑1 (MQ=60)
TCTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGG < SRR4302533.2665656/94‑1 (MQ=60)
CTGCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGC > SRR4302533.1309028/1‑94 (MQ=60)
GCTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGAGTGCAGATTGGTCTCGGCAA > SRR4302533.1052043/1‑94 (MQ=60)
CTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCCTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAAT > SRR4302533.4378048/1‑94 (MQ=60)
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ATTATGGCTTCTGGCCTTGGTGACTGGATTGCCCACGGTCTTGCTCCGCTGGCGAGCCATCCACTGGGTCTGGTCATGCTGGCGCTCATCTGTTCCTTCCCACTGCTTTCACCTTTCTTCGGCCCAGGCGCAGTTATCGCACAGGTTATCGGCGTATTGATTGGCGTGCAGATTGGTCTCGGCAAT > NC_000913/2824985‑2825170
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
