Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > NC_000913/946469‑946655
|
GGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GG > SRR4302540.9599531/1‑94 (MQ=60)
GGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GG < SRR4302540.8887498/94‑1 (MQ=60)
GGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GG > SRR4302540.7098301/1‑94 (MQ=60)
GAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGC < SRR4302540.2113067/94‑1 (MQ=60)
GAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGC > SRR4302540.6434368/1‑94 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCT < SRR4302540.6025044/94‑1 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCT < SRR4302540.6850173/94‑1 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCT < SRR4302540.6025043/94‑1 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGGTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GC‑GGCT > SRR4302540.6777713/1‑94 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCCATGGTACAACATTGCGCTGATGGCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCT < SRR4302540.6850174/94‑1 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGgct < SRR4302540.622056/94‑4 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGgct < SRR4302540.5002156/94‑4 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGgct < SRR4302540.7286024/94‑4 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTG < SRR4302540.4283725/94‑1 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTG > SRR4302540.2977300/1‑94 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTG > SRR4302540.5172846/1‑94 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGG < SRR4302540.586033/94‑1 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGG > SRR4302540.821211/1‑94 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGG > SRR4302540.6491690/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGT < SRR4302540.1482543/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGG < SRR4302540.7023527/94‑1 (MQ=60)
CAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGG < SRR4302540.3609455/94‑1 (MQ=60)
TTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTG < SRR4302540.1132719/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTT < SRR4302540.7064531/94‑1 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTT < SRR4302540.6855821/94‑1 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTT < SRR4302540.3256133/94‑1 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTT > SRR4302540.1237733/1‑94 (MQ=60)
ctggtccgacatggcggTGATGTCTTGTATCACTGCGTGGGGTTTTGGCAATGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTT < SRR4302540.7317711/77‑1 (MQ=60)
ATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTT > SRR4302540.9130442/1‑94 (MQ=60)
TGGTACACCATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCACACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTT > SRR4302540.6340762/1‑94 (MQ=60)
TGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTT > SRR4302540.6340761/1‑94 (MQ=60)
GGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTT > SRR4302540.6531408/1‑94 (MQ=60)
GGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTC < SRR4302540.5153142/94‑1 (MQ=60)
GTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTC > SRR4302540.8319189/1‑94 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT < SRR4302540.5386213/94‑1 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT < SRR4302540.6381635/94‑1 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGG < SRR4302540.4989080/94‑1 (MQ=60)
ACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGG < SRR4302540.1327292/94‑1 (MQ=60)
ACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGT < SRR4302540.5740251/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGT > SRR4302540.7007780/1‑94 (MQ=60)
CATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG < SRR4302540.2774742/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG > SRR4302540.6703168/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG > SRR4302540.8492457/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTT < SRR4302540.940827/94‑1 (MQ=60)
TTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTT > SRR4302540.7258965/1‑94 (MQ=60)
TTGCGCTGATGTCCTTTATCACTGTCTGGGGGTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGCTGTTTTTTAATGGGTGCT > SRR4302540.7258964/1‑94 (MQ=60)
TGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTT > SRR4302540.1306160/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTT > SRR4302540.119389/1‑94 (MQ=60)
GCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTT < SRR4302540.7147389/94‑1 (MQ=60)
CGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTA < SRR4302540.8593502/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGTTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAT < SRR4302540.6098179/94‑1 (MQ=60)
GCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAT > SRR4302540.4772871/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAT < SRR4302540.6396396/94‑1 (MQ=60)
CTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCT < SRR4302540.7640401/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCT > SRR4302540.4476786/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTT > SRR4302540.9320101/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTT < SRR4302540.6830735/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAAATACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTT < SRR4302540.4711956/94‑1 (MQ=60)
GATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTT > SRR4302540.7711813/1‑94 (MQ=60)
GATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTT < SRR4302540.3959039/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG > SRR4302540.4381835/1‑94 (MQ=60)
ATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302540.6055042/94‑1 (MQ=60)
ATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTGGTTTTTTCttggtgtttattctttt > SRR4302540.5030094/1‑77 (MQ=60)
TGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302540.7516153/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302540.2221370/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302540.319680/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCA > SRR4302540.1555171/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCA < SRR4302540.5575992/94‑1 (MQ=60)
TCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAC < SRR4302540.8806918/94‑1 (MQ=60)
CTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACT > SRR4302540.7780165/1‑94 (MQ=60)
TTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTA > SRR4302540.9984895/1‑94 (MQ=60)
TATCACTGTCTGTGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAT < SRR4302540.3604479/94‑1 (MQ=60)
ATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAT < SRR4302540.3735997/94‑1 (MQ=60)
ATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT < SRR4302540.2908148/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT < SRR4302540.5042790/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT < SRR4302540.6228478/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT < SRR4302540.6228175/94‑1 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT > SRR4302540.4572873/1‑94 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGGTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT > SRR4302540.4572872/1‑94 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTT < SRR4302540.2642748/94‑1 (MQ=60)
CACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTC > SRR4302540.5336312/1‑94 (MQ=60)
ACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCA > SRR4302540.1914877/1‑94 (MQ=60)
CTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCA > SRR4302540.1688120/1‑94 (MQ=60)
CTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCA > SRR4302540.5683161/1‑94 (MQ=60)
CTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCAC < SRR4302540.4842261/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACA > SRR4302540.4982590/1‑94 (MQ=60)
GTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAC < SRR4302540.3044906/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAC < SRR4302540.6380043/94‑1 (MQ=60)
TCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACC < SRR4302540.8609189/94‑1 (MQ=60)
TGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCT > SRR4302540.2051945/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCT < SRR4302540.8946799/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACGTT < SRR4302540.6527405/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTT < SRR4302540.6527406/94‑1 (MQ=60)
GGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTA < SRR4302540.9152321/94‑1 (MQ=60)
GGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302540.9532471/94‑1 (MQ=60)
GGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302540.8590696/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302540.5847635/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302540.7313726/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATG < SRR4302540.925370/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGC > SRR4302540.4280549/1‑94 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGGGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGC > SRR4302540.4280548/1‑94 (MQ=60)
TTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCG < SRR4302540.20860/94‑1 (MQ=60)
TGTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGTGGCTGGTGGTTGTTTGTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCG < SRR4302540.20859/94‑1 (MQ=60)
TGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGGTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTA > SRR4302540.5812856/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTTGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATT > SRR4302540.3861192/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGT < SRR4302540.6839631/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGTGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTT < SRR4302540.5116344/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTT < SRR4302540.849743/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTG < SRR4302540.8527476/94‑1 (MQ=60)
TTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTG < SRR4302540.3011684/94‑1 (MQ=60)
TTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTG < SRR4302540.4774340/94‑1 (MQ=60)
TTGTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTG < SRR4302540.7442226/94‑1 (MQ=60)
TGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGT > SRR4302540.5513982/1‑94 (MQ=60)
GTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGT < SRR4302540.1747472/94‑1 (MQ=60)
GTTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGT < SRR4302540.7970412/94‑1 (MQ=60)
TTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTTGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTC < SRR4302540.7920694/94‑1 (MQ=60)
TTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTC > SRR4302540.8348427/1‑94 (MQ=60)
TTAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTC < SRR4302540.7920693/94‑1 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCA < SRR4302540.5928629/94‑1 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAACTTATGCGCTAATTGTTGGTCA < SRR4302540.1868938/94‑1 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAG > SRR4302540.8865064/1‑94 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAG < SRR4302540.10066015/94‑1 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAG < SRR4302540.3073125/94‑1 (MQ=60)
ATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTT < SRR4302540.7150133/94‑1 (MQ=60)
AACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA < SRR4302540.5840685/94‑1 (MQ=60)
AACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTGCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA < SRR4302540.9376206/94‑1 (MQ=60)
AACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302540.103172/94‑1 (MQ=60)
AACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302540.1181631/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302540.7267948/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302540.5937018/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302540.450419/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGG < SRR4302540.9935672/94‑1 (MQ=60)
CTATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGG < SRR4302540.3123924/94‑1 (MQ=60)
CTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGC > SRR4302540.7086915/1‑94 (MQ=60)
TATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATTCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCT < SRR4302540.9965966/94‑1 (MQ=60)
TATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCT < SRR4302540.582736/94‑1 (MQ=60)
ATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCT > SRR4302540.3389413/1‑94 (MQ=60)
ATGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGGGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCATTTAGGCT > SRR4302540.5977020/1‑94 (MQ=60)
TGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTC < SRR4302540.1868302/94‑1 (MQ=60)
TGCCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTC < SRR4302540.1868301/94‑1 (MQ=60)
CCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGA > SRR4302540.4942536/1‑94 (MQ=60)
CCAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGA > SRR4302540.1674210/1‑94 (MQ=60)
CAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATTGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAC > SRR4302540.4501397/1‑94 (MQ=60)
CAACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAC < SRR4302540.2069540/94‑1 (MQ=60)
AACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACC > SRR4302540.7054418/1‑94 (MQ=60)
AACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACC < SRR4302540.8827070/94‑1 (MQ=60)
AACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCT > SRR4302540.6403234/1‑94 (MQ=60)
ACCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCT < SRR4302540.5941213/94‑1 (MQ=60)
CCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTT > SRR4302540.7965792/1‑94 (MQ=60)
CCAGGG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGGGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTT > SRR4302540.5259471/1‑94 (MQ=60)
CCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTC > SRR4302540.8955011/1‑94 (MQ=60)
CCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTC < SRR4302540.2542546/94‑1 (MQ=60)
CA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCA < SRR4302540.399247/94‑1 (MQ=60)
GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAA > SRR4302540.10049962/1‑94 (MQ=60)
G‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAACG > SRR4302540.6754666/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGA > SRR4302540.1218184/1‑94 (MQ=60)
GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGA > SRR4302540.619184/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCTCTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT < SRR4302540.940135/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > SRR4302540.1734571/1‑94 (MQ=60)
GCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT < SRR4302540.728254/94‑1 (MQ=60)
|
GGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GG‑GGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > NC_000913/946469‑946655
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
