Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
245 |
579.6 |
28867798 |
97.7% |
28203838 |
96.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,979,546 |
Δ1 bp |
coding (1047/1386 nt) |
yifK → |
putative amino acid/amine transport protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,979,545 | 0 | G | . | 99.8%
| 2448.0
/ ‑3.5
| 510 | coding (1046/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (258/251); minor base C (0/1); total (258/252) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 538 total aligned reads displayed.
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979451‑3979636
|
aCCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTa > 2:11149969/1‑96 (MQ=255)
ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAc > 1:12427412/1‑96 (MQ=255)
ggcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcat < 2:3121302/96‑1 (MQ=255)
gcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTAcatc > 1:4119677/1‑96 (MQ=255)
gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 2:13463923/96‑1 (MQ=255)
gcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 2:7951968/96‑1 (MQ=255)
cAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 1:9040639/96‑1 (MQ=255)
aaTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTTTTGCTATTCTGCT‑GATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTcc > 2:10476941/1‑96 (MQ=255)
tagCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa > 1:7774170/3‑96 (MQ=255)
tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa < 1:11241927/96‑1 (MQ=255)
ggCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCaa < 2:10178868/96‑1 (MQ=255)
gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt < 2:4284314/96‑1 (MQ=255)
gCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAt > 2:4978650/1‑96 (MQ=255)
cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 1:9583458/96‑1 (MQ=255)
cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATc < 1:2326589/96‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 2:8308084/96‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc > 1:6120503/1‑96 (MQ=255)
aaaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg < 2:13089575/96‑1 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc < 1:1648227/96‑1 (MQ=255)
aaGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGc < 2:353943/96‑1 (MQ=255)
aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa < 2:5085343/96‑1 (MQ=255)
gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCaa < 1:11353353/96‑2 (MQ=255)
tgtCCCGTCACGGCGTCCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGc < 1:12793290/94‑1 (MQ=255)
ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgt < 1:7158121/96‑1 (MQ=255)
ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGCGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCACCgtgg > 1:3203903/1‑95 (MQ=255)
gTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 2:13331205/96‑1 (MQ=255)
tCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 1:3508275/96‑1 (MQ=255)
tCACGGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt > 2:6963219/1‑96 (MQ=255)
cACGGCGTACCGGTTGCGAGTGTGGCATTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt < 2:8948738/96‑1 (MQ=255)
aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTg < 2:1996259/96‑1 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt > 1:2454350/1‑96 (MQ=255)
cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt > 2:7666623/1‑96 (MQ=255)
ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCTAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc > 2:1750097/1‑96 (MQ=255)
ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCTGCAGCGTGTGTTTgtc > 2:7332264/1‑96 (MQ=255)
gCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtct < 2:8633631/96‑1 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctcc < 1:9301011/96‑3 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac > 2:9285828/1‑96 (MQ=255)
gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac < 2:6051013/96‑1 (MQ=255)
tACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg > 1:7421127/1‑96 (MQ=255)
ccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc < 1:7231667/96‑1 (MQ=255)
cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct < 2:1183053/96‑1 (MQ=255)
cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct > 2:5763502/1‑96 (MQ=255)
ggTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtcta < 1:14426138/96‑1 (MQ=255)
tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg > 1:6504354/1‑96 (MQ=255)
tGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg < 2:12113268/96‑1 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:14024448/1‑96 (MQ=255)
cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTg > 1:14221791/1‑96 (MQ=255)
gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGc < 1:13503957/96‑1 (MQ=255)
tgtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg < 2:185982/96‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 2:2682388/96‑1 (MQ=255)
gtgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc < 2:139787/96‑1 (MQ=255)
tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCg > 2:14384406/1‑96 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 2:2765430/1‑96 (MQ=255)
ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGt > 2:5514675/1‑96 (MQ=255)
gCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 1:6368768/1‑96 (MQ=255)
cAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGc > 2:4497455/1‑96 (MQ=255)
cAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACAGCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGCTTGTCTACGTCTACGGTGCCAGCGtcc > 1:4424274/1‑94 (MQ=255)
ggaTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 1:10052736/3‑96 (MQ=255)
gTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt < 2:11459166/96‑1 (MQ=255)
aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 2:10001701/96‑1 (MQ=255)
aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 2:5260511/96‑1 (MQ=255)
aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc > 1:6724342/1‑96 (MQ=255)
aTCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc < 1:5987525/96‑1 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACTTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg > 1:10317009/1‑96 (MQ=255)
tCTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg < 1:119374/96‑1 (MQ=255)
cTATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 1:4747216/1‑96 (MQ=255)
tATTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTGCTTCCggg < 1:1515360/96‑1 (MQ=255)
aTTGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgggg < 1:2656894/96‑1 (MQ=255)
tGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt < 1:2038328/96‑1 (MQ=255)
tGCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAt > 1:8032137/1‑96 (MQ=255)
gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 1:2209418/96‑1 (MQ=255)
gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 2:4626217/96‑1 (MQ=255)
gCTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 2:638968/96‑1 (MQ=255)
cTATTCTGCTAAATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCAAATCCGCAGCGGGTGTTTGTCTACTTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCGGGGGATg > 1:8403792/1‑96 (MQ=255)
cTATTCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg < 2:3745961/96‑1 (MQ=255)
tCTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 2:2421833/1‑96 (MQ=255)
cggCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa > 1:8227463/3‑96 (MQ=255)
cTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa < 1:5859532/96‑1 (MQ=255)
cTGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCa > 2:10645847/1‑96 (MQ=255)
tGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:13615607/96‑1 (MQ=255)
tGCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:5547813/96‑1 (MQ=255)
gCT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATg > 1:370528/1‑96 (MQ=255)
cT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAtcg < 1:10517536/96‑3 (MQ=255)
cT‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATgg > 2:3257630/1‑96 (MQ=255)
t‑AATTGGCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt > 1:1089104/1‑96 (MQ=255)
t‑AATTGGCTCATGACT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCCGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt < 1:11585646/96‑1 (MQ=255)
attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt > 1:13219130/5‑96 (MQ=255)
attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 1:4972532/92‑1 (MQ=255)
attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 1:870925/92‑1 (MQ=255)
attggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 2:11349414/92‑1 (MQ=255)
tggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgt < 2:6504354/94‑1 (MQ=255)
tggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgt > 1:9775641/3‑96 (MQ=255)
ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg > 1:2785818/2‑96 (MQ=255)
ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg < 2:12988275/95‑1 (MQ=255)
ggCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgat > 1:13102069/2‑94 (MQ=255)
cTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGat < 2:9660892/96‑1 (MQ=255)
aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAtt > 2:7085653/1‑96 (MQ=255)
tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg > 1:5231722/1‑96 (MQ=255)
tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg < 2:13828916/96‑1 (MQ=255)
tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTg < 2:12545241/96‑1 (MQ=255)
|
CAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCT‑AATT‑GCTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > NC_000913/3979451‑3979636
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 312 total aligned reads displayed.
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAGCCAGC > NC_000913/3979449‑3979646
|
NNNAGTCACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTCCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAAC < SRR4302518.13476203/101‑1 (MQ=60)
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCGGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCTGNNN > SRR4302518.11373096/1‑101 (MQ=60)
GTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCGATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACA > SRR4302518.195639/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCA < SRR4302518.8348991/101‑1 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCA > SRR4302518.4869818/1‑101 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGAGGCAGGATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCCTCATGCCT‑GAACTACATCA > SRR4302518.4569638/1‑101 (MQ=60)
ACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCA > SRR4302518.5530837/1‑101 (MQ=60)
CCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATNNN > SRR4302518.7732929/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCCATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.9901198/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.9477617/101‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.6801155/101‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTC < SRR4302518.250828/101‑1 (MQ=60)
GGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCANNN > SRR4302518.8470585/1‑101 (MQ=60)
NNNGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTGC < SRR4302518.11062906/101‑1 (MQ=60)
GCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCC > SRR4302518.4319434/1‑101 (MQ=60)
GCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATNNN > SRR4302518.14157034/1‑101 (MQ=60)
GCGGCAATCGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATNNN > SRR4302518.13590106/1‑101 (MQ=60)
NNNCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GACCTACATCATTCCC < SRR4302518.14093283/101‑1 (MQ=60)
CGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCC > SRR4302518.3922341/1‑101 (MQ=60)
NNNAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA < SRR4302518.11768052/101‑1 (MQ=60)
