Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NC_000913 |
3,972,637 |
2 bp→GC |
coding (430‑431/546 nt) |
wecD → |
hypothetical protein |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NC_000913 | 3,972,637 | 0 | C | G | 100.0%
| 1221.9
/ NA
| 377 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (163/214); total (163/214) |
* | NC_000913 | 3,972,638 | 0 | G | C | 99.7%
| 1214.4
/ NA
| 377 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (162/213); minor base T (0/1); total (163/214) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972553‑3972724
||
aaTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGTTCACGGt < 1:2809079/93‑1 (MQ=255)
cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTaaaa > 2:4494388/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa < 2:9566160/93‑1 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa > 2:3816470/1‑93 (MQ=255)
cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa > 2:6176753/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 2:5754841/1‑93 (MQ=255)
gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 1:5881282/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt > 1:8144201/1‑93 (MQ=255)
tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt < 2:9246100/93‑1 (MQ=255)
cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCgg > 1:4085398/1‑93 (MQ=255)
gAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCggg < 1:2020143/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 1:2307634/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 1:8210149/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt > 1:6759537/1‑93 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:3491068/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:8601217/93‑1 (MQ=255)
aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:6405935/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:1555212/93‑1 (MQ=255)
aTTGGCCTGATGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCATGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:2032175/93‑1 (MQ=255)
ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg > 1:4314791/1‑93 (MQ=255)
atGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg < 1:5168411/92‑1 (MQ=255)
tGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGc < 1:9458622/93‑1 (MQ=255)
gCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGa > 2:501718/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 1:1099395/1‑93 (MQ=255)
tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 2:7202754/1‑93 (MQ=255)
gctggctgGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCa > 2:1320859/1‑93 (MQ=255)
ctggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaa < 1:6042506/93‑1 (MQ=255)
tggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaaa > 1:7702242/1‑93 (MQ=255)
ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaaag > 1:5398729/1‑92 (MQ=255)
gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 2:7376704/93‑1 (MQ=255)
ctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATgg < 1:9983163/93‑1 (MQ=255)
tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATggg < 2:4419372/93‑1 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 1:5594564/93‑1 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 2:7996418/93‑1 (MQ=255)
ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 2:2510034/93‑1 (MQ=255)
gACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCa < 2:8109669/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGGAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTTAAGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac < 1:9629579/93‑1 (MQ=255)
cgcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac > 1:460208/1‑93 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca < 2:7570696/93‑1 (MQ=255)
gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca < 1:3713221/93‑1 (MQ=255)
cgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAacac < 2:7006067/93‑1 (MQ=255)
cgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAacac < 1:1015665/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc < 2:1774756/93‑1 (MQ=255)
gTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccg > 2:2824743/1‑93 (MQ=255)
gTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccg > 2:6771038/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:9540395/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:4873163/1‑93 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc < 1:6527386/93‑1 (MQ=255)
tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:8769169/1‑93 (MQ=255)
cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg > 1:6899561/1‑93 (MQ=255)
aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 2:2672946/1‑93 (MQ=255)
ggTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCcgcg > 2:2123270/1‑93 (MQ=255)
tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt > 2:6591719/1‑93 (MQ=255)
ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa > 1:3978788/1‑93 (MQ=255)
tgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaa > 2:7470479/1‑93 (MQ=255)
tgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaa < 1:4500574/93‑1 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCGAAATGGGCAACACGGCCGCGCTTaaa > 1:3118178/1‑93 (MQ=255)
gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa < 1:5010076/93‑1 (MQ=255)
agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 1:2249858/93‑1 (MQ=255)
gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAct > 1:7576833/1‑92 (MQ=255)
gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg > 2:4588472/1‑93 (MQ=255)
gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGCCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg > 1:1612143/1‑93 (MQ=255)
gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 2:1885376/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTCAACGatac > 2:414399/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:8015430/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac > 1:172197/1‑93 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:1692789/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:7282756/93‑1 (MQ=255)
aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:7920544/93‑1 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca > 2:9356646/1‑93 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca < 1:7090865/93‑1 (MQ=255)
tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca < 1:914475/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:7857531/93‑1 (MQ=255)
cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata > 1:1398637/1‑93 (MQ=255)
aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac < 1:9269690/93‑1 (MQ=255)
aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac > 2:5457642/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCACCACCGCCGCGCTTCACCGAtacataca > 1:6447446/1‑93 (MQ=255)
aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 1:6320514/1‑93 (MQ=255)
cGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaaa < 2:7344369/93‑1 (MQ=255)
ggCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAg < 1:8587671/93‑1 (MQ=255)
gcgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgt > 1:9716134/1‑93 (MQ=255)
cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg < 2:9855078/93‑1 (MQ=255)
gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTGAAACAACTTTGGGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGGTACATACAAAgcgg > 2:5893560/1‑93 (MQ=255)
cTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 2:3391234/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAGTGGGCAACACCGCCGTGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg < 1:5279465/93‑1 (MQ=255)
tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 2:884585/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 1:8279559/1‑93 (MQ=255)
aaaCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGc > 2:2303704/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCGGGGCTTAAAGGAAACATACAAAGGGGGGCGa > 1:9844606/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa > 1:3377044/1‑93 (MQ=255)
aCTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGAAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGa > 1:1194782/1‑93 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 1:5529121/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa < 2:9675617/93‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGaa > 2:6258713/1‑93 (MQ=255)
tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt < 1:9809958/93‑1 (MQ=255)
ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGt > 2:4724041/1‑93 (MQ=255)
ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGt < 1:7456934/93‑1 (MQ=255)
ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCACTTAAACGATACATACAAAGTGGCGCGTAtct > 2:8433519/1‑91 (MQ=255)
gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 1:5997104/93‑1 (MQ=255)
gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 2:92620/93‑1 (MQ=255)
||
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972553‑3972724
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 216 total aligned reads displayed.
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972544‑3972724
|
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302540.9801464/94‑1 (MQ=60)
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATG < SRR4302540.7432372/94‑1 (MQ=60)
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCGC‑‑‑‑GGTA > SRR4302540.688702/1‑94 (MQ=60)
ATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAA < SRR4302540.1314794/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAAC < SRR4302540.5984354/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAAC < SRR4302540.6023312/94‑1 (MQ=60)
CGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAAC < SRR4302540.1158608/94‑1 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGATGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGAGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACA > SRR4302540.6893531/1‑94 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACA < SRR4302540.4640380/94‑1 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACA < SRR4302540.4565197/94‑1 (MQ=60)
GACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACA > SRR4302540.8055624/1‑94 (MQ=60)
CAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAAC < SRR4302540.8361307/94‑1 (MQ=60)
AGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACT > SRR4302540.2327362/1‑94 (MQ=60)
AGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACT > SRR4302540.5946282/1‑94 (MQ=60)
GATTCGCGAATTTGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCCAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.675320/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.1477589/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.4927363/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.3470847/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.7205209/94‑1 (MQ=60)
GATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCGGAGCTGATGCGAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTT < SRR4302540.4927361/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT > SRR4302540.9506310/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT < SRR4302540.6197346/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT < SRR4302540.3791001/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT > SRR4302540.7013772/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT < SRR4302540.7870338/94‑1 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT > SRR4302540.7944736/1‑94 (MQ=60)
ATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTT > SRR4302540.8238736/1‑94 (MQ=60)
TGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTG < SRR4302540.2190690/94‑1 (MQ=60)
GCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGC < SRR4302540.6563388/94‑1 (MQ=60)
GGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCG < SRR4302540.1733379/94‑1 (MQ=60)
CGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCG < SRR4302540.9579656/94‑1 (MQ=60)
GCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGG < SRR4302540.2606745/94‑1 (MQ=60)
GCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGG > SRR4302540.4129458/1‑94 (MQ=60)
GCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGGGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTACAACAACTTTGCGG > SRR4302540.4129457/1‑94 (MQ=60)
gagtggggCTGCTGTCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGAGGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGT < SRR4302540.5482384/86‑1 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGT > SRR4302540.417143/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGT > SRR4302540.6834243/1‑94 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGT < SRR4302540.1437559/94‑1 (MQ=60)
GAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGT < SRR4302540.2041981/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302540.2332476/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG > SRR4302540.6455080/1‑94 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302540.976478/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302540.8777825/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302540.8305572/94‑1 (MQ=60)
AATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTG < SRR4302540.8777824/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGG < SRR4302540.7572451/94‑1 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGG > SRR4302540.4361769/1‑94 (MQ=60)
ATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGGGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGATCAC‑‑‑‑GGTAAAAAAACTTTGCGGGTGG > SRR4302540.7796756/1‑94 (MQ=60)
ATGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGC < SRR4302540.5224630/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCG < SRR4302540.3837862/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCG < SRR4302540.9570859/94‑1 (MQ=60)
TGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCG < SRR4302540.9846998/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGA < SRR4302540.9274015/94‑1 (MQ=60)
GGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGA < SRR4302540.4430440/94‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACC > SRR4302540.6351983/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC < SRR4302540.9957890/94‑1 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302540.1110717/1‑94 (MQ=60)
CTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCC > SRR4302540.5271108/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302540.8963118/1‑94 (MQ=60)
TGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGATCAC‑‑‑‑GGTAAAAAAACTTTGCGGGTGGCGACCCA > SRR4302540.4520609/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAA > SRR4302540.2054752/1‑94 (MQ=60)
CTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAA < SRR4302540.6109620/94‑1 (MQ=60)
CTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAA > SRR4302540.7790306/1‑94 (MQ=60)
TGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAT < SRR4302540.9549129/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAT < SRR4302540.9563804/94‑1 (MQ=60)
TGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAAG > SRR4302540.5458087/1‑94 (MQ=60)
GCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGG < SRR4302540.7271843/94‑1 (MQ=60)
CTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGG < SRR4302540.10099561/94‑1 (MQ=60)
TGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGC < SRR4302540.7008009/94‑1 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCA < SRR4302540.5656120/94‑1 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCA < SRR4302540.409247/94‑1 (MQ=60)
GGACGCGGTGCAGGAGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCA > SRR4302540.6791907/1‑94 (MQ=60)
GACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAA < SRR4302540.6193184/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAA < SRR4302540.5910355/94‑1 (MQ=60)
GACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAA < SRR4302540.2006845/94‑1 (MQ=60)
GCGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAAC < SRR4302540.9962143/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAAC < SRR4302540.6081794/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAAC < SRR4302540.9825817/94‑1 (MQ=60)
ACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAAC > SRR4302540.465118/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGGAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTAT‑‑‑‑GCTTAAGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACA < SRR4302540.9743051/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACA < SRR4302540.4509563/94‑1 (MQ=60)
CGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACA > SRR4302540.1226700/1‑94 (MQ=60)
CGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACA > SRR4302540.562623/1‑94 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302540.3753740/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302540.47467/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302540.7259258/94‑1 (MQ=60)
GCGGTGCAGGGGCTGAGCTTATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAC < SRR4302540.7594692/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACC < SRR4302540.6707157/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACC < SRR4302540.1025958/94‑1 (MQ=60)
CGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GATAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACC < SRR4302540.8774235/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACACCTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCC > SRR4302540.7993181/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCG > SRR4302540.817573/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCG < SRR4302540.8270898/94‑1 (MQ=60)
GGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCG > SRR4302540.5373996/1‑94 (MQ=60)
GGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCG < SRR4302540.166196/94‑1 (MQ=60)
GGGGCAGGTGCTGAGCTTATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCG < SRR4302540.8270896/94‑1 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.9653294/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.9653293/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.8965288/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.1705385/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.8870803/1‑94 (MQ=60)
GTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGC > SRR4302540.4925449/1‑94 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302540.6599875/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302540.2294463/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302540.8258625/94‑1 (MQ=60)
TGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCC < SRR4302540.5346818/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCG > SRR4302540.6976196/1‑94 (MQ=60)
CAGGGGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGG > SRR4302540.1035407/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG > SRR4302540.508926/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG < SRR4302540.7479556/94‑1 (MQ=60)
AGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCG < SRR4302540.8663953/94‑1 (MQ=60)
GGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGC > SRR4302540.2168183/1‑94 (MQ=60)
GGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGC > SRR4302540.1098129/1‑94 (MQ=60)
GTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCT < SRR4302540.1370923/94‑1 (MQ=60)
GTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCT > SRR4302540.5048886/1‑94 (MQ=60)
GCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTA < SRR4302540.5625909/94‑1 (MQ=60)
GCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTA > SRR4302540.4021646/1‑94 (MQ=60)
GCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTA > SRR4302540.1629924/1‑94 (MQ=60)
CTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAA < SRR4302540.4673809/94‑1 (MQ=60)
CTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAA < SRR4302540.7019004/94‑1 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCGAAATGGGCAACACGGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.3152265/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.2578464/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA < SRR4302540.9916275/94‑1 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.8651785/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.5531890/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.9937416/1‑94 (MQ=60)
TGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAA > SRR4302540.6043222/1‑94 (MQ=60)
GAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAC < SRR4302540.5064328/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACT > SRR4302540.7661850/1‑94 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302540.6556016/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302540.2274013/94‑1 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGCCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG > SRR4302540.1629804/1‑94 (MQ=60)
AGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCGCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACG < SRR4302540.2274015/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGA > SRR4302540.5911846/1‑94 (MQ=60)
TGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATA > SRR4302540.7709796/1‑94 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC < SRR4302540.7569880/94‑1 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC < SRR4302540.8358720/94‑1 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC > SRR4302540.531815/1‑94 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC < SRR4302540.9604280/94‑1 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC < SRR4302540.3560416/94‑1 (MQ=60)
GATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATAC > SRR4302540.173917/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302540.1711144/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302540.8012860/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302540.8108663/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302540.991486/1‑94 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302540.4816536/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA < SRR4302540.7364026/94‑1 (MQ=60)
ATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACA > SRR4302540.40416/1‑94 (MQ=60)
TGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACAT < SRR4302540.5334031/94‑1 (MQ=60)
TGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACAT < SRR4302540.7169772/94‑1 (MQ=60)
TGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACAT < SRR4302540.924145/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA < SRR4302540.5642533/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA < SRR4302540.6933065/94‑1 (MQ=60)
GCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATA < SRR4302540.9680881/94‑1 (MQ=60)
CAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATAC < SRR4302540.7949344/94‑1 (MQ=60)
CAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATAC < SRR4302540.7949343/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCACCACCGCCGCGCTTCACCGATACATACA > SRR4302540.6519215/1‑94 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA < SRR4302540.9380540/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA < SRR4302540.2814573/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA < SRR4302540.3403182/94‑1 (MQ=60)
AAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACA > SRR4302540.6390899/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAA > SRR4302540.4195422/1‑94 (MQ=60)
ACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAA > SRR4302540.4195424/1‑94 (MQ=60)
ACGGCACTAAAGTGGGCGTATGCTCAG‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACACAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAA < SRR4302540.6055939/94‑1 (MQ=60)
CGGCGCTAAACTGGGCGTATCCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAG < SRR4302540.1717325/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT > SRR4302540.5154403/1‑94 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT < SRR4302540.8687501/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT < SRR4302540.8229062/94‑1 (MQ=60)
GGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGT > SRR4302540.9830293/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGG > SRR4302540.768774/1‑94 (MQ=60)
CGCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGG < SRR4302540.309869/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGT > SRR4302540.9139316/1‑94 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAGCTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG < SRR4302540.2952207/94‑1 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG > SRR4302540.7985569/1‑94 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG < SRR4302540.1176326/94‑1 (MQ=60)
CTAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTG < SRR4302540.3038957/94‑1 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAGTGGGCAACACCGCCGTGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC < SRR4302540.5337126/94‑1 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC > SRR4302540.8375722/1‑94 (MQ=60)
TAAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGC < SRR4302540.544650/94‑1 (MQ=60)
AAACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCG > SRR4302540.9710992/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCGGGGCTTAAAGGAAACATACAAAGGGGGGCGA > SRR4302540.9959687/1‑94 (MQ=57)
AACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302540.3413934/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302540.9719353/1‑94 (MQ=60)
AACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGAAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGA > SRR4302540.1207087/1‑94 (MQ=60)
ACTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAA > SRR4302540.5565445/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCGAAATGGGCAGCCCCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.6303305/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCACCACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGACT > SRR4302540.3492086/1‑94 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.8359757/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.5883579/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.3349805/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.1493725/94‑1 (MQ=60)
CTGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAT < SRR4302540.1747442/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302540.9924769/94‑1 (MQ=60)
TGGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATG < SRR4302540.10061852/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGT < SRR4302540.6085325/94‑1 (MQ=60)
GGGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGT < SRR4302540.6085324/94‑1 (MQ=60)
GGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTA < SRR4302540.1171558/94‑1 (MQ=60)
GGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTA < SRR4302540.7540074/94‑1 (MQ=60)
GGCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTA < SRR4302540.8097441/94‑1 (MQ=60)
GCGTATGCTCAC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG < SRR4302540.7455973/94‑1 (MQ=60)
|
CGGGAACTCAATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGC‑‑‑‑GGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972544‑3972724
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |