Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,979,535 |
+G |
coding (1036/1386 nt) |
yifK → |
putative amino acid/amine transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,979,534 | 1 | . | G | 99.2%
| 1959.0
/ 3.5
| 495 | coding (1035/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base G (248/243); total (249/246) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 535 total aligned reads displayed.
GCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT > NC_000913/3979439‑3979625
|
gCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAAtt < 2:1331204/96‑1 (MQ=255)
gAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑gg > 1:185982/1‑95 (MQ=255)
aaaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggct < 1:2558660/96‑4 (MQ=255)
aaaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggct > 1:14066447/1‑93 (MQ=255)
aaaCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑ggctc < 1:4438810/96‑5 (MQ=255)
aCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCAt < 1:4803221/96‑1 (MQ=255)
aCCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCAt < 2:2945421/96‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATg < 1:2668956/96‑1 (MQ=255)
ccGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATg < 2:6510576/96‑1 (MQ=255)
cttCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGc > 2:10518559/3‑96 (MQ=255)
gTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCGGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGcc > 1:10863422/1‑96 (MQ=255)
gTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGcc > 2:2656894/1‑96 (MQ=255)
ttACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCTgaac > 1:2221599/1‑93 (MQ=255)
aCCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 2:11149969/1‑96 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAc > 1:7351364/1‑96 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAc > 1:12427412/1‑96 (MQ=255)
ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat < 2:7426059/96‑1 (MQ=255)
ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat > 1:8069110/1‑96 (MQ=255)
cggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGGGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatca > 2:615717/1‑96 (MQ=255)
cAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 1:6469991/96‑1 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAttgc < 1:10567310/96‑3 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc > 2:11376525/1‑96 (MQ=255)
aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTccc < 2:2735867/96‑1 (MQ=255)
gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt < 2:4284314/96‑1 (MQ=255)
ggaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGCGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc > 1:11110229/3‑96 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 1:2408455/96‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 2:3152794/96‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc > 1:9941952/1‑96 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg < 2:13089575/96‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg < 2:7630376/96‑1 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg > 2:921724/1‑96 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc < 2:353943/96‑1 (MQ=255)
aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa > 1:7695784/1‑96 (MQ=255)
aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa < 1:8259817/96‑1 (MQ=255)
gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAg > 2:10174183/1‑96 (MQ=255)
tttCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 2:12506394/96‑1 (MQ=255)
tttCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 1:7929421/96‑1 (MQ=255)
tgtCCCGTCACGGCGTCCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 1:12793290/94‑1 (MQ=255)
ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgt < 1:6722609/96‑1 (MQ=255)
cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtg > 2:5547813/1‑96 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt > 2:13615607/1‑96 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt > 2:12161462/1‑96 (MQ=255)
tCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 2:519930/96‑1 (MQ=255)
tCACGGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt > 2:6963219/1‑96 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTg < 2:1996259/96‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt < 1:5414091/96‑1 (MQ=255)
ggCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc > 1:5099894/1‑96 (MQ=255)
gCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 2:8633631/96‑1 (MQ=255)
cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgttta > 1:1646598/1‑96 (MQ=255)
cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtcta < 1:952720/96‑1 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg < 2:13439214/96‑1 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg < 1:14421592/96‑1 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg > 1:860460/1‑96 (MQ=255)
ccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgcc < 1:9027023/96‑3 (MQ=255)
ccGGTTGCGAGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc < 2:10351521/96‑1 (MQ=255)
ggTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtcta < 2:7934717/96‑1 (MQ=255)
gtggCGGGTGT‑GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACa < 1:3881160/93‑1 (MQ=255)
gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTTTTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtctac < 1:5839570/96‑1 (MQ=255)
tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCC‑CGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg < 2:12757707/96‑1 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:14221791/1‑96 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:1319604/1‑96 (MQ=255)
gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGc < 1:13503957/96‑1 (MQ=255)
gtgtGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa < 1:2101984/96‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg < 2:185982/96‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg < 2:4650359/96‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg < 2:8145856/96‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 2:139787/96‑1 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCg > 2:11831575/1‑96 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCg > 2:14384406/1‑96 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCg > 1:330163/1‑96 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 1:12047127/1‑96 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt < 2:8906766/96‑1 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt < 1:4267914/96‑1 (MQ=255)
cgTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt > 1:11277700/2‑96 (MQ=255)
ggaTCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 1:10052736/3‑96 (MQ=255)
gTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt < 2:589755/96‑1 (MQ=255)
gTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 1:3014947/1‑96 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc < 2:163943/96‑1 (MQ=255)
tATCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc > 1:7230416/1‑96 (MQ=255)
aTCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 1:5987525/96‑1 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACTTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg > 1:10317009/1‑96 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcct < 1:11429247/96‑2 (MQ=255)
cTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCGAATCCGCAGCGGGTGTTTGTCTACGTCGACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 1:6186887/1‑96 (MQ=255)
cTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 2:4503835/1‑96 (MQ=255)
cTATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 2:11535422/1‑96 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTGCTTCCggg < 1:1515360/96‑1 (MQ=255)
aTTGCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgggg > 1:3612580/1‑96 (MQ=255)
tGCTATTCTGGTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAACCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 2:4994451/96‑1 (MQ=255)
gCTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg > 1:7103683/1‑96 (MQ=255)
cTATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg < 2:3745961/96‑1 (MQ=255)
tATTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGt < 2:5292435/96‑1 (MQ=255)
aTTCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTg < 2:10817410/96‑1 (MQ=255)
ttCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGc > 2:9644448/1‑96 (MQ=255)
tCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc < 1:9293444/96‑1 (MQ=255)
tCTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 2:2421833/1‑96 (MQ=255)
cTGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa > 1:13093078/1‑96 (MQ=255)
tGCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:13615607/96‑1 (MQ=255)
gCTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg < 2:706878/96‑1 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATgg < 1:11639216/96‑1 (MQ=255)
cTAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATgg > 2:3257965/1‑96 (MQ=255)
|
GCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT > NC_000913/3979439‑3979625
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 323 total aligned reads displayed.
ACTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979435‑3979636
|
gagtgacaaaaaacggcttttttcgggcggaaatgcagtaagtttccgtaACGGCGTACCTGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G < SRR4302518.6705131/51‑1 (MQ=60)
CCTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G < SRR4302518.5981129/101‑1 (MQ=60)
ACTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G > SRR4302518.3307496/1‑101 (MQ=60)
ACTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G > SRR4302518.5026083/1‑101 (MQ=60)
ACTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAANN‑N > SRR4302518.11949586/1‑101 (MQ=60)
NNNGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggct < SRR4302518.12815645/101‑4 (MQ=60)
GGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggct > SRR4302518.1226294/1‑98 (MQ=60)
GCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggnnn > SRR4302518.9508908/1‑97 (MQ=60)
nnnaaaaccagCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCA < SRR4302518.12559847/90‑1 (MQ=60)
NNNAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCA < SRR4302518.8964561/101‑1 (MQ=60)
GAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCAT > SRR4302518.193512/1‑101 (MQ=60)
NNNAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATG < SRR4302518.7930196/101‑1 (MQ=60)
NNNAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATG < SRR4302518.12922222/101‑1 (MQ=60)
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATG < SRR4302518.825705/101‑1 (MQ=60)
AAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggctcgtg > SRR4302518.2039681/1‑94 (MQ=60)
AAAAACCGTCAGTGACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggctcnnn > SRR4302518.14521577/1‑94 (MQ=60)
AAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggctcannn > SRR4302518.14710390/1‑93 (MQ=60)
AAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGGCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTTCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGC > SRR4302518.1605893/1‑101 (MQ=60)
AAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Ggctcatnnn > SRR4302518.11910170/1‑92 (MQ=60)
ACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGCGGCAGTGTCTGTTGCTTTTCTGCTAATTGG‑CTCATGCNNN > SRR4302518.13746263/1‑101 (MQ=60)
NNNAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GTCTCATGCCT‑GAAC < SRR4302518.11464919/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTCACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTCCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAAC < SRR4302518.13476203/101‑1 (MQ=60)
