Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACT > NC_000913/715618‑715804
|
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTTATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAAT < SRR4302540.1589388/94‑1 (MQ=60)
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAAT < SRR4302540.957977/94‑1 (MQ=60)
TATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATC < SRR4302540.5882358/94‑1 (MQ=60)
TATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACC > SRR4302540.1915013/1‑94 (MQ=60)
ATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCT > SRR4302540.8407005/1‑94 (MQ=60)
ATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCT < SRR4302540.10124859/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTT > SRR4302540.110320/1‑94 (MQ=60)
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTT < SRR4302540.5683182/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTT < SRR4302540.5200354/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTT < SRR4302540.5884440/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTT < SRR4302540.9417968/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT > SRR4302540.4492933/1‑94 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT < SRR4302540.9957712/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTA < SRR4302540.10021692/94‑1 (MQ=60)
AATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTA < SRR4302540.8680470/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTAT > SRR4302540.4402541/1‑94 (MQ=60)
ATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTAT < SRR4302540.1015844/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTAT < SRR4302540.8292748/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTAT > SRR4302540.3259661/1‑94 (MQ=60)
CAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTA < SRR4302540.4616385/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTA < SRR4302540.3005021/94‑1 (MQ=60)
CAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTA < SRR4302540.6173001/94‑1 (MQ=60)
AGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAA > SRR4302540.9602089/1‑94 (MQ=60)
AGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGAAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAA > SRR4302540.9558717/1‑94 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAAC < SRR4302540.5681255/94‑1 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAC < SRR4302540.9101219/94‑1 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAC < SRR4302540.5794927/94‑1 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAC < SRR4302540.5794926/94‑1 (MQ=60)
CAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATTGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACC < SRR4302540.9798485/94‑1 (MQ=60)
CAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACC > SRR4302540.128825/1‑94 (MQ=60)
AGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCG > SRR4302540.9659200/1‑94 (MQ=60)
AGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCG > SRR4302540.9659201/1‑94 (MQ=60)
AGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCG > SRR4302540.1923566/1‑94 (MQ=60)
GACCTCCGGAGCCATAGACTAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGG < SRR4302540.9898696/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTA < SRR4302540.6229255/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTA < SRR4302540.1316014/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTA < SRR4302540.110754/94‑1 (MQ=60)
CTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAA > SRR4302540.3274723/1‑94 (MQ=60)
CCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCTCCTGTAATTGATAAAGTCCGGTTTCCGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAG < SRR4302540.1292963/94‑1 (MQ=60)
CCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAG < SRR4302540.1885166/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGA > SRR4302540.7171654/1‑94 (MQ=60)
CCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGA > SRR4302540.312814/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAG > SRR4302540.1965927/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAG < SRR4302540.9407901/94‑1 (MQ=60)
CGGAGACATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAG < SRR4302540.5197310/94‑1 (MQ=60)
GGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGT < SRR4302540.9976821/94‑1 (MQ=60)
GGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGT > SRR4302540.5201351/1‑94 (MQ=60)
GGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGT > SRR4302540.8021328/1‑94 (MQ=60)
GGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGT > SRR4302540.5471551/1‑94 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC > SRR4302540.8117080/1‑94 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC > SRR4302540.3774563/1‑94 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC > SRR4302540.1330082/1‑94 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC > SRR4302540.5319574/1‑94 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC < SRR4302540.2900641/94‑1 (MQ=60)
AGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTC < SRR4302540.2900643/94‑1 (MQ=60)
GCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCG < SRR4302540.3365854/94‑1 (MQ=60)
GCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCG > SRR4302540.3932227/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.3304785/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.8519886/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.8296805/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.1707393/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.3304783/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG > SRR4302540.10111560/1‑94 (MQ=60)
CCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGG < SRR4302540.6805737/94‑1 (MQ=60)
CATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGT > SRR4302540.8051347/1‑94 (MQ=60)
CATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGT > SRR4302540.1992552/1‑94 (MQ=60)
CATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGT < SRR4302540.7907230/94‑1 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302540.4408431/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTT > SRR4302540.7071876/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302540.6617823/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302540.6385706/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302540.297725/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302540.7064115/1‑94 (MQ=60)
TAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAT < SRR4302540.8228171/94‑1 (MQ=60)
TAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAT < SRR4302540.6105111/94‑1 (MQ=60)
AGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGATCGGTATG > SRR4302540.8014267/1‑94 (MQ=60)
AGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATG < SRR4302540.1227606/94‑1 (MQ=60)
AGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATG < SRR4302540.5049860/94‑1 (MQ=60)
GACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGG > SRR4302540.954069/1‑94 (MQ=60)
ACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGT < SRR4302540.1010326/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTACACGGTAAGAGTTCGGTATGGTTT < SRR4302540.1825670/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTT < SRR4302540.200336/94‑1 (MQ=60)
CGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTG < SRR4302540.6873687/94‑1 (MQ=60)
GCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGG < SRR4302540.1201114/94‑1 (MQ=60)
GCACCCATCGGGGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGGTCGGTATGGTTTGTGG > SRR4302540.3938665/1‑94 (MQ=60)
CACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGC < SRR4302540.6421042/94‑1 (MQ=60)
CACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGC < SRR4302540.6421043/94‑1 (MQ=60)
ACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCG > SRR4302540.1818333/1‑94 (MQ=60)
ACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCG > SRR4302540.5861105/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTC > SRR4302540.9533171/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTC > SRR4302540.8590594/1‑94 (MQ=60)
CATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCT > SRR4302540.4611000/1‑94 (MQ=60)
CATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCT < SRR4302540.9030776/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTT > SRR4302540.6399155/1‑94 (MQ=60)
ATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTT < SRR4302540.1098068/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTT < SRR4302540.4333752/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTT < SRR4302540.9818055/94‑1 (MQ=60)
CGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTT > SRR4302540.4272304/1‑94 (MQ=60)
CGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTT < SRR4302540.7705078/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGCGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTA > SRR4302540.7133686/1‑94 (MQ=60)
GGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTA < SRR4302540.9422894/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTA > SRR4302540.7194769/1‑94 (MQ=60)
GTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAA > SRR4302540.467698/1‑94 (MQ=60)
TGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAC < SRR4302540.3621874/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCA < SRR4302540.1981674/94‑1 (MQ=60)
ATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCA > SRR4302540.4843471/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCTGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302540.4437824/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302540.9217862/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302540.9217866/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302540.5386060/94‑1 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302540.1097504/94‑1 (MQ=60)
TTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGT > SRR4302540.8871668/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT > SRR4302540.847615/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT < SRR4302540.8953962/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTC < SRR4302540.6925357/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTC < SRR4302540.3502137/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCT > SRR4302540.6109921/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCT > SRR4302540.5706287/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCT > SRR4302540.2285457/1‑94 (MQ=60)
GTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCT > SRR4302540.7380531/1‑94 (MQ=60)
TTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTG < SRR4302540.1216185/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGG < SRR4302540.7339939/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGG < SRR4302540.3348934/94‑1 (MQ=60)
GTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAACCCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGA > SRR4302540.7923990/1‑94 (MQ=60)
GTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGA > SRR4302540.1527273/1‑94 (MQ=60)
GTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGA < SRR4302540.4912003/94‑1 (MQ=60)
TCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGAT < SRR4302540.132597/94‑1 (MQ=60)
TCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGAT < SRR4302540.8686476/94‑1 (MQ=60)
TCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGAT < SRR4302540.96157/94‑1 (MQ=60)
CACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATGTTTATTACCCGGTAAGAGATCGGTATGGTCTGTCGCGTCTTTTCACCAATTCTGGCTT > SRR4302540.10085306/1‑94 (MQ=60)
CACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATT > SRR4302540.10085307/1‑94 (MQ=60)
ACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTA > SRR4302540.5028672/1‑94 (MQ=60)
CCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTAT < SRR4302540.6507078/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTAT < SRR4302540.8540476/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTAT < SRR4302540.533460/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTAT < SRR4302540.3723435/94‑1 (MQ=60)
TGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTG < SRR4302540.9689627/94‑1 (MQ=60)
TGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTG < SRR4302540.3612363/94‑1 (MQ=60)
GTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGG < SRR4302540.6912696/94‑1 (MQ=60)
GTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGG > SRR4302540.4643785/1‑94 (MQ=60)
TAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGC > SRR4302540.9509779/1‑94 (MQ=60)
TAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGC > SRR4302540.9509777/1‑94 (MQ=60)
AATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCC < SRR4302540.1202753/94‑1 (MQ=60)
ATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCA > SRR4302540.1718938/1‑94 (MQ=60)
TTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAG < SRR4302540.7096758/94‑1 (MQ=60)
TTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAG > SRR4302540.2721387/1‑94 (MQ=60)
TGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGC > SRR4302540.3312155/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCT > SRR4302540.5750645/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTG > SRR4302540.9897115/1‑94 (MQ=60)
TAAAGTGCGGTATCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTG < SRR4302540.3136147/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT < SRR4302540.9360474/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT < SRR4302540.2732162/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT > SRR4302540.2183830/1‑94 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT < SRR4302540.997391/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATC > SRR4302540.9887935/1‑94 (MQ=60)
GTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATC > SRR4302540.5323671/1‑94 (MQ=60)
CGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTC < SRR4302540.7986482/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCA < SRR4302540.2147498/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCA < SRR4302540.7811383/94‑1 (MQ=60)
GTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAG > SRR4302540.309706/1‑94 (MQ=60)
GTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAG > SRR4302540.8281826/1‑94 (MQ=60)
TTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGT < SRR4302540.9229975/94‑1 (MQ=60)
TTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTA > SRR4302540.7965450/1‑94 (MQ=60)
GGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTT > SRR4302540.4861358/1‑94 (MQ=60)
GGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTT > SRR4302540.10047330/1‑94 (MQ=60)
GGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTT > SRR4302540.5350552/1‑94 (MQ=60)
GCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTA < SRR4302540.3382303/94‑1 (MQ=60)
TAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT > SRR4302540.8940622/1‑94 (MQ=60)
TAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT < SRR4302540.6750710/94‑1 (MQ=60)
TAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT < SRR4302540.6750714/94‑1 (MQ=60)
AATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAA < SRR4302540.4222406/94‑1 (MQ=60)
AATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAA < SRR4302540.623519/94‑1 (MQ=60)
AACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAA < SRR4302540.2341944/94‑1 (MQ=60)
ACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAAC < SRR4302540.4978137/94‑1 (MQ=60)
TCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACT > SRR4302540.9367118/1‑94 (MQ=60)
|
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAACT > NC_000913/715618‑715804
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
