Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
1548 |
369.5 |
20095359 |
96.9% |
19472402 |
93.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 528 total aligned reads displayed.
TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC > NC_000913/1949379‑1949565
|
TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT < SRR4302540.3350405/94‑1 (MQ=60)
CGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTGGCATCCTAAGTGGGTGCGGGTGGGT‑A > SRR4302540.8453518/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT < SRR4302540.5423927/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT < SRR4302540.6524028/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT < SRR4302540.6559503/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT > SRR4302540.951472/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑AT < SRR4302540.1361530/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑AT > SRR4302540.7490231/1‑94 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑AT < SRR4302540.3603895/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑AT < SRR4302540.9291125/94‑1 (MQ=60)
GCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑AT > SRR4302540.9481182/1‑94 (MQ=60)
CCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATC < SRR4302540.4983166/94‑1 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCA > SRR4302540.3870383/1‑94 (MQ=60)
CCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCA > SRR4302540.3709572/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCAC < SRR4302540.540848/94‑1 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCAC < SRR4302540.1028359/94‑1 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCAC > SRR4302540.5178150/1‑94 (MQ=60)
CGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCAC > SRR4302540.8877183/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACTTCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302540.6637237/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC > SRR4302540.8042572/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACC > SRR4302540.4800232/1‑94 (MQ=60)
GTGTGCGTAGCGCGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACC < SRR4302540.7587271/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302540.1859057/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302540.4891194/94‑1 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG > SRR4302540.9197832/1‑94 (MQ=60)
GTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAG < SRR4302540.3520847/94‑1 (MQ=60)
TGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGTGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGC > SRR4302540.2413400/1‑94 (MQ=60)
TGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGC > SRR4302540.5537659/1‑94 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCC < SRR4302540.4394034/94‑1 (MQ=60)
GCGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCACCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGCTGGGT‑ATCACCAGCC > SRR4302540.1931628/1‑94 (MQ=60)
GGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCAGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCT < SRR4302540.6108647/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCT < SRR4302540.9010176/94‑1 (MQ=60)
CGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCT > SRR4302540.6177370/1‑94 (MQ=60)
GTATCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTT > SRR4302540.7361131/1‑94 (MQ=60)
GTAGCGTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTT > SRR4302540.1854229/1‑94 (MQ=60)
AGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGA > SRR4302540.1946276/1‑94 (MQ=60)
GCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAA < SRR4302540.1336992/94‑1 (MQ=60)
GCGGGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGTTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAA < SRR4302540.7869905/94‑1 (MQ=60)
CGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAG > SRR4302540.4572474/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302540.2274296/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302540.2197415/1‑94 (MQ=60)
GTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGA > SRR4302540.5592574/1‑94 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302540.6496790/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAG < SRR4302540.6900121/94‑1 (MQ=60)
TGGAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAG > SRR4302540.8201065/1‑94 (MQ=60)
GAAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTA > SRR4302540.2041223/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTATATCGGTCTGCGGCAAAGGTCGCATCCTAACTGGGTGTGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.5206629/94‑1 (MQ=53)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.8504084/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.1163851/94‑1 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT > SRR4302540.3410054/1‑94 (MQ=60)
AAGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTAT < SRR4302540.10069025/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302540.1010302/94‑1 (MQ=60)
AGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATG < SRR4302540.9274666/94‑1 (MQ=60)
GAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTACATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGC > SRR4302540.5391330/1‑94 (MQ=60)
GAGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGC > SRR4302540.1898728/1‑94 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC < SRR4302540.6463598/94‑1 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC > SRR4302540.4071023/1‑94 (MQ=60)
AGATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCC < SRR4302540.6829332/94‑1 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC > SRR4302540.3152432/1‑94 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC > SRR4302540.8419277/1‑94 (MQ=60)
GATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCC < SRR4302540.3952878/94‑1 (MQ=60)
ATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG < SRR4302540.6250729/94‑1 (MQ=60)
ATCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG < SRR4302540.3292923/94‑1 (MQ=60)
ATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCG > SRR4302540.3763972/1‑94 (MQ=60)
TCCTTCACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302540.6438837/1‑94 (MQ=60)
TCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGC > SRR4302540.1963946/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT > SRR4302540.7089895/1‑94 (MQ=60)
CAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACT > SRR4302540.2488265/1‑94 (MQ=60)
AACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTT > SRR4302540.7474287/1‑94 (MQ=60)
CCGCGTTATGATTGACATCGGTCCCCCGCAAGGATCGCATCCAAAATGGGTCCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.3532462/94‑1 (MQ=50)
ACGCGTTATGATTTACATCGTTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGGCACTTT > SRR4302540.2578377/1‑94 (MQ=60)
ACGCGTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.7924038/94‑1 (MQ=60)
ACGCGTTATCATTTACCGCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTT < SRR4302540.2785130/94‑1 (MQ=60)
CGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTA > SRR4302540.3145695/1‑94 (MQ=60)
CGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAAC > SRR4302540.207309/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCTCGCCACTATAACG > SRR4302540.701775/1‑94 (MQ=60)
GTTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACT > SRR4302540.5957268/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.4748444/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.8936669/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.4950726/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG > SRR4302540.9577366/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGCGGTTGGGT‑ATCACCATCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAGCTG > SRR4302540.7732091/1‑94 (MQ=60)
TTATGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG < SRR4302540.869324/94‑1 (MQ=60)
TTATGATGTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTG < SRR4302540.6970646/94‑1 (MQ=60)
tgaATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCG < SRR4302540.8911464/91‑1 (MQ=60)
TGATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGT > SRR4302540.5936981/1‑94 (MQ=60)
gattcacagcggtgtgccacagTGGTCGCATCATAAGGGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCGGCTTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302540.9707495/72‑1 (MQ=24)
GATTTACCTCGGTCGGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302540.2554450/94‑1 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302540.506362/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302540.10152284/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG > SRR4302540.8268825/1‑94 (MQ=60)
GATTTACATCGGCCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTGGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTG < SRR4302540.8076390/94‑1 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302540.598725/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302540.9005349/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGGTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGA > SRR4302540.6318583/1‑94 (MQ=60)
ATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGG > SRR4302540.7217921/1‑94 (MQ=60)
ttaacagcggtctgcgcCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGTGGTTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGac < SRR4302540.4710936/77‑3 (MQ=54)
TTTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGac > SRR4302540.7715026/1‑92 (MQ=60)
ttacttggctctcCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACAGGCCTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAG < SRR4302540.4036639/81‑1 (MQ=60)
TTACATCGTCCTGCCGCAATGGTCGCCTCCTAAAGGGGTGCGGTTGGGT‑ACCCCCAGCCTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302540.9926750/94‑4 (MQ=52)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg > SRR4302540.825577/1‑91 (MQ=60)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg > SRR4302540.3170887/1‑91 (MQ=60)
TTACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTAAAGAGTTTGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacg < SRR4302540.3430883/94‑4 (MQ=60)
TACGTCGGTCTACCGCAATGGTCGCACCAAAAAGGGGTGCGGTTGGTG‑ATCCCCACCCTGGAAGAGTAGGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGG < SRR4302540.5461538/94‑1 (MQ=44)
TACATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgc > SRR4302540.5914844/1‑90 (MQ=60)
TACATCGGTCTGCCCAAATGGTCGCATCATAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgc < SRR4302540.321667/94‑5 (MQ=60)
ccacCGGTCTGCCGCAAGGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcg < SRR4302540.1127420/90‑6 (MQ=60)
CAGCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGGGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgg < SRR4302540.8553659/94‑7 (MQ=60)
ATCGGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcggg > SRR4302540.1416614/1‑87 (MQ=60)
ATCGGTCCACCGCATTGGTCGCACCCAAAAGGGGTGTTGTTGGGG‑ACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCA < SRR4302540.8423718/94‑1 (MQ=60)
ggtctgccgtaattctcccatccgaagggggttgGGTTGGGT‑ATCACCGGCCGTGAAGGGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat < SRR4302540.7941848/60‑11 (MQ=28)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGCAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTcacgcgggcct > SRR4302540.7027780/1‑83 (MQ=60)
GGTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat > SRR4302540.725722/1‑84 (MQ=60)
GGCCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGGGGGGTGGGGT‑ATCCCGAGCCTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcat < SRR4302540.3080266/94‑11 (MQ=44)
GTCTGCCGCAATGTTCGCATCCAAAAGGGGTGCGTTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatt < SRR4302540.619810/94‑12 (MQ=57)
GTCTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatt < SRR4302540.1695186/94‑12 (MQ=60)
GTCTCCCGCAATGGTCCCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatt < SRR4302540.1486768/94‑12 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302540.2473557/1‑81 (MQ=60)
CTGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttt > SRR4302540.2645193/1‑81 (MQ=60)
CTACCGCATTGGACGCATCATAATTGGGTGCGGTTGGTA‑ATCACCAGCCTAGAAGAGTATTTCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA < SRR4302540.4915430/94‑1 (MQ=53)
CTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCA > SRR4302540.9669461/1‑94 (MQ=60)
gcccgcaagggcccccaCCTAAATGGGTCCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTGAAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCAC < SRR4302540.7836382/77‑1 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302540.5660407/1‑80 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302540.603575/1‑80 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta > SRR4302540.2429268/1‑80 (MQ=60)
TGCCGCAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGCGTTTGGGT‑ACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatttta < SRR4302540.602341/94‑15 (MQ=60)
ACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACC > SRR4302540.4589722/1‑94 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaa > SRR4302540.310577/1‑77 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaa > SRR4302540.7523699/1‑77 (MQ=60)
CGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCT < SRR4302540.1681089/94‑1 (MQ=60)
caAATGGTCGCATCCTAAAGGGGTGGGGTTGGGG‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTT < SRR4302540.4728077/92‑1 (MQ=60)
GCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaa > SRR4302540.7191644/1‑76 (MQ=60)
GCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaa > SRR4302540.7461376/1‑76 (MQ=60)
GCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaa > SRR4302540.1561730/1‑76 (MQ=60)
GAAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaa < SRR4302540.6677316/94‑19 (MQ=60)
AATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatc > SRR4302540.8583114/1‑74 (MQ=60)
AATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatc > SRR4302540.4517013/1‑74 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGGGGTGGGTT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca < SRR4302540.550966/94‑22 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatct > SRR4302540.9469787/1‑73 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca > SRR4302540.3827200/1‑73 (MQ=60)
ATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca > SRR4302540.419310/1‑73 (MQ=60)
AGGGTCCCATCCTAAATGGGTGGGTTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatca < SRR4302540.2866941/94‑22 (MQ=60)
gggtccccTCCTAAATGGGGGCGGTTGGGT‑ATCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcac < SRR4302540.9685448/86‑23 (MQ=60)
TGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcac > SRR4302540.2336066/1‑72 (MQ=60)
GTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGGGTATGCCCGCGACTTTAACTGCGTGacgggggaattttcaaaatcacta > SRR4302540.8305861/1‑70 (MQ=60)
CGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaa > SRR4302540.2560976/1‑68 (MQ=60)
CGCATCCAAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ACCCCCAGCCTTGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaa < SRR4302540.5699491/94‑27 (MQ=54)
ctttcttaaagggggGCGGTTGGGC‑ACCACCAGCTTTAAAGAGTCTCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTG < SRR4302540.8616597/79‑1 (MQ=60)
GCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaag > SRR4302540.3561114/1‑67 (MQ=60)
GCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaag > SRR4302540.676586/1‑67 (MQ=60)
GCATCATAAGGGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaag < SRR4302540.1749676/94‑28 (MQ=60)
CCATCCTAAGTGGGTGCGTTTGGGT‑ACCACCACCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaag < SRR4302540.13216/94‑28 (MQ=49)
CATCTTAAATGGGGGCGGTTGGGT‑ACCCCCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaaga < SRR4302540.8373434/94‑29 (MQ=50)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaaga > SRR4302540.318847/1‑66 (MQ=60)
CATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGC > SRR4302540.9115536/1‑94 (MQ=60)
TTCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCCCCAGCTTGGAAAAGTAGCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCC < SRR4302540.4450658/94‑1 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302540.9862768/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302540.1141259/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302540.4367538/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaa > SRR4302540.6285826/1‑65 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCC > SRR4302540.2300893/1‑94 (MQ=60)
ATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGAGGAGGGCAACACGACGCTTTACGCCCTGCC > SRR4302540.7077809/1‑94 (MQ=60)
TCTTAAATGGGTGGGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTGGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302540.9191228/94‑31 (MQ=51)
TCTTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302540.9381686/94‑31 (MQ=60)
TCCTAAATGGGTGTGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac < SRR4302540.201200/94‑31 (MQ=60)
TCCTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaac > SRR4302540.6577180/1‑64 (MQ=60)
TCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCG > SRR4302540.1533649/1‑94 (MQ=60)
CCTAAATGGGTGCGTTGGGGT‑ATCCCCAGCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacg < SRR4302540.7383798/94‑32 (MQ=43)
CCTAAAGGGGTGGGGTTGGGT‑ATCCCCACCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacg < SRR4302540.5305948/94‑32 (MQ=43)
CTAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacacgggcattttacacatcactaaagaacgc > SRR4302540.2446710/1‑62 (MQ=60)
TAAATGGGTGCGTTTGGGT‑ATCCCCAGCTTTGAAGAGGATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcaggcattttaaaaatcactaaagaacgcc < SRR4302540.2858069/94‑34 (MQ=39)
TAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcc > SRR4302540.3645888/1‑61 (MQ=60)
TAAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcc > SRR4302540.8714673/1‑61 (MQ=60)
AAATGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCCTGGAAGATTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgccc < SRR4302540.1832133/94‑35 (MQ=52)
AAATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgccc > SRR4302540.2950406/1‑60 (MQ=60)
AGTGGGTGCGGTGGGGG‑ATCACCAGCTTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACC < SRR4302540.6729133/94‑1 (MQ=60)
AATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgccca > SRR4302540.9355927/1‑59 (MQ=60)
AATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACC > SRR4302540.7565613/1‑94 (MQ=60)
ATGGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaa > SRR4302540.8654888/1‑58 (MQ=60)
GGGGTGCGGTTGGTT‑ATCACCAGCTTGGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaag < SRR4302540.8138610/94‑38 (MQ=41)
GGGTGGGGTTGGGT‑ATCACCAGCTTTGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaaga < SRR4302540.57754/94‑39 (MQ=42)
GGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaaga > SRR4302540.2160603/1‑56 (MQ=60)
GGGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcggccattttaaaaatcactaaagaacgcacaaga > SRR4302540.4471826/1‑56 (MQ=60)
GGTGCGTTTGGGT‑ACCACCACCTTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagag < SRR4302540.5361676/94‑40 (MQ=31)
GGTGCGGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagag > SRR4302540.6027483/1‑55 (MQ=60)
GGTGCGGTTGGGG‑ACCCCCAGCCTGGAAGAGTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCTACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAG < SRR4302540.5286415/94‑1 (MQ=60)
GGTGCGGTTGGGG‑ACCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAG < SRR4302540.2716922/94‑1 (MQ=60)
GCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTT > SRR4302540.7288167/1‑94 (MQ=60)
gggtgGGGG‑ATCCCCACCCTTGAAGATTATCCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTG < SRR4302540.2988095/89‑1 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt > SRR4302540.3840287/1‑50 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt > SRR4302540.8494330/1‑50 (MQ=60)
GGTTGGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcatattaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgt > SRR4302540.9820579/1‑50 (MQ=60)
GGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGT > SRR4302540.1221601/1‑94 (MQ=60)
GTTGGGGTATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGT < SRR4302540.6960202/94‑1 (MQ=60)
TTGGAG‑ATCCCCAGCCTTAAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgt < SRR4302540.3628865/94‑47 (MQ=60)
GGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttt > SRR4302540.9166347/1‑46 (MQ=60)
GGGT‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttt > SRR4302540.6809168/1‑46 (MQ=60)
GGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTG > SRR4302540.4284572/1‑94 (MQ=60)
GT‑ATCAGCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGacgcgggcattttaaaaatcactaaagaacgcccaagagcatgtgttttc > SRR4302540.4552935/1‑44 (MQ=60)
GG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCG > SRR4302540.5440068/1‑94 (MQ=60)
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TCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGG‑ATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGC > NC_000913/1949379‑1949565
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