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCGGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGNNN > SRR4302518.11373096/1‑101 (MQ=60)
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGNNN > SRR4302518.11325369/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGaatt < SRR4302518.10778827/101‑5 (MQ=60)
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTA < SRR4302518.2741640/101‑1 (MQ=60)
NNNACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGaactact < SRR4302518.9279571/101‑8 (MQ=60)
GTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACA > SRR4302518.6399402/1‑101 (MQ=60)
GGTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGaactnnn > SRR4302518.14972154/1‑94 (MQ=60)
TTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAT > SRR4302518.2328696/1‑101 (MQ=60)
TTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAT < SRR4302518.5135384/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCA < SRR4302518.8348991/101‑1 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCA > SRR4302518.4869818/1‑101 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGAGGCAGGATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCCTCATGCCT‑GAACTACATCA > SRR4302518.4569638/1‑101 (MQ=60)
CCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATNNN > SRR4302518.13012705/1‑101 (MQ=60)
CCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATNNN > SRR4302518.7732929/1‑101 (MQ=60)
CCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCAT < SRR4302518.7313078/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCCATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.9901198/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.9477617/101‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.250828/101‑1 (MQ=60)
NNNGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTGC < SRR4302518.11062906/101‑1 (MQ=60)
GCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCC > SRR4302518.4319434/1‑101 (MQ=60)
GCGGCAATCGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATNNN > SRR4302518.13590106/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCNNN > SRR4302518.14458820/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCNNN > SRR4302518.14856992/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGGGGCAGTATTTGTTGCTATGCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA > SRR4302518.3165255/1‑101 (MQ=60)
GCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCNNN > SRR4302518.12578066/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTCCATCATTCCCAAT < SRR4302518.7637263/101‑1 (MQ=60)
GAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCGGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCNNN > SRR4302518.11900419/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302518.10046761/101‑1 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC > SRR4302518.6809632/1‑101 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302518.2439758/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC < SRR4302518.12307185/101‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC < SRR4302518.359104/101‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC > SRR4302518.1459009/1‑101 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG < SRR4302518.404803/101‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG > SRR4302518.6032645/1‑101 (MQ=60)
TAGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATNNN > SRR4302518.8167252/1‑101 (MQ=60)
NNNCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG < SRR4302518.8151601/101‑1 (MQ=60)
GGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGC > SRR4302518.3241660/1‑101 (MQ=60)
GGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGC < SRR4302518.1720674/101‑1 (MQ=60)
NNNAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCA < SRR4302518.8667217/101‑1 (MQ=60)
GCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCA > SRR4302518.1169347/1‑101 (MQ=60)
NNNAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAA < SRR4302518.11885433/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC < SRR4302518.8326493/101‑1 (MQ=60)
NNNAGTGTCCCGTCACGGCGTCCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC < SRR4302518.13389069/101‑1 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCCCGGCGTACCGGTTGCGGGGGGGGCAGTTTCTATTGCTATTCTGCTAATT‑Gtctctggcctgaaaaccatcatttccaatccgcagt > SRR4302518.6990672/1‑65 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCNNN > SRR4302518.10415509/1‑101 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC < SRR4302518.661762/101‑1 (MQ=60)
AGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCNNN > SRR4302518.8086609/1‑101 (MQ=60)
NNNTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGT < SRR4302518.7534357/101‑1 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGT > SRR4302518.1549007/1‑101 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGT > SRR4302518.3443625/1‑101 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGNNN > SRR4302518.10398290/1‑101 (MQ=60)
NNNCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302518.8503226/101‑1 (MQ=60)
ngCGTCACGGNGTACCTGTTGCGTGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATGCCCAATCCGCCGCGTGTGTTN < SRR4302518.1967336/99‑1 (MQ=60)
NNNGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTT < SRR4302518.10336433/101‑1 (MQ=60)
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CGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGT < SRR4302518.5690606/101‑1 (MQ=60)
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GTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTC > SRR4302518.3722591/1‑101 (MQ=60)
GTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGGGTGTTTNNN > SRR4302518.10870539/1‑101 (MQ=60)
TCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCT < SRR4302518.1904690/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCC < SRR4302518.9749726/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTAC < SRR4302518.14219856/101‑1 (MQ=60)
ACGGAGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTAC < SRR4302518.7286078/101‑1 (MQ=60)
CGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTNNN > SRR4302518.9355837/1‑101 (MQ=60)
CGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTTTACGTCT > SRR4302518.1718961/1‑101 (MQ=60)
NNNCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA < SRR4302518.15096648/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTACTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA < SRR4302518.10815791/101‑1 (MQ=60)
NNNCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCCATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑TAACTTCATCATTCCCAATCCCCAGCGTGTGTTTGGCTACGTCTA < SRR4302518.13574773/101‑1 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA > SRR4302518.6134292/1‑101 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA > SRR4302518.2540184/1‑101 (MQ=60)
acCCGGTGGCGGGTGT‑GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACA < SRR4302518.4065449/99‑1 (MQ=60)
TACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCNNN > SRR4302518.7804536/1‑101 (MQ=60)
GACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTTTTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTAC < SRR4302518.6135398/101‑1 (MQ=60)
NNNGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACTG < SRR4302518.11229741/101‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCTGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACNNN > SRR4302518.13370883/1‑101 (MQ=60)
CGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACNNN > SRR4302518.11785833/1‑101 (MQ=60)
CGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGGGTTTGTCTACGTCTACAGT > SRR4302518.3799700/1‑101 (MQ=60)
GGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCTCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACANNN > SRR4302518.10593173/1‑101 (MQ=60)
GGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTG > SRR4302518.4424596/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGC < SRR4302518.14123985/101‑1 (MQ=60)
TTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCC < SRR4302518.2795739/101‑1 (MQ=60)
NNNCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCC < SRR4302518.14030828/101‑1 (MQ=60)
TGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCA < SRR4302518.2200624/101‑1 (MQ=60)
NNNGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCTA < SRR4302518.9655331/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTGGCAGTATCTCTTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCG < SRR4302518.8755236/101‑1 (MQ=60)
GGTTTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGT < SRR4302518.4478342/101‑1 (MQ=60)
GTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTG > SRR4302518.5190230/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGC < SRR4302518.15088857/101‑1 (MQ=60)
GGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGC < SRR4302518.6327359/101‑1 (MQ=60)
ATGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTNNN > SRR4302518.11807193/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGNNN > SRR4302518.8911994/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTT > SRR4302518.343387/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTT > SRR4302518.2822952/1‑101 (MQ=60)
GGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCNNN > SRR4302518.9875023/1‑101 (MQ=60)
NNNGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.14184548/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6249617/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6291264/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6877798/101‑1 (MQ=60)
CAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCG < SRR4302518.1403554/101‑1 (MQ=60)
CAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAGCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGCTTGTCTACGTCTACGGTGCCAGCGTCCTTCCG > SRR4302518.4649807/1‑101 (MQ=60)
NNNATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGG < SRR4302518.13754856/101‑1 (MQ=60)
AGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAAGTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCNNN > SRR4302518.13234252/1‑101 (MQ=60)
AGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGG > SRR4302518.1641603/1‑101 (MQ=60)
GTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTGCTTCCGGG < SRR4302518.1580293/101‑1 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGNNN > SRR4302518.7608741/1‑101 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGG < SRR4302518.2783818/101‑1 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCAAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTCCATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGNNN > SRR4302518.10653900/1‑101 (MQ=60)
NNNCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GACCTACATCATCCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTTCGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGG < SRR4302518.14149023/101‑1 (MQ=60)
ATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTTCGTCTACATGGCCAGCGTGCTTCCGGGGA > SRR4302518.1271701/1‑101 (MQ=60)
ATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGT > SRR4302518.7074223/1‑101 (MQ=60)
TTTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGNNN > SRR4302518.8493349/1‑101 (MQ=60)
TCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCTGGTAT > SRR4302518.1864672/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCGAATCCGCAGCGGGTGTTTGTCTACGTCGACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG > SRR4302518.6502314/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGNNN > SRR4302518.7876381/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG < SRR4302518.2315783/101‑1 (MQ=60)
TATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGG > SRR4302518.5629246/1‑101 (MQ=60)
taTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑AAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT < SRR4302518.2492842/99‑1 (MQ=60)
NNNGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT < SRR4302518.11965703/101‑1 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT > SRR4302518.2296353/1‑101 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT > SRR4302518.6679263/1‑101 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGG > SRR4302518.3781859/1‑101 (MQ=60)
TGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGNNN > SRR4302518.8432184/1‑101 (MQ=60)
TGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGAGC > SRR4302518.3826952/1‑101 (MQ=60)
GCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTNNN > SRR4302518.7478323/1‑101 (MQ=60)
GATATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATtgtnnn > SRR4302518.11243486/1‑95 (MQ=60)
CTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCA < SRR4302518.6156413/101‑1 (MQ=60)
TCTTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT < SRR4302518.2863878/101‑1 (MQ=60)
NNNTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT < SRR4302518.14239954/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATT < SRR4302518.13711838/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG < SRR4302518.15051359/101‑1 (MQ=60)
ATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG > SRR4302518.2901618/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG < SRR4302518.14724923/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG < SRR4302518.12187198/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATCG < SRR4302518.11009837/101‑1 (MQ=60)
nnngctaatcgG‑CTCATGCCT‑GAACTCCATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302518.8533517/90‑1 (MQ=60)
TCTGCTACTTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCCACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302518.2286357/101‑1 (MQ=60)
TCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGCGCTTCCGGGGATGGTGCCATNNN > SRR4302518.11632178/1‑101 (MQ=60)
NNNCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTC < SRR4302518.9286791/101‑1 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGNNN > SRR4302518.13698602/1‑101 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTT > SRR4302518.1530085/1‑101 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGCGCTTCCGGGGATGTTGCCATGNNN > SRR4302518.9097350/1‑101 (MQ=60)
CGGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGNNN > SRR4302518.8633706/1‑101 (MQ=60)
nnntaattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.9467709/92‑1 (MQ=60)
TGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.5231009/101‑1 (MQ=60)
TGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT > SRR4302518.5477918/1‑101 (MQ=60)
TGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.2414857/101‑1 (MQ=60)
TACTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGNNN > SRR4302518.12028861/1‑101 (MQ=60)
tctaattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAACCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG < SRR4302518.4769465/93‑1 (MQ=60)
GCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302518.5011553/1‑101 (MQ=60)
GCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302518.385137/1‑101 (MQ=60)
nnnattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGT < SRR4302518.10166024/94‑1 (MQ=60)
CTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGT > SRR4302518.4987634/1‑101 (MQ=60)
CTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGT > SRR4302518.5585340/1‑101 (MQ=60)
tgattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTNNN > SRR4302518.11124602/7‑101 (MQ=60)
nnnttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG < SRR4302518.8820280/95‑1 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG > SRR4302518.2654566/1‑101 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGCGCCATGGTTTNNN > SRR4302518.14746795/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCGATGGTTTGGGA > SRR4302518.7024343/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.2437646/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.3135845/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.6500156/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA < SRR4302518.6770376/101‑1 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGNNN > SRR4302518.8443017/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGGGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.90831/1‑101 (MQ=60)
NNN‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA < SRR4302518.10092914/101‑1 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGGTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTNNN > SRR4302518.13116951/1‑101 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTNNN > SRR4302518.13828848/1‑101 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTGGTGAT > SRR4302518.6221362/1‑101 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGAGCGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGAT > SRR4302518.6563434/1‑101 (MQ=60)
ttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA > SRR4302518.5302622/4‑101 (MQ=60)
ttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGGCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGGGCCATGGTTTGTGNNN > SRR4302518.10195256/4‑101 (MQ=60)
NN‑N‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAT < SRR4302518.9733698/101‑1 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATT > SRR4302518.6941059/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATT < SRR4302518.2636787/101‑1 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGatatnnn > SRR4302518.13707885/1‑94 (MQ=60)
G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > SRR4302518.5351875/1‑101 (MQ=60)
|
ACTGGCGAAAAACCGTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979435‑3979636
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |