Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
946,562 |
+G |
coding (303/1623 nt) |
b0899 → |
putative transport |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 946,558 | 1 | . | G | 100.0%
| 605.8
/ NA
| 186 | Q100R (CAG→CGG) | b0899 | putative transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (88/98); total (88/98) |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAC > NC_000913/946466‑946645
|
cAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑g < 2:1377160/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gg > 2:5632552/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gg < 2:2728807/93‑1 (MQ=255)
aGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gg > 1:5496966/1‑93 (MQ=255)
aGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGGCTTTTATCACTTTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATTACTATGCCAACCA‑gg > 1:1196899/1‑93 (MQ=255)
ggAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCCACCA‑ggg > 2:2630684/1‑93 (MQ=255)
ggAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑ggg > 1:5042621/1‑93 (MQ=255)
gAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gggg < 2:3758545/93‑1 (MQ=255)
aaaaaCAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑ggggg < 1:1697654/93‑2 (MQ=255)
aaaaaCAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑ggggg > 2:2031879/1‑92 (MQ=255)
aaaaCAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gggggc > 1:4675214/1‑91 (MQ=255)
aaaCAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑gggggct > 1:2730639/1‑90 (MQ=255)
cGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGgttgt < 1:2788541/93‑1 (MQ=255)
gATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGgttgtt < 1:3476097/93‑1 (MQ=255)
gATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGgttgtt > 1:5282699/1‑93 (MQ=255)
aTGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGttt < 2:549698/93‑1 (MQ=255)
tGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGtttt < 2:3917798/93‑1 (MQ=255)
tGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGtttt > 2:4568957/1‑93 (MQ=255)
acaacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCa < 1:5961826/93‑1 (MQ=255)
acaacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCa < 2:1922839/93‑1 (MQ=255)
acaacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCa > 1:2914043/1‑93 (MQ=255)
aacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATg < 1:4256459/93‑1 (MQ=255)
aacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATg > 2:1538731/1‑93 (MQ=255)
aacaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATg < 1:1974368/93‑1 (MQ=255)
acaTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATgg < 2:1425389/93‑1 (MQ=255)
caTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATggg < 1:3662070/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGgt < 2:3117382/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGgt < 1:1043096/93‑1 (MQ=255)
aTTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGgt < 2:3051252/93‑1 (MQ=255)
tGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGgtgt < 1:3205210/93‑1 (MQ=255)
cgcTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGttt > 1:3284251/1‑93 (MQ=255)
gcTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTa < 1:301003/93‑1 (MQ=255)
gcTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTa > 2:1200992/1‑93 (MQ=255)
cTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAt > 1:3892976/1‑93 (MQ=255)
cTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAt < 2:4141974/93‑1 (MQ=255)
cTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAt > 2:2226029/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATc < 2:2264785/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATc < 2:1814785/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATc > 2:3267677/1‑93 (MQ=255)
tGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATc < 2:5224559/93‑1 (MQ=255)
tGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATc < 1:5754398/93‑1 (MQ=255)
gATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCt > 1:2328072/1‑93 (MQ=255)
tGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCttt < 1:6276917/93‑1 (MQ=255)
tGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCttt < 1:2447708/93‑1 (MQ=255)
gTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTg > 2:6197825/1‑93 (MQ=255)
tCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGc < 2:2158948/93‑1 (MQ=255)
tCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGc > 1:263489/1‑93 (MQ=255)
ttttATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAc > 2:583446/1‑93 (MQ=255)
ttttATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAc > 1:1413344/1‑93 (MQ=255)
ttATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCActc < 2:2575160/93‑1 (MQ=255)
ttATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCActc < 2:4318190/93‑1 (MQ=255)
ttATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCActc > 2:4602778/1‑93 (MQ=255)
tATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCActct > 2:6292940/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGGCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGTACTCTAt > 2:2798921/1‑93 (MQ=255)
tCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAt < 1:3802094/93‑1 (MQ=255)
cACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTAtt < 1:5379546/93‑1 (MQ=255)
gTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTcac > 1:5578095/1‑93 (MQ=255)
tCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTcaca > 2:4390394/1‑93 (MQ=255)
cTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCacac < 2:4633908/93‑1 (MQ=255)
cTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCacac > 2:1084984/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAcc > 2:3414571/1‑93 (MQ=255)
tGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACAcc < 1:3780971/93‑1 (MQ=255)
ggggTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCt > 1:4437060/1‑93 (MQ=255)
ggggTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCt > 2:2754765/1‑93 (MQ=255)
gggTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCtt < 2:849229/93‑1 (MQ=255)
gggTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCtt > 1:1228206/1‑93 (MQ=255)
gTTTTGGCCACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAt > 2:6138351/1‑93 (MQ=255)
gTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAt < 1:15380/93‑1 (MQ=255)
ttGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATgcg > 1:1332413/1‑93 (MQ=255)
gCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTCTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTa < 2:5072977/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAtt < 2:2417060/93‑1 (MQ=255)
aCGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAtt < 2:2359111/93‑1 (MQ=255)
gttgttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAttgt > 1:6035728/1‑93 (MQ=255)
gttgttAATAACTATGCCAACCAGGGGGATGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTTACACCTTATGCGCTAAttgt > 2:2496926/1‑93 (MQ=255)
ttgttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAttgtt > 2:2932690/1‑93 (MQ=255)
ttgttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAttgtt < 2:72075/93‑1 (MQ=255)
ttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGt > 2:4778250/1‑93 (MQ=255)
ttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGt < 2:4893245/93‑1 (MQ=255)
ttAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGt > 1:6113971/1‑93 (MQ=255)
ataaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAg > 2:744139/1‑93 (MQ=255)
taaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGt < 2:5455595/93‑1 (MQ=255)
aaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGtt < 1:1910367/93‑1 (MQ=255)
aaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGtt < 2:5923925/93‑1 (MQ=255)
aaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGtt > 1:2576040/1‑93 (MQ=255)
aaCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGtt < 2:2885388/93‑1 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCGTGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa < 1:2081001/93‑1 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa < 1:5689734/93‑1 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa > 1:1513521/1‑93 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa > 2:3811797/1‑93 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa < 2:2949385/93‑1 (MQ=255)
aCTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTa > 1:4947141/1‑93 (MQ=255)
cTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAg < 2:4034383/93‑1 (MQ=255)
cTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAg > 1:173716/1‑93 (MQ=255)
aTGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGc > 2:2013947/1‑93 (MQ=255)
tGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCt > 1:5407781/1‑93 (MQ=255)
gCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTc < 2:4442887/93‑1 (MQ=255)
ccAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCg > 1:1613429/1‑93 (MQ=255)
cAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGa < 2:1505227/93‑1 (MQ=255)
aaCCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAc > 1:79980/1‑93 (MQ=255)
aaCCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAc > 2:1670660/1‑93 (MQ=255)
|
TCAGGAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAC > NC_000913/946466‑946645
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > NC_000913/946470‑946655
|
GAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGG < SRR4302533.3451798/94‑1 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGgc > SRR4302533.4703544/1‑92 (MQ=60)
AAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGgc < SRR4302533.1707937/94‑3 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGgct > SRR4302533.2747390/1‑91 (MQ=60)
AAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGgct < SRR4302533.1406626/94‑4 (MQ=60)
AAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTG > SRR4302533.5688036/1‑94 (MQ=60)
ACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGT < SRR4302533.4198902/94‑1 (MQ=60)
GTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGT > SRR4302533.1068081/1‑94 (MQ=60)
TGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTG < SRR4302533.5408141/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTT < SRR4302533.2805680/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTT > SRR4302533.5314346/1‑94 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTT < SRR4302533.1944615/94‑1 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTT > SRR4302533.2089980/1‑94 (MQ=60)
GATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTT < SRR4302533.3497546/94‑1 (MQ=60)
ATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTT < SRR4302533.3865432/94‑1 (MQ=60)
TGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTT < SRR4302533.1559601/94‑1 (MQ=60)
GTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTC < SRR4302533.5331678/94‑1 (MQ=60)
TACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCA > SRR4302533.2931920/1‑94 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT > SRR4302533.2945939/1‑94 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT > SRR4302533.3735954/1‑94 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT < SRR4302533.5997894/94‑1 (MQ=60)
ACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCAT > SRR4302533.4806890/1‑94 (MQ=60)
CAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATG < SRR4302533.360307/94‑1 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGG < SRR4302533.4282121/94‑1 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGG > SRR4302533.2782902/1‑94 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGG < SRR4302533.1986457/94‑1 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGG < SRR4302533.605588/94‑1 (MQ=60)
AACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGG < SRR4302533.3882852/94‑1 (MQ=60)
CATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGT < SRR4302533.3684584/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG < SRR4302533.2594728/94‑1 (MQ=60)
ATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG > SRR4302533.2398768/1‑94 (MQ=60)
ATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTG < SRR4302533.1049230/94‑1 (MQ=60)
TGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTT < SRR4302533.3224943/94‑1 (MQ=60)
GCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTT > SRR4302533.3304524/1‑94 (MQ=60)
CGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTA > SRR4302533.1620109/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAT > SRR4302533.3916736/1‑94 (MQ=60)
GCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTAT < SRR4302533.302844/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCT > SRR4302533.2342484/1‑94 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCT < SRR4302533.5789119/94‑1 (MQ=60)
TGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCT > SRR4302533.5427490/1‑94 (MQ=60)
GATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTT > SRR4302533.4991877/1‑94 (MQ=60)
ATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTT < SRR4302533.5503053/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302533.2462812/94‑1 (MQ=60)
TGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTG < SRR4302533.6314397/94‑1 (MQ=60)
GTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGC > SRR4302533.6276413/1‑94 (MQ=60)
GTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGC > SRR4302533.265086/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAC > SRR4302533.1421891/1‑94 (MQ=60)
CTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCAC > SRR4302533.4256717/1‑94 (MQ=60)
TATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTA > SRR4302533.245162/1‑94 (MQ=60)
TCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATT < SRR4302533.3825362/94‑1 (MQ=60)
CACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTT < SRR4302533.5411869/94‑1 (MQ=60)
CACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTT > SRR4302533.1231619/1‑94 (MQ=60)
ACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTC < SRR4302533.3229649/94‑1 (MQ=60)
TGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCAC > SRR4302533.1635567/1‑94 (MQ=60)
TGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCAC > SRR4302533.5611807/1‑94 (MQ=60)
CTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACC > SRR4302533.5868334/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCT > SRR4302533.4463882/1‑94 (MQ=60)
TGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCT < SRR4302533.3804131/94‑1 (MQ=60)
GGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTT > SRR4302533.1235559/1‑94 (MQ=60)
GGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302533.252061/94‑1 (MQ=60)
GGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTAT < SRR4302533.1732655/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATG < SRR4302533.3128500/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATG < SRR4302533.273417/94‑1 (MQ=60)
GTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATG < SRR4302533.15487/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCG < SRR4302533.6102780/94‑1 (MQ=60)
TTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCG > SRR4302533.1340410/1‑94 (MQ=60)
GGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTA < SRR4302533.801146/94‑1 (MQ=60)
CAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAAT > SRR4302533.1527269/1‑94 (MQ=60)
AACGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATT < SRR4302533.5580363/94‑1 (MQ=60)
CGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGT > SRR4302533.4421726/1‑94 (MQ=60)
CGTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGT > SRR4302533.6072305/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTT > SRR4302533.5729893/1‑94 (MQ=60)
TGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGG > SRR4302533.3820324/1‑94 (MQ=60)
TGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGG < SRR4302533.1484558/94‑1 (MQ=60)
TGTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGG > SRR4302533.2814656/1‑94 (MQ=60)
GTTAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGT > SRR4302533.6150865/1‑94 (MQ=60)
TAATAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGCGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCA > SRR4302533.52026/1‑94 (MQ=60)
TAACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTT > SRR4302533.2591888/1‑94 (MQ=60)
AACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA > SRR4302533.4977091/1‑94 (MQ=60)
AACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA < SRR4302533.1922021/94‑1 (MQ=60)
AACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTA > SRR4302533.1522643/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCGTGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302533.2093808/94‑1 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG > SRR4302533.174811/1‑94 (MQ=60)
ACTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAG < SRR4302533.5724100/94‑1 (MQ=60)
CTATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGG > SRR4302533.2939926/1‑94 (MQ=60)
TATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGC > SRR4302533.5976549/1‑94 (MQ=60)
ATGCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCT > SRR4302533.5440278/1‑94 (MQ=60)
GCCAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCG > SRR4302533.1623208/1‑94 (MQ=60)
CAACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGAC > SRR4302533.80492/1‑94 (MQ=60)
AACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACC < SRR4302533.2313502/94‑1 (MQ=60)
ACCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCT > SRR4302533.1356325/1‑94 (MQ=60)
CCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTT > SRR4302533.2974688/1‑94 (MQ=60)
CCAGGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTT > SRR4302533.3007313/1‑94 (MQ=60)
cagGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTC > SRR4302533.2495754/4‑94 (MQ=60)
cagGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTC > SRR4302533.1194080/4‑94 (MQ=60)
agGGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCA > SRR4302533.190342/3‑94 (MQ=60)
GGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAG < SRR4302533.134919/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTTTTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT < SRR4302533.3769487/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT < SRR4302533.1307759/94‑1 (MQ=60)
GCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > SRR4302533.3034618/1‑94 (MQ=60)
|
GAAAAACAGTTGCGATGGTACAACATTGCGCTGATGTCTTTTATCACTGTCTGGGGTTTTGGCAACGTTGTTAATAACTATGCCAACCA‑GGGGCTGGTGGTTGTTTTTTCATGGGTGTTTATCTTTGCACTCTATTTCACACCTTATGCGCTAATTGTTGGTCAGTTAGGCTCGACCTTCAAAGAT > NC_000913/946470‑946655
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