NNNAATGGCGAAAGTTCCCCGCCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA < SRR4302518.8360281/101‑1 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCNNN > SRR4302518.8128736/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCNNN > SRR4302518.14856992/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCNNN > SRR4302518.14458820/1‑101 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA < SRR4302518.5249391/101‑1 (MQ=60)
GGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGGGGCAGTATTTGTTGCTATGCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCA > SRR4302518.3165255/1‑101 (MQ=60)
NNNTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTCCATCATTCCCAAT < SRR4302518.7637263/101‑1 (MQ=60)
CAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAAT > SRR4302518.3300125/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302518.10046761/101‑1 (MQ=60)
NNNGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302518.13485710/101‑1 (MQ=60)
AATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATC < SRR4302518.2439758/101‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCC < SRR4302518.359104/101‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG < SRR4302518.404803/101‑1 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG > SRR4302518.6032645/1‑101 (MQ=60)
TGGCGAAAGTTGCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCG < SRR4302518.6519906/101‑1 (MQ=60)
TAGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATNNN > SRR4302518.8167252/1‑101 (MQ=60)
GGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGC < SRR4302518.1720674/101‑1 (MQ=60)
GGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGC > SRR4302518.3241660/1‑101 (MQ=60)
NNNAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCA < SRR4302518.8667217/101‑1 (MQ=60)
NNNAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAA < SRR4302518.11885433/101‑1 (MQ=60)
CGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGNNN > SRR4302518.14276621/1‑101 (MQ=60)
NNNAGTGTCCCGTCACGGCGTCCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC < SRR4302518.13389069/101‑1 (MQ=60)
GGAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGCGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCNNN > SRR4302518.11629961/1‑101 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCNNN > SRR4302518.10415509/1‑101 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC < SRR4302518.661762/101‑1 (MQ=60)
GAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGC > SRR4302518.6431308/1‑101 (MQ=60)
AGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCNNN > SRR4302518.8086609/1‑101 (MQ=60)
NNNTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGT < SRR4302518.7534357/101‑1 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGT > SRR4302518.3443625/1‑101 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGT > SRR4302518.1549007/1‑101 (MQ=60)
TTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGNNN > SRR4302518.10398290/1‑101 (MQ=60)
TCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302518.3671595/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302518.8503226/101‑1 (MQ=60)
NNNCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTT < SRR4302518.14031307/101‑1 (MQ=60)
NNNGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTT < SRR4302518.10336433/101‑1 (MQ=60)
NNNTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTG < SRR4302518.7824182/101‑1 (MQ=60)
NNNTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTC < SRR4302518.13708906/101‑1 (MQ=60)
CCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGCGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCACCGTGGGATTG > SRR4302518.3353048/1‑101 (MQ=60)
CGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGT < SRR4302518.5690606/101‑1 (MQ=60)
GTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGGGTGTTTNNN > SRR4302518.10870539/1‑101 (MQ=60)
NNNGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTA < SRR4302518.13760995/101‑1 (MQ=60)
CACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTA < SRR4302518.6616128/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCC < SRR4302518.9749726/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTAC < SRR4302518.14219856/101‑1 (MQ=60)
ACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTTCATCATTCCCAATCAGCAGCGTGTGGTTGTCTAC > SRR4302518.2383850/1‑101 (MQ=60)
NNNCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACG < SRR4302518.15091673/101‑1 (MQ=60)
CGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTNNN > SRR4302518.9355837/1‑101 (MQ=60)
CGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACG > SRR4302518.2572808/1‑101 (MQ=60)
GGCGTACCGGTTGCGGGGGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGT > SRR4302518.5363733/1‑101 (MQ=60)
NNNTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTC < SRR4302518.7610030/101‑1 (MQ=60)
GCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACNNN > SRR4302518.12967562/1‑101 (MQ=60)
CGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCT > SRR4302518.1637756/1‑101 (MQ=60)
NNNCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA < SRR4302518.15096648/101‑1 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA > SRR4302518.6134292/1‑101 (MQ=60)
GTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTA > SRR4302518.2540184/1‑101 (MQ=60)
acCCGGTGGCGGGTGT‑GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACA < SRR4302518.4065449/99‑1 (MQ=60)
TACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTAC > SRR4302518.893696/1‑101 (MQ=60)
GACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTTTTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTAC < SRR4302518.6135398/101‑1 (MQ=60)
ACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATGCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTNNN > SRR4302518.10698310/1‑101 (MQ=60)
ACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGGGTTTGTCTACGTCTACA > SRR4302518.5157508/1‑101 (MQ=60)
NNNGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACTG < SRR4302518.11229741/101‑1 (MQ=60)
NNNTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGT < SRR4302518.12740268/101‑1 (MQ=60)
CGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACNNN > SRR4302518.11785833/1‑101 (MQ=60)
GGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCTCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACANNN > SRR4302518.10593173/1‑101 (MQ=60)
GGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTG > SRR4302518.479360/1‑101 (MQ=60)
GGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTG > SRR4302518.4424596/1‑101 (MQ=60)
NNNGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGC < SRR4302518.14123985/101‑1 (MQ=60)
NNNGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGC < SRR4302518.9264006/101‑1 (MQ=60)
NNNCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCC < SRR4302518.14030828/101‑1 (MQ=60)
TGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCA < SRR4302518.2200624/101‑1 (MQ=60)
TGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCA > SRR4302518.6837527/1‑101 (MQ=60)
GCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAG < SRR4302518.2777322/101‑1 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCNNN > SRR4302518.14666325/1‑101 (MQ=60)
CGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGC > SRR4302518.1373932/1‑101 (MQ=60)
NNNTGTGGCAGTATCTCTTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCG < SRR4302518.8755236/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCG < SRR4302518.7573246/101‑1 (MQ=60)
NNNTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGAG < SRR4302518.12238387/101‑1 (MQ=60)
GAGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCANNN > SRR4302518.11119024/1‑101 (MQ=60)
NNNGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGT < SRR4302518.8777731/101‑1 (MQ=60)
GGTTTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGT < SRR4302518.4478342/101‑1 (MQ=60)
GTGTGGCAGTATCGATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCNNN > SRR4302518.11936899/1‑101 (MQ=60)
TGTGGCAGGATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTCTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGC > SRR4302518.1648319/1‑101 (MQ=60)
ATGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTNNN > SRR4302518.11807193/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGNNN > SRR4302518.8911994/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTT > SRR4302518.343387/1‑101 (MQ=60)
TGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTT > SRR4302518.2822952/1‑101 (MQ=60)
GGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCNNN > SRR4302518.12620670/1‑101 (MQ=60)
GGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCNNN > SRR4302518.9875023/1‑101 (MQ=60)
NNNGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.14184548/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6249617/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6291264/101‑1 (MQ=60)
GCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑GCCTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCC < SRR4302518.6877798/101‑1 (MQ=60)
NNNTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCT < SRR4302518.11964559/101‑1 (MQ=60)
CAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCG < SRR4302518.124226/101‑1 (MQ=60)
CAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACAGCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGCTTGTCTACGTCTACGGTGCCAGCGTCCTTCCG > SRR4302518.4649807/1‑101 (MQ=60)
AGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCNNN > SRR4302518.10940297/1‑101 (MQ=60)
GTATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCCGCGTGCTTCCGGG < SRR4302518.1580293/101‑1 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGNNN > SRR4302518.7608741/1‑101 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGG < SRR4302518.2783818/101‑1 (MQ=60)
TATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGG > SRR4302518.1133701/1‑101 (MQ=60)
ATCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGT > SRR4302518.7074223/1‑101 (MQ=60)
TTTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGNNN > SRR4302518.8493349/1‑101 (MQ=60)
TCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACTTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGNNN > SRR4302518.10803034/1‑101 (MQ=60)
TCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCTGGTAT > SRR4302518.1864672/1‑101 (MQ=60)
TCTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGAT < SRR4302518.2132431/101‑1 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCGAATCCGCAGCGGGTGTTTGTCTACGTCGACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG > SRR4302518.6502314/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGNNN > SRR4302518.7876381/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG > SRR4302518.4996177/1‑101 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG < SRR4302518.6974086/101‑1 (MQ=60)
CTATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATG < SRR4302518.2315783/101‑1 (MQ=60)
TATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGG > SRR4302518.5629246/1‑101 (MQ=60)
taTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑AAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT < SRR4302518.2492842/99‑1 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATNNN > SRR4302518.9732135/1‑101 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT > SRR4302518.6679263/1‑101 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGT > SRR4302518.2296353/1‑101 (MQ=60)
ATTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGG > SRR4302518.3781859/1‑101 (MQ=60)
TTGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGNNN > SRR4302518.13286430/1‑101 (MQ=60)
TGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGNNN > SRR4302518.8432184/1‑101 (MQ=60)
TGCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGAGC > SRR4302518.3826952/1‑101 (MQ=60)
GCTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTNNN > SRR4302518.7478323/1‑101 (MQ=60)
CTATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCA < SRR4302518.6156413/101‑1 (MQ=60)
TCTTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAT < SRR4302518.2863878/101‑1 (MQ=60)
NNNCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG < SRR4302518.15051359/101‑1 (MQ=60)
ATTCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATG > SRR4302518.2901618/1‑101 (MQ=60)
NNNTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG < SRR4302518.12187198/101‑1 (MQ=60)
NNNTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGG < SRR4302518.14724923/101‑1 (MQ=60)
nnngctaatcgG‑CTCATGCCT‑GAACTCCATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302518.8533517/90‑1 (MQ=60)
TCTGCTACTTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCCACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302518.2286357/101‑1 (MQ=60)
TCTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGCGCTTCCGGGGATGGTGCCATNNN > SRR4302518.11632178/1‑101 (MQ=60)
NNNCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTC < SRR4302518.9286791/101‑1 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTT > SRR4302518.7101770/1‑101 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTT > SRR4302518.1530085/1‑101 (MQ=60)
CTGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGCGCTTCCGGGGATGTTGCCATGNNN > SRR4302518.9097350/1‑101 (MQ=60)
CGGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGNNN > SRR4302518.8633706/1‑101 (MQ=60)
nnntaattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.9467709/92‑1 (MQ=60)
nnntaattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.14577225/92‑1 (MQ=60)
nnngctaattggctcatgactGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTCCGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGT < SRR4302518.12131217/80‑1 (MQ=60)
TGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.5231009/101‑1 (MQ=60)
TGCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTT < SRR4302518.2414857/101‑1 (MQ=60)
TACTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGNNN > SRR4302518.12028861/1‑101 (MQ=60)
gataattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGTATGGGGCCATGGTNNN > SRR4302518.11204603/9‑101 (MQ=60)
GCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302518.5011553/1‑101 (MQ=60)
GCTAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTG > SRR4302518.385137/1‑101 (MQ=60)
nnnattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGT < SRR4302518.10166024/94‑1 (MQ=60)
nnnttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG < SRR4302518.8820280/95‑1 (MQ=60)
aaattgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTNNN > SRR4302518.11897390/7‑101 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG > SRR4302518.2654566/1‑101 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG > SRR4302518.1132123/1‑101 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTG > SRR4302518.6365813/1‑101 (MQ=60)
TAATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGCGCCATGGTTTNNN > SRR4302518.14746795/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCGATGGTTTGGGA > SRR4302518.7024343/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.2437646/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA < SRR4302518.6770376/101‑1 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.3135845/1‑101 (MQ=60)
AATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGGGCCATGGTTTGTGA > SRR4302518.90831/1‑101 (MQ=60)
NNN‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA < SRR4302518.10092914/101‑1 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGGTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTNNN > SRR4302518.13116951/1‑101 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTNNN > SRR4302518.13828848/1‑101 (MQ=60)
ATTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTGGTGAT > SRR4302518.6221362/1‑101 (MQ=60)
ttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA > SRR4302518.1910906/4‑101 (MQ=60)
ttgG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGGCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGGGCCATGGTTTGTGNNN > SRR4302518.10195256/4‑101 (MQ=60)
TG‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGANNN > SRR4302518.8234251/1‑101 (MQ=60)
NN‑N‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATAT < SRR4302518.9733698/101‑1 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATT > SRR4302518.2917835/1‑101 (MQ=60)
G‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGCGTTTGTCTACGTCTCCAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGatatnnn > SRR4302518.13707885/1‑94 (MQ=60)
G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTG > SRR4302518.5351875/1‑101 (MQ=60)
CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGA > SRR4302518.6168483/1‑101 (MQ=60)
CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATNNN > SRR4302518.7549171/1‑101 (MQ=60)
CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGACAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGA < SRR4302518.6465597/101‑1 (MQ=60)
CTCATGCCT‑GAACAACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATNNN > SRR4302518.14507471/1‑101 (MQ=60)
CATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGACTACAGTGACAGCGTGCTTCCGGGGATGGAGCCGGGGATTGTGATATTGATA > SRR4302518.630410/1‑101 (MQ=60)
nnngcctGAACTACATCATTCCCAATCCACAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATA < SRR4302518.13138263/94‑1 (MQ=60)
ATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAA < SRR4302518.728718/101‑1 (MQ=60)
TGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAG > SRR4302518.5500789/1‑101 (MQ=60)
TGCCT‑GAACTACATCACTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAG < SRR4302518.7333172/101‑1 (MQ=60)
GCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATANNN > SRR4302518.10350980/1‑101 (MQ=60)
GCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAGC < SRR4302518.3807901/101‑1 (MQ=60)
CCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCGACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAANNN > SRR4302518.12681349/1‑101 (MQ=60)
NNNAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAGCCA < SRR4302518.13365411/101‑1 (MQ=60)
NNNCTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAGCCAGC < SRR4302518.13674751/101‑1 (MQ=60)
|
GTCAGTTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATATTGATAAGCCAGC > NC_000913/3979449‑3979646
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 2 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |