Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
715,711 |
T→C |
D37G (GAT→GGT) |
ybfH ← |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 715,711 | 0 | T | C | 100.0%
| 617.2
/ NA
| 186 | D37G (GAT→GGT) | ybfH | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (65/121); total (65/121) |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT > NC_000913/715621‑715800
|
tcaatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCt > 1:5266472/1‑93 (MQ=255)
tcaatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCt < 1:5903090/93‑1 (MQ=255)
tcaatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGGTTCGGCTAAACCt > 1:6067294/1‑93 (MQ=255)
caatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCtt < 1:2112074/93‑1 (MQ=255)
caatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCtt < 1:172355/93‑1 (MQ=255)
aatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCttt < 2:3762567/93‑1 (MQ=255)
aatcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCttt < 2:1798126/93‑1 (MQ=255)
atcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTtta < 2:2014868/93‑1 (MQ=255)
tcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTttat > 2:1358116/1‑93 (MQ=255)
tcaGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTttat < 1:1857140/93‑1 (MQ=255)
agcagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTttatta < 2:2350124/93‑1 (MQ=255)
gcagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTaa < 2:854410/93‑1 (MQ=255)
gcagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTaa < 1:5112816/93‑1 (MQ=255)
gcagACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTaa < 1:4579093/93‑1 (MQ=255)
agACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAcc < 1:1313161/93‑1 (MQ=255)
ccTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGt > 1:3898180/1‑93 (MQ=255)
ccTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGt < 1:3181698/93‑1 (MQ=255)
cTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTa > 2:4146411/1‑93 (MQ=255)
tCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTaa > 2:636745/1‑93 (MQ=255)
tCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTaa > 2:4510296/1‑93 (MQ=255)
ccGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAag < 1:1011366/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAaga < 2:1551386/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAaga < 1:3437944/93‑1 (MQ=255)
cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAaga > 2:1074652/1‑93 (MQ=255)
cGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAaga < 1:3639455/93‑1 (MQ=255)
ggAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAagag < 1:6288394/93‑1 (MQ=255)
gAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGt < 1:2597689/93‑1 (MQ=255)
gCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTc < 1:1624446/93‑1 (MQ=255)
gCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTc > 2:3598138/1‑93 (MQ=255)
gCCATAGACAAGCGCACCCATCGGCGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTc > 2:3677788/1‑93 (MQ=255)
aTAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGt < 2:1992457/93‑1 (MQ=255)
tAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGtt > 1:871159/1‑92 (MQ=255)
tAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTa > 1:3716833/1‑93 (MQ=255)
tAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTa < 1:476876/93‑1 (MQ=255)
aGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAt > 2:5702384/1‑93 (MQ=255)
aGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAt < 2:1193759/93‑1 (MQ=255)
gACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATg < 2:4087055/93‑1 (MQ=255)
cAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGt < 1:688970/93‑1 (MQ=255)
aaGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGtt < 2:4599063/93‑1 (MQ=255)
aGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGttt > 1:4208425/1‑93 (MQ=255)
aGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGttt < 1:2439615/93‑1 (MQ=255)
aGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGttt > 2:4248902/1‑93 (MQ=255)
cgcTCCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTtgt < 1:1945333/93‑1 (MQ=255)
cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGGTAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTtgt < 1:4362013/93‑1 (MQ=255)
cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTtgt < 2:4893492/93‑1 (MQ=255)
cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTtgt < 2:4869722/93‑1 (MQ=255)
cgcACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTtgt < 2:5822334/93‑1 (MQ=255)
aCCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGc > 2:5053631/1‑93 (MQ=255)
cATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTc > 1:1485705/1‑93 (MQ=255)
cATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTc < 1:498099/93‑1 (MQ=255)
gTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGTTTTCGGCTAAACTTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTa > 1:6307986/1‑93 (MQ=255)
gTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTa < 2:2582216/93‑1 (MQ=255)
gTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTa < 2:4712984/93‑1 (MQ=255)
gATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAc > 1:2349181/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAc > 1:4626918/1‑93 (MQ=255)
gATTTTGTTGTCACCTGTAATTGACAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAc > 1:3553801/1‑93 (MQ=255)
ttttGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCa < 1:3767761/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGt < 2:958700/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGt < 1:5394670/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGt < 1:2653702/93‑1 (MQ=255)
ttgttgTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGt < 1:4974032/93‑1 (MQ=255)
tgttgtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGtt < 2:5155912/93‑1 (MQ=255)
gttgtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTc > 2:5148274/1‑93 (MQ=255)
gttgtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTc < 1:2485605/93‑1 (MQ=255)
gttgtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTc < 2:4971751/93‑1 (MQ=255)
tgtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTg < 2:3892093/93‑1 (MQ=255)
gtCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTgg > 2:172096/1‑93 (MQ=255)
cACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGat < 2:3213068/93‑1 (MQ=255)
ccTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGatta < 2:1258073/93‑1 (MQ=255)
ccTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGatta < 2:6124137/93‑1 (MQ=255)
ccTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGatta < 1:4330854/93‑1 (MQ=255)
cTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGattat > 2:4446747/1‑93 (MQ=255)
tGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGattatt < 2:173262/93‑1 (MQ=255)
tAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTgg > 1:4408071/1‑93 (MQ=255)
aTTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGcc > 2:671101/1‑93 (MQ=255)
gATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAgg > 1:5681890/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGc > 1:1841582/1‑93 (MQ=255)
aTAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGc < 2:2704325/93‑1 (MQ=255)
aTAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGc < 2:4945658/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCt < 2:5752678/93‑1 (MQ=255)
tAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCt > 1:4114951/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCtta < 1:2822212/93‑3 (MQ=255)
aaGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGa > 1:2394311/1‑93 (MQ=255)
aaGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGa < 2:3711725/93‑1 (MQ=255)
aGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGaa < 1:5372561/93‑1 (MQ=255)
aGTGCGGTTTCGACTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGaa < 1:3238559/93‑1 (MQ=255)
gTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAt < 2:4374075/93‑1 (MQ=255)
gCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCt < 1:1790186/93‑1 (MQ=255)
ggTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTc < 1:5477156/93‑1 (MQ=255)
gTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCa > 1:272608/1‑93 (MQ=255)
tCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTa < 1:1493183/93‑1 (MQ=255)
tCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTa > 1:1032636/1‑93 (MQ=255)
cGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAt < 1:5491201/93‑1 (MQ=255)
ggCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAtt > 2:2203826/1‑93 (MQ=255)
ggCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAtt < 2:2584952/93‑1 (MQ=255)
gCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAttt < 1:297321/93‑1 (MQ=255)
gCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAttt < 1:3632824/93‑1 (MQ=255)
cTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTa > 2:2482874/1‑93 (MQ=255)
aaaCCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACt < 2:5534373/93‑1 (MQ=255)
aaaCCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACt > 2:5964459/1‑93 (MQ=255)
|
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT > NC_000913/715621‑715800
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAAC > NC_000913/715618‑715803
|
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAAC < SRR4302533.4740023/94‑1 (MQ=60)
TATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACC > SRR4302533.5000947/1‑94 (MQ=60)
TATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACC < SRR4302533.741624/94‑1 (MQ=60)
ATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCT > SRR4302533.5298072/1‑94 (MQ=60)
ATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCT < SRR4302533.6216235/94‑1 (MQ=60)
ATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGGTTCGGCTAAACCT > SRR4302533.6104010/1‑94 (MQ=60)
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTT < SRR4302533.5515201/94‑1 (MQ=60)
TCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTT < SRR4302533.5938739/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT < SRR4302533.2125103/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT < SRR4302533.173443/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT < SRR4302533.5964581/94‑1 (MQ=60)
CAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTT < SRR4302533.1822402/94‑1 (MQ=60)
ATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTAT < SRR4302533.4810514/94‑1 (MQ=60)
TCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATT < SRR4302533.1868467/94‑1 (MQ=60)
AGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAA > SRR4302533.2476711/1‑94 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAC < SRR4302533.5143713/94‑1 (MQ=60)
GCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAAC < SRR4302533.4606845/94‑1 (MQ=60)
AGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCG < SRR4302533.1321041/94‑1 (MQ=60)
AGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCG > SRR4302533.2199684/1‑94 (MQ=60)
GACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGG > SRR4302533.4325470/1‑94 (MQ=60)
GACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGG < SRR4302533.6329155/94‑1 (MQ=60)
GACCTCCGGAGCCATAGACAAGAGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGG < SRR4302533.2916499/94‑1 (MQ=60)
ACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGT > SRR4302533.3921963/1‑94 (MQ=60)
CCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTA < SRR4302533.3201270/94‑1 (MQ=60)
CCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTA < SRR4302533.2406769/94‑1 (MQ=60)
CCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGA < SRR4302533.1017285/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAG < SRR4302533.3459177/94‑1 (MQ=60)
CGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAG > SRR4302533.1194193/1‑94 (MQ=60)
CGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAG < SRR4302533.3661832/94‑1 (MQ=60)
GGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGT < SRR4302533.6325906/94‑1 (MQ=60)
GAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTT < SRR4302533.2613651/94‑1 (MQ=60)
GCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCG < SRR4302533.1634285/94‑1 (MQ=60)
CATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGT < SRR4302533.5426415/94‑1 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTT > SRR4302533.876272/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302533.3739648/1‑94 (MQ=60)
ATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTA > SRR4302533.3591215/1‑94 (MQ=60)
TAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAT < SRR4302533.378405/94‑1 (MQ=60)
TAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAT > SRR4302533.6106082/1‑94 (MQ=60)
TAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTAT < SRR4302533.479722/94‑1 (MQ=60)
GACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGG < SRR4302533.4208945/94‑1 (MQ=60)
ACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGT > SRR4302533.2782939/1‑94 (MQ=60)
ACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGT < SRR4302533.5807837/94‑1 (MQ=60)
CAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTT < SRR4302533.693042/94‑1 (MQ=60)
AAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTT > SRR4302533.4233886/1‑94 (MQ=60)
AGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTG < SRR4302533.2454680/94‑1 (MQ=60)
CGCTCCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTG < SRR4302533.1957197/94‑1 (MQ=60)
CGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGGTAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTG < SRR4302533.4388343/94‑1 (MQ=60)
GCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGG > SRR4302533.1671461/1‑94 (MQ=60)
CACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGC > SRR4302533.4073466/1‑94 (MQ=60)
CCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGT > SRR4302533.2691526/1‑94 (MQ=60)
CCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTC > SRR4302533.1494672/1‑94 (MQ=60)
CATCGTTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCT < SRR4302533.3039154/94‑1 (MQ=60)
CATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCT < SRR4302533.501066/94‑1 (MQ=60)
CATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCT < SRR4302533.3691539/94‑1 (MQ=60)
ATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTT > SRR4302533.2436869/1‑94 (MQ=60)
TCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTT < SRR4302533.1892084/94‑1 (MQ=60)
GGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGTTTTCGGCTAAACTTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTA > SRR4302533.6345832/1‑94 (MQ=60)
TGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAC > SRR4302533.2363714/1‑94 (MQ=60)
TGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAC > SRR4302533.4654961/1‑94 (MQ=60)
TGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGACAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAAC > SRR4302533.3575697/1‑94 (MQ=60)
GATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACC > SRR4302533.3860980/1‑94 (MQ=60)
TTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAG < SRR4302533.3790865/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT < SRR4302533.2670003/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT < SRR4302533.5427086/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT < SRR4302533.4650298/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTT < SRR4302533.5004191/94‑1 (MQ=60)
GTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCT < SRR4302533.2500921/94‑1 (MQ=60)
TTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTG < SRR4302533.3541481/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGG < SRR4302533.746146/94‑1 (MQ=60)
TGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGG < SRR4302533.2084014/94‑1 (MQ=60)
GTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGA > SRR4302533.1775645/1‑94 (MQ=60)
TCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGAT < SRR4302533.5294846/94‑1 (MQ=60)
CACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATT < SRR4302533.1449517/94‑1 (MQ=60)
CACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATT < SRR4302533.1584792/94‑1 (MQ=60)
CCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTAT < SRR4302533.4356946/94‑1 (MQ=60)
TGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTG < SRR4302533.5007520/94‑1 (MQ=60)
TGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTG > SRR4302533.4370640/1‑94 (MQ=60)
GTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGG > SRR4302533.4434690/1‑94 (MQ=60)
TGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGG > SRR4302533.5716209/1‑94 (MQ=60)
TGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGG < SRR4302533.88005/94‑1 (MQ=60)
TGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGG < SRR4302533.2602894/94‑1 (MQ=60)
GATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGC > SRR4302533.1852814/1‑94 (MQ=60)
ATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCT > SRR4302533.4139955/1‑94 (MQ=60)
AAAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGA > SRR4302533.2409090/1‑94 (MQ=60)
AAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTTAA < SRR4302533.2839581/94‑1 (MQ=60)
AAGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAA < SRR4302533.4714583/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT < SRR4302533.5404840/94‑1 (MQ=60)
AGTGCGGTTTCGACTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAAT < SRR4302533.3258518/94‑1 (MQ=60)
GTGCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATC > SRR4302533.3231769/1‑94 (MQ=60)
GCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTT > SRR4302533.1500716/1‑94 (MQ=60)
GCGGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTT < SRR4302533.1801074/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCA < SRR4302533.5434760/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCA > SRR4302533.274267/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCA < SRR4302533.5510170/94‑1 (MQ=60)
TTCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTA > SRR4302533.1038708/1‑94 (MQ=60)
TCGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTAT < SRR4302533.1502187/94‑1 (MQ=60)
CGGCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATT < SRR4302533.5524327/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTA < SRR4302533.299143/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTA < SRR4302533.3655173/94‑1 (MQ=60)
GCTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTA < SRR4302533.56534/94‑1 (MQ=60)
CTAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTAC < SRR4302533.3368029/94‑1 (MQ=60)
TAAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACT > SRR4302533.4571575/1‑94 (MQ=60)
AAACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTA < SRR4302533.5118516/94‑1 (MQ=60)
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ACCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAAC < SRR4302533.1289644/94‑1 (MQ=60)
|
TTATCAATCAGCAGACCTCCGGAGCCATAGACAAGCGCACCCATCGGTGATTTTGTTGTCACCTGTAATTGATAAAGTGCGGTTTCGGCTAAATCTTTATTAACCGGTAAGAGTTCGGTATGGTTTGTGGCGTCTTTTAACCAGTTCTGGATTATTGGCCAGGCTGAATCTTCAGTATTTACTAAC > NC_000913/715618‑715803
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
