Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
1624 |
250.6 |
12620048 |
98.0% |
12367647 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,360,184 |
G→A |
D84N (GAC→AAC) |
ycjC → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,360,184 | 0 | G | A | 100.0%
| 821.9
/ NA
| 223 | D84N (GAC→AAC) | ycjC | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (117/106); total (117/106) |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
AAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACGACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACG > NC_000913/1360094‑1360273
|
gctgctGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACtt > 2:3035029/1‑93 (MQ=255)
gctgctGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACtt > 2:1309908/1‑93 (MQ=255)
tgctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTaa < 2:6274962/93‑1 (MQ=255)
tgctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTaa < 1:5366027/93‑1 (MQ=255)
tgctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTaa < 1:6053338/93‑1 (MQ=255)
gctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAt < 1:5032374/93‑1 (MQ=255)
gctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAt > 2:1864734/1‑93 (MQ=255)
gctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAt < 1:1618786/93‑1 (MQ=255)
gctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTATTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAt > 2:4029036/1‑93 (MQ=255)
ctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAACCCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAtt < 2:3881806/93‑1 (MQ=255)
ctgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAtt < 1:4379161/93‑1 (MQ=255)
tgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTg > 2:3637732/1‑93 (MQ=255)
tgAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTg < 1:2424857/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTga < 1:5891586/93‑1 (MQ=255)
gAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTga > 1:2937095/1‑93 (MQ=255)
aGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTgagt > 2:5095148/1‑92 (MQ=255)
aGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTgaga > 2:1953809/1‑93 (MQ=255)
aGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCATTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTgaga > 2:2551249/1‑93 (MQ=255)
ggTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGAt > 2:5752416/1‑93 (MQ=255)
ggTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGAt < 1:4849467/93‑1 (MQ=255)
ggTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGAt > 1:2830938/1‑93 (MQ=255)
gtgtATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATg < 1:768746/93‑1 (MQ=255)
gtATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATggg < 2:1363203/93‑1 (MQ=255)
tATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGt < 2:1276190/93‑1 (MQ=255)
aTGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTa < 1:5795883/93‑1 (MQ=255)
tGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAg > 1:5926625/1‑93 (MQ=255)
tGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAg > 2:4138605/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGt < 1:335364/93‑1 (MQ=255)
gTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTc > 1:4103954/1‑93 (MQ=255)
tCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCa > 2:4488087/1‑93 (MQ=255)
tCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCa < 2:429902/93‑1 (MQ=255)
tGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAgg > 1:3639486/1‑93 (MQ=255)
cACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGgtg > 1:4940637/1‑93 (MQ=255)
tctcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGgtgtga > 1:3757343/1‑92 (MQ=255)
ctcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTc > 2:5536611/1‑93 (MQ=255)
ctcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTc < 1:4975683/93‑1 (MQ=255)
ctcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTc > 2:5342595/1‑93 (MQ=255)
ctcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTc > 2:5912786/1‑93 (MQ=255)
tcGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCa > 1:2777963/1‑93 (MQ=255)
cGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCaa > 1:6281207/1‑93 (MQ=255)
ggAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAAt < 1:1637204/93‑1 (MQ=255)
gAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGGTGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATg > 1:4584399/1‑93 (MQ=255)
gAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATg > 1:2294839/1‑93 (MQ=255)
aaTTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGa < 1:389491/93‑1 (MQ=255)
aaTTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGa < 1:1801677/93‑1 (MQ=255)
aTTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGaa > 1:6180456/1‑93 (MQ=255)
cTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCt < 1:1980642/93‑1 (MQ=255)
ttttCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTg > 1:4149194/1‑93 (MQ=255)
tttCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTgg > 2:629927/1‑93 (MQ=255)
tCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGtt > 1:2091376/1‑93 (MQ=255)
tCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGtt < 1:3594300/93‑1 (MQ=255)
tCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGtt < 2:1660016/93‑1 (MQ=255)
aGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATa > 1:4176950/1‑93 (MQ=255)
aGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATa < 2:6017087/93‑1 (MQ=255)
cGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACg > 2:5009190/1‑93 (MQ=255)
ggAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACgg > 1:1907732/1‑93 (MQ=255)
gAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGt > 2:1536086/1‑93 (MQ=255)
gAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGt > 1:1407356/1‑93 (MQ=255)
aaCCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAAcc < 2:5958159/93‑1 (MQ=255)
aaCCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAAcc < 2:5156681/93‑1 (MQ=255)
aCCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAAccc < 2:2215530/93‑1 (MQ=255)
cTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGa < 2:4600627/93‑1 (MQ=255)
tgatgaGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGaa > 1:5219268/1‑93 (MQ=255)
gatgaGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAAt < 2:1638028/93‑1 (MQ=255)
gatgaGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAAt < 1:4299932/93‑1 (MQ=255)
atgaGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATc < 1:1175889/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCTAATCGCa < 2:3155594/93‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCa < 1:926212/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAc < 1:1288304/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAc < 2:2247169/93‑1 (MQ=255)
gCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAc < 2:278845/93‑1 (MQ=255)
cGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTGCATAACGGTAACCCGAATCGCACGc > 1:6086341/1‑93 (MQ=255)
gCAGGTCGTCATTAATCAGGACAGCTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCt < 1:1030603/93‑1 (MQ=255)
gCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCt > 2:178818/1‑93 (MQ=255)
cAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTg < 2:5447519/93‑1 (MQ=255)
aGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTgg > 2:4859107/1‑93 (MQ=255)
ggTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGc < 2:566031/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGc < 1:5979081/93‑1 (MQ=255)
ggTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGc > 2:2601379/1‑93 (MQ=255)
gtcgtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCg > 1:3876837/1‑93 (MQ=255)
tcgtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCga > 1:991206/1‑93 (MQ=255)
tcgtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCga > 2:2009323/1‑93 (MQ=255)
cgtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGGAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgat > 1:1600724/1‑93 (MQ=255)
gtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgatg < 2:3025821/93‑1 (MQ=255)
gtcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgatg > 1:1898386/1‑93 (MQ=255)
tcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgatga > 1:641692/1‑93 (MQ=255)
tcATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgatga > 2:2436782/1‑93 (MQ=255)
cATTAATCAGGACAACATAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCgatgat < 1:3419321/93‑1 (MQ=255)
ttAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCt > 2:4360353/1‑93 (MQ=255)
aaTCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCttt < 2:3432308/93‑1 (MQ=255)
aTCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTg > 2:1665953/1‑93 (MQ=255)
tCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGa < 2:4920666/93‑1 (MQ=255)
tCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGa > 2:4754951/1‑93 (MQ=255)
tCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGAGTGTCAATGAAGCTGGATCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGa > 2:268979/1‑93 (MQ=255)
aGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGaaa < 1:3481017/93‑1 (MQ=255)
aGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGaaa > 1:4008719/1‑93 (MQ=255)
aGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGaaa < 1:4654762/93‑1 (MQ=255)
aGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGaaa > 1:2176646/1‑93 (MQ=255)
aGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGaaa < 1:878393/93‑1 (MQ=255)
gacaacTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACg > 2:2399767/1‑93 (MQ=255)
|
AAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACGACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACG > NC_000913/1360094‑1360273
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAAAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACGACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGTACC > NC_000913/1360091‑1360277
|
CAAAAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACA < SRR4302533.4932228/94‑1 (MQ=60)
AAAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAAC > SRR4302533.3637155/1‑94 (MQ=60)
TGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAT < SRR4302533.6089999/94‑1 (MQ=60)
TGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAAT < SRR4302533.5398260/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATT > SRR4302533.4832646/1‑94 (MQ=60)
GCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATT < SRR4302533.5062862/94‑1 (MQ=60)
GCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATT < SRR4302533.1628592/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTG > SRR4302533.875406/1‑94 (MQ=60)
CTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTG < SRR4302533.4405601/94‑1 (MQ=60)
CTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTG < SRR4302533.2906627/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGA < SRR4302533.2439827/94‑1 (MQ=60)
TGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGA > SRR4302533.2955048/1‑94 (MQ=60)
TGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGA > SRR4302533.2920168/1‑94 (MQ=60)
GAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAG < SRR4302533.5927174/94‑1 (MQ=60)
AGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGAT > SRR4302533.2848359/1‑94 (MQ=60)
GGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATG < SRR4302533.4878856/94‑1 (MQ=60)
GTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGG > SRR4302533.1974308/1‑94 (MQ=60)
GTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGG < SRR4302533.773277/94‑1 (MQ=60)
GTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGG < SRR4302533.1634658/94‑1 (MQ=60)
GTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGT < SRR4302533.3879497/94‑1 (MQ=60)
GTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGT > SRR4302533.6273995/1‑94 (MQ=60)
TATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTA < SRR4302533.1913260/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAG > SRR4302533.5962449/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAG < SRR4302533.4259190/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAG < SRR4302533.5830900/94‑1 (MQ=60)
ATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAG < SRR4302533.6243627/94‑1 (MQ=60)
TGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGT < SRR4302533.1965184/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTC < SRR4302533.337414/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTC > SRR4302533.4128918/1‑94 (MQ=60)
TCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCTAGCCGGAAAGACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAG < SRR4302533.6123152/94‑1 (MQ=60)
TCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAG > SRR4302533.6021856/1‑94 (MQ=60)
CTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGG > SRR4302533.3661863/1‑94 (MQ=60)
TGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGG > SRR4302533.229547/1‑94 (MQ=60)
GTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGT < SRR4302533.4273527/94‑1 (MQ=60)
TCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTG > SRR4302533.4970546/1‑94 (MQ=60)
CCTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTG < SRR4302533.5364976/94‑1 (MQ=60)
ACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTG > SRR4302533.634106/1‑94 (MQ=60)
CTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGA > SRR4302533.3780376/1‑94 (MQ=60)
CTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCA > SRR4302533.2795027/1‑94 (MQ=60)
CTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCA < SRR4302533.5005850/94‑1 (MQ=60)
CTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCA < SRR4302533.5087773/94‑1 (MQ=60)
TCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAA > SRR4302533.6318696/1‑94 (MQ=60)
GGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGGTGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATG > SRR4302533.4612170/1‑94 (MQ=60)
GGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATG < SRR4302533.162134/94‑1 (MQ=60)
GGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATG < SRR4302533.4092330/94‑1 (MQ=60)
GGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATG < SRR4302533.1647118/94‑1 (MQ=60)
GGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATG > SRR4302533.2309048/1‑94 (MQ=60)
AATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAA < SRR4302533.2184026/94‑1 (MQ=60)
AATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAA > SRR4302533.4646707/1‑94 (MQ=60)
AATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAA > SRR4302533.6217574/1‑94 (MQ=60)
AATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAA < SRR4302533.391845/94‑1 (MQ=60)
AATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAA < SRR4302533.1812640/94‑1 (MQ=60)
TTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGC > SRR4302533.5009639/1‑94 (MQ=60)
TTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGC > SRR4302533.3393926/1‑94 (MQ=60)
TCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCT < SRR4302533.3527376/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTG < SRR4302533.1992767/94‑1 (MQ=60)
CTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTG > SRR4302533.4522673/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTG > SRR4302533.4174334/1‑94 (MQ=60)
CTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTG > SRR4302533.4174333/1‑94 (MQ=60)
TTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGG > SRR4302533.5744710/1‑94 (MQ=60)
TTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGG < SRR4302533.4128790/94‑1 (MQ=60)
TTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTT > SRR4302533.2104257/1‑94 (MQ=60)
TCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTC < SRR4302533.3616415/94‑1 (MQ=60)
CCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCA < SRR4302533.1150507/94‑1 (MQ=60)
CGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCAT < SRR4302533.743012/94‑1 (MQ=60)
CGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCAT < SRR4302533.3904132/94‑1 (MQ=60)
GAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATA > SRR4302533.4202257/1‑94 (MQ=60)
GAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATA < SRR4302533.1744411/94‑1 (MQ=60)
GCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAAC < SRR4302533.3854847/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACG > SRR4302533.3461196/1‑94 (MQ=60)
CGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGG < SRR4302533.284510/94‑1 (MQ=60)
CGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGG > SRR4302533.1919370/1‑94 (MQ=60)
CGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGG < SRR4302533.4353710/94‑1 (MQ=60)
CGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGG > SRR4302533.4147447/1‑94 (MQ=60)
GGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGT > SRR4302533.6029175/1‑94 (MQ=60)
GGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGT > SRR4302533.1819176/1‑94 (MQ=60)
GGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGT > SRR4302533.1415866/1‑94 (MQ=60)
ACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCG < SRR4302533.1453564/94‑1 (MQ=60)
CCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGA > SRR4302533.5061104/1‑94 (MQ=60)
CTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAA > SRR4302533.5951644/1‑94 (MQ=60)
CTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAA > SRR4302533.5250681/1‑94 (MQ=60)
TGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAAT > SRR4302533.3752578/1‑94 (MQ=60)
TGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAAT > SRR4302533.1732092/1‑94 (MQ=60)
GATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATC < SRR4302533.2462128/94‑1 (MQ=60)
GATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATC < SRR4302533.2329143/94‑1 (MQ=60)
GATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATC < SRR4302533.4325791/94‑1 (MQ=60)
ATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCG < SRR4302533.1182945/94‑1 (MQ=60)
TGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGC > SRR4302533.938987/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAG > SRR4302533.3447053/1‑94 (MQ=60)
AGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAC < SRR4302533.1408091/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAC < SRR4302533.931647/94‑1 (MQ=60)
AGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCAC < SRR4302533.4717907/94‑1 (MQ=60)
GCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACG < SRR4302533.1296057/94‑1 (MQ=60)
CCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTGCATAACGGTAACCCGAATCGCACGC > SRR4302533.6123136/1‑94 (MQ=60)
CCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGCGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGG > SRR4302533.6123135/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCT > SRR4302533.784619/1‑94 (MQ=60)
CGCAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCT > SRR4302533.5964631/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTCGTCATTAATCAGGACAGCTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTG < SRR4302533.1036665/94‑1 (MQ=60)
CAGGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGG > SRR4302533.1467372/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCG > SRR4302533.3900498/1‑94 (MQ=60)
GGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCG < SRR4302533.6015295/94‑1 (MQ=60)
GGTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCG > SRR4302533.5843389/1‑94 (MQ=60)
GTCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGA > SRR4302533.997002/1‑94 (MQ=60)
TCGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGGAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGAT > SRR4302533.1610414/1‑94 (MQ=60)
CGTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATG > SRR4302533.1909977/1‑94 (MQ=60)
GTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGA > SRR4302533.1286229/1‑94 (MQ=60)
GTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGA > SRR4302533.645466/1‑94 (MQ=60)
GTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGA > SRR4302533.3932777/1‑94 (MQ=60)
GTCATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGA > SRR4302533.4974816/1‑94 (MQ=60)
CATTAATCAGGACAACATAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATC < SRR4302533.3440448/94‑1 (MQ=60)
ATTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCT > SRR4302533.5817219/1‑94 (MQ=60)
TTAATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTT < SRR4302533.3046984/94‑1 (MQ=60)
ATCAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGA < SRR4302533.920654/94‑1 (MQ=60)
CAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAA > SRR4302533.4033127/1‑94 (MQ=60)
CAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAA > SRR4302533.2048936/1‑94 (MQ=60)
CAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAA > SRR4302533.2190064/1‑94 (MQ=60)
CAGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAA > SRR4302533.4920301/1‑94 (MQ=60)
AGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAAC < SRR4302533.883549/94‑1 (MQ=60)
AGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAAC < SRR4302533.4682968/94‑1 (MQ=60)
AGGACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAAC < SRR4302533.3502490/94‑1 (MQ=60)
GACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGT < SRR4302533.2314545/94‑1 (MQ=60)
ACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGCTGATCTTTGAAACGTA > SRR4302533.5404471/1‑94 (MQ=60)
ACAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGTA > SRR4302533.2870395/1‑94 (MQ=60)
CAACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGTAC < SRR4302533.6027132/94‑1 (MQ=60)
AACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGTACC > SRR4302533.5768866/1‑94 (MQ=60)
|
CAAAAGCTGCTGAAGGTGTATGGTCTGTCACTCTCGGAATTCTTTTCCGAGCCGGAAAAACCTGATGAGCCGCAGGTCGTCATTAATCAGGACGACTTAATTGAGATGGGTAGTCAGGGTGTGTCAATGAAGCTGGTTCATAACGGTAACCCGAATCGCACGCTGGCGATGATCTTTGAAACGTACC > NC_000913/1360091‑1360277
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
